Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A225AVP5

Protein Details
Accession A0A225AVP5    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-210TAAAGRRGRGRPRKAKNPSQRKKTAEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-206TAAAGRRGRGRPRKAKNPSQRKK
Subcellular Location(s) cyto 23, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MVIHLGAVPGEKYIGVECTIIPITVDAMLNGAVWLALDTFYLVIKDKEYHTTWLLYLQFRVFDCVYHYVLADVLIPIRCLCARSFSLCSRRLNIRLLGPVKRVTVTYNQNGVSRGIASIIFSKPDTAAKAAKELNGTLVDGRPMKVEVVVDATHAPQVPAPKPLSERVTQSKAQPKPATATKNTAAAGRRGRGRPRKAKNPSQRKKTAEELDAEMVDYFAGSENAPVGAETTNGTAPAANGDEAMAEIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.1
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.12
9 0.11
10 0.11
11 0.12
12 0.12
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.07
18 0.06
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.04
23 0.04
24 0.04
25 0.04
26 0.05
27 0.05
28 0.06
29 0.07
30 0.08
31 0.09
32 0.12
33 0.14
34 0.19
35 0.21
36 0.24
37 0.25
38 0.26
39 0.24
40 0.27
41 0.28
42 0.24
43 0.23
44 0.2
45 0.21
46 0.19
47 0.23
48 0.18
49 0.15
50 0.18
51 0.19
52 0.2
53 0.18
54 0.17
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.1
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.13
69 0.14
70 0.18
71 0.23
72 0.28
73 0.35
74 0.39
75 0.41
76 0.4
77 0.44
78 0.43
79 0.42
80 0.38
81 0.33
82 0.35
83 0.37
84 0.35
85 0.33
86 0.31
87 0.28
88 0.26
89 0.24
90 0.19
91 0.22
92 0.25
93 0.26
94 0.28
95 0.28
96 0.29
97 0.29
98 0.27
99 0.21
100 0.16
101 0.12
102 0.09
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.12
115 0.11
116 0.15
117 0.16
118 0.16
119 0.16
120 0.15
121 0.14
122 0.13
123 0.13
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.12
145 0.12
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.21
150 0.25
151 0.28
152 0.26
153 0.31
154 0.33
155 0.37
156 0.37
157 0.41
158 0.46
159 0.45
160 0.52
161 0.48
162 0.43
163 0.44
164 0.49
165 0.49
166 0.42
167 0.45
168 0.38
169 0.4
170 0.39
171 0.37
172 0.32
173 0.31
174 0.34
175 0.32
176 0.38
177 0.39
178 0.49
179 0.55
180 0.64
181 0.68
182 0.73
183 0.8
184 0.82
185 0.87
186 0.88
187 0.9
188 0.9
189 0.9
190 0.89
191 0.83
192 0.8
193 0.78
194 0.74
195 0.67
196 0.6
197 0.54
198 0.48
199 0.42
200 0.37
201 0.27
202 0.2
203 0.15
204 0.11
205 0.07
206 0.05
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.11
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.13
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.1