Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Q5QC08

Protein Details
Accession A0A1Q5QC08    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-386PDDHQHTAKKRGRGRPRKRKTLDEDEVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-379AKKRGRGRPRKRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.833, cyto_mito 1.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028020  ASX_DEUBAD_dom  
IPR044867  DEUBAD_dom  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13919  ASXH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51916  DEUBAD  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MPPKRKAVSATTNTQVVDAPQTRSRTRSQQLQTPAEPVRDAAHLETSRAMSSTPKQNAARKRGPWGEDYLMTNPKSALVHADLVRLFSNPKAWEYLEEDEKRELISLLPSHIHPNPDPDPEDPDSKIPPLPESFLRYDNNWRAALRNFQYDLESGRYKPDWQRQARRAVQERAEGKFDDYKEREFEQFWGQKQKINHGLIAGESSKVKLETLIQHDVVRVGDVWKYWRKFGKQTVIEKEVKITAIDGAILSFLVPVGQRVFLCSFNEPEKDPTHEGKHAVTDDSQMNNDISPVSHDDEPAALKTHDQPNQDEPSKGSNDADNSDHAPGPQLDVEAEINKEEIQVKEDESTTDQPMAEILPDDHQHTAKKRGRGRPRKRKTLDEDEVPVNTALEATEASVDAETEPSSCPVENGTSLNPDQDAKGGTQKEPTTSMDVDSPGVDKLTQVETENPQSQKTLPLSPTSLEIEVHNIAGPNALTKKILEIDGRIKNPPNGNAWKEFRCYRNNQDMGSLWEVRQAWYVKFQQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.38
3 0.29
4 0.31
5 0.27
6 0.29
7 0.31
8 0.37
9 0.39
10 0.43
11 0.47
12 0.48
13 0.52
14 0.57
15 0.57
16 0.6
17 0.67
18 0.7
19 0.66
20 0.63
21 0.59
22 0.51
23 0.45
24 0.38
25 0.31
26 0.25
27 0.25
28 0.19
29 0.24
30 0.23
31 0.24
32 0.25
33 0.24
34 0.23
35 0.22
36 0.21
37 0.17
38 0.23
39 0.32
40 0.34
41 0.41
42 0.46
43 0.54
44 0.63
45 0.68
46 0.7
47 0.65
48 0.69
49 0.69
50 0.66
51 0.61
52 0.58
53 0.53
54 0.47
55 0.47
56 0.43
57 0.41
58 0.38
59 0.36
60 0.29
61 0.27
62 0.24
63 0.21
64 0.2
65 0.17
66 0.22
67 0.22
68 0.26
69 0.23
70 0.24
71 0.25
72 0.21
73 0.19
74 0.15
75 0.2
76 0.18
77 0.19
78 0.21
79 0.21
80 0.23
81 0.27
82 0.31
83 0.34
84 0.35
85 0.35
86 0.33
87 0.33
88 0.3
89 0.25
90 0.21
91 0.13
92 0.15
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.17
97 0.21
98 0.23
99 0.26
100 0.22
101 0.28
102 0.29
103 0.32
104 0.33
105 0.3
106 0.34
107 0.33
108 0.36
109 0.3
110 0.3
111 0.27
112 0.27
113 0.27
114 0.21
115 0.22
116 0.2
117 0.22
118 0.22
119 0.26
120 0.27
121 0.29
122 0.3
123 0.3
124 0.37
125 0.4
126 0.41
127 0.38
128 0.35
129 0.34
130 0.35
131 0.4
132 0.34
133 0.33
134 0.3
135 0.29
136 0.3
137 0.28
138 0.28
139 0.25
140 0.24
141 0.19
142 0.21
143 0.21
144 0.24
145 0.31
146 0.38
147 0.43
148 0.5
149 0.6
150 0.63
151 0.72
152 0.74
153 0.75
154 0.73
155 0.7
156 0.65
157 0.62
158 0.59
159 0.51
160 0.48
161 0.39
162 0.34
163 0.32
164 0.29
165 0.31
166 0.29
167 0.29
168 0.3
169 0.31
170 0.31
171 0.27
172 0.28
173 0.28
174 0.31
175 0.32
176 0.38
177 0.36
178 0.38
179 0.38
180 0.43
181 0.43
182 0.4
183 0.37
184 0.28
185 0.28
186 0.25
187 0.26
188 0.19
189 0.11
