Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0K3CRV2

Protein Details
Accession A0A0K3CRV2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-29TYNVTRFTRQVLKRHRRAPPSLVIHydrophilic
360-398RERAILEKKRIQQQQKRAQAARRKERKKQDQEQARLAGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-387KKRIQQQQKRAQAARRKERKK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSSGATYNVTRFTRQVLKRHRRAPPSLVIHLYPTHFRFEHQHGNFAYDSPMKCFLEAVREQKLPTDLLEVLDESGVVYYDGCLIVEVHDHRDSAPASGASRASLSLSLSQARETPAMSRAEVYRIVLAPNPATLWTELGIMSRRMEQEAAAERREDTVGWTEEEALEVESVILNRTMPPLCLSPSMQTNRVANSMLRATTLRPPKRKRFCSSGDCEDDEDGEEGQKKEREEHEKLMKVGDEGVPRTKGPAFSRLAFIQAYRERQNNPTLAAQPGSSATSIRLGGASAAAAAAQGGPVPTPRGQSRAVSPAASTASGRPQKKKAGDGMSDSGSAIGGAINTAAQQKKAAQLAGQVQDPAERERAILEKKRIQQQQKRAQAARRKERKKQDQEQARLAGDLQVGTPGSSAAGTPTAWQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.52
3 0.56
4 0.65
5 0.72
6 0.81
7 0.84
8 0.82
9 0.83
10 0.8
11 0.79
12 0.76
13 0.72
14 0.66
15 0.58
16 0.52
17 0.48
18 0.43
19 0.39
20 0.33
21 0.33
22 0.29
23 0.3
24 0.34
25 0.38
26 0.46
27 0.42
28 0.47
29 0.42
30 0.45
31 0.44
32 0.38
33 0.34
34 0.29
35 0.28
36 0.25
37 0.31
38 0.27
39 0.27
40 0.28
41 0.24
42 0.28
43 0.33
44 0.34
45 0.34
46 0.36
47 0.36
48 0.38
49 0.39
50 0.31
51 0.26
52 0.25
53 0.19
54 0.18
55 0.19
56 0.16
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.11
73 0.12
74 0.16
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.21
79 0.21
80 0.18
81 0.19
82 0.15
83 0.15
84 0.17
85 0.17
86 0.14
87 0.14
88 0.12
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.13
94 0.15
95 0.15
96 0.16
97 0.16
98 0.17
99 0.17
100 0.15
101 0.15
102 0.17
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.16
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.08
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.16
135 0.23
136 0.25
137 0.23
138 0.22
139 0.22
140 0.23
141 0.23
142 0.18
143 0.12
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.14
149 0.13
150 0.14
151 0.12
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.05
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.1
167 0.12
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.2
172 0.22
173 0.23
174 0.24
175 0.24
176 0.23
177 0.24
178 0.23
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.12
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.17
187 0.27
188 0.31
189 0.39
190 0.47
191 0.57
192 0.67
193 0.73
194 0.72
195 0.7
196 0.7
197 0.69
198 0.68
199 0.65
200 0.59
201 0.52
202 0.47
203 0.4
204 0.33
205 0.25
206 0.19
207 0.11
208 0.08
209 0.1
210 0.09
211 0.12
212 0.14
213 0.13
214 0.17
215 0.23
216 0.3
217 0.32
218 0.39
219 0.44
220 0.45
221 0.45
222 0.42
223 0.36
224 0.29
225 0.26
226 0.22
227 0.16
228 0.15
229 0.17
230 0.17
231 0.17
232 0.19
233 0.18
234 0.19
235 0.19
236 0.25
237 0.25
238 0.25
239 0.29
240 0.27
241 0.28
242 0.23
243 0.21
244 0.21
245 0.22
246 0.25
247 0.26
248 0.28
249 0.29
250 0.32
251 0.37
252 0.31
253 0.3
254 0.29
255 0.27
256 0.26
257 0.24
258 0.2
259 0.16
260 0.15
261 0.14
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.04
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.02
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.08
285 0.09
286 0.13
287 0.14
288 0.18
289 0.2
290 0.22
291 0.26
292 0.29
293 0.29
294 0.26
295 0.25
296 0.24
297 0.23
298 0.21
299 0.18
300 0.13
301 0.21
302 0.28
303 0.33
304 0.36
305 0.41
306 0.49
307 0.53
308 0.57
309 0.56
310 0.56
311 0.55
312 0.55
313 0.53
314 0.46
315 0.42
316 0.36
317 0.27
318 0.19
319 0.15
320 0.09
321 0.06
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.13
331 0.15
332 0.21
333 0.23
334 0.23
335 0.19
336 0.24
337 0.3
338 0.32
339 0.31
340 0.26
341 0.23
342 0.25
343 0.26
344 0.24
345 0.2
346 0.17
347 0.16
348 0.18
349 0.24
350 0.3
351 0.36
352 0.42
353 0.47
354 0.54
355 0.64
356 0.7
357 0.75
358 0.77
359 0.79
360 0.82
361 0.84
362 0.86
363 0.83
364 0.83
365 0.82
366 0.83
367 0.83
368 0.83
369 0.83
370 0.84
371 0.88
372 0.9
373 0.92
374 0.91
375 0.91
376 0.91
377 0.9
378 0.88
379 0.82
380 0.72
381 0.61
382 0.51
383 0.44
384 0.34
385 0.26
386 0.18
387 0.15
388 0.14
389 0.13
390 0.13
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09