Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X7RDR1

Protein Details
Accession A0A1X7RDR1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-270PSHNDRTAQPSKPKRKRRRTNVPLKLKKHPPSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-266SKPKRKRRRTNVPLKLKKH
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 7, cyto_nucl 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MVRLVTLSRDVSPPPTRRNQIASDESSSKEEDVLQHGEPTLAAIEAGEAHIRDHLSYFLRRLSKVSRPVIDAPRLALSEFSELYRRSEHKNGRHFVVHQHDHPISGVHYDLRLQFSSTSTISFAIPYGLPGNPNSMRPNRMAIETRVHNLWNNLIESASYATGSLLIWDTGEYEILPRYNKKAQKMTDDEESSQDDVEMHGMRTQSELLVEAFQSRHIRLRLHGTRLPPGYTVALRLPSHNDRTAQPSKPKRKRRRTNVPLKLKKHPPSDSESESSDKTSVPNIDQDEAKDVAAASDGEEDTAIRVNNAYPGAFNTIGSIHQRYWFLALDRPNSGFVKAHTGRWVGDWDAFYVYGRDHERSLITARLAEDVMADDGIDAFVGRKMWRPIVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.54
3 0.57
4 0.6
5 0.65
6 0.63
7 0.62
8 0.63
9 0.59
10 0.56
11 0.53
12 0.5
13 0.46
14 0.41
15 0.33
16 0.26
17 0.23
18 0.2
19 0.22
20 0.23
21 0.21
22 0.21
23 0.21
24 0.21
25 0.18
26 0.17
27 0.12
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.07
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.13
42 0.16
43 0.19
44 0.21
45 0.26
46 0.29
47 0.3
48 0.33
49 0.36
50 0.41
51 0.47
52 0.52
53 0.49
54 0.5
55 0.57
56 0.6
57 0.58
58 0.5
59 0.43
60 0.39
61 0.36
62 0.31
63 0.24
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.15
68 0.17
69 0.17
70 0.2
71 0.25
72 0.26
73 0.29
74 0.38
75 0.45
76 0.5
77 0.59
78 0.6
79 0.59
80 0.6
81 0.56
82 0.54
83 0.55
84 0.51
85 0.43
86 0.46
87 0.42
88 0.38
89 0.37
90 0.3
91 0.2
92 0.17
93 0.16
94 0.1
95 0.1
96 0.11
97 0.13
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.18
104 0.17
105 0.15
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.11
111 0.09
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.16
119 0.15
120 0.18
121 0.23
122 0.25
123 0.27
124 0.27
125 0.31
126 0.27
127 0.29
128 0.3
129 0.27
130 0.3
131 0.29
132 0.3
133 0.27
134 0.26
135 0.24
136 0.21
137 0.21
138 0.17
139 0.15
140 0.13
141 0.12
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.08
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.09
164 0.09
165 0.14
166 0.21
167 0.25
168 0.29
169 0.36
170 0.38
171 0.45
172 0.49
173 0.47
174 0.47
175 0.45
176 0.4
177 0.34
178 0.33
179 0.25
180 0.2
181 0.16
182 0.1
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.06
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.15
204 0.17
205 0.18
206 0.18
207 0.28
208 0.31
209 0.35
210 0.38
211 0.35
212 0.39
213 0.4
214 0.39
215 0.29
216 0.26
217 0.21
218 0.18
219 0.18
220 0.14
221 0.17
222 0.16
223 0.17
224 0.21
225 0.24
226 0.28
227 0.28
228 0.29
229 0.25
230 0.33
231 0.39
232 0.39
233 0.44
234 0.5
235 0.59
236 0.68
237 0.77
238 0.8
239 0.86
240 0.91
241 0.92
242 0.94
243 0.93
244 0.95
245 0.94
246 0.94
247 0.93
248 0.87
249 0.86
250 0.83
251 0.8
252 0.77
253 0.71
254 0.64
255 0.61
256 0.62
257 0.58
258 0.51
259 0.46
260 0.4
261 0.36
262 0.33
263 0.27
264 0.21
265 0.16
266 0.18
267 0.17
268 0.16
269 0.2
270 0.21
271 0.22
272 0.22
273 0.22
274 0.23
275 0.21
276 0.2
277 0.15
278 0.13
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.06
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.1
290 0.09
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.12
299 0.17
300 0.17
301 0.16
302 0.14
303 0.14
304 0.16
305 0.19
306 0.2
307 0.16
308 0.19
309 0.21
310 0.2
311 0.23
312 0.23
313 0.21
314 0.24
315 0.28
316 0.28
317 0.3
318 0.31
319 0.32
320 0.3
321 0.3
322 0.27
323 0.22
324 0.29
325 0.28
326 0.3
327 0.31
328 0.32
329 0.31
330 0.31
331 0.33
332 0.24
333 0.26
334 0.24
335 0.2
336 0.2
337 0.2
338 0.18
339 0.16
340 0.14
341 0.17
342 0.19
343 0.2
344 0.19
345 0.21
346 0.22
347 0.24
348 0.27
349 0.25
350 0.23
351 0.24
352 0.23
353 0.23
354 0.22
355 0.19
356 0.16
357 0.14
358 0.14
359 0.11
360 0.1
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.07
368 0.09
369 0.1
370 0.17
371 0.22