Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A225APX3

Protein Details
Accession A0A225APX3    Localization Confidence High Confidence Score 24.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-64KVDSSERRDRDRSRDKERRRKGRSRDRDDKDEDLKBasic
71-104GSANGSHRSRRRSRSRDSDRRRRRDRYGDDHRSGBasic
138-168REDDRPSRRDRDGRRRSRSRGRRSRTPEEDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-98RRDRDRSRDKERRRKGRSRDRDDKDEDLKSPRSEHGSANGSHRSRRRSRSRDSDRRRRRDRYG
109-121RGGGRARSRSRSP
125-162RYYRPNGRSRRDDREDDRPSRRDRDGRRRSRSRGRRSR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12283  RRM1_RBM39_like  
cd12284  RRM2_RBM23_RBM39  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSGLDVEALLESTAASINEASERDRDDRSKVDSSERRDRDRSRDKERRRKGRSRDRDDKDEDLKSPRSEHGSANGSHRSRRRSRSRDSDRRRRRDRYGDDHRSGGDFYRGGGRARSRSRSPYDERYYRPNGRSRRDDREDDRPSRRDRDGRRRSRSRGRRSRTPEEDLNEDERDKRTVFVQQLAARLRTKELIAFFEKVGPVKEAQIVKDRVSGRSKGVGYVEFKDESSVPLAIQLTGQKLLGIPIIAQLTEAEKNRQARNPEATTGQSASAPFHRLYVGNIHFSITENDLQNVFEPFGELEFVQLQKDETARSRGYGFVQFRDPNQAREALEKMNGFDLAGRPIRVGLGNDKFTPESTANLLQRFQGQGHHQHQQQQYQGSSFSGHGGRSVQAGAAPSNFDRAGGRDTDKGAGGASALDDTDVAGVNFNNYSRDALMRKLARTDEPEPSADEKLQPLRPKTEPKPLPVNVNMASRCVLLRNMFDPAEEEGDSWVKELEDDVRAECEEKYGHVVHISLDPNSQGDIYLKFDRVQGGENAIKGLNGRFFGGKQISAQPVVDAVYSSLFSRTKAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.07
4 0.08
5 0.11
6 0.12
7 0.14
8 0.15
9 0.2
10 0.22
11 0.28
12 0.3
13 0.32
14 0.37
15 0.41
16 0.45
17 0.43
18 0.51
19 0.52
20 0.57
21 0.63
22 0.65
23 0.66
24 0.68
25 0.72
26 0.73
27 0.76
28 0.77
29 0.77
30 0.81
31 0.85
32 0.87
33 0.92
34 0.92
35 0.92
36 0.93
37 0.93
38 0.94
39 0.93
40 0.93
41 0.93
42 0.9
43 0.89
44 0.85
45 0.82
46 0.77
47 0.7
48 0.63
49 0.59
50 0.57
51 0.49
52 0.46
53 0.42
54 0.42
55 0.4
56 0.38
57 0.39
58 0.39
59 0.39
60 0.42
61 0.46
62 0.41
63 0.46
64 0.5
65 0.52
66 0.55
67 0.64
68 0.69
69 0.7
70 0.78
71 0.82
72 0.87
73 0.89
74 0.91
75 0.92
76 0.92
77 0.94
78 0.94
79 0.91
80 0.89
81 0.89
82 0.88
83 0.87
84 0.87
85 0.86
86 0.8
87 0.74
88 0.65
89 0.55
90 0.46
91 0.37
92 0.3
93 0.2
94 0.17
95 0.22
96 0.23
97 0.22
98 0.26
99 0.3
100 0.35
101 0.41
102 0.47
103 0.45
104 0.52
105 0.57
106 0.61
107 0.63
108 0.64
109 0.67
110 0.68
111 0.66
112 0.66
113 0.68
114 0.68
115 0.67
116 0.65
117 0.65
118 0.66
119 0.73
120 0.72
121 0.73
122 0.72
123 0.74
124 0.71
125 0.73
126 0.73
127 0.71
128 0.72
129 0.69
130 0.67
131 0.65
132 0.67
133 0.65
134 0.67
135 0.7
136 0.73
137 0.77
138 0.82
139 0.85
140 0.86
141 0.89
142 0.89
143 0.89
144 0.89
145 0.86
146 0.86
147 0.86
148 0.87
149 0.83
150 0.8
151 0.74
152 0.67
153 0.63
154 0.56
155 0.51
156 0.42
157 0.36
158 0.31
159 0.27
160 0.26
161 0.22
162 0.19
163 0.17
164 0.21
165 0.22
166 0.24
167 0.28
168 0.28
169 0.34
170 0.35
171 0.37
172 0.32
173 0.3
174 0.28
175 0.23
176 0.21
177 0.19
178 0.18
179 0.19
180 0.21
181 0.22
182 0.2
183 0.21
184 0.22
185 0.19
186 0.19
187 0.16
188 0.13
189 0.13
190 0.18
191 0.17
192 0.18
193 0.25
194 0.26
195 0.26
196 0.31
197 0.31
198 0.31
199 0.34
200 0.33
201 0.28
202 0.32
203 0.31
204 0.27
205 0.27
206 0.26
207 0.24
208 0.25
209 0.25
210 0.19
211 0.19
212 0.18
213 0.17
214 0.15
215 0.14
216 0.11
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.08
238 0.11
239 0.12
240 0.12
241 0.15
242 0.2
243 0.23
244 0.26
245 0.28
246 0.29
247 0.35
248 0.35
249 0.33
250 0.31
251 0.29
252 0.27
253 0.24
254 0.2
255 0.14
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.17
269 0.17
270 0.16
271 0.17
272 0.17
273 0.12
274 0.13
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.16
303 0.17
304 0.23
305 0.22
306 0.2
307 0.25
308 0.24
309 0.24
310 0.33
311 0.32
312 0.27
313 0.27
314 0.28
315 0.24
316 0.26
317 0.27
318 0.18
319 0.2
320 0.18
321 0.17
322 0.15
323 0.14
324 0.11
325 0.11
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.15
336 0.18
337 0.2
338 0.2
339 0.22
340 0.22
341 0.21
342 0.23
343 0.17
344 0.14
345 0.15
346 0.21
347 0.22
348 0.23
349 0.23
350 0.2
351 0.21
352 0.21
353 0.18
354 0.17
355 0.18
356 0.26
357 0.29
358 0.35
359 0.35
360 0.42
361 0.45
362 0.46
363 0.46
364 0.41
365 0.37
366 0.32
367 0.31
368 0.24
369 0.21
370 0.17
371 0.16
372 0.14
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.12
378 0.12
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.1
385 0.09
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.11
390 0.12
391 0.14
392 0.15
393 0.18
394 0.17
395 0.19
396 0.2
397 0.19
398 0.17
399 0.15
400 0.12
401 0.1
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.15
422 0.15
423 0.17
424 0.24
425 0.27
426 0.27
427 0.3
428 0.31
429 0.31
430 0.36
431 0.38
432 0.37
433 0.36
434 0.36
435 0.35
436 0.36
437 0.34
438 0.29
439 0.26
440 0.24
441 0.28
442 0.32
443 0.35
444 0.36
445 0.4
446 0.45
447 0.53
448 0.54
449 0.59
450 0.58
451 0.58
452 0.64
453 0.61
454 0.62
455 0.55
456 0.55
457 0.48
458 0.5
459 0.44
460 0.36
461 0.34
462 0.28
463 0.25
464 0.21
465 0.21
466 0.16
467 0.19
468 0.19
469 0.22
470 0.22
471 0.21
472 0.22
473 0.21
474 0.21
475 0.18
476 0.17
477 0.15
478 0.17
479 0.16
480 0.15
481 0.13
482 0.1
483 0.1
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.14
488 0.15
489 0.16
490 0.17
491 0.18
492 0.17
493 0.16
494 0.14
495 0.14
496 0.18
497 0.17
498 0.18
499 0.18
500 0.18
501 0.17
502 0.23
503 0.23
504 0.19
505 0.19
506 0.19
507 0.18
508 0.18
509 0.17
510 0.12
511 0.12
512 0.13
513 0.18
514 0.21
515 0.22
516 0.22
517 0.24
518 0.26
519 0.26
520 0.27
521 0.24
522 0.27
523 0.28
524 0.27
525 0.27
526 0.24
527 0.23
528 0.21
529 0.22
530 0.19
531 0.17
532 0.19
533 0.19
534 0.19
535 0.27
536 0.28
537 0.26
538 0.26
539 0.32
540 0.34
541 0.34
542 0.33
543 0.26
544 0.24
545 0.24
546 0.2
547 0.14
548 0.11
549 0.1
550 0.11
551 0.11
552 0.15
553 0.15