Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238FSL8

Protein Details
Accession A0A238FSL8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-63QVHPARPHSWRNSRCTRRIHRIARSSSTPHydrophilic
405-424QEEKPKVTSGFKKRKMHGANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-356REKKRIKEEMEEQRKRAK
414-429GFKKRKMHGANAVRKK
Subcellular Location(s) mito 14.5, nucl 9.5, cyto_mito 9.333, cyto_nucl 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MTQDIRSALGFYHAVSPLGIIVSPPCKLVPFSLHQVHPARPHSWRNSRCTRRIHRIARSSSTPRAWPRTDVLPRLDTSYRTEYWISKDRYWCKYCSIYIADDKPSRIHHETGLKHKGNYERYIREIYKRGERDKRDKKEEAEEIARIEQAARIAMGPSALDLGEGTSSTPQASTSKPTAGPPDSFASYTTAADLGFKDEVTVVDPKVEALEKDKETRQTEGIIGQWQVVKKKKPQLTTAPTMANTTPGAIPPSPQWMQNLPGYSNGVKLENEVKGEKQDEQGTKQHEPEQDQPKAPRYLNEKAYTADDDDYDPNKVGPVKLKRKILTLKEQQEIDDREREKKRIKEEMEEQRKRAKLERGNGWSQVEVGDEGLLEFEDPPEAEDDVKQEHNQGGDVTKPSIAEEQEEKPKVTSGFKKRKMHGANAVRKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.17
4 0.14
5 0.14
6 0.13
7 0.07
8 0.1
9 0.13
10 0.14
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.17
15 0.2
16 0.23
17 0.26
18 0.34
19 0.4
20 0.4
21 0.46
22 0.49
23 0.5
24 0.52
25 0.51
26 0.46
27 0.46
28 0.55
29 0.57
30 0.64
31 0.67
32 0.68
33 0.74
34 0.8
35 0.81
36 0.83
37 0.83
38 0.83
39 0.86
40 0.87
41 0.86
42 0.85
43 0.84
44 0.8
45 0.79
46 0.74
47 0.71
48 0.65
49 0.62
50 0.6
51 0.61
52 0.57
53 0.53
54 0.5
55 0.53
56 0.56
57 0.54
58 0.51
59 0.47
60 0.45
61 0.47
62 0.44
63 0.36
64 0.35
65 0.36
66 0.32
67 0.31
68 0.33
69 0.3
70 0.35
71 0.42
72 0.41
73 0.41
74 0.49
75 0.54
76 0.61
77 0.62
78 0.57
79 0.54
80 0.54
81 0.49
82 0.46
83 0.42
84 0.37
85 0.4
86 0.41
87 0.42
88 0.39
89 0.39
90 0.36
91 0.35
92 0.38
93 0.35
94 0.33
95 0.32
96 0.38
97 0.42
98 0.49
99 0.56
100 0.51
101 0.48
102 0.51
103 0.53
104 0.5
105 0.51
106 0.5
107 0.43
108 0.45
109 0.51
110 0.49
111 0.47
112 0.49
113 0.46
114 0.48
115 0.51
116 0.55
117 0.57
118 0.63
119 0.69
120 0.72
121 0.78
122 0.77
123 0.76
124 0.71
125 0.71
126 0.67
127 0.62
128 0.54
129 0.46
130 0.39
131 0.34
132 0.3
133 0.22
134 0.17
135 0.12
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.08
159 0.09
160 0.13
161 0.14
162 0.17
163 0.18
164 0.19
165 0.24
166 0.24
167 0.24
168 0.23
169 0.23
170 0.22
171 0.21
172 0.2
173 0.18
174 0.16
175 0.15
176 0.13
177 0.1
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.06
196 0.09
197 0.14
198 0.15
199 0.18
200 0.2
201 0.25
202 0.26
203 0.28
204 0.25
205 0.22
206 0.21
207 0.19
208 0.18
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.17
215 0.21
216 0.24
217 0.29
218 0.38
219 0.42
220 0.44
221 0.49
222 0.54
223 0.56
224 0.57
225 0.55
226 0.48
227 0.43
228 0.41
229 0.34
230 0.26
231 0.19
232 0.14
233 0.11
234 0.09
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.1
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.18
243 0.17
244 0.2
245 0.22
246 0.23
247 0.17
248 0.18
249 0.2
250 0.18
251 0.18
252 0.16
253 0.15
254 0.13
255 0.14
256 0.17
257 0.15
258 0.17
259 0.16
260 0.16
261 0.18
262 0.19
263 0.19
264 0.19
265 0.24
266 0.24
267 0.27
268 0.32
269 0.34
270 0.35
271 0.36
272 0.38
273 0.35
274 0.38
275 0.42
276 0.46
277 0.46
278 0.48
279 0.49
280 0.49
281 0.51
282 0.47
283 0.44
284 0.42
285 0.44
286 0.47
287 0.47
288 0.42
289 0.38
290 0.4
291 0.36
292 0.31
293 0.24
294 0.18
295 0.17
296 0.19
297 0.19
298 0.17
299 0.16
300 0.14
301 0.15
302 0.16
303 0.16
304 0.21
305 0.31
306 0.39
307 0.46
308 0.54
309 0.54
310 0.6
311 0.67
312 0.66
313 0.66
314 0.66
315 0.66
316 0.63
317 0.62
318 0.55
319 0.54
320 0.51
321 0.44
322 0.42
323 0.37
324 0.42
325 0.46
326 0.52
327 0.53
328 0.55
329 0.6
330 0.62
331 0.64
332 0.63
333 0.68
334 0.72
335 0.75
336 0.74
337 0.69
338 0.67
339 0.67
340 0.61
341 0.59
342 0.57
343 0.54
344 0.57
345 0.64
346 0.63
347 0.64
348 0.65
349 0.59
350 0.5
351 0.42
352 0.33
353 0.24
354 0.17
355 0.13
356 0.09
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.13
372 0.16
373 0.19
374 0.19
375 0.2
376 0.22
377 0.22
378 0.22
379 0.21
380 0.19
381 0.2
382 0.22
383 0.21
384 0.2
385 0.19
386 0.2
387 0.23
388 0.21
389 0.22
390 0.24
391 0.28
392 0.37
393 0.4
394 0.39
395 0.36
396 0.39
397 0.38
398 0.42
399 0.46
400 0.48
401 0.56
402 0.65
403 0.73
404 0.74
405 0.81
406 0.8
407 0.79
408 0.79
409 0.78