FuNGI

A0A1X7RJU4

Protein Details

Accession

A0A1X7RJU4

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
195-216	GEASKPVKKKAQKKVEEGRDNT	Hydrophilic
420-446	ERDEMVKHKRLRKQLRKKEHQNQYDSD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
39-54	GRKKVVRKAPAPAQKP
199-208	KPVKKKAQKK
426-437	KHKRLRKQLRKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13, mito 3, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPAQAPSGPSSATPSAGGPPAAARRTKPAVSIFNTGRKKVVRKAPAPAQKPGGQKSGANGTAQQNAQAHGDRAASTSHQHGGNADENGTYDEYEITIQRSSLDKGIRYHALKLHSRTDAAGKPFPVSPYDESQFVRPMRLHRRYARDKMEVADLSDANSGADDKEREQMTARRAERQAEREENQKLIAPTGGEASKPVKKKAQKKVEEGRDNTDPVRMKRQQLRYEEARPWHLEDFEGKNVWVGSYEQALSENSIMLVLAEGGFQMVPVEKWYKFIQTNKVNAMDSEEVEKHMAKKFNMPRWALGTQLANEVARKEARSQMIQAHRAKSREADDDVPKREMDDGDFQADKDMLDLDVQDEFQDDDEGMLFQGEDGEDGDDIAKRIYLEMRDAGLGGTGVKKEDVDPVEEERRREMAERDEMVKHKRLRKQLRKKEHQNQYDSDDSNADPYASSSESVDSDEEREKAEEDAKREEEAKKAAALLAGEKSGASSRGTNTPSGRPEKRDISRLSSKRPGSSDASDLSGNESSRKRAKGINGHAVSKLAPGGGRALSPDAAKHRLARSGNASGSDTDTSRAPRPKVKLHNSPPGSPTRGTPNGSRAVSPARSPASAAAAEKKNFPTLEDVRSAIPAEGIEIKALVSLFKARLGKRGAEFITLVKAAGTQDKASGRIMRKGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.23
3	0.22
4	0.2
5	0.21
6	0.22
7	0.22
8	0.16
9	0.2
10	0.25
11	0.29
12	0.31
13	0.29
14	0.35
15	0.42
16	0.43
17	0.43
18	0.43
19	0.47
20	0.49
21	0.55
22	0.53
23	0.56
24	0.6
25	0.56
26	0.55
27	0.53
28	0.55
29	0.56
30	0.6
31	0.61
32	0.61
33	0.69
34	0.73
35	0.76
36	0.74
37	0.71
38	0.68
39	0.64
40	0.66
41	0.62
42	0.57
43	0.49
44	0.46
45	0.44
46	0.46
47	0.42
48	0.35
49	0.35
50	0.33
51	0.37
52	0.36
53	0.36
54	0.28
55	0.28
56	0.3
57	0.28
58	0.25
59	0.21
60	0.22
61	0.19
62	0.18
63	0.18
64	0.17
65	0.17
66	0.19
67	0.21
68	0.21
69	0.21
70	0.21
71	0.24
72	0.27
73	0.26
74	0.23
75	0.18
76	0.18
77	0.2
78	0.2
79	0.15
80	0.11
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.11
86	0.11
87	0.11
88	0.12
89	0.15
90	0.16
91	0.2
92	0.23
93	0.25
94	0.27
95	0.33
96	0.38
97	0.37
98	0.4
99	0.39
100	0.42
101	0.45
102	0.47
103	0.47
104	0.43
105	0.42
106	0.39
107	0.41
108	0.39
109	0.38
110	0.37
111	0.32
112	0.32
113	0.33
114	0.33
115	0.28
116	0.27
117	0.25
118	0.28
119	0.29
120	0.3
121	0.29
122	0.31
123	0.35
124	0.31
125	0.31
126	0.27
127	0.34
128	0.41
129	0.48
130	0.54
131	0.55
132	0.65
133	0.71
134	0.77
135	0.77
136	0.72
137	0.65
138	0.59
139	0.58
140	0.49
141	0.41
142	0.35
143	0.27
144	0.23
145	0.21
146	0.19
147	0.12
148	0.11
149	0.1
150	0.07
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.17
155	0.17
156	0.18
157	0.21
158	0.26
159	0.29
160	0.37
161	0.37
162	0.38
163	0.4
164	0.45
165	0.48
166	0.49
167	0.51
168	0.49
169	0.5
170	0.49
171	0.5
172	0.45
173	0.39
174	0.37
175	0.29
176	0.23
177	0.21
178	0.15
179	0.13
180	0.15
181	0.14
182	0.1
183	0.12
184	0.15
185	0.2
186	0.23
187	0.26
188	0.31
189	0.39
190	0.49
191	0.58
192	0.65
193	0.67
194	0.74
195	0.81
196	0.83
197	0.84
198	0.77
199	0.71
200	0.64
201	0.58
202	0.49
203	0.44
204	0.38
205	0.32
206	0.39
207	0.37
208	0.41
209	0.48
210	0.57
211	0.59
212	0.6
213	0.64
214	0.61
215	0.62
216	0.6
217	0.55
218	0.5
219	0.44
220	0.42
221	0.36
222	0.3
223	0.25
224	0.24
225	0.25
226	0.23
227	0.22
228	0.18
229	0.18
230	0.17
231	0.17
232	0.13
233	0.1
234	0.08
235	0.09
236	0.09
237	0.08
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.08
243	0.06
244	0.06
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.06
259	0.09
260	0.09
261	0.12
262	0.13
263	0.18
264	0.22
265	0.27
