FuNGI

A0A0K3CLD1

Protein Details

Accession

A0A0K3CLD1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
62-81	EPEAKPQKPKSRFALQREKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
276-284	KGKREERES

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 13.5, cyto 10

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C

Amino Acid Sequences

MAQRIRPSLADLSDYDQPAFLELDAPAQPAAQVMRTRPPTVASSLPPPIPVIQPSSSTAPSEPEAKPQKPKSRFALQREKEAAAAAQRAPPTGAERFELSLDELDAEVAEQEEQLPRRDIVKDVLERPTSQPKPPSAPGPSRPSPLAPGGTRPTGFPAPGRGVFPRKSQPSAPTSPSVTSTPSSSGPRIFRTSSLVPPTPTSSSLDAASLTSDPADSISSLLSSVSRENEDVVSRMSESEILEEQRQIREEMGLSEGVLRMLQMRGERRRGEVQDKGKREERESRPLPVERKEEVKREEGEEEEGSPEYIRRHFFPNEPPNPALDWTRPVPPPSTSSSSTPASLQTRTFDLSGAPIASSPATDSPEATLSTDHHVSSSTTFTISSLLALTGSSVPSQRSTALTILERIIVRSRAEKGEEKEWEVVRIEYLKLTGCLAPFAPTEPVLAPDWPLCALDELLRSATSPVFQRLPDGWDSSELELVQTSLALMRVVCASSSVQRKPDPPTLLFDLIKVFMLEKDNGTTTGTSGATAEVFRDEAVQRSMTALLEPLAIGHSRSRQLLKPDTRTSDATTEGVSARLSTAPFYQLFTDLVGLYDSISLSDRLFGLVLLPPLAMSYPVDYRRLIWTDYAHILRHLRFTVDEAISDVPPSRAETAIASYLEPRETNEALLMAYVDALASGAVSLASTPFLHFVALHHVASAVFVDEADSASTTAAKLVKALLARRAGKVLQQVLRYRQAEEGVEVKVPPACFDADEASMSERRQWLRMLVGDGGAQQLDALLEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.28
3	0.24
4	0.22
5	0.2
6	0.19
7	0.15
8	0.11
9	0.1
10	0.14
11	0.14
12	0.15
13	0.13
14	0.12
15	0.12
16	0.12
17	0.13
18	0.14
19	0.17
20	0.19
21	0.29
22	0.33
23	0.35
24	0.35
25	0.37
26	0.35
27	0.36
28	0.38
29	0.33
30	0.34
31	0.38
32	0.37
33	0.35
34	0.33
35	0.31
36	0.29
37	0.28
38	0.27
39	0.24
40	0.26
41	0.28
42	0.31
43	0.3
44	0.29
45	0.27
46	0.25
47	0.25
48	0.29
49	0.26
50	0.31
51	0.39
52	0.42
53	0.52
54	0.58
55	0.67
56	0.68
57	0.75
58	0.73
59	0.75
60	0.79
61	0.79
62	0.8
63	0.73
64	0.76
65	0.73
66	0.66
67	0.56
68	0.48
69	0.4
70	0.32
71	0.32
72	0.24
73	0.23
74	0.23
75	0.23
76	0.22
77	0.22
78	0.22
79	0.23
80	0.23
81	0.21
82	0.22
83	0.23
84	0.23
85	0.22
86	0.19
87	0.16
88	0.14
89	0.13
90	0.11
91	0.09
92	0.09
93	0.08
94	0.06
95	0.06
96	0.05
97	0.05
98	0.06
99	0.11
100	0.13
101	0.16
102	0.18
103	0.19
104	0.22
105	0.24
106	0.25
107	0.25
108	0.32
109	0.35
110	0.36
111	0.42
112	0.41
113	0.42
114	0.45
115	0.5
116	0.45
117	0.45
118	0.47
119	0.46
120	0.51
121	0.52
122	0.55
123	0.52
124	0.56
125	0.59
126	0.61
127	0.59
128	0.56
129	0.54
130	0.48
131	0.45
132	0.41
133	0.38
134	0.31
135	0.33
136	0.33
137	0.35
138	0.34
139	0.3
140	0.32
141	0.28
142	0.28
143	0.23
144	0.25
145	0.26
146	0.28
147	0.3
148	0.29
149	0.34
150	0.36
151	0.4
152	0.44
153	0.44
154	0.46
155	0.47
156	0.49
157	0.5
158	0.53
159	0.51
160	0.46
161	0.43
162	0.41
163	0.39
164	0.34
165	0.29
166	0.24
167	0.22
168	0.2
169	0.21
170	0.24
171	0.23
172	0.27
173	0.28
174	0.32