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.07
196 0.1
197 0.14
198 0.2
199 0.23
200 0.23
201 0.23
202 0.23
203 0.23
204 0.2
205 0.15
206 0.1
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.12
211 0.18
212 0.19
213 0.23
214 0.28
215 0.31
216 0.36
217 0.43
218 0.48
219 0.49
220 0.55
221 0.58
222 0.59
223 0.57
224 0.51
225 0.45
226 0.36
227 0.29
228 0.22
229 0.15
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.02
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.1
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.17
254 0.16
255 0.17
256 0.17
257 0.2
258 0.22
259 0.24
260 0.25
261 0.26
262 0.26
263 0.23
264 0.24
265 0.21
266 0.19
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.11
275 0.11
276 0.08
277 0.06
278 0.07
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.11
287 0.11
288 0.08
289 0.09
290 0.14
291 0.2
292 0.24
293 0.25
294 0.27
295 0.3
296 0.37
297 0.38
298 0.34
299 0.28
300 0.29
301 0.29
302 0.27
303 0.22
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.19
308 0.16
309 0.15
310 0.16
311 0.16
312 0.14
313 0.14
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.1
328 0.09
329 0.11
330 0.11
331 0.12
332 0.13
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.18
337 0.17
338 0.17
339 0.16
340 0.14
341 0.14
342 0.13
343 0.1
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.11
349 0.13
350 0.14
351 0.18
352 0.21
353 0.31
354 0.34
355 0.41
356 0.48
357 0.57
358 0.66
359 0.74
360 0.82
361 0.83
362 0.88
363 0.91
364 0.88
365 0.88
366 0.85
367 0.85
368 0.8
369 0.74
370 0.68
371 0.59
372 0.53
373 0.45
374 0.36
375 0.25
376 0.18
377 0.13
378 0.08
379 0.06
380 0.06
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.05
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.08
393 0.1
394 0.09
395 0.09
396 0.1
397 0.12
398 0.13
399 0.14
400 0.15
401 0.17
402 0.18
403 0.19
404 0.18
405 0.17
406 0.15
407 0.15
408 0.15
409 0.12
410 0.19
411 0.21
412 0.21
413 0.27
414 0.27
415 0.28
416 0.3
417 0.31
418 0.29
419 0.27
420 0.27
421 0.24
422 0.23
423 0.22
424 0.19
425 0.17
426 0.13
427 0.12
428 0.11
429 0.09
430 0.1
431 0.12
432 0.13
433 0.14
434 0.18
435 0.22
436 0.29
437 0.35
438 0.34
439 0.32
440 0.32
441 0.31
442 0.34
443 0.33
444 0.33
445 0.29
446 0.32
447 0.33
448 0.32
449 0.35
450 0.31
451 0.28
452 0.22
453 0.2
454 0.21
455 0.19
456 0.19
457 0.16
458 0.14
459 0.12
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.15
467 0.19
468 0.2
469 0.24
470 0.21
471 0.24
472 0.32
473 0.4
474 0.42
475 0.43
476 0.45
477 0.48
478 0.51
479 0.5
480 0.5
481 0.51
482 0.53
483 0.57
484 0.59
485 0.57
486 0.58
487 0.6
488 0.58
489 0.58
490 0.61
491 0.62
492 0.66
493 0.66
494 0.61
495 0.6
496 0.55
497 0.52
498 0.5
499 0.43
500 0.32
501 0.33
502 0.33
503 0.29
504 0.33
505 0.3
506 0.26
507 0.32