FuNGI

A0A0K3C6W0

Protein Details

Accession

A0A0K3C6W0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
146-165	PSTARGTKFKPNMRRKERVV	Hydrophilic
174-195	GESNWRNKRGPRPPPRPRQDLQ	Hydrophilic
511-535	NAATNGTSKKPKSRRRSSSTSSSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-17	KGRGRGRGRR
181-189	KRGPRPPPR
295-318	LRTKIRRLQERKQERLKKEAARAK
519-525	KKPKSRR
584-610	KKEREEERRLRMEKAKKEGGVKREGKR

Subcellular Location(s)

mito 11.5, nucl 9.5, cyto_mito 8.833, cyto_nucl 7.833, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSDTGAPKGRGRGRGRRVGATTLSGATIDTNTASPSPQPAAADSSASASRASSVSAPRGASGTPAPSVEATEDALEPSNAAASSSAAPQRRSSVKRVPSVGVGSTRAPSDGLARTPSIGLAGGRDRPVGGLLGSTSEFRRDATAGPSTARGTKFKPNMRRKERVVDDDEECEDGESNWRNKRGPRPPPRPRQDLQMTASGPMAQGPGGPPKTWGARPTAGASGAAVMAASRAGTLNQMLDDDEDASDLEVDDDPYDEAGGLRFKAVDLNDIGSAEKRVGDDGMAPLTLPRDPKVLRTKIRRLQERKQERLKKEAARAKSEAGVKAEPQDDSLPGSGTSTPATAATPAPLDSKEGSLALMSVDEDKEAKDLKDLEEEEKKEIILSEAFDLAPETRGELYMFQFPRKFPEFVPSSSVKSESHPSGDLASLSIKPDPDAPAPRKVAPPPWGRFGTRTEKAARWSEHEGRIGELCVHRSGKVTLRLEGDLRYEVLPAAQPSFLQEIAVLDHPSRNAATNGTSKKPKSRRRSSSTSSSSSSSSSSDSPSSSKTPALPADSLVVLGQTSKKFIVVPQIEDLLEKVGEQEKKEREEERRLRMEKAKKEGGVKREGKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.73
2	0.75
3	0.74
4	0.71
5	0.67
6	0.61
7	0.54
8	0.47
9	0.37
10	0.33
11	0.25
12	0.21
13	0.16
14	0.14
15	0.11
16	0.09
17	0.09
18	0.1
19	0.11
20	0.12
21	0.12
22	0.15
23	0.17
24	0.18
25	0.19
26	0.19
27	0.24
28	0.23
29	0.23
30	0.2
31	0.21
32	0.2
33	0.19
34	0.18
35	0.12
36	0.14
37	0.12
38	0.14
39	0.14
40	0.18
41	0.22
42	0.25
43	0.25
44	0.24
45	0.25
46	0.24
47	0.22
48	0.21
49	0.19
50	0.17
51	0.17
52	0.17
53	0.16
54	0.17
55	0.16
56	0.14
57	0.12
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.12
62	0.11
63	0.1
64	0.09
65	0.1
66	0.08
67	0.08
68	0.07
69	0.08
70	0.09
71	0.14
72	0.19
73	0.22
74	0.23
75	0.25
76	0.31
77	0.39
78	0.42
79	0.45
80	0.5
81	0.54
82	0.6
83	0.62
84	0.58
85	0.53
86	0.51
87	0.46
88	0.4
89	0.34
90	0.28
91	0.25
92	0.23
93	0.2
94	0.17
95	0.14
96	0.16
97	0.17
98	0.17
99	0.19
100	0.19
101	0.19
102	0.19
103	0.18
104	0.14
105	0.12
106	0.1
107	0.1
108	0.13
109	0.15
110	0.16
111	0.16
112	0.16
113	0.15
114	0.16
115	0.13
116	0.1
117	0.08
118	0.07
119	0.08
120	0.09
121	0.1
122	0.1
123	0.11
124	0.12
125	0.12
126	0.14
127	0.13
128	0.14
129	0.17
130	0.21
131	0.2
132	0.2
133	0.22
134	0.21
135	0.25
136	0.26
137	0.25
138	0.24
139	0.33
140	0.4
141	0.47
142	0.56
143	0.62
144	0.71
145	0.77
146	0.81
147	0.78
148	0.79
149	0.78
150	0.74
151	0.69
152	0.63
153	0.56
154	0.5
155	0.45
156	0.36
157	0.29
158	0.21
159	0.16
160	0.12
161	0.15
162	0.17
163	0.22
164	0.26
165	0.29
166	0.32
167	0.38
168	0.48
169	0.53
170	0.59
171	0.65
172	0.71
173	0.79
174	0.87
175	0.89
176	0.86
177	0.77
178	0.76
179	0.72
180	0.68
181	0.6
182	0.55
183	0.47
184	0.4
185	0.39
186	0.29
187	0.22
188	0.15
189	0.13
190	0.06
191	0.06
192	0.07
193	0.14
194	0.15
195	0.15
196	0.16
197	0.18
198	0.22
199	0.24
200	0.24
201	0.23
202	0.23
203	0.25
204	0.26
205	0.25
206	0.22
207	0.19
208	0.17
209	0.12
210	0.1
211	0.08
212	0.05
213	0.04
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.04
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.04
235	0.05
236	0.04
237	0.05