175	0.34
176	0.33
177	0.31
178	0.34
179	0.35
180	0.36
181	0.39
182	0.37
183	0.34
184	0.35
185	0.37
186	0.33
187	0.3
188	0.27
189	0.23
190	0.22
191	0.21
192	0.19
193	0.16
194	0.14
195	0.13
196	0.1
197	0.08
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.05
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.08
212	0.09
213	0.11
214	0.11
215	0.12
216	0.13
217	0.14
218	0.14
219	0.13
220	0.12
221	0.11
222	0.11
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.11
227	0.12
228	0.13
229	0.14
230	0.16
231	0.17
232	0.17
233	0.18
234	0.17
235	0.15
236	0.14
237	0.14
238	0.13
239	0.13
240	0.1
241	0.09
242	0.1
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.08
250	0.11
251	0.18
252	0.24
253	0.31
254	0.32
255	0.35
256	0.42
257	0.45
258	0.47
259	0.47
260	0.52
261	0.54
262	0.57
263	0.58
264	0.57
265	0.55
266	0.54
267	0.57
268	0.53
269	0.55
270	0.53
271	0.53
272	0.52
273	0.55
274	0.54
275	0.5
276	0.48
277	0.4
278	0.45
279	0.44
280	0.46
281	0.44
282	0.44
283	0.4
284	0.37
285	0.37
286	0.3
287	0.29
288	0.23
289	0.2
290	0.16
291	0.14
292	0.12
293	0.1
294	0.11
295	0.1
296	0.12
297	0.13
298	0.14
299	0.19
300	0.21
301	0.25
302	0.34
303	0.42
304	0.44
305	0.47
306	0.45
307	0.41
308	0.4
309	0.38
310	0.3
311	0.21
312	0.2
313	0.17
314	0.21
315	0.21
316	0.22
317	0.22
318	0.21
319	0.23
320	0.25
321	0.28
322	0.25
323	0.26
324	0.29
325	0.28
326	0.27
327	0.25
328	0.24
329	0.21
330	0.2
331	0.19
332	0.16
333	0.16
334	0.17
335	0.16
336	0.13
337	0.11
338	0.1
339	0.1
340	0.09
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.06
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.09
356	0.08
357	0.11
358	0.12
359	0.11
360	0.1
361	0.1
362	0.1
363	0.11
364	0.11
365	0.09
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.04
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.08
384	0.08
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.12
389	0.12
390	0.12
391	0.12
392	0.13
393	0.12
394	0.11
395	0.12
396	0.12
397	0.12
398	0.13
399	0.15
400	0.15
401	0.18
402	0.22
403	0.23
404	0.28
405	0.29
406	0.29
407	0.31
408	0.3
409	0.28
410	0.24
411	0.21
412	0.15
413	0.15
414	0.13
415	0.09
416	0.09
417	0.08
418	0.07
419	0.09
420	0.09
421	0.08
422	0.08
423	0.08
424	0.09
425	0.09
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.1
430	0.09
431	0.11
432	0.1
433	0.1
434	0.1
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.09
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.09
452	0.11
453	0.12
454	0.12
455	0.15
456	0.15
457	0.18
458	0.18
459	0.18
460	0.16
461	0.16
462	0.18
463	0.16
464	0.16
465	0.13
466	0.11
467	0.09
468	0.09
469	0.07
470	0.05
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.06
