Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8BQ13

Protein Details
Accession G8BQ13    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
478-507NRGIGRDSSRGPNRNKRPRANPRPARFSHNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
470-503NRGLNRNINRGIGRDSSRGPNRNKRPRANPRPAR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12, mito 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR040132  Tex1/THOC3  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
KEGG tpf:TPHA_0B04250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSLSKPPVRGERNTSVKKPVVPDTTNNELATSIYKQATMDKKLSEKLTRTITDELLNKKNVEHITDDRRLLILSRAKSRFVVGISPNEVYAIEFQPTGKALAYSRYDGSLTVWFLVHDTFNRSFKAYKKDAMGVEKPITSISWNSNEVGQFATVSNSNYIQIWNVDHNTHSLTKYRTLNLDSSDAKLRFTKCHYDPSSQWLAAVTKNNEICLFDVKANHKQVHFYNFNEEVEGSITFICWNNHGNYIIVGTSIGEISLLRVNNNKELKNIIKVPAHRGKITGLKVTPLGDKLVSVGEDGACLIWDLESLTCISTIVECESNIRTFDLSPSGKLLVVVSEEGKFRFYDMITTEKINDYDQKHLDSDFIVKFYPNKSWLMISGENDTLCRLYSEKGHSDELSFWKSFHPEVFPENEKARTYNDLNAKKSKHDWNSEQALLRGSNRDSNRDSSRAPNRGASRESSRGPDRESNRGLNRNINRGIGRDSSRGPNRNKRPRANPRPARFSHN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.69
3 0.68
4 0.66
5 0.62
6 0.61
7 0.59
8 0.54
9 0.57
10 0.56
11 0.58
12 0.58
13 0.52
14 0.44
15 0.35
16 0.32
17 0.29
18 0.24
19 0.21
20 0.18
21 0.19
22 0.19
23 0.27
24 0.33
25 0.35
26 0.37
27 0.37
28 0.41
29 0.46
30 0.52
31 0.52
32 0.48
33 0.49
34 0.53
35 0.51
36 0.51
37 0.48
38 0.44
39 0.42
40 0.44
41 0.44
42 0.42
43 0.43
44 0.39
45 0.36
46 0.41
47 0.37
48 0.34
49 0.33
50 0.34
51 0.4
52 0.45
53 0.46
54 0.4
55 0.38
56 0.36
57 0.31
58 0.31
59 0.29
60 0.28
61 0.37
62 0.38
63 0.39
64 0.4
65 0.4
66 0.36
67 0.3
68 0.32
69 0.26
70 0.3
71 0.31
72 0.31
73 0.29
74 0.26
75 0.25
76 0.19
77 0.18
78 0.14
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.17
89 0.2
90 0.21
91 0.21
92 0.21
93 0.21
94 0.2
95 0.21
96 0.18
97 0.16
98 0.15
99 0.14
100 0.12
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.1
105 0.15
106 0.18
107 0.21
108 0.22
109 0.23
110 0.26
111 0.31
112 0.38
113 0.36
114 0.37
115 0.39
116 0.43
117 0.45
118 0.48
119 0.45
120 0.41
121 0.39
122 0.35
123 0.31
124 0.26
125 0.23
126 0.17
127 0.17
128 0.16
129 0.18
130 0.19
131 0.19
132 0.21
133 0.21
134 0.2
135 0.18
136 0.14
137 0.11
138 0.1
139 0.11
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.15
155 0.17
156 0.18
157 0.17
158 0.18
159 0.19
160 0.25
161 0.28
162 0.29
163 0.29
164 0.3
165 0.31
166 0.29
167 0.31
168 0.26
169 0.25
170 0.3
171 0.27
172 0.25
173 0.27
174 0.27
175 0.26
176 0.29
177 0.35
178 0.3
179 0.4
180 0.42
181 0.43
182 0.43
183 0.46
184 0.47
185 0.39
186 0.36
187 0.28
188 0.25
189 0.23
190 0.27
191 0.22
192 0.21
193 0.21
194 0.22
195 0.21
196 0.2
197 0.18
198 0.16
199 0.16
200 0.13
201 0.17
202 0.2
203 0.27
204 0.31
205 0.32
206 0.29
207 0.31
208 0.32
209 0.36
210 0.35
211 0.29
212 0.3
213 0.3
214 0.3
215 0.27
216 0.24
217 0.16
218 0.14
219 0.13
220 0.08
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.11
248 0.12
249 0.19
250 0.23
251 0.23
252 0.21
253 0.25
254 0.26
255 0.27
256 0.28
257 0.26
258 0.26
259 0.27
260 0.34
261 0.37
262 0.38
263 0.34
264 0.32
265 0.31
266 0.33
267 0.34
268 0.3
269 0.23
270 0.22
271 0.23
272 0.23
273 0.21
274 0.16
275 0.15
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.09
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.11
312 0.12
313 0.17
314 0.16
315 0.15
316 0.16
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.08
325 0.09
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.11
332 0.1
333 0.12
334 0.13
335 0.17
336 0.17
337 0.18
338 0.19
339 0.19
340 0.19
341 0.18
342 0.22
343 0.2
344 0.26
345 0.27
346 0.28
347 0.27
348 0.26
349 0.26
350 0.2
351 0.23
352 0.17
353 0.16
354 0.15
355 0.14
356 0.17
357 0.18
358 0.22
359 0.19
360 0.2
361 0.2
362 0.21
363 0.22
364 0.26
365 0.27
366 0.24
367 0.24
368 0.24
369 0.23
370 0.22
371 0.21
372 0.15
373 0.12
374 0.11
375 0.09
376 0.09
377 0.15
378 0.21
379 0.25
380 0.28
381 0.31
382 0.31
383 0.31
384 0.34
385 0.33
386 0.32
387 0.27
388 0.24
389 0.24
390 0.26
391 0.25
392 0.23
393 0.22
394 0.19
395 0.23
396 0.28
397 0.3
398 0.32
399 0.34
400 0.36
401 0.33
402 0.33
403 0.32
404 0.32
405 0.31
406 0.34
407 0.4
408 0.44
409 0.48
410 0.54
411 0.54
412 0.52
413 0.57
414 0.59
415 0.58
416 0.59
417 0.6
418 0.61
419 0.66
420 0.65
421 0.61
422 0.52
423 0.47
424 0.4
425 0.36
426 0.32
427 0.27
428 0.3
429 0.3
430 0.35
431 0.36
432 0.41
433 0.45
434 0.45
435 0.46
436 0.48
437 0.56
438 0.56
439 0.55
440 0.56
441 0.55
442 0.57
443 0.57
444 0.54
445 0.51
446 0.51
447 0.51
448 0.51
449 0.52
450 0.49
451 0.52
452 0.55
453 0.52
454 0.55
455 0.58
456 0.6
457 0.62
458 0.66
459 0.63
460 0.64
461 0.66
462 0.65
463 0.63
464 0.59
465 0.52
466 0.47
467 0.49
468 0.46
469 0.44
470 0.4
471 0.41
472 0.46
473 0.53
474 0.59
475 0.63
476 0.67
477 0.74
478 0.81
479 0.86
480 0.87
481 0.89
482 0.91
483 0.93
484 0.94
485 0.93
486 0.92
487 0.92