Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QWV4

Protein Details
Accession C4QWV4    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-65EDKTPSPKSEKNSKPKDKSTKQDDAEHydrophilic
140-182PAAPKPVSSKSQKKNKKKVKDQSNKQNRKKTPIKQQQHQQQAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
124-130KQGKEKW
139-170LPAAPKPVSSKSQKKNKKKVKDQSNKQNRKKT
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr1-1_0351  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSYAIAAANGSSKEATEIELSTELAKTAIADSPVESAGDEDKTPSPKSEKNSKPKDKSTKQDDAELEAEKIKKSLAPAPVPVVNAWGSSIPSAAIDEIVKTKDDILTAASRENSKSSSKPAAAKQGKEKWVPFKAAVVLPAAPKPVSSKSQKKNKKKVKDQSNKQNRKKTPIKQQQHQQQAQIKGSDENNKKLDKKQPNGTSTESAVAPIATPLEFNEQQTATAKAVPPQVPQQDNLDQVEQPISTSDDHQHEQSQQNLHAHHNHQNNHKPYRQFNNGYRKYQGRQQYNNNNGVFIPFNNRQQHPQGFHGFIPAYSPNAFHPRPFQPIYPQQAAAFAAQDPLPSLTYQLDYYFSLENLVKDIYLRKQMNSQGFIPLTVIFNFFRVNALSSGNYHLVVDALKYCMNIESRGSDNGIKIRALNDWEKWVLPFSQREESGKDESVPEPVSEIIQTEVEASTST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.15
3 0.13
4 0.14
5 0.15
6 0.16
7 0.16
8 0.15
9 0.15
10 0.13
11 0.11
12 0.1
13 0.08
14 0.09
15 0.11
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.14
20 0.15
21 0.14
22 0.12
23 0.11
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.18
29 0.22
30 0.23
31 0.27
32 0.31
33 0.34
34 0.42
35 0.5
36 0.56
37 0.63
38 0.72
39 0.79
40 0.82
41 0.87
42 0.91
43 0.89
44 0.89
45 0.87
46 0.86
47 0.78
48 0.77
49 0.67
50 0.62
51 0.55
52 0.47
53 0.38
54 0.33
55 0.32
56 0.24
57 0.23
58 0.18
59 0.17
60 0.18
61 0.23
62 0.27
63 0.29
64 0.31
65 0.35
66 0.37
67 0.37
68 0.33
69 0.29
70 0.22
71 0.18
72 0.16
73 0.13
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.08
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.1
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.17
96 0.18
97 0.18
98 0.19
99 0.2
100 0.2
101 0.21
102 0.22
103 0.26
104 0.31
105 0.33
106 0.38
107 0.41
108 0.49
109 0.51
110 0.53
111 0.57
112 0.58
113 0.61
114 0.6
115 0.6
116 0.57
117 0.56
118 0.55
119 0.46
120 0.4
121 0.38
122 0.34
123 0.31
124 0.24
125 0.2
126 0.18
127 0.19
128 0.17
129 0.13
130 0.12
131 0.15
132 0.17
133 0.22
134 0.29
135 0.38
136 0.46
137 0.57
138 0.67
139 0.75
140 0.82
141 0.86
142 0.89
143 0.9
144 0.91
145 0.91
146 0.92
147 0.91
148 0.92
149 0.93
150 0.93
151 0.91
152 0.91
153 0.83
154 0.82
155 0.81
156 0.78
157 0.78
158 0.78
159 0.78
160 0.76
161 0.81
162 0.81
163 0.82
164 0.76
165 0.71
166 0.67
167 0.63
168 0.58
169 0.5
170 0.42
171 0.34
172 0.34
173 0.36
174 0.33
175 0.33
176 0.35
177 0.37
178 0.39
179 0.42
180 0.49
181 0.49
182 0.52
183 0.56
184 0.6
185 0.59
186 0.61
187 0.58
188 0.5
189 0.42
190 0.37
191 0.27
192 0.2
193 0.16
194 0.12
195 0.09
196 0.07
197 0.06
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.1
202 0.11
203 0.11
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.18
214 0.18
215 0.18
216 0.22
217 0.26
218 0.26
219 0.26
220 0.28
221 0.25
222 0.26
223 0.26
224 0.22
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.11
229 0.09
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.08
234 0.12
235 0.14
236 0.15
237 0.16
238 0.17
239 0.2
240 0.22
241 0.24
242 0.23
243 0.23
244 0.25
245 0.26
246 0.26
247 0.27
248 0.28
249 0.32
250 0.36
251 0.38
252 0.43
253 0.5
254 0.54
255 0.55
256 0.57
257 0.54
258 0.53
259 0.57
260 0.58
261 0.56
262 0.57
263 0.63
264 0.64
265 0.63
266 0.61
267 0.57
268 0.51
269 0.51
270 0.51
271 0.49
272 0.5
273 0.56
274 0.62
275 0.65
276 0.71
277 0.64
278 0.56
279 0.47
280 0.41
281 0.32
282 0.22
283 0.22
284 0.18
285 0.26
286 0.31
287 0.32
288 0.34
289 0.4
290 0.46
291 0.42
292 0.44
293 0.41
294 0.38
295 0.37
296 0.36
297 0.3
298 0.24
299 0.23
300 0.18
301 0.16
302 0.14
303 0.15
304 0.14
305 0.22
306 0.22
307 0.2
308 0.26
309 0.28
310 0.34
311 0.36
312 0.34
313 0.35
314 0.43
315 0.49
316 0.46
317 0.43
318 0.36
319 0.36
320 0.35
321 0.27
322 0.2
323 0.13
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.14
339 0.14
340 0.13
341 0.14
342 0.15
343 0.14
344 0.14
345 0.13
346 0.11
347 0.11
348 0.15
349 0.17
350 0.25
351 0.26
352 0.26
353 0.32
354 0.39
355 0.45
356 0.45
357 0.42
358 0.39
359 0.38
360 0.36
361 0.31
362 0.25
363 0.2
364 0.17
365 0.19
366 0.12
367 0.13
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.12
372 0.14
373 0.13
374 0.15
375 0.15
376 0.16
377 0.2
378 0.2
379 0.19
380 0.16
381 0.15
382 0.13
383 0.12
384 0.12
385 0.1
386 0.1
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.15
391 0.16
392 0.17
393 0.17
394 0.19
395 0.21
396 0.23
397 0.26
398 0.24
399 0.26
400 0.29
401 0.29
402 0.26
403 0.24
404 0.24
405 0.25
406 0.28
407 0.29
408 0.27
409 0.3
410 0.32
411 0.32
412 0.31
413 0.3
414 0.28
415 0.28
416 0.32
417 0.32
418 0.38
419 0.39
420 0.42
421 0.43
422 0.45
423 0.45
424 0.41
425 0.37
426 0.32
427 0.3
428 0.32
429 0.3
430 0.25
431 0.21
432 0.19
433 0.19
434 0.16
435 0.16
436 0.13
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.11