Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X7RCN3

Protein Details
Accession A0A1X7RCN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-320LEEQPSHPKNKKRRGASNKSTNTIHydrophilic
382-404LCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGVMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-310KNKKRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004855  TFIIA_asu/bsu  
IPR009088  TFIIA_b-brl  
Gene Ontology GO:0005672  C:transcription factor TFIIA complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03153  TFIIA  
CDD cd07976  TFIIA_alpha_beta_like  
Amino Acid Sequences MTNALVGDVYEKIINDVVQTSTTDFEESGVSSATLQELQQEWQAKLSQRGVAQMPWDPKPQPPPVPQQQPVNQQPLPPSNNGVSQQSYQQYGGHPAHPSNGGSRIKAEPGTEQQYNGLPNGGYPPNPADTQGGLARAQHLVQQQYGNAASASLNAMQQRGGLALPGQPKPPQGLQLPAGTPQAAQQQFQQQQQAAMARQQQQLHQQQAQPRIKVEGDGSGQQQNNYNHQQQQQQQQQQPRPSYGQTDGADDALEEWRAQLAARRAVSAEQTQEADRMMHEYVMRVSDNLENGLMVTLEEQPSHPKNKKRRGASNKSTNTITPSSSTAIPSIPQLDGAEDEENKLDIKDEDDADAINSDLDDSDEDAGGPMGDDDDDLGDSILCTYDKVQRVKNKWKCTLKDGVMSVGGKEWVFHKGMGEFEW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.1
18 0.09
19 0.1
20 0.1
21 0.1
22 0.09
23 0.12
24 0.13
25 0.14
26 0.19
27 0.23
28 0.22
29 0.24
30 0.29
31 0.28
32 0.34
33 0.35
34 0.34
35 0.32
36 0.36
37 0.35
38 0.33
39 0.32
40 0.32
41 0.33
42 0.32
43 0.36
44 0.33
45 0.36
46 0.42
47 0.47
48 0.49
49 0.51
50 0.57
51 0.62
52 0.7
53 0.7
54 0.71
55 0.71
56 0.72
57 0.72
58 0.7
59 0.61
60 0.54
61 0.55
62 0.54
63 0.5
64 0.42
65 0.39
66 0.33
67 0.37
68 0.36
69 0.33
70 0.29
71 0.26
72 0.3
73 0.28
74 0.29
75 0.25
76 0.25
77 0.23
78 0.27
79 0.28
80 0.26
81 0.26
82 0.24
83 0.26
84 0.26
85 0.26
86 0.21
87 0.27
88 0.26
89 0.24
90 0.27
91 0.26
92 0.27
93 0.27
94 0.26
95 0.22
96 0.26
97 0.31
98 0.28
99 0.27
100 0.26
101 0.27
102 0.27
103 0.23
104 0.18
105 0.12
106 0.12
107 0.16
108 0.16
109 0.13
110 0.14
111 0.16
112 0.17
113 0.18
114 0.19
115 0.15
116 0.14
117 0.17
118 0.16
119 0.16
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.17
129 0.17
130 0.16
131 0.18
132 0.18
133 0.14
134 0.11
135 0.1
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.05
149 0.05
150 0.09
151 0.13
152 0.14
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.2
157 0.2
158 0.21
159 0.19
160 0.21
161 0.21
162 0.23
163 0.23
164 0.21
165 0.21
166 0.16
167 0.15
168 0.13
169 0.19
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.25
174 0.29
175 0.31
176 0.32
177 0.24
178 0.24
179 0.26
180 0.26
181 0.18
182 0.17
183 0.2
184 0.23
185 0.26
186 0.26
187 0.27
188 0.33
189 0.38
190 0.38
191 0.37
192 0.34
193 0.36
194 0.45
195 0.47
196 0.39
197 0.34
198 0.33
199 0.29
200 0.27
201 0.23
202 0.16
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.24
210 0.22
211 0.27
212 0.29
213 0.31
214 0.3
215 0.34
216 0.39
217 0.38
218 0.46
219 0.49
220 0.52
221 0.54
222 0.58
223 0.61
224 0.61
225 0.58
226 0.51
227 0.46
228 0.39
229 0.38
230 0.32
231 0.32
232 0.26
233 0.27
234 0.24
235 0.21
236 0.2
237 0.16
238 0.15
239 0.09
240 0.08
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.09
247 0.12
248 0.17
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.19
253 0.22
254 0.2
255 0.17
256 0.14
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.14
261 0.12
262 0.1
263 0.11
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.13
275 0.12
276 0.11
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.05
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.08
286 0.08
287 0.15
288 0.19
289 0.27
290 0.33
291 0.4
292 0.5
293 0.6
294 0.68
295 0.71
296 0.79
297 0.81
298 0.86
299 0.88
300 0.88
301 0.84
302 0.79
303 0.71
304 0.61
305 0.55
306 0.46
307 0.37
308 0.28
309 0.24
310 0.23
311 0.22
312 0.22
313 0.18
314 0.16
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.15
325 0.13
326 0.14
327 0.13
328 0.14
329 0.13
330 0.12
331 0.11
332 0.09
333 0.1
334 0.13
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.13
340 0.13
341 0.11
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.06
370 0.07
371 0.09
372 0.17
373 0.24
374 0.3
375 0.38
376 0.46
377 0.56
378 0.67
379 0.74
380 0.77
381 0.8
382 0.85
383 0.82
384 0.79
385 0.8
386 0.74
387 0.72
388 0.64
389 0.57
390 0.52
391 0.47
392 0.4
393 0.32
394 0.28
395 0.2
396 0.19
397 0.17
398 0.17
399 0.18
400 0.18
401 0.19
402 0.19