266	0.34
267	0.37
268	0.41
269	0.42
270	0.43
271	0.39
272	0.35
273	0.34
274	0.26
275	0.2
276	0.19
277	0.16
278	0.14
279	0.15
280	0.15
281	0.13
282	0.17
283	0.2
284	0.17
285	0.26
286	0.33
287	0.39
288	0.45
289	0.44
290	0.41
291	0.43
292	0.43
293	0.35
294	0.3
295	0.24
296	0.18
297	0.18
298	0.17
299	0.11
300	0.11
301	0.11
302	0.1
303	0.1
304	0.1
305	0.11
306	0.15
307	0.17
308	0.18
309	0.19
310	0.24
311	0.29
312	0.36
313	0.37
314	0.37
315	0.37
316	0.37
317	0.36
318	0.32
319	0.29
320	0.25
321	0.24
322	0.25
323	0.28
324	0.33
325	0.35
326	0.33
327	0.3
328	0.27
329	0.25
330	0.21
331	0.17
332	0.16
333	0.14
334	0.16
335	0.16
336	0.16
337	0.15
338	0.15
339	0.12
340	0.08
341	0.07
342	0.05
343	0.04
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.1
379	0.11
380	0.1
381	0.1
382	0.09
383	0.08
384	0.07
385	0.06
386	0.06
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.11
393	0.12
394	0.13
395	0.15
396	0.19
397	0.27
398	0.29
399	0.29
400	0.26
401	0.27
402	0.25
403	0.25
404	0.24
405	0.21
406	0.26
407	0.27
408	0.28
409	0.3
410	0.33
411	0.35
412	0.39
413	0.4
414	0.42
415	0.46
416	0.54
417	0.62
418	0.7
419	0.77
420	0.81
421	0.86
422	0.89
423	0.93
424	0.93
425	0.92
426	0.89
427	0.83
428	0.75
429	0.69
430	0.64
431	0.54
432	0.44
433	0.35
434	0.27
435	0.23
436	0.2
437	0.14
438	0.09
439	0.08
440	0.1
441	0.09
442	0.09
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.1
447	0.11
448	0.09
449	0.11
450	0.13
451	0.13
452	0.13
453	0.14
454	0.13
455	0.14
456	0.19
457	0.2
458	0.21
459	0.26
460	0.26
461	0.27
462	0.29
463	0.3
464	0.28
465	0.28
466	0.25
467	0.2
468	0.19
469	0.18
470	0.16
471	0.15
472	0.13
473	0.11
474	0.1
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.09
481	0.1
482	0.12
483	0.19
484	0.21
485	0.24
486	0.26
487	0.31
488	0.36
489	0.43
490	0.45
491	0.43
492	0.48
493	0.53
494	0.55
495	0.57
496	0.54
497	0.54
498	0.6
499	0.6
500	0.62
501	0.61
502	0.6
503	0.56
504	0.55
505	0.52
506	0.47
507	0.45
508	0.41
509	0.33
510	0.33
511	0.28
512	0.26
513	0.24
514	0.21
515	0.19
516	0.2
517	0.21
518	0.24
519	0.3
520	0.32
521	0.31
522	0.34
523	0.42
524	0.47
525	0.54
526	0.59
527	0.56
528	0.56
529	0.54
530	0.49
531	0.41
532	0.32
533	0.24
534	0.14
535	0.11
536	0.09
537	0.11
538	0.11
539	0.11
540	0.11
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.16
545	0.19
546	0.22
547	0.24
548	0.27
549	0.28
550	0.34
551	0.35
552	0.37
553	0.38
554	0.41
555	0.4
556	0.38
557	0.37
558	0.3
559	0.32
560	0.28
561	0.22
562	0.17
563	0.19
564	0.2
565	0.26
566	0.32
567	0.33
568	0.39
569	0.45
570	0.54
571	0.62
572	0.68
573	0.72
574	0.73
575	0.8
576	0.77
577	0.74
578	0.69
579	0.66
580	0.61
581	0.51
582	0.45
583	0.43
584	0.45
585	0.44
586	0.43
587	0.42
588	0.46
589	0.46
590	0.44
591	0.38
592	0.39
593	0.38
594	0.36
595	0.36
596	0.31
597	0.3
598	0.3
599	0.29
600	0.26
601	0.26
602	0.26
603	0.28
604	0.32
605	0.33
606	0.36
607	0.37
608	0.38
609	0.36
610	0.35
611	0.36
612	0.33
613	0.37
614	0.36
615	0.35
616	0.3
617	0.32
618	0.31
619	0.23
620	0.19
621	0.13
622	0.13
623	0.15
624	0.14
625	0.13
626	0.12
627	0.11
628	0.12
629	0.12
630	0.1
631	0.08
632	0.12
633	0.13
634	0.19
635	0.26
636	0.25
637	0.33
638	0.37
639	0.42
640	0.4
641	0.48
642	0.43
643	0.4
644	0.4
645	0.34
646	0.35
647	0.29
648	0.26
649	0.18
650	0.18
651	0.16
652	0.21
653	0.22
654	0.17
655	0.23
656	0.25
657	0.27
658	0.3
659	0.36
660	0.35

A0A1X7RJU4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer