Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X7S979

Protein Details
Accession A0A1X7S979    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSTDTKTTKKRKSGDDVVPPTKKHydrophilic
48-82APAPLKSALKKKKDTTKKAESKPAKAKKEKKSAAAHydrophilic
273-292TWGKRVGKEEKRRSGKGKKLBasic
352-377EEKNVEEKKGGKKEKRKAKSVDAAAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-79APLKSALKKKKDTTKKAESKPAKAKKEKKS
248-291GAKGGKVRPRNRIEGGILKRGTDRETWGKRVGKEEKRRSGKGKK
349-391KKIEEKNVEEKKGGKKEKRKAKSVDAAAEAAPKKKTKKAKVAA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.666, nucl 11.5, cyto 9.5, mito_nucl 9.499, cyto_mito 8.499, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSTDTKTTKKRKSGDDVVPPTKKVKVATTSTRTTRSADAPAPPPAAEAPAPLKSALKKKKDTTKKAESKPAKAKKEKKSAAAAAAQDIISDDEEAGTALTTAQTDALFAGFTDSEDEEAEDDINADTDAIDVAKLPKAPKPKALTGATTSSDPESIPGVVYISRIPHGFYEPQMAAYFSQFGPISAIRLARNRKTGKSQHFAFIQFESASVADIVARTMDKYLLFGHLLQARTIPLDQVKEGLFSKQGAKGGKVRPRNRIEGGILKRGTDRETWGKRVGKEEKRRSGKGKKLEELGYEFEMPEVKGVESVPVQQQAVEGAVEGAIEGKPAVDPKEVIVDEVEEKKIEEKKIEEKNVEEKKGGKKEKRKAKSVDAAAEAAPKKKTKKAKVAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.83
4 0.83
5 0.79
6 0.72
7 0.65
8 0.59
9 0.52
10 0.44
11 0.42
12 0.41
13 0.45
14 0.53
15 0.57
16 0.6
17 0.62
18 0.64
19 0.58
20 0.53
21 0.5
22 0.44
23 0.43
24 0.4
25 0.41
26 0.4
27 0.43
28 0.41
29 0.36
30 0.34
31 0.28
32 0.27
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.2
37 0.21
38 0.21
39 0.23
40 0.26
41 0.36
42 0.43
43 0.48
44 0.53
45 0.61
46 0.71
47 0.79
48 0.83
49 0.82
50 0.84
51 0.85
52 0.85
53 0.88
54 0.85
55 0.84
56 0.84
57 0.84
58 0.83
59 0.84
60 0.85
61 0.85
62 0.89
63 0.84
64 0.8
65 0.79
66 0.73
67 0.67
68 0.62
69 0.53
70 0.43
71 0.39
72 0.32
73 0.23
74 0.19
75 0.15
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.06
97 0.05
98 0.06
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.04
119 0.05
120 0.07
121 0.09
122 0.11
123 0.14
124 0.23
125 0.26
126 0.33
127 0.37
128 0.4
129 0.45
130 0.46
131 0.45
132 0.4
133 0.41
134 0.34
135 0.29
136 0.26
137 0.19
138 0.17
139 0.14
140 0.11
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.12
155 0.12
156 0.12
157 0.16
158 0.15
159 0.16
160 0.15
161 0.15
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.08
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.1
173 0.12
174 0.11
175 0.17
176 0.22
177 0.23
178 0.31
179 0.33
180 0.35
181 0.42
182 0.49
183 0.51
184 0.53
185 0.51
186 0.47
187 0.47
188 0.46
189 0.39
190 0.31
191 0.24
192 0.17
193 0.16
194 0.12
195 0.09
196 0.08
197 0.06
198 0.06
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.12
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.09
223 0.1
224 0.1
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.15
234 0.19
235 0.18
236 0.2
237 0.26
238 0.33
239 0.39
240 0.47
241 0.5
242 0.56
243 0.6
244 0.64
245 0.59
246 0.56
247 0.52
248 0.51
249 0.5
250 0.48
251 0.43
252 0.38
253 0.36
254 0.34
255 0.32
256 0.24
257 0.25
258 0.27
259 0.32
260 0.36
261 0.42
262 0.46
263 0.46
264 0.53
265 0.58
266 0.58
267 0.64
268 0.69
269 0.72
270 0.75
271 0.79
272 0.8
273 0.8
274 0.79
275 0.78
276 0.76
277 0.7
278 0.68
279 0.65
280 0.59
281 0.53
282 0.47
283 0.4
284 0.32
285 0.26
286 0.21
287 0.19
288 0.16
289 0.13
290 0.11
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.11
295 0.1
296 0.13
297 0.15
298 0.17
299 0.17
300 0.16
301 0.16
302 0.14
303 0.14
304 0.11
305 0.08
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.08
317 0.11
318 0.11
319 0.12
320 0.13
321 0.21
322 0.21
323 0.21
324 0.19
325 0.19
326 0.21
327 0.24
328 0.24
329 0.16
330 0.17
331 0.22
332 0.27
333 0.27
334 0.28
335 0.3
336 0.38
337 0.48
338 0.55
339 0.52
340 0.51
341 0.59
342 0.64
343 0.62
344 0.55
345 0.52
346 0.55
347 0.62
348 0.68
349 0.67
350 0.69
351 0.76
352 0.84
353 0.87
354 0.87
355 0.84
356 0.84
357 0.84
358 0.82
359 0.78
360 0.71
361 0.63
362 0.55
363 0.54
364 0.46
365 0.4
366 0.38
367 0.37
368 0.39
369 0.45
370 0.55
371 0.58