Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A225ALI6

Protein Details
Accession A0A225ALI6    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-120DAENLKLIGRHKRKRREDEEGGTRKRKEGRREKKKRQQRDSDAESAEBasic
157-178MDAAMKQKTRRRRKADGIDLEQHydrophilic
396-415EDRFRRMKARQLNAGKPSRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-133GRHKRKRREDEEGGTRKRKEGRREKKKRQQRDSDAESAEGKQGRRRTAKSRR
149-170RRRALDRAMDAAMKQKTRRRRK
401-415RMKARQLNAGKPSRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEPQAELPATDRDEVRAELDDLNDNGDTGINLDLGLSDDESVLSEVDEAQFEDFNPDDVDIEDRPALDVDAENLKLIGRHKRKRREDEEGGTRKRKEGRREKKKRQQRDSDAESAEGKQGRRRTAKSRREATPEDDETLSPEERRRRALDRAMDAAMKQKTRRRRKADGIDLEQMADQEIEDMRRRMTDAARIDAEARRQGQPAMHKLKMLPEVLNLLNRNQYTASLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGELPAYNIQRDLMDVLGKLPINKDSLVASGIGKVIVFYTKSKRPELKIKRQAERLLADWTRPILQRSDDYSKRVYEEVDFDPTRLVNRANIAQQTAEEARARELLPPRLANRARREMGHTSYSIVPRSTVVQDNKFARPVGASGEDRFRRMKARQLNAGKPSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.24
4 0.26
5 0.24
6 0.24
7 0.21
8 0.21
9 0.2
10 0.21
11 0.23
12 0.2
13 0.21
14 0.19
15 0.16
16 0.15
17 0.13
18 0.11
19 0.08
20 0.09
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.06
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.08
32 0.09
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.14
51 0.11
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.14
67 0.17
68 0.26
69 0.32
70 0.42
71 0.52
72 0.63
73 0.73
74 0.82
75 0.86
76 0.86
77 0.84
78 0.84
79 0.85
80 0.84
81 0.81
82 0.78
83 0.71
84 0.66
85 0.65
86 0.63
87 0.63
88 0.64
89 0.68
90 0.73
91 0.83
92 0.89
93 0.91
94 0.95
95 0.95
96 0.94
97 0.94
98 0.92
99 0.91
100 0.87
101 0.83
102 0.73
103 0.64
104 0.55
105 0.44
106 0.38
107 0.32
108 0.25
109 0.23
110 0.27
111 0.33
112 0.39
113 0.43
114 0.5
115 0.58
116 0.67
117 0.71
118 0.74
119 0.72
120 0.73
121 0.71
122 0.66
123 0.64
124 0.56
125 0.49
126 0.42
127 0.36
128 0.3
129 0.29
130 0.24
131 0.17
132 0.2
133 0.24
134 0.26
135 0.3
136 0.32
137 0.34
138 0.4
139 0.46
140 0.48
141 0.44
142 0.45
143 0.42
144 0.38
145 0.34
146 0.33
147 0.29
148 0.25
149 0.25
150 0.28
151 0.38
152 0.48
153 0.59
154 0.61
155 0.66
156 0.74
157 0.8
158 0.84
159 0.82
160 0.76
161 0.69
162 0.61
163 0.52
164 0.42
165 0.32
166 0.22
167 0.13
168 0.08
169 0.05
170 0.05
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.12
178 0.13
179 0.18
180 0.18
181 0.2
182 0.2
183 0.2
184 0.21
185 0.21
186 0.21
187 0.18
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.18
193 0.21
194 0.28
195 0.31
196 0.3
197 0.29
198 0.29
199 0.32
200 0.33
201 0.3
202 0.21
203 0.16
204 0.18
205 0.18
206 0.21
207 0.17
208 0.15
209 0.17
210 0.17
211 0.17
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.06
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.07
274 0.08
275 0.1
276 0.17
277 0.23
278 0.27
279 0.34
280 0.39
281 0.44
282 0.54
283 0.61
284 0.66
285 0.7
286 0.75
287 0.76
288 0.78
289 0.76
290 0.71
291 0.63
292 0.53
293 0.51
294 0.43
295 0.36
296 0.31
297 0.28
298 0.26
299 0.25
300 0.24
301 0.19
302 0.21
303 0.24
304 0.3
305 0.37
306 0.37
307 0.39
308 0.4
309 0.39
310 0.39
311 0.35
312 0.3
313 0.23
314 0.25
315 0.24
316 0.29
317 0.27
318 0.25
319 0.26
320 0.25
321 0.24
322 0.21
323 0.2
324 0.14
325 0.18
326 0.22
327 0.25
328 0.27
329 0.26
330 0.24
331 0.23
332 0.26
333 0.23
334 0.22
335 0.2
336 0.18
337 0.19
338 0.21
339 0.22
340 0.22
341 0.27
342 0.31
343 0.35
344 0.39
345 0.39
346 0.46
347 0.52
348 0.54
349 0.57
350 0.6
351 0.57
352 0.55
353 0.6
354 0.56
355 0.56
356 0.53
357 0.44
358 0.38
359 0.41
360 0.42
361 0.38
362 0.31
363 0.27
364 0.23
365 0.26
366 0.27
367 0.3
368 0.34
369 0.36
370 0.43
371 0.47
372 0.5
373 0.49
374 0.45
375 0.38
376 0.32
377 0.28
378 0.26
379 0.28
380 0.26
381 0.27
382 0.37
383 0.38
384 0.39
385 0.41
386 0.38
387 0.4
388 0.41
389 0.48
390 0.48
391 0.55
392 0.62
393 0.69
394 0.75
395 0.77