Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q5QAV8

Protein Details
Accession A0A1Q5QAV8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MPKEKTTRKTKARGEGGRRKKGKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-24KTTRKTKARGEGGRRKKGKS
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01390  HMG-box_NHP6-like  
Amino Acid Sequences MPKEKTTRKTKARGEGGRRKKGKSVFAKSALEESTPWLISPPITDPNAPKRGLSAYMFFANENRERVREENPGIGFGPLGRKLGELWKGLSDSERKPYEDKAAADKKRYEDEKASYMAGEDDEESA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.86
3 0.87
4 0.87
5 0.83
6 0.76
7 0.73
8 0.7
9 0.7
10 0.69
11 0.67
12 0.65
13 0.67
14 0.66
15 0.59
16 0.56
17 0.47
18 0.37
19 0.28
20 0.23
21 0.19
22 0.16
23 0.15
24 0.12
25 0.12
26 0.11
27 0.12
28 0.12
29 0.14
30 0.15
31 0.16
32 0.19
33 0.27
34 0.33
35 0.32
36 0.28
37 0.25
38 0.26
39 0.28
40 0.25
41 0.19
42 0.16
43 0.17
44 0.18
45 0.16
46 0.15
47 0.16
48 0.16
49 0.16
50 0.15
51 0.14
52 0.16
53 0.18
54 0.21
55 0.23
56 0.23
57 0.25
58 0.24
59 0.25
60 0.23
61 0.21
62 0.17
63 0.12
64 0.14
65 0.11
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.16
71 0.2
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.22
78 0.21
79 0.2
80 0.26
81 0.28
82 0.28
83 0.3
84 0.33
85 0.37
86 0.38
87 0.37
88 0.39
89 0.46
90 0.49
91 0.52
92 0.54
93 0.5
94 0.54
95 0.55
96 0.51
97 0.48
98 0.49
99 0.47
100 0.45
101 0.42
102 0.33
103 0.31
104 0.26
105 0.19
106 0.15