Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A225AF62

Protein Details
Accession A0A225AF62    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-317EGGVKWQEREIRRRQKRREAIALDRSWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-308KWQEREIRRRQKRR
Subcellular Location(s) cysk 12, nucl 6, mito 4, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013921  Mediator_Med20  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08612  Med20  
Amino Acid Sequences MPHTGVYFIPSSPSAPHILGPLTERLRSVYGDQAIPIGRWGLEHKLMRDTPSCLPASAHAPNPAPSKARYVQFLSMTNYPKLGFIYASEDDNDGNDPVAQQQTASGMIMSTVPIPSAAEIFRHFVRNCEPIWCHRHTVTVTGTVYDVGDFRVRLGELRQMQPQARVRGTIMEIEWRGPSVITAALSSTFLNSHKAKNDPDNDLAPIADTMDIDAKIEEAAEETPYIPTEAEINTEYTQIAQLIRDFWAHLAITQHIIADTKQQAAIRESILVADVGREVKIKLSQRRSPAEGGVKWQEREIRRRQKRREAIALDRSWGGGSGMSQQQLQEDEEEELEGGVDLARQYMELFRFSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.2
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.21
8 0.26
9 0.25
10 0.26
11 0.25
12 0.25
13 0.26
14 0.27
15 0.27
16 0.26
17 0.26
18 0.26
19 0.26
20 0.26
21 0.25
22 0.23
23 0.21
24 0.15
25 0.11
26 0.12
27 0.15
28 0.17
29 0.23
30 0.27
31 0.28
32 0.35
33 0.36
34 0.39
35 0.39
36 0.38
37 0.35
38 0.37
39 0.36
40 0.29
41 0.28
42 0.27
43 0.3
44 0.29
45 0.28
46 0.27
47 0.28
48 0.32
49 0.35
50 0.36
51 0.32
52 0.3
53 0.35
54 0.35
55 0.36
56 0.36
57 0.37
58 0.39
59 0.39
60 0.41
61 0.38
62 0.38
63 0.39
64 0.35
65 0.32
66 0.28
67 0.25
68 0.22
69 0.19
70 0.13
71 0.1
72 0.16
73 0.16
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.07
84 0.09
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.07
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.11
108 0.13
109 0.19
110 0.18
111 0.19
112 0.23
113 0.24
114 0.24
115 0.26
116 0.27
117 0.28
118 0.34
119 0.35
120 0.33
121 0.31
122 0.35
123 0.3
124 0.33
125 0.28
126 0.27
127 0.24
128 0.21
129 0.21
130 0.17
131 0.16
132 0.12
133 0.1
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.14
143 0.16
144 0.19
145 0.21
146 0.23
147 0.24
148 0.3
149 0.34
150 0.32
151 0.29
152 0.28
153 0.25
154 0.25
155 0.24
156 0.19
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.11
163 0.1
164 0.08
165 0.08
166 0.05
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.11
178 0.12
179 0.15
180 0.17
181 0.2
182 0.23
183 0.29
184 0.32
185 0.32
186 0.33
187 0.32
188 0.29
189 0.26
190 0.24
191 0.17
192 0.13
193 0.09
194 0.07
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.1
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.16
249 0.18
250 0.2
251 0.21
252 0.23
253 0.17
254 0.17
255 0.16
256 0.14
257 0.13
258 0.1
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.08
266 0.11
267 0.17
268 0.24
269 0.33
270 0.41
271 0.46
272 0.54
273 0.6
274 0.61
275 0.58
276 0.57
277 0.56
278 0.48
279 0.49
280 0.5
281 0.48
282 0.44
283 0.45
284 0.45
285 0.44
286 0.51
287 0.56
288 0.58
289 0.65
290 0.75
291 0.82
292 0.86
293 0.9
294 0.9
295 0.89
296 0.86
297 0.84
298 0.83
299 0.75
300 0.66
301 0.56
302 0.48
303 0.37
304 0.3
305 0.2
306 0.11
307 0.1
308 0.14
309 0.17
310 0.17
311 0.18
312 0.18
313 0.19
314 0.2
315 0.21
316 0.16
317 0.15
318 0.16
319 0.15
320 0.15
321 0.13
322 0.11
323 0.1
324 0.08
325 0.07
326 0.05
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.13
334 0.14