Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8ZSH0

Protein Details
Accession G8ZSH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-295SKESEGKSRKRKVKAAGETRLKRRNIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-293GKSRKRKVKAAGETRLKRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG tdl:TDEL_0C05730  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MGDLVAASLIAEDDEFARETILKTAKYVAENGASFEKKLRDDPRFSFVNPGNSHYELYERMLVDEQRSGTKNNEAFLQDKDTKPQEPYPFSFMSYAKKLTKRDLEIIKLSAAYCVVNEDIDYMEKMRNQFKEDELFGFLSPDHALNSTFIHFMNQYRKVKSGELGPPFFELRNEDFKYKILHRSFERAEFNEYSKELKNEKQRAMHMQKVQFAAFDWTQFKVVDKFIPLSSDDTDVPKPLDFNQLAVKRLGSAGGLDMFDKVHEQQQTSSKESEGKSRKRKVKAAGETRLKRRNIGSSMRNTSDIKYIECPISHKMVPEDKFDKHLQILLTDPHYKLEREKYEAKHKLSNLSSTEVFENVKRIARIASEKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.08
3 0.08
4 0.09
5 0.1
6 0.12
7 0.18
8 0.22
9 0.21
10 0.21
11 0.27
12 0.3
13 0.3
14 0.32
15 0.28
16 0.29
17 0.29
18 0.3
19 0.32
20 0.29
21 0.28
22 0.31
23 0.32
24 0.28
25 0.37
26 0.42
27 0.43
28 0.5
29 0.53
30 0.54
31 0.53
32 0.51
33 0.52
34 0.48
35 0.49
36 0.44
37 0.44
38 0.43
39 0.41
40 0.41
41 0.33
42 0.31
43 0.23
44 0.25
45 0.25
46 0.2
47 0.2
48 0.22
49 0.23
50 0.22
51 0.24
52 0.22
53 0.23
54 0.24
55 0.25
56 0.24
57 0.31
58 0.3
59 0.28
60 0.31
61 0.28
62 0.28
63 0.28
64 0.33
65 0.3
66 0.3
67 0.35
68 0.34
69 0.35
70 0.37
71 0.42
72 0.42
73 0.43
74 0.45
75 0.45
76 0.42
77 0.41
78 0.4
79 0.35
80 0.33
81 0.31
82 0.33
83 0.33
84 0.38
85 0.39
86 0.44
87 0.5
88 0.48
89 0.53
90 0.53
91 0.51
92 0.49
93 0.47
94 0.4
95 0.33
96 0.29
97 0.21
98 0.16
99 0.11
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.11
112 0.14
113 0.19
114 0.21
115 0.23
116 0.25
117 0.26
118 0.28
119 0.28
120 0.27
121 0.23
122 0.22
123 0.19
124 0.17
125 0.15
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.13
140 0.2
141 0.27
142 0.3
143 0.31
144 0.34
145 0.35
146 0.35
147 0.33
148 0.33
149 0.32
150 0.33
151 0.32
152 0.3
153 0.29
154 0.29
155 0.27
156 0.21
157 0.17
158 0.15
159 0.22
160 0.23
161 0.22
162 0.22
163 0.23
164 0.27
165 0.26
166 0.31
167 0.25
168 0.28
169 0.29
170 0.35
171 0.35
172 0.37
173 0.37
174 0.3
175 0.33
176 0.3
177 0.29
178 0.25
179 0.24
180 0.21
181 0.19
182 0.21
183 0.19
184 0.23
185 0.32
186 0.36
187 0.4
188 0.41
189 0.43
190 0.5
191 0.53
192 0.54
193 0.51
194 0.47
195 0.47
196 0.44
197 0.41
198 0.31
199 0.26
200 0.24
201 0.18
202 0.17
203 0.14
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.15
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.15
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.15
220 0.16
221 0.17
222 0.16
223 0.16
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.2
228 0.17
229 0.18
230 0.25
231 0.27
232 0.28
233 0.28
234 0.26
235 0.19
236 0.19
237 0.18
238 0.1
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.11
250 0.13
251 0.14
252 0.18
253 0.26
254 0.31
255 0.33
256 0.33
257 0.3
258 0.33
259 0.33
260 0.4
261 0.41
262 0.47
263 0.54
264 0.63
265 0.7
266 0.73
267 0.79
268 0.79
269 0.8
270 0.8
271 0.8
272 0.8
273 0.82
274 0.82
275 0.83
276 0.82
277 0.72
278 0.65
279 0.59
280 0.58
281 0.54
282 0.55
283 0.54
284 0.54
285 0.6
286 0.59
287 0.58
288 0.51
289 0.46
290 0.45
291 0.38
292 0.32
293 0.28
294 0.29
295 0.28
296 0.27
297 0.29
298 0.25
299 0.3
300 0.28
301 0.27
302 0.3
303 0.36
304 0.37
305 0.42
306 0.43
307 0.39
308 0.44
309 0.44
310 0.41
311 0.35
312 0.36
313 0.28
314 0.25
315 0.26
316 0.25
317 0.28
318 0.28
319 0.27
320 0.28
321 0.29
322 0.29
323 0.33
324 0.39
325 0.4
326 0.43
327 0.51
328 0.54
329 0.63
330 0.7
331 0.69
332 0.67
333 0.64
334 0.66
335 0.61
336 0.61
337 0.53
338 0.5
339 0.46
340 0.4
341 0.39
342 0.32
343 0.3
344 0.25
345 0.26
346 0.23
347 0.27
348 0.25
349 0.25
350 0.25
351 0.29