481	0.07
482	0.12
483	0.19
484	0.2
485	0.24
486	0.26
487	0.3
488	0.35
489	0.41
490	0.4
491	0.35
492	0.38
493	0.39
494	0.41
495	0.37
496	0.32
497	0.26
498	0.22
499	0.2
500	0.15
501	0.11
502	0.09
503	0.11
504	0.12
505	0.11
506	0.12
507	0.13
508	0.13
509	0.14
510	0.12
511	0.1
512	0.12
513	0.11
514	0.1
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.08
524	0.08
525	0.1
526	0.12
527	0.12
528	0.11
529	0.12
530	0.13
531	0.11
532	0.11
533	0.09
534	0.07
535	0.07
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.06
540	0.07
541	0.09
542	0.12
543	0.14
544	0.17
545	0.2
546	0.23
547	0.3
548	0.39
549	0.44
550	0.49
551	0.53
552	0.55
553	0.55
554	0.54
555	0.5
556	0.42
557	0.37
558	0.29
559	0.24
560	0.2
561	0.17
562	0.15
563	0.12
564	0.1
565	0.09
566	0.1
567	0.1
568	0.09
569	0.1
570	0.13
571	0.13
572	0.14
573	0.14
574	0.14
575	0.14
576	0.13
577	0.13
578	0.1
579	0.1
580	0.09
581	0.08
582	0.07
583	0.07
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.08
590	0.08
591	0.08
592	0.08
593	0.07
594	0.08
595	0.09
596	0.09
597	0.09
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.07
603	0.06
604	0.08
605	0.13
606	0.16
607	0.18
608	0.18
609	0.2
610	0.25
611	0.27
612	0.26
613	0.23
614	0.23
615	0.25
616	0.31
617	0.31
618	0.26
619	0.27
620	0.3
621	0.28
622	0.3
623	0.27
624	0.23
625	0.21
626	0.23
627	0.27
628	0.23
629	0.22
630	0.2
631	0.21
632	0.2
633	0.2
634	0.18
635	0.11
636	0.12
637	0.14
638	0.14
639	0.12
640	0.13
641	0.14
642	0.16
643	0.18
644	0.18
645	0.16
646	0.16
647	0.17
648	0.18
649	0.17
650	0.16
651	0.18
652	0.18
653	0.18
654	0.17
655	0.16
656	0.14
657	0.14
658	0.12
659	0.07
660	0.06
661	0.05
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.03
666	0.03
667	0.03
668	0.03
669	0.03
670	0.03
671	0.03
672	0.04
673	0.05
674	0.06
675	0.06
676	0.08
677	0.08
678	0.09
679	0.09
680	0.1
681	0.17
682	0.2
683	0.19
684	0.18
685	0.18
686	0.18
687	0.18
688	0.17
689	0.09
690	0.06
691	0.06
692	0.07
693	0.06
694	0.07
695	0.08
696	0.08
697	0.07
698	0.07
699	0.08
700	0.07
701	0.1
702	0.11
703	0.11
704	0.11
705	0.12
706	0.15
707	0.19
708	0.22
709	0.25
710	0.32
711	0.35
712	0.36
713	0.39
714	0.37
715	0.37
716	0.42
717	0.43
718	0.4
719	0.44
720	0.49
721	0.51
722	0.6
723	0.56
724	0.5
725	0.46
726	0.44
727	0.38
728	0.35
729	0.31
730	0.24
731	0.24
732	0.22
733	0.2
734	0.2
735	0.19
736	0.17
737	0.16
738	0.15
739	0.14
740	0.17
741	0.19
742	0.17
743	0.18
744	0.18
745	0.19
746	0.21
747	0.21
748	0.24
749	0.27
750	0.28
751	0.29
752	0.31
753	0.31
754	0.34
755	0.38
756	0.36
757	0.31
758	0.3
759	0.28
760	0.26
761	0.24
762	0.17
763	0.13
764	0.09
765	0.08

A0A0K3CLD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer