Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8ZV38

Protein Details
Accession G8ZV38    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-148RFLPKPKVAGPPKPKKKKPSGRGGAPGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-25GRGGFGGRGGRGGARG
124-207PKPKVAGPPKPKKKKPSGRGGAPGGRGGRGGFSRGGSRGGFGGGRGGGFSRGGSRGGFGGGRGGSRGGFGGSRGGFRGGRGGRR
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 11.166, cyto_nucl 7.333, cyto 6.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG tdl:TDEL_0E02390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MSFRGSSRGGRGGFGGRGGRGGARGGARMPQGPPDTVLEMGSFMQPCEGDIVCRSINTKIPYFNAPIYLENKSQIGKVDEILGPLNEVFFTIKCSEGVQATSFKDGDKFYIAPDKLLPIERFLPKPKVAGPPKPKKKKPSGRGGAPGGRGGRGGFSRGGSRGGFGGGRGGGFSRGGSRGGFGGGRGGSRGGFGGSRGGFRGGRGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.28
3 0.21
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.16
8 0.16
9 0.16
10 0.14
11 0.16
12 0.15
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.21
17 0.24
18 0.25
19 0.25
20 0.26
21 0.25
22 0.25
23 0.23
24 0.22
25 0.15
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.11
30 0.09
31 0.1
32 0.09
33 0.09
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.1
38 0.14
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.2
44 0.23
45 0.24
46 0.23
47 0.25
48 0.28
49 0.29
50 0.27
51 0.25
52 0.23
53 0.24
54 0.24
55 0.25
56 0.23
57 0.21
58 0.21
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.12
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.17
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.19
104 0.18
105 0.14
106 0.18
107 0.2
108 0.23
109 0.26
110 0.3
111 0.27
112 0.28
113 0.3
114 0.35
115 0.38
116 0.45
117 0.51
118 0.58
119 0.68
120 0.77
121 0.8
122 0.8
123 0.86
124 0.87
125 0.85
126 0.86
127 0.84
128 0.81
129 0.81
130 0.77
131 0.71
132 0.61
133 0.56
134 0.45
135 0.36
136 0.29
137 0.22
138 0.18
139 0.14
140 0.15
141 0.13
142 0.13
143 0.16
144 0.16
145 0.19
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.11
152 0.13
153 0.1
154 0.1
155 0.09
156 0.1
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.13
168 0.1
169 0.13
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.21
185 0.2
186 0.2
187 0.29