Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238F820

Protein Details
Accession A0A238F820    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
675-701STSTMNPAKRRYRRHPKPDPNAPVKPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
467-481GKKKSIMGGRRRRKP
683-691KRRYRRHPK
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 7, cyto 7, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR001660  SAM  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF00536  SAM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSSSSSSSSSSSSSLLPAGPAIGSGSSGSSGDRQDYFGTLAVVDSAGASATAPATATIPGDSSNNNCSNHGHHHTTVYPYHHSPVAVSASPATSSATAAASARAPAGSAVSAASAAVGDRSSILETTRSRPSLHDHGAALGPPPTLSNVGVSWINRYHQAMPRHASAATTTTAPASGGGTANPANHSAHAIVPNQSHAYSHLHHHHPAHPASSSSSSSASSSSHHTQYFNSGGAALSHLLHHPDQTVTSSASPHWNPHGAPAPYPTPVTPSLLSSSNTPSANQSSITHVESSALEVAPSTVSASAAGATAHSAASGLLHIPLAASTTTTTNAAAEHSISTLAQMHTHLWPTYPSSAISSGSTSLGPAASRLTAAPAMAAAPINSVHELLYSLQLLQYYDTFVEEGFDRLEALDDITEADFEAVGVRRGHRRLIQRHLASSKGMSNYNCPKLHPMGSMFPSGLRRCIGKKKSIMGGRRRRKPALITSAGYLPRSPPLALAGIPPSAPLVLPVALGHGENGTSPILPTLDPVKKDEVGKAEWVDQGVADRPKNVAASRSVSAADDFALTSKMGDEAEDGDDDHVGDISIATTLVEDNEMSSLTSSIVASRPSGGNKSRGVKRKSIAPALGSAPTSVTQTNRNVFYIHPTNSASVTRSTTASPTAVPINAVSTSTSASTSTMNPAKRRYRRHPKPDPNAPVKPPSAYVEFSTSIRAQLCSSKSFTEIARIVGERWQALPCSEKADLERRTVEAKEAYARDLELYQKSAEWREYDAYLREFRTKYPDSTIGPSTTTSGITEAETASSPNPSASGRESKVLLSGKGRGGRRSSTSTSTLQVADEGTPTSSARVGRRTSRRSLVKVDAREEASSDLDGDGEDVDGEGETDEDALLSSTNGNATVPGGKAEGFDKEQWDAVRVLANVHRRESELSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.15
4 0.13
5 0.13
6 0.11
7 0.1
8 0.09
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.12
17 0.13
18 0.16
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.2
23 0.21
24 0.19
25 0.18
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.1
30 0.08
31 0.07
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.06
41 0.07
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.15
50 0.22
51 0.27
52 0.28
53 0.29
54 0.3
55 0.34
56 0.41
57 0.45
58 0.43
59 0.39
60 0.42
61 0.44
62 0.47
63 0.46
64 0.42
65 0.41
66 0.37
67 0.38
68 0.36
69 0.33
70 0.29
71 0.28
72 0.29
73 0.23
74 0.22
75 0.2
76 0.19
77 0.19
78 0.19
79 0.16
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.11
89 0.11
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.14
112 0.17
113 0.22
114 0.29
115 0.3
116 0.3
117 0.31
118 0.38
119 0.41
120 0.43
121 0.43
122 0.36
123 0.36
124 0.36
125 0.35
126 0.29
127 0.21
128 0.16
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.11
136 0.13
137 0.16
138 0.16
139 0.18
140 0.19
141 0.2
142 0.21
143 0.24
144 0.28
145 0.32
146 0.38
147 0.41
148 0.43
149 0.44
150 0.43
151 0.4
152 0.34
153 0.29
154 0.25
155 0.19
156 0.16
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.15
174 0.14
175 0.15
176 0.18
177 0.19
178 0.2
179 0.2
180 0.22
181 0.22