238	0.04
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.04
244	0.04
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.08
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.1
257	0.11
258	0.11
259	0.09
260	0.09
261	0.07
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.07
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.11
278	0.12
279	0.19
280	0.28
281	0.34
282	0.4
283	0.48
284	0.57
285	0.59
286	0.67
287	0.7
288	0.68
289	0.69
290	0.73
291	0.74
292	0.73
293	0.77
294	0.78
295	0.71
296	0.71
297	0.7
298	0.65
299	0.64
300	0.62
301	0.56
302	0.52
303	0.5
304	0.44
305	0.41
306	0.38
307	0.31
308	0.27
309	0.24
310	0.19
311	0.21
312	0.2
313	0.16
314	0.15
315	0.13
316	0.11
317	0.12
318	0.12
319	0.09
320	0.08
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.1
337	0.09
338	0.1
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.07
343	0.07
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.07
353	0.08
354	0.08
355	0.09
356	0.11
357	0.12
358	0.17
359	0.18
360	0.21
361	0.26
362	0.27
363	0.27
364	0.26
365	0.25
366	0.2
367	0.18
368	0.16
369	0.1
370	0.1
371	0.08
372	0.09
373	0.09
374	0.08
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.08
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.11
385	0.17
386	0.18
387	0.2
388	0.22
389	0.22
390	0.28
391	0.31
392	0.3
393	0.23
394	0.31
395	0.32
396	0.31
397	0.36
398	0.32
399	0.3
400	0.3
401	0.32
402	0.24
403	0.23
404	0.26
405	0.22
406	0.23
407	0.21
408	0.2
409	0.2
410	0.19
411	0.17
412	0.13
413	0.13
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.11
418	0.1
419	0.13
420	0.16
421	0.19
422	0.27
423	0.29
424	0.35
425	0.38
426	0.4
427	0.42
428	0.42
429	0.43
430	0.43
431	0.49
432	0.45
433	0.49
434	0.5
435	0.47
436	0.47
437	0.47
438	0.48
439	0.42
440	0.43
441	0.41
442	0.4
443	0.44
444	0.49
445	0.44
446	0.4
447	0.45
448	0.47
449	0.47
450	0.48
451	0.43
452	0.38
453	0.37
454	0.32
455	0.28
456	0.23
457	0.2
458	0.2
459	0.21
460	0.19
461	0.21
462	0.23
463	0.26
464	0.33
465	0.33
466	0.33
467	0.35
468	0.36
469	0.35
470	0.33
471	0.29
472	0.21
473	0.21
474	0.17
475	0.15
476	0.13
477	0.12
478	0.13
479	0.12
480	0.12
481	0.11
482	0.11
483	0.13
484	0.15
485	0.14
486	0.12
487	0.11
488	0.1
489	0.13
490	0.15
491	0.13
492	0.12
493	0.13
494	0.14
495	0.15
496	0.15
497	0.15
498	0.14
499	0.15
500	0.18
501	0.25
502	0.3
503	0.35
504	0.42
505	0.43
506	0.53
507	0.61
508	0.67
509	0.7
510	0.76
511	0.8
512	0.81
513	0.88
514	0.85
515	0.85
516	0.82
517	0.77
518	0.69
519	0.6
520	0.53
521	0.44
522	0.38
523	0.29
524	0.24
525	0.2
526	0.21
527	0.2
528	0.21
529	0.22
530	0.24
531	0.26
532	0.26
533	0.27
534	0.25
535	0.29
536	0.32
537	0.34
538	0.31
539	0.28
540	0.29
541	0.26
542	0.24
543	0.18
544	0.14
545	0.1
546	0.11
547	0.14
548	0.12
549	0.15
550	0.15
551	0.16
552	0.17
553	0.18
554	0.28
555	0.27
556	0.3
557	0.31
558	0.33
559	0.32
560	0.32
561	0.3
562	0.22
563	0.18
564	0.14
565	0.13
566	0.18
567	0.21
568	0.23
569	0.31
570	0.36
571	0.41
572	0.46
573	0.51
574	0.52
575	0.6
576	0.67
577	0.68
578	0.72
579	0.69
580	0.72
581	0.74
582	0.76
583	0.73
584	0.74
585	0.72
586	0.66
587	0.73
588	0.73
589	0.71
590	0.72

A0A0K3C6W0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer