FuNGI

A0A286UP11

Protein Details

Accession

A0A286UP11

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-59	QGGPPSPTKPPMPKRRKKEITLFQKNPSRP	Hydrophilic
252-279	PSGSKDEKTNNNKKKKFQKKTRQVFLVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-47	TKPPMPKRRKK
264-270	KKKKFQK
743-751	PKTKKRKPG

Subcellular Location(s)

nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTPSPTPATSSAVSTMITPAHGAQERPPQQGGPPSPTKPPMPKRRKKEITLFQKNPSRPFALAQMQAANGKGPATSSSVLGTGPRFSRPQPSSNPTLGVPTTKPQQNQSQQPNSRSPSASSTPPPASSSQNDLSTATTTTPDLPYQEYQLMSCDRHGWQYDVFKFDSRKSVDIQTWPRPVKLNRKEIKRADTSANAGAEGDVAPVPVGPMLGPDGKPVIGADGRIVMVDAEGKPIRSDGKSSVPSSMRTVTPSGSKDEKTNNNKKKKFQKKTRQVFLVPDHIRQLRKEERYPWVMEDTTGKEVWEGRMEEASKSDLHGLFMPAPDQVFKFVPAHRWYKFQKRRPQHLVWSLEEAEKMMAKMQKSKDPERWLRRADDGKRRTAPMAGGLGGGSLVYDEGRESRALGGRRLHTVDTGSRDLFGDDDDEEGGGARRARERARGAEGDLDEMEYEEDFADDDEQIEVDPNDEEAKELEERLKREYKNANKTREGHIDESDEEEDMDNLTGAGKEMKKLVRKVEKNAAYDSEEDENPYASSQEEEEEEEPTPTATGVQEQPQTRPASKANSRPGTPRAGSRSGSPAPPSGGSTAGNVVKIKSEGGGTTSVVSSSSSAPGGLLAPPQSPVLGMGGHSIVAKRATSPKAPSMPKMKTTSTSGGNGNGNNRATSPLAGGGRSRAGSPNPISPGGGSRSGSPGVGNSPPTSASKKRKAEDGAGGSGSGATIGGASISAPVGGGGGGGGNTAPKTKKRKPGAGGANGSASGPGTPISASTTSGSFKTARSSASIPASSSINSTATTSSSGSLSGFPVIDASTSLSAALLVQWLKASPGATTRECIQYFQPCLTDEGKKSRFTGLVKEVAALKGGI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.19
3	0.15
4	0.14
5	0.13
6	0.12
7	0.18
8	0.2
9	0.2
10	0.24
11	0.34
12	0.4
13	0.43
14	0.44
15	0.38
16	0.4
17	0.48
18	0.47
19	0.45
20	0.46
21	0.45
22	0.5
23	0.54
24	0.57
25	0.58
26	0.64
27	0.67
28	0.71
29	0.79
30	0.81
31	0.88
32	0.9
33	0.89
34	0.89
35	0.88
36	0.88
37	0.89
38	0.86
39	0.83
40	0.83
41	0.79
42	0.74
43	0.69
44	0.62
45	0.52
46	0.49
47	0.47
48	0.45
49	0.43
50	0.4
51	0.36
52	0.33
53	0.33
54	0.31
55	0.24
56	0.17
57	0.14
58	0.12
59	0.11
60	0.11
61	0.14
62	0.14
63	0.14
64	0.15
65	0.15
66	0.15
67	0.17
68	0.16
69	0.17
70	0.17
71	0.21
72	0.22
73	0.24
74	0.34
75	0.36
76	0.42
77	0.46
78	0.51
79	0.54
80	0.54
81	0.54
82	0.44
83	0.45
84	0.38
85	0.33
86	0.29
87	0.27
88	0.33
89	0.36
90	0.38
91	0.39
92	0.49
93	0.53
94	0.61
95	0.66
96	0.69
97	0.71
98	0.74
99	0.77
100	0.71
101	0.67
102	0.59
103	0.52
104	0.48
105	0.45
106	0.44
107	0.4
108	0.42
109	0.39
110	0.39
111	0.39
112	0.34
113	0.36
114	0.33
115	0.37
116	0.34
117	0.33
118	0.33
119	0.31
120	0.3
121	0.26
122	0.24
123	0.18
124	0.14
125	0.13
126	0.15
127	0.16
128	0.15
129	0.16
130	0.19
131	0.19
132	0.21
133	0.24
134	0.22
135	0.2
136	0.23
137	0.24
138	0.21
139	0.21
140	0.21
141	0.19
142	0.24
143	0.25
144	0.24
145	0.25
146	0.33
147	0.36
148	0.36
149	0.36
150	0.36
151	0.37
152	0.37
153	0.41
154	0.35
155	0.34
156	0.33
157	0.37
158	0.37
159	0.43
160	0.48
161	0.48
162	0.54
163	0.54
164	0.53
165	0.54
166	0.57
167	0.59
168	0.61
169	0.64
170	0.62
171	0.7
172	0.77
173	0.77
174	0.78
175	0.73
176	0.67
177	0.62
178	0.58
179	0.52
180	0.47
181	0.4
182	0.32
183	0.26
184	0.22
185	0.17
186	0.13
187	0.1
188	0.06
189	0.06
