Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A286UPF1

Protein Details
Accession A0A286UPF1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
281-300NSNGTWRPRNNNNWNNNQNNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSRNPGSAPPPVPPPVPPSGPPPGLPPVPPPGPQQNPQVYIKEISINKPPIFTGATNRARKWLADVRAYLMLNQAVYNNDEKRILFTLSYMRSTDYNAGLSEAEKWADLWMEQHWNNLGLWADFEQAFKDRFITSDEAGEAIRELNKLKVKNQKYDEYINMFQMLARQAKITEYNALMPYFLQGLPTKLVESAYNSTQLPDTMDKWYDYVRKIGIQWNNMNQLLQGRGITVKSPTVKDPDAMDVDRVQLSKNQRTEYLKEGKCFNCGRKGHISRNCNTERNSNGTWRPRNNNNWNNNQNNQNTQGSSNPRPSGFFKQRQVRQTETEEQPEAPAPQMIEYGLSSKARAAHIATLLGGITEEERNSIFSELNEQGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.39
4 0.38
5 0.38
6 0.43
7 0.43
8 0.42
9 0.4
10 0.4
11 0.39
12 0.38
13 0.36
14 0.35
15 0.37
16 0.38
17 0.4
18 0.43
19 0.47
20 0.5
21 0.56
22 0.55
23 0.56
24 0.58
25 0.55
26 0.48
27 0.43
28 0.4
29 0.38
30 0.34
31 0.33
32 0.38
33 0.41
34 0.39
35 0.38
36 0.37
37 0.32
38 0.33
39 0.3
40 0.29
41 0.33
42 0.42
43 0.47
44 0.47
45 0.49
46 0.47
47 0.46
48 0.46
49 0.44
50 0.4
51 0.4
52 0.41
53 0.39
54 0.43
55 0.43
56 0.35
57 0.29
58 0.24
59 0.19
60 0.18
61 0.15
62 0.12
63 0.14
64 0.18
65 0.17
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.21
70 0.22
71 0.22
72 0.17
73 0.17
74 0.23
75 0.24
76 0.26
77 0.23
78 0.21
79 0.21
80 0.23
81 0.25
82 0.19
83 0.17
84 0.15
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.14
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.09
98 0.15
99 0.16
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.16
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.11
114 0.12
115 0.11
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.14
120 0.16
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.09
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.08
132 0.12
133 0.17
134 0.18
135 0.24
136 0.34
137 0.37
138 0.45
139 0.49
140 0.5
141 0.5
142 0.53
143 0.5
144 0.47
145 0.43
146 0.35
147 0.31
148 0.25
149 0.21
150 0.19
151 0.18
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.14
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.1
179 0.12
180 0.11
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.12
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.16
194 0.18
195 0.17
196 0.18
197 0.17
198 0.17
199 0.19
200 0.25
201 0.26
202 0.28
203 0.3
204 0.32
205 0.35
206 0.34
207 0.32
208 0.25
209 0.23
210 0.18
211 0.16
212 0.11
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.12
219 0.14
220 0.15
221 0.17
222 0.21
223 0.21
224 0.22
225 0.22
226 0.22
227 0.23
228 0.22
229 0.21
230 0.16
231 0.17
232 0.17
233 0.16
234 0.13
235 0.15
236 0.21
237 0.27
238 0.3
239 0.3
240 0.34
241 0.39
242 0.41
243 0.44
244 0.48
245 0.44
246 0.43
247 0.48
248 0.43
249 0.46
250 0.47
251 0.43
252 0.42
253 0.41
254 0.44
255 0.48
256 0.55
257 0.58
258 0.62
259 0.64
260 0.59
261 0.67
262 0.67
263 0.61
264 0.57
265 0.54
266 0.49
267 0.5
268 0.48
269 0.45
270 0.48
271 0.52
272 0.58
273 0.58
274 0.62
275 0.64
276 0.72
277 0.76
278 0.78
279 0.77
280 0.79
281 0.8
282 0.79
283 0.75
284 0.72
285 0.65
286 0.6
287 0.57
288 0.49
289 0.42
290 0.37
291 0.39
292 0.38
293 0.4
294 0.43
295 0.41
296 0.39
297 0.41
298 0.45
299 0.49
300 0.51
301 0.54
302 0.57
303 0.64
304 0.7
305 0.75
306 0.76
307 0.7
308 0.66
309 0.65
310 0.65
311 0.6
312 0.58
313 0.52
314 0.46
315 0.42
316 0.39
317 0.32
318 0.24
319 0.21
320 0.16
321 0.14
322 0.15
323 0.13
324 0.12
325 0.11
326 0.12
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.15
331 0.19
332 0.19
333 0.21
334 0.22
335 0.23
336 0.24
337 0.24
338 0.22
339 0.19
340 0.17
341 0.15
342 0.12
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.12
350 0.14
351 0.15
352 0.14
353 0.12
354 0.19