182 0.21
183 0.18
184 0.17
185 0.2
186 0.19
187 0.24
188 0.3
189 0.32
190 0.36
191 0.39
192 0.42
193 0.44
194 0.44
195 0.4
196 0.33
197 0.31
198 0.3
199 0.3
200 0.26
201 0.21
202 0.2
203 0.19
204 0.18
205 0.18
206 0.15
207 0.13
208 0.18
209 0.21
210 0.24
211 0.25
212 0.25
213 0.25
214 0.3
215 0.3
216 0.25
217 0.2
218 0.16
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.1
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.13
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.14
238 0.2
239 0.2
240 0.21
241 0.22
242 0.24
243 0.23
244 0.27
245 0.34
246 0.28
247 0.28
248 0.3
249 0.28
250 0.27
251 0.28
252 0.23
253 0.18
254 0.19
255 0.21
256 0.18
257 0.17
258 0.18
259 0.2
260 0.21
261 0.19
262 0.21
263 0.23
264 0.22
265 0.21
266 0.21
267 0.22
268 0.22
269 0.21
270 0.18
271 0.19
272 0.21
273 0.22
274 0.19
275 0.17
276 0.17
277 0.16
278 0.16
279 0.13
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.06
326 0.07
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.13
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.13
341 0.13
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.12
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.05
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.03
407 0.03
408 0.05
409 0.04
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.14
414 0.15
415 0.18
416 0.22
417 0.3
418 0.35
419 0.43
420 0.5
421 0.47
422 0.51
423 0.49
424 0.45
425 0.37
426 0.31
427 0.26
428 0.2
429 0.21
430 0.17
431 0.22
432 0.27
433 0.34
434 0.33
435 0.3
436 0.31
437 0.31
438 0.33
439 0.28
440 0.24
441 0.21
442 0.22
443 0.22
444 0.19
445 0.18
446 0.2
447 0.19
448 0.18
449 0.14
450 0.14
451 0.17
452 0.27
453 0.29
454 0.32
455 0.35
456 0.37
457 0.43
458 0.48
459 0.52
460 0.53
461 0.6
462 0.63
463 0.68
464 0.7
465 0.65
466 0.62
467 0.6
468 0.57
469 0.55
470 0.5
471 0.42
472 0.37
473 0.4
474 0.37
475 0.32
476 0.24
477 0.16
478 0.13
479 0.14
480 0.12
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.05
502 0.04
503 0.04
504 0.04
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.12
514 0.15
515 0.16
516 0.18
517 0.2
518 0.22
519 0.23
520 0.25
521 0.21
522 0.2
523 0.21
524 0.2
525 0.2
526 0.18
527 0.17
528 0.14
529 0.11
530 0.11
531 0.13
532 0.15
533 0.13
534 0.13
535 0.13
536 0.15
537 0.16
538 0.16
539 0.14
540 0.14
541 0.17
542 0.17
543 0.18
544 0.17
545 0.16
546 0.15
547 0.13
548 0.11
549 0.07
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.06
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.07
568 0.05
569 0.04
570 0.04
571 0.03
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.04
579 0.04
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.05
584 0.04
585 0.05
586 0.05
587 0.05
588 0.06
589 0.05
590 0.06
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.1
595 0.11
596 0.13
597 0.18
598 0.19
599 0.23
600 0.27
601 0.35
602 0.4
603 0.48
604 0.51
605 0.52
606 0.51
607 0.55
608 0.56
609 0.54
610 0.49
611 0.41
612 0.39
613 0.35
614 0.35
615 0.26
616 0.2
617 0.15
618 0.13
619 0.14
620 0.12
621 0.11
622 0.15
623 0.19
624 0.23
625 0.24
626 0.25
627 0.24
628 0.23
629 0.29
630 0.31
631 0.28
632 0.27
633 0.26
634 0.26
635 0.27
636 0.28
637 0.22
638 0.18
639 0.18
640 0.17
641 0.17
642 0.16
643 0.16
644 0.17
645 0.16
646 0.14
647 0.13
648 0.14
649 0.13
650 0.12
651 0.11
652 0.11
653 0.11
654 0.11
655 0.09
656 0.08
657 0.09
658 0.09
659 0.1
660 0.08
661 0.09
662 0.1
663 0.1
664 0.16
665 0.21
666 0.25
667 0.28
668 0.36
669 0.45
670 0.52
671 0.61
672 0.66
673 0.72
674 0.79
675 0.86
676 0.89
677 0.9
678 0.92
679 0.93
680 0.92
681 0.89
682 0.85
683 0.78
684 0.72
685 0.63
686 0.54
687 0.45
688 0.39
689 0.34
690 0.29
691 0.26
692 0.25
693 0.24
694 0.24
695 0.25
696 0.22
697 0.21
698 0.2
699 0.19
700 0.16
701 0.21
702 0.23
703 0.23
704 0.25
705 0.23
706 0.24
707 0.25
708 0.24
709 0.26
710 0.24
711 0.22
712 0.23
713 0.22
714 0.22
715 0.23
716 0.25
717 0.18
718 0.18
719 0.18
720 0.16
721 0.16
722 0.2
723 0.16
724 0.2
725 0.2
726 0.2
727 0.23
728 0.31
729 0.33
730 0.34
731 0.35
732 0.31
733 0.34
734 0.33
735 0.32
736 0.26
737 0.25
738 0.27
739 0.26
740 0.25
741 0.23
742 0.22
743 0.2
744 0.19
745 0.22
746 0.17
747 0.18
748 0.17
749 0.18
750 0.21
751 0.23
752 0.24
753 0.21
754 0.23
755 0.23
756 0.24
757 0.26
758 0.27
759 0.28
760 0.29
761 0.3
762 0.33
763 0.32
764 0.32
765 0.37
766 0.37
767 0.36
768 0.39
769 0.42
770 0.39
771 0.43
772 0.45
773 0.38
774 0.35
775 0.33
776 0.28
777 0.23
778 0.2
779 0.16
780 0.13
781 0.13
782 0.12
783 0.12
784 0.1
785 0.1
786 0.1
787 0.11
788 0.1
789 0.11
790 0.1
791 0.1
792 0.11
793 0.1
794 0.13
795 0.17
796 0.25
797 0.25
798 0.28
799 0.29
800 0.28
801 0.34
802 0.34
803 0.31
804 0.26
805 0.3
806 0.33
807 0.38
808 0.41
809 0.4
810 0.42
811 0.45
812 0.47
813 0.49
814 0.48
815 0.47
816 0.48
817 0.45
818 0.43
819 0.41
820 0.35
821 0.28
822 0.24
823 0.2
824 0.16
825 0.15
826 0.13
827 0.11
828 0.12
829 0.12
830 0.12
831 0.13
832 0.17
833 0.21
834 0.27
835 0.32
836 0.41
837 0.51
838 0.56
839 0.61
840 0.67
841 0.71
842 0.69
843 0.72
844 0.72
845 0.7
846 0.7
847 0.65
848 0.61
849 0.56
850 0.5
851 0.44
852 0.36
853 0.29
854 0.23
855 0.2
856 0.14
857 0.11
858 0.11
859 0.1
860 0.08
861 0.06
862 0.06
863 0.05
864 0.05
865 0.05
866 0.05
867 0.05
868 0.05
869 0.05
870 0.05
871 0.05
872 0.04
873 0.05
874 0.05
875 0.05
876 0.05
877 0.06
878 0.06
879 0.07
880 0.08
881 0.07
882 0.08
883 0.09
884 0.12
885 0.12
886 0.13
887 0.13
888 0.13
889 0.14
890 0.16
891 0.19
892 0.2
893 0.22
894 0.24
895 0.25
896 0.28
897 0.27
898 0.29
899 0.24
900 0.21
901 0.24
902 0.21
903 0.23
904 0.26
905 0.33
906 0.34
907 0.37
908 0.38
909 0.35