Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G3AVT0

Protein Details
Accession G3AVT0    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAKSVKKTQSKKAAPKKETVEKSHydrophilic
106-128ESSSAAKSNKKKKSKRGIMYIGRHydrophilic
217-262KVIPWGKISKHKHDKPKTKEQWEVLVKKFEQSKKNKQNELKSKGIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
112-121KSNKKKKSKR
219-235IPWGKISKHKHDKPKTK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG spaa:SPAPADRAFT_63601  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKSVKKTQSKKAAPKKETVEKSVEQIEEDLQLPSSSDEEEQAADEEEEEEPLSSEDDDDDDDEDLHGLSSDDEDEEEQEEQEEQKEQQQPEEKSKSRHTVNKSVESSSAAKSNKKKKSKRGIMYIGRLPSGFQEQELTKYFTQFGDIINLKLSRNKKTGKSKHYGFIEFESYEVAKVAAETMNNYLLFGHLLKCQVLENNDEIHQDLFKDANKKFKVIPWGKISKHKHDKPKTKEQWEVLVKKFEQSKKNKQNELKSKGIDFDLNNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.82
4 0.81
5 0.77
6 0.71
7 0.67
8 0.58
9 0.58
10 0.55
11 0.46
12 0.37
13 0.32
14 0.27
15 0.23
16 0.22
17 0.18
18 0.12
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.1
32 0.1
33 0.1
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.15
73 0.22
74 0.21
75 0.26
76 0.34
77 0.36
78 0.43
79 0.51
80 0.48
81 0.47
82 0.53
83 0.54
84 0.53
85 0.57
86 0.55
87 0.57
88 0.59
89 0.63
90 0.58
91 0.53
92 0.47
93 0.43
94 0.38
95 0.29
96 0.29
97 0.22
98 0.26
99 0.33
100 0.42
101 0.48
102 0.56
103 0.63
104 0.68
105 0.77
106 0.82
107 0.81
108 0.81
109 0.81
110 0.77
111 0.74
112 0.68
113 0.57
114 0.47
115 0.4
116 0.31
117 0.22
118 0.19
119 0.13
120 0.09
121 0.11
122 0.11
123 0.14
124 0.16
125 0.18
126 0.15
127 0.16
128 0.17
129 0.14
130 0.16
131 0.13
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.13
136 0.15
137 0.16
138 0.14
139 0.2
140 0.22
141 0.22
142 0.28
143 0.32
144 0.39
145 0.49
146 0.58
147 0.61
148 0.66
149 0.64
150 0.65
151 0.65
152 0.59
153 0.5
154 0.43
155 0.39
156 0.3
157 0.27
158 0.21
159 0.16
160 0.13
161 0.12
162 0.09
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.16
192 0.15
193 0.12
194 0.11
195 0.11
196 0.14
197 0.2
198 0.21
199 0.3
200 0.31
201 0.33
202 0.34
203 0.37
204 0.45
205 0.44
206 0.5
207 0.49
208 0.56
209 0.58
210 0.66
211 0.68
212 0.68
213 0.73
214 0.74
215 0.77
216 0.79
217 0.86
218 0.85
219 0.89
220 0.88
221 0.86
222 0.85
223 0.78
224 0.78
225 0.77
226 0.75
227 0.68
228 0.66
229 0.58
230 0.55
231 0.59
232 0.57
233 0.57
234 0.59
235 0.66
236 0.69
237 0.78
238 0.82
239 0.83
240 0.87
241 0.88
242 0.86
243 0.83
244 0.76
245 0.69
246 0.62
247 0.56
248 0.5