Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BYJ7

Protein Details
Accession G8BYJ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26SENNNTESKKKVPKSKKVDDDDDEDAcidic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000717  PCI_dom  
IPR019585  Rpn7/CSN1  
IPR045135  Rpn7_N  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0008541  C:proteasome regulatory particle, lid subcomplex  
GO:0043161  P:proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG tpf:TPHA_0J01170  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01399  PCI  
PF10602  RPN7  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSENNNTESKKKVPKSKKVDDDDDEDVIYADPTVNKVPNFEVSELSFILTQPSLISQHEDVEKSVMEKIKAEHMAPYYKYLTHEYLPKDKNNKTVIPFDEKLYKELLDLNEQNITELKERITEIEENDEGELELAQSWIKLGEYYAQIGDRENAQEVLEKAITKAISTGAKIDIMLTITRIGFFYNDQHFVKEKLEAINSMLEKGGGDWERRNRYKTYKGMHCLAIRDFKEAAGLLVDSLATFTSTELTSYENIATYASVAGLFTLERTDLKLKIIDSPELLSLLTTNSALQSISSLTISLYTSDYSSYFPYLLETYDNVLIPCKYLNKHADYFVRAMRRTVYAQLLESYKTLSLTSMANAFGVSVDFLDNDLGRFIPNKQLNCVIDRYNGIVQTNRPDNKNSQYHLLIKQGDGLLTKLQKYTAAVKLTGSSDHAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.82
3 0.87
4 0.89
5 0.87
6 0.87
7 0.81
8 0.76
9 0.7
10 0.61
11 0.5
12 0.4
13 0.32
14 0.23
15 0.18
16 0.12
17 0.09
18 0.08
19 0.11
20 0.15
21 0.18
22 0.18
23 0.2
24 0.22
25 0.28
26 0.31
27 0.3
28 0.28
29 0.26
30 0.28
31 0.26
32 0.25
33 0.18
34 0.14
35 0.16
36 0.13
37 0.12
38 0.09
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.16
43 0.15
44 0.19
45 0.22
46 0.23
47 0.22
48 0.21
49 0.21
50 0.18
51 0.23
52 0.22
53 0.19
54 0.2
55 0.21
56 0.27
57 0.29
58 0.28
59 0.28
60 0.29
61 0.34
62 0.33
63 0.36
64 0.3
65 0.29
66 0.31
67 0.31
68 0.31
69 0.28
70 0.33
71 0.34
72 0.41
73 0.44
74 0.49
75 0.53
76 0.53
77 0.59
78 0.58
79 0.58
80 0.53
81 0.56
82 0.53
83 0.53
84 0.51
85 0.45
86 0.47
87 0.43
88 0.4
89 0.34
90 0.3
91 0.22
92 0.25
93 0.24
94 0.23
95 0.23
96 0.23
97 0.24
98 0.24
99 0.24
100 0.21
101 0.21
102 0.16
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.18
109 0.17
110 0.16
111 0.2
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.17
116 0.13
117 0.11
118 0.1
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.11
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.13
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.14
149 0.13
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.13
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.12
172 0.14
173 0.18
174 0.18
175 0.2
176 0.21
177 0.22
178 0.22
179 0.18
180 0.17
181 0.15
182 0.16
183 0.14
184 0.14
185 0.16
186 0.15
187 0.14
188 0.12
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.12
193 0.1
194 0.11
195 0.14
196 0.21
197 0.3
198 0.32
199 0.35
200 0.35
201 0.4
202 0.47
203 0.5
204 0.51
205 0.51
206 0.53
207 0.53
208 0.53
209 0.48
210 0.42
211 0.37
212 0.36
213 0.29
214 0.28
215 0.25
216 0.2
217 0.19
218 0.17
219 0.15
220 0.08
221 0.07
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.07
256 0.1
257 0.1
258 0.12
259 0.14
260 0.14
261 0.19
262 0.21
263 0.2
264 0.18
265 0.18
266 0.17
267 0.16
268 0.15
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.12
304 0.13
305 0.14
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.13
311 0.15
312 0.15
313 0.22
314 0.28
315 0.32
316 0.34
317 0.39
318 0.42
319 0.41
320 0.43
321 0.4
322 0.41
323 0.36
324 0.35
325 0.32
326 0.31
327 0.3
328 0.31
329 0.31
330 0.25
331 0.25
332 0.27
333 0.26
334 0.24
335 0.22
336 0.19
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.12
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.1
363 0.11
364 0.2
365 0.25
366 0.27
367 0.3
368 0.37
369 0.39
370 0.41
371 0.43
372 0.36
373 0.34
374 0.34
375 0.34
376 0.3
377 0.3
378 0.28
379 0.28
380 0.28
381 0.33
382 0.41
383 0.41
384 0.4
385 0.43
386 0.48
387 0.54
388 0.59
389 0.54
390 0.52
391 0.53
392 0.57
393 0.56
394 0.57
395 0.5
396 0.42
397 0.43
398 0.38
399 0.33
400 0.28
401 0.25
402 0.24
403 0.26
404 0.28
405 0.24
406 0.24
407 0.24
408 0.27
409 0.32
410 0.33
411 0.33
412 0.32
413 0.32
414 0.34
415 0.34
416 0.32