Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238FDW9

Protein Details
Accession A0A238FDW9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
485-507IVKARSASQRKAHKVRRAFREQVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
484-502PIVKARSASQRKAHKVRRA
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9, cyto 5.5, mito 5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR041588  Integrase_H2C2  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
Pfam View protein in Pfam  
PF17921  Integrase_H2C2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MEDDLLYLNDKGRMRLCVPFGHVQKRSMRELVLQHGHTVLGHAGTYRLVGWLQDKFYWPGMAVEAKKFGMTCPSCQACKPPHNTPMGLLHSLPVPDTPYENIHLDFQGPFPSARDVNGARVDYLLNAIDRLTGEVIMIPCNQTALTAEKTAKLFIAFVYPRWGIPQEITMDNDKVFRAAFWQNMWQLLGTTLSFSTSYHPQTNGKIERVHRDMNAAMRQLVTEEQTNWPQVVPFVEFAINSGRSSASGFSPFELSRFRTPQAMPSNLRYKGNTKNLASFVQETNLRVQQARDVIARTKVYQTITANKKRRADNEPQGTAGDKDVSPIGKYFWVSTKNLITAPFRARKWCPLFMGPYKCLTYNSNSSTYVLDIPTRLLSRRISPRFHASQLQQHRESDEALWPMRIVNTVPIFPIDSLEMSITKVISHITVVTDPQAPIHKFLVEDSATKSKWFIEETHDDFNEDLPAVQTYLRKRHVNKVRELPIVKARSASQRKAHKVRRAFREQVAMKATREKLQQLAELADYKASILRTTGELIDFTGLANQTGLGTLLHKGKRETRLVGGHHVVKQFKSVWSDDQSESGATDNFERMAIDQSVPRM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.37
4 0.37
5 0.41
6 0.46
7 0.51
8 0.55
9 0.56
10 0.56
11 0.6
12 0.61
13 0.61
14 0.55
15 0.5
16 0.46
17 0.48
18 0.51
19 0.5
20 0.46
21 0.41
22 0.38
23 0.36
24 0.3
25 0.26
26 0.18
27 0.11
28 0.1
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.1
37 0.13
38 0.17
39 0.2
40 0.21
41 0.24
42 0.26
43 0.28
44 0.27
45 0.24
46 0.21
47 0.21
48 0.25
49 0.25
50 0.25
51 0.26
52 0.25
53 0.25
54 0.24
55 0.22
56 0.25
57 0.25
58 0.26
59 0.32
60 0.36
61 0.37
62 0.39
63 0.46
64 0.44
65 0.51
66 0.55
67 0.54
68 0.57
69 0.61
70 0.6
71 0.56
72 0.55
73 0.51
74 0.46
75 0.37
76 0.3
77 0.27
78 0.26
79 0.23
80 0.16
81 0.13
82 0.12
83 0.14
84 0.15
85 0.16
86 0.19
87 0.21
88 0.21
89 0.2
90 0.2
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.16
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.18
99 0.17
100 0.17
101 0.22
102 0.2
103 0.24
104 0.29
105 0.28
106 0.24
107 0.24
108 0.23
109 0.18
110 0.18
111 0.14
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.1
118 0.09
119 0.07
120 0.07
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.08
130 0.09
131 0.12
132 0.13
133 0.16
134 0.17
135 0.2
136 0.21
137 0.21
138 0.2
139 0.16
140 0.14
141 0.11
142 0.18
143 0.16
144 0.16
145 0.21
146 0.21
147 0.2
148 0.22
149 0.23
150 0.16
151 0.16
152 0.19
153 0.17
154 0.18
155 0.2
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.2
160 0.17
161 0.14
162 0.12
163 0.1
164 0.12
165 0.14
166 0.15
167 0.16
168 0.21
169 0.21
170 0.22
171 0.22
172 0.18
173 0.15
174 0.14
175 0.13
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.1
183 0.14
184 0.18
185 0.19
186 0.22
187 0.23
188 0.27
189 0.35
190 0.36
191 0.34
192 0.36
193 0.37
194 0.42
195 0.44
196 0.44
197 0.35
198 0.34
199 0.33
200 0.33
201 0.33
202 0.26
203 0.22
204 0.19
205 0.19
206 0.17
207 0.16
208 0.12
209 0.1
210 0.11
211 0.13
212 0.15
