Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A286UQ52

Protein Details
Accession A0A286UQ52    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-57SASNQPSSPPMKKRKRDEVNGKDDIKHydrophilic
59-89QLSLPPKPPVIKKQKRGRKNKRNRQEYTSGTHydrophilic
179-198ALHGKNKRWKKERVHKSPLWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-48KKRKRD
62-82LPPKPPVIKKQKRGRKNKRNR
183-217KNKRWKKERVHKSPLWYNIPPEKPSTKSKGKGKSK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047313  SMN_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
CDD cd22852  SMN_C  
cd22851  SMN_N  
Amino Acid Sequences MARQVVSYSDLDAPYSAPRIVETEVATQPMASASNQPSSPPMKKRKRDEVNGKDDIKSQLSLPPKPPVIKKQKRGRKNKRNRQEYTSGTALVDAHWDDPGLQVSGISYDEDYDAVGANADYNNEDGEWEDDEYHGDAAIADENHDEEEEDESRDLTHEEIWDDSALIAAWDAANEEYEALHGKNKRWKKERVHKSPLWYNIPPEKPSTKSKGKGKSKQESAVPKAATTPAVQTLSGLTEAEDNQSSAPLNFDTFVPTHDPSLTFTGPSSPPPLPQNTQSHLGQIQNYYESILPPPGNAAYTTTGGMGFTANTKGAGVGTINADEAFNRAIGAMYWCGYWTAMYHVQRAHERVTDRVNFTAENNQDSPIEDEEETELLVSTQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.17
4 0.14
5 0.14
6 0.17
7 0.18
8 0.2
9 0.19
10 0.22
11 0.23
12 0.24
13 0.23
14 0.2
15 0.19
16 0.17
17 0.15
18 0.11
19 0.16
20 0.17
21 0.23
22 0.23
23 0.23
24 0.27
25 0.34
26 0.41
27 0.44
28 0.52
29 0.58
30 0.68
31 0.77
32 0.83
33 0.86
34 0.89
35 0.9
36 0.9
37 0.88
38 0.87
39 0.8
40 0.7
41 0.64
42 0.57
43 0.48
44 0.38
45 0.3
46 0.27
47 0.31
48 0.34
49 0.34
50 0.38
51 0.4
52 0.45
53 0.5
54 0.55
55 0.6
56 0.65
57 0.71
58 0.75
59 0.81
60 0.86
61 0.91
62 0.92
63 0.92
64 0.93
65 0.94
66 0.94
67 0.94
68 0.9
69 0.87
70 0.84
71 0.78
72 0.73
73 0.64
74 0.54
75 0.43
76 0.38
77 0.3
78 0.21
79 0.17
80 0.12
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.08
86 0.1
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.09
168 0.11
169 0.15
170 0.23
171 0.29
172 0.38
173 0.44
174 0.53
175 0.6
176 0.69
177 0.76
178 0.79
179 0.82
180 0.76
181 0.76
182 0.73
183 0.68
184 0.64
185 0.53
186 0.47
187 0.46
188 0.45
189 0.4
190 0.37
191 0.34
192 0.31
193 0.36
194 0.39
195 0.39
196 0.44
197 0.51
198 0.58
199 0.65
200 0.7
201 0.74
202 0.76
203 0.74
204 0.71
205 0.69
206 0.66
207 0.61
208 0.58
209 0.49
210 0.4
211 0.35
212 0.32
213 0.27
214 0.19
215 0.16
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.09
241 0.11
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.2
249 0.19
250 0.15
251 0.15
252 0.18
253 0.18
254 0.19
255 0.21
256 0.17
257 0.2
258 0.23
259 0.28
260 0.26
261 0.33
262 0.38
263 0.37
264 0.41
265 0.38
266 0.37
267 0.35
268 0.34
269 0.29
270 0.24
271 0.22
272 0.19
273 0.19
274 0.17
275 0.15
276 0.13
277 0.13
278 0.15
279 0.14
280 0.12
281 0.14
282 0.13
283 0.14
284 0.13
285 0.14
286 0.13
287 0.14
288 0.15
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.09
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.1
312 0.09
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.14
328 0.21
329 0.23
330 0.27
331 0.29
332 0.34
333 0.39
334 0.41
335 0.38
336 0.36
337 0.36
338 0.37
339 0.44
340 0.45
341 0.43
342 0.43
343 0.41
344 0.37
345 0.37
346 0.41
347 0.35
348 0.34
349 0.32
350 0.3
351 0.29
352 0.3
353 0.31
354 0.24
355 0.25
356 0.19
357 0.19
358 0.2
359 0.19
360 0.17
361 0.14
362 0.12