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.03
196	0.04
197	0.07
198	0.09
199	0.1
200	0.1
201	0.12
202	0.11
203	0.12
204	0.11
205	0.12
206	0.1
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.06
214	0.06
215	0.08
216	0.08
217	0.11
218	0.12
219	0.12
220	0.12
221	0.14
222	0.17
223	0.15
224	0.18
225	0.17
226	0.24
227	0.29
228	0.3
229	0.35
230	0.34
231	0.35
232	0.35
233	0.35
234	0.27
235	0.25
236	0.25
237	0.21
238	0.24
239	0.24
240	0.25
241	0.26
242	0.27
243	0.28
244	0.35
245	0.43
246	0.48
247	0.58
248	0.62
249	0.69
250	0.74
251	0.79
252	0.83
253	0.84
254	0.85
255	0.86
256	0.87
257	0.87
258	0.92
259	0.92
260	0.88
261	0.8
262	0.75
263	0.68
264	0.67
265	0.58
266	0.49
267	0.44
268	0.41
269	0.4
270	0.35
271	0.38
272	0.36
273	0.41
274	0.44
275	0.44
276	0.47
277	0.5
278	0.5
279	0.45
280	0.4
281	0.34
282	0.3
283	0.28
284	0.24
285	0.22
286	0.21
287	0.18
288	0.15
289	0.16
290	0.17
291	0.17
292	0.15
293	0.13
294	0.17
295	0.18
296	0.17
297	0.17
298	0.17
299	0.13
300	0.13
301	0.16
302	0.12
303	0.13
304	0.13
305	0.14
306	0.13
307	0.13
308	0.13
309	0.1
310	0.09
311	0.09
312	0.08
313	0.1
314	0.09
315	0.11
316	0.13
317	0.14
318	0.21
319	0.24
320	0.3
321	0.29
322	0.35
323	0.39
324	0.48
325	0.56
326	0.59
327	0.64
328	0.69
329	0.78
330	0.79
331	0.8
332	0.77
333	0.76
334	0.72
335	0.63
336	0.57
337	0.48
338	0.4
339	0.34
340	0.25
341	0.17
342	0.13
343	0.11
344	0.1
345	0.11
346	0.11
347	0.18
348	0.21
349	0.26
350	0.31
351	0.37
352	0.41
353	0.48
354	0.57
355	0.58
356	0.63
357	0.6
358	0.57
359	0.58
360	0.59
361	0.58
362	0.59
363	0.55
364	0.55
365	0.54
366	0.53
367	0.47
368	0.4
369	0.33
370	0.25
371	0.23
372	0.16
373	0.13
374	0.11
375	0.1
376	0.08
377	0.07
378	0.04
379	0.03
380	0.02
381	0.02
382	0.02
383	0.03
384	0.03
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.07
389	0.12
390	0.13
391	0.16
392	0.2
393	0.2
394	0.23
395	0.24
396	0.22
397	0.19
398	0.19
399	0.18
400	0.19
401	0.19
402	0.17
403	0.16
404	0.16
405	0.15
406	0.13
407	0.11
408	0.07
409	0.05
410	0.06
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.08
420	0.11
421	0.13
422	0.19
423	0.21
424	0.24
425	0.28
426	0.28
427	0.27
428	0.28
429	0.26
430	0.21
431	0.18
432	0.15
433	0.1
434	0.09
435	0.08
436	0.04
437	0.05
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.05
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.12
461	0.14
462	0.16
463	0.2
464	0.27
465	0.25
466	0.32
467	0.41
468	0.46
469	0.54
470	0.6
471	0.62
472	0.61
473	0.64
474	0.63
475	0.62
476	0.56
477	0.47
478	0.41
479	0.37
480	0.31
481	0.3
482	0.25
483	0.17
484	0.13
485	0.11
486	0.09
487	0.08
488	0.07
489	0.04
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.04
494	0.08
495	0.07
496	0.08
497	0.12
498	0.17
499	0.22
500	0.25
501	0.34
502	0.4
503	0.44
504	0.49
505	0.55
506	0.57
507	0.54
508	0.53
509	0.47
510	0.38
511	0.35
512	0.32
513	0.25
514	0.18
515	0.17
516	0.15
517	0.14
518	0.12
519	0.11
520	0.09
521	0.06
522	0.07
523	0.06
524	0.07