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.08
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.14
238 0.13
239 0.14
240 0.15
241 0.17
242 0.19
243 0.22
244 0.22
245 0.23
246 0.24
247 0.3
248 0.34
249 0.37
250 0.34
251 0.37
252 0.43
253 0.41
254 0.42
255 0.36
256 0.34
257 0.37
258 0.43
259 0.44
260 0.38
261 0.4
262 0.41
263 0.4
264 0.37
265 0.31
266 0.23
267 0.2
268 0.2
269 0.16
270 0.17
271 0.18
272 0.17
273 0.15
274 0.14
275 0.15
276 0.15
277 0.16
278 0.14
279 0.14
280 0.15
281 0.18
282 0.19
283 0.17
284 0.17
285 0.18
286 0.17
287 0.19
288 0.19
289 0.25
290 0.33
291 0.41
292 0.46
293 0.49
294 0.54
295 0.54
296 0.58
297 0.56
298 0.57
299 0.57
300 0.58
301 0.54
302 0.49
303 0.46
304 0.41
305 0.34
306 0.26
307 0.17
308 0.09
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.13
319 0.16
320 0.17
321 0.19
322 0.2
323 0.2
324 0.2
325 0.21
326 0.19
327 0.2
328 0.26
329 0.29
330 0.28
331 0.32
332 0.33
333 0.4
334 0.44
335 0.43
336 0.4
337 0.37
338 0.43
339 0.45
340 0.49
341 0.41
342 0.39
343 0.36
344 0.33
345 0.32
346 0.28
347 0.25
348 0.25
349 0.27
350 0.27
351 0.27
352 0.27
353 0.26
354 0.25
355 0.22
356 0.16
357 0.13
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.14
364 0.15
365 0.21
366 0.31
367 0.36
368 0.37
369 0.4
370 0.46
371 0.47
372 0.49
373 0.47
374 0.4
375 0.44
376 0.5
377 0.53
378 0.48
379 0.44
380 0.43
381 0.38
382 0.36
383 0.28
384 0.23
385 0.18
386 0.17
387 0.16
388 0.15
389 0.15
390 0.14
391 0.13
392 0.1
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.14
398 0.14
399 0.13
400 0.14
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.12
420 0.12
421 0.14
422 0.2
423 0.19
424 0.21
425 0.22
426 0.21
427 0.19
428 0.2
429 0.23
430 0.18
431 0.18
432 0.2
433 0.25
434 0.24
435 0.24
436 0.24
437 0.2
438 0.21
439 0.22
440 0.19
441 0.2
442 0.27
443 0.31
444 0.37
445 0.36
446 0.34
447 0.32
448 0.31
449 0.25
450 0.18
451 0.14
452 0.08
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.14
457 0.18
458 0.26
459 0.33
460 0.39
461 0.43
462 0.53
463 0.61
464 0.65
465 0.68
466 0.7
467 0.71
468 0.72
469 0.69
470 0.64
471 0.63
472 0.58
473 0.5
474 0.42
475 0.37
476 0.4
477 0.46
478 0.48
479 0.48
480 0.55
481 0.64
482 0.73
483 0.79
484 0.78
485 0.8
486 0.82
487 0.84
488 0.83
489 0.79
490 0.73
491 0.74
492 0.67
493 0.63
494 0.6
495 0.53
496 0.45
497 0.48
498 0.46
499 0.4
500 0.42
501 0.38
502 0.37
503 0.37
504 0.38
505 0.32
506 0.32
507 0.28
508 0.27
509 0.25
510 0.2
511 0.16
512 0.14
513 0.15
514 0.13
515 0.11
516 0.1
517 0.11
518 0.13
519 0.15
520 0.16
521 0.14
522 0.14
523 0.14
524 0.15
525 0.13
526 0.11
527 0.12
528 0.11
529 0.11
530 0.1
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.06
536 0.07
537 0.11
538 0.19
539 0.21
540 0.24
541 0.29
542 0.36
543 0.44
544 0.49
545 0.49
546 0.49
547 0.54
548 0.55
549 0.58
550 0.57
551 0.54
552 0.53
553 0.54
554 0.5
555 0.43
556 0.44
557 0.39
558 0.37
559 0.37
560 0.35
561 0.36
562 0.39
563 0.43
564 0.4
565 0.39
566 0.36
567 0.31
568 0.28
569 0.24
570 0.19
571 0.15
572 0.16
573 0.15
574 0.14
575 0.14
576 0.14
577 0.13
578 0.17
579 0.18
580 0.18