525	0.07
526	0.09
527	0.1
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.06
535	0.07
536	0.05
537	0.07
538	0.09
539	0.13
540	0.18
541	0.19
542	0.2
543	0.25
544	0.28
545	0.26
546	0.28
547	0.27
548	0.31
549	0.36
550	0.43
551	0.47
552	0.49
553	0.5
554	0.51
555	0.52
556	0.5
557	0.45
558	0.42
559	0.38
560	0.38
561	0.37
562	0.35
563	0.38
564	0.33
565	0.34
566	0.3
567	0.26
568	0.23
569	0.23
570	0.22
571	0.16
572	0.16
573	0.14
574	0.13
575	0.15
576	0.14
577	0.15
578	0.14
579	0.14
580	0.13
581	0.13
582	0.13
583	0.1
584	0.09
585	0.08
586	0.09
587	0.11
588	0.1
589	0.1
590	0.1
591	0.09
592	0.09
593	0.09
594	0.08
595	0.08
596	0.09
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.08
603	0.08
604	0.08
605	0.09
606	0.1
607	0.1
608	0.09
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.07
617	0.08
618	0.07
619	0.08
620	0.09
621	0.09
622	0.1
623	0.17
624	0.2
625	0.25
626	0.29
627	0.34
628	0.41
629	0.44
630	0.47
631	0.5
632	0.51
633	0.53
634	0.54
635	0.49
636	0.44
637	0.47
638	0.46
639	0.4
640	0.39
641	0.34
642	0.33
643	0.34
644	0.32
645	0.3
646	0.3
647	0.27
648	0.24
649	0.23
650	0.22
651	0.2
652	0.19
653	0.17
654	0.16
655	0.16
656	0.17
657	0.17
658	0.16
659	0.18
660	0.17
661	0.17
662	0.16
663	0.17
664	0.22
665	0.25
666	0.28
667	0.29
668	0.3
669	0.29
670	0.26
671	0.28
672	0.25
673	0.26
674	0.21
675	0.19
676	0.21
677	0.22
678	0.21
679	0.17
680	0.15
681	0.15
682	0.17
683	0.18
684	0.16
685	0.16
686	0.18
687	0.21
688	0.26
689	0.31
690	0.39
691	0.47
692	0.54
693	0.56
694	0.62
695	0.63
696	0.63
697	0.63
698	0.59
699	0.52
700	0.44
701	0.42
702	0.34
703	0.29
704	0.22
705	0.13
706	0.07
707	0.03
708	0.03
709	0.03
710	0.03
711	0.03
712	0.03
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.03
721	0.03
722	0.03
723	0.03
724	0.03
725	0.03
726	0.04
727	0.05
728	0.09
729	0.13
730	0.21
731	0.31
732	0.4
733	0.5
734	0.59
735	0.68
736	0.69
737	0.77
738	0.79
739	0.79
740	0.74
741	0.66
742	0.58
743	0.48
744	0.43
745	0.32
746	0.22
747	0.13
748	0.09
749	0.07
750	0.06
751	0.06
752	0.07
753	0.1
754	0.11
755	0.12
756	0.13
757	0.15
758	0.16
759	0.17
760	0.19
761	0.17
762	0.17
763	0.21
764	0.22
765	0.21
766	0.24
767	0.26
768	0.29
769	0.34
770	0.35
771	0.3
772	0.29
773	0.29
774	0.25
775	0.25
776	0.21
777	0.16
778	0.15
779	0.15
780	0.14
781	0.14
782	0.16
783	0.15
784	0.14
785	0.13
786	0.13
787	0.13
788	0.13
789	0.13
790	0.13
791	0.12
792	0.11
793	0.11
794	0.11
795	0.1
796	0.09
797	0.11
798	0.1
799	0.1
800	0.1
801	0.09
802	0.09
803	0.09
804	0.08
805	0.09
806	0.08
807	0.09
808	0.1
809	0.1
810	0.11
811	0.13
812	0.13
813	0.11
814	0.16
815	0.22
816	0.23
817	0.26
818	0.28
819	0.35
820	0.35
821	0.36
822	0.36
823	0.39
824	0.41
825	0.41
826	0.39
827	0.32
828	0.36
829	0.38
830	0.39
831	0.36
832	0.44
833	0.46
834	0.47
835	0.47
836	0.49
837	0.5
838	0.46
839	0.49
840	0.46
841	0.48
842	0.45
843	0.45
844	0.42
845	0.37

A0A286UP11

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer