FuNGI

A0A238FGE9

Protein Details

Accession

A0A238FGE9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
259-280	HSRGFRGCPLRNKKKEPSDSSA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 9, nucl 5.5, pero 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MNLRADGSWEVILQSVDCLVTSYKASLVSQSAQPASASSTLPATSGLSGLSDESPSTRASSTSLSAVQIADLVFTSRERVETKNAIACKFTANSISEEQMAHCDHLTSAKDMWDTSKAIHTKGRSSRTMELLSILTAPFTGDIPFKVFVNKIKIAMVEFRTLGAPLPQWLFAGMLVRSLPSQYDSIVASLATEVNVVMDWEEFLPKLLMSIEMAQTRNANHSLAARMEVDDNPLVARITGTGPRDYSQVLCTRCKVIGHSRGFRGCPLRNKKKEPSDSSANVAAVGVDESALPGFRLIYPGAPPQFPWIVDSGAHVHCVGDKSVLSNFIEAPLRISTANESKVLSSGHGSVTSFTSFGCRVEIGKGMKYVVGPKNELIFSIASTPVLRTRPGPGFLLDAIHKVPGAPVTMVAATREHGSCTLMAAHRKLGHQSTESILQMVKSGAVTGLTLKDEKVLPCFSCIRAKSKRSPFSMISAEAPHTLYRVFIELGFVETPDRQGNTIYLAIVDQYSTCKWTQVLKDKKAETIIATWRVRSDNGKEFDNAWFRAYLQKQGIIVEITALYTPEQNGQVERLNGSLMGLVRAMLFDSGLPSSFWSDALSVATFVLNRRPHPRIPNKTAFELIAFVHVPNERRTKLAPRATQGVFIGYASEYNYRVWVASEKKVSTSRHITCVDAPEQSLVTGSPSPLPSAFASTPPPPAFASTGPILDEGGDVGDVPRDDENGPSDDDNPPAHNSEAIVPREGYAVVRVGPNPGRYENVDAANVLPEGSRRRPPPTEVPPVVAAIMAFVLDSPPMFEDKLSYDIYCAAVFNDEDIEIPKKFEEEAMKSPYRNHWVAAMASELLQFDHHGVFQEETWHEGIRVLGTIWVYSIKRDATGKIIRFKARLVAQGFAQRPGSTIMTPTLLLHLEQFDFDCAFLNGKMTEDVYVRYPKGWTGPQTPCKYLMLVGSMYGTKQAPREWYRAINDLMVARGYMRATADACLYIKHSGSSFAIITLYVDDGLIASNDQSFLDAELSSLHEVFKLKRLGPVSYFLGFEIHRTADYILVHQSKYIRTMLEKFDFASPSKRRAFTPMDDRPSLRIDNTPFPDVSMYQSANSCPTVDDWAAVKRIFRYLNSTVDWGIMYRNNSTTRVMVYSDASFADDPESRRSSKQQSLVATSTTEAEILSASSATREAIWLRRLVGDVGIPQSGPTVIQEDNAACIQIAKDPVDHVRTKHFDIAHLFVRERVASGEVELEYCPTHVNAADLMTKGLEPQRFDQLRALLGMVSLVSLTGGSVRSRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.09
3	0.08
4	0.08
5	0.09
6	0.09
7	0.1
8	0.12
9	0.12
10	0.13
11	0.15
12	0.16
13	0.17
14	0.2
15	0.22
16	0.24
17	0.28
18	0.27
19	0.26
20	0.25
21	0.23
22	0.22
23	0.21
24	0.19
25	0.15
26	0.16
27	0.15
28	0.16
29	0.16
30	0.14
31	0.12
32	0.11
33	0.1
34	0.09
35	0.09
36	0.1
37	0.11
38	0.1
39	0.1
40	0.11
41	0.12
42	0.13
43	0.15
44	0.14
45	0.13
46	0.15
47	0.18
48	0.19
49	0.21
50	0.22
51	0.2
52	0.21
53	0.2
54	0.18
55	0.16
56	0.14
57	0.1
58	0.09
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.12
63	0.11
64	0.15
65	0.17
66	0.2
67	0.27
68	0.32
69	0.37
70	0.4
71	0.44
72	0.42
73	0.41
74	0.38
75	0.36
76	0.31
77	0.28
78	0.26
79	0.24
80	0.26
81	0.27
82	0.28
83	0.25
84	0.24
85	0.23
86	0.23
87	0.22
88	0.19
89	0.17
90	0.16
91	0.15
92	0.2
93	0.21
94	0.19
95	0.19
96	0.21
97	0.22
98	0.22
99	0.25
100	0.23
101	0.22
102	0.21
103	0.28
104	0.27
105	0.29
106	0.34
107	0.34
108	0.39
109	0.47
110	0.52
111	0.49
112	0.53
113	0.56
114	0.57
115	0.57
116	0.48
117	0.42
118	0.35
119	0.3
120	0.25
121	0.19
122	0.13
123	0.1
124	0.09
125	0.08
126	0.07
127	0.08
128	0.08
129	0.1
130	0.13
131	0.14
132	0.14
133	0.17
134	0.19
135	0.24
136	0.3
137	0.32
138	0.3
139	0.31
140	0.31
141	0.3
142	0.34
143	0.31
144	0.27
145	0.24
146	0.24
147	0.23
148	0.22
149	0.2
150	0.16
151	0.14
152	0.14
153	0.15
154	0.15
155	0.14
156	0.14
157	0.14
158	0.12
159	0.15
160	0.12
161	0.12
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.12
171	0.12
172	0.12
173	0.12
174	0.11
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.07
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.06
188	0.07
189	0.07
190	0.08
191	0.09
192	0.08
193	0.09
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.12
198	0.14
199	0.18
200	0.19
201	0.19
202	0.2
203	0.21
204	0.23
205	0.22
206	0.19
207	0.16
208	0.18
209	0.2
210	0.19
211	0.21
212	0.17
213	0.17
214	0.18
215	0.17
216	0.18
217	0.16
218	0.15
219	0.13
220	0.13
221	0.12
222	0.1
223	0.09
224	0.07
225	0.1
226	0.14
227	0.16
228	0.18
229	0.19
230	0.2
231	0.22
232	0.21
233	0.2
234	0.2
235	0.24
236	0.26
237	0.28
238	0.29
239	0.3
240	0.31
241	0.31
242	0.32
243	0.35
244	0.41
245	0.46
246	0.5
247	0.53
248	0.56
249	0.56
250	0.55
251	0.54
252	0.5
253	0.53
254	0.58
255	0.63
256	0.68
257	0.75
258	0.8
259	0.82
260	0.86
261	0.83
262	0.79
263	0.77
264	0.71
265	0.66
266	0.6
267	0.49
268	0.39
269	0.31
270	0.23
271	0.14
272	0.12
273	0.07
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.12
287	0.18
288	0.2
289	0.2
290	0.2
291	0.22
292	0.24
293	0.23
294	0.21
295	0.17
296	0.16
297	0.16
298	0.17
299	0.17
300	0.16
301	0.16
302	0.15
303	0.13
304	0.14
305	0.15
306	0.14
307	0.11
308	0.11
309	0.12
310	0.13
311	0.16
312	0.14
313	0.14
314	0.13
315	0.15
316	0.16
317	0.14
318	0.16
319	0.14
320	0.14
321	0.13
322	0.14
323	0.15
324	0.18
325	0.2
326	0.19
327	0.19
328	0.18
329	0.2
330	0.2
331	0.16
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.13
339	0.13
340	0.11
341	0.1
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.1
347	0.11
348	0.12
349	0.18
350	0.17
351	0.19
352	0.2
353	0.19
354	0.19
355	0.19
356	0.26
357	0.25
358	0.26
359	0.26
360	0.26
361	0.29
362	0.28
363	0.27
364	0.21
365	0.16
366	0.13
367	0.14
368	0.13
369	0.1
370	0.1
371	0.11
372	0.13
373	0.14
374	0.15
375	0.14
376	0.19
377	0.22
378	0.24
379	0.25
380	0.22
381	0.22
382	0.22
383	0.23
384	0.18
385	0.16
386	0.14
387	0.13
388	0.11
389	0.09
390	0.09
391	0.08
392	0.09
393	0.08
394	0.07
395	0.08
396	0.09
397	0.09
398	0.09
399	0.08
400	0.08
401	0.1
402	0.1
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.09
407	0.1
408	0.13
409	0.14
410	0.17
411	0.17
412	0.2
413	0.22
414	0.23
415	0.25
416	0.24
417	0.24
418	0.23
419	0.23
420	0.22
421	0.23
422	0.22
423	0.19
424	0.17
425	0.14
426	0.13
427	0.12
428	0.1
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.06
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.1
440	0.12
441	0.12
442	0.15
443	0.16
444	0.16
445	0.19
446	0.21
447	0.21
448	0.26
449	0.27
450	0.32
451	0.38
452	0.43
453	0.5
454	0.58
455	0.63
456	0.61
457	0.64
458	0.58
459	0.55
460	0.52
461	0.44
462	0.36
463	0.29
464	0.26
465	0.21
466	0.2
467	0.15
468	0.12
469	0.1
470	0.09
471	0.08
472	0.08
473	0.08
474	0.07
475	0.08
476	0.07
477	0.09
478	0.09
479	0.09
480	0.08
481	0.08
482	0.09
483	0.1
484	0.1
485	0.09
486	0.09
487	0.09
488	0.11
489	0.11
490	0.1
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.07
495	0.07
496	0.04
497	0.06
498	0.06
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.1
503	0.16
504	0.23
505	0.31
506	0.41
507	0.45
508	0.51
509	0.52
510	0.52
511	0.49
512	0.42
513	0.33
514	0.28
515	0.27
516	0.28
517	0.27
518	0.26
519	0.25
520	0.26
521	0.26
522	0.24
523	0.25
524	0.26
525	0.28
526	0.29
527	0.28
528	0.29
529	0.32
530	0.33
531	0.28
532	0.21
533	0.19
534	0.17
535	0.24
536	0.23
537	0.24
538	0.2
539	0.22
540	0.21
541	0.21
542	0.22
543	0.15
544	0.14
545	0.09
546	0.08
547	0.06
548	0.06
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.07
554	0.08
555	0.08
556	0.09
557	0.1
558	0.12
559	0.12
560	0.12
561	0.1
562	0.09
563	0.09
564	0.08
565	0.08
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.04
574	0.04
575	0.03
576	0.04
577	0.04
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.07
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.06
590	0.06
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.12
595	0.13
596	0.16
597	0.21
598	0.25
599	0.29
600	0.39
601	0.49
602	0.51
603	0.58
604	0.64
605	0.61
606	0.59
607	0.56
608	0.46
609	0.36
610	0.28
611	0.2
612	0.13
613	0.1
614	0.08
615	0.09
616	0.1
617	0.12
618	0.15
619	0.19
620	0.18
621	0.19
622	0.21
623	0.27
624	0.34
625	0.4
626	0.39
627	0.37
628	0.42
629	0.41
630	0.41
631	0.34
632	0.26
633	0.18
634	0.15
635	0.13
636	0.07
637	0.07
638	0.06
639	0.07
640	0.07
641	0.07
642	0.08
643	0.07
644	0.07
645	0.08
646	0.12
647	0.14
648	0.17
649	0.2
650	0.2
651	0.22
652	0.28
653	0.29
654	0.29
655	0.34
656	0.32
657	0.35
658	0.36
659	0.34
660	0.31
661	0.33
662	0.29
663	0.21
664	0.2
665	0.14
666	0.13
667	0.11
668	0.1
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.08
674	0.08
675	0.09
676	0.09
677	0.11
678	0.09
679	0.13
680	0.13
681	0.12
682	0.15
683	0.16
684	0.2
685	0.18
686	0.2
687	0.16
688	0.17
689	0.17
690	0.14
691	0.16
692	0.12
693	0.13
694	0.11
695	0.11
696	0.1
697	0.08
698	0.08
699	0.05
700	0.04
701	0.03
702	0.03
703	0.03
704	0.04
705	0.04
706	0.05
707	0.05
708	0.06
709	0.07
710	0.08
711	0.1
712	0.1
713	0.11
714	0.11
715	0.12
716	0.12
717	0.14
718	0.14
719	0.13
720	0.13
721	0.14
722	0.13
723	0.12
724	0.11
725	0.14
726	0.2
727	0.19
728	0.19
729	0.17
730	0.18
731	0.18
732	0.17
733	0.13
734	0.08
735	0.08
736	0.07
737	0.08
738	0.08
739	0.11
740	0.13
741	0.15
742	0.16
743	0.16
744	0.17
745	0.18
746	0.22
747	0.21
748	0.2
749	0.18
750	0.16
751	0.16
752	0.15
753	0.13
754	0.09
755	0.06
756	0.07
757	0.11
758	0.15
759	0.2
760	0.22
761	0.27
762	0.3
763	0.35
764	0.42
765	0.46
766	0.52
767	0.48
768	0.48
769	0.43
770	0.41
771	0.36
772	0.26
773	0.18
774	0.08
775	0.07
776	0.04
777	0.03
778	0.03
779	0.03
780	0.03
781	0.03
782	0.03
783	0.04
784	0.05
785	0.05
786	0.05
787	0.07
788	0.08
789	0.12
790	0.12
791	0.12
792	0.11
793	0.12
794	0.13
795	0.12
796	0.1
797	0.07
798	0.08
799	0.07
800	0.07
801	0.07
802	0.06
803	0.06
804	0.08
805	0.1
806	0.09
807	0.1
808	0.1
809	0.1
810	0.1
811	0.13
812	0.16
813	0.19
814	0.24
815	0.3
816	0.32
817	0.32
818	0.35
819	0.37
820	0.38
821	0.34
822	0.29
823	0.24
824	0.24
825	0.24
826	0.22
827	0.18
828	0.12
829	0.11
830	0.11
831	0.09
832	0.07
833	0.06
834	0.06
835	0.06
836	0.07
837	0.06
838	0.07
839	0.08
840	0.09
841	0.09
842	0.13
843	0.12
844	0.14
845	0.15
846	0.14
847	0.13
848	0.13
849	0.13
850	0.09
851	0.09
852	0.07
853	0.07
854	0.07
855	0.07
856	0.07
857	0.1
858	0.1
859	0.1
860	0.12
861	0.11
862	0.13
863	0.15
864	0.15
865	0.2
866	0.27
867	0.31
868	0.35
869	0.4
870	0.41
871	0.41
872	0.41
873	0.39
874	0.35
875	0.38
876	0.32
877	0.28
878	0.27
879	0.34
880	0.34
881	0.3
882	0.28
883	0.21
884	0.2
885	0.22
886	0.21
887	0.14
888	0.14
889	0.13
890	0.13
891	0.14
892	0.13
893	0.12
894	0.1
895	0.1
896	0.1
897	0.1
898	0.09
899	0.09
900	0.09
901	0.09
902	0.09
903	0.08
904	0.09
905	0.08
906	0.09
907	0.08
908	0.1
909	0.09
910	0.09
911	0.1
912	0.09
913	0.11
914	0.1
915	0.12
916	0.14
917	0.18
918	0.17
919	0.18
920	0.18
921	0.17
922	0.21
923	0.25
924	0.26
925	0.3
926	0.39
927	0.47
928	0.51
929	0.52
930	0.5
931	0.46
932	0.42
933	0.35
934	0.27
935	0.21
936	0.16
937	0.14
938	0.13
939	0.12
940	0.12
941	0.12
942	0.11
943	0.1
944	0.12
945	0.15
946	0.22
947	0.26
948	0.31
949	0.32
950	0.38
951	0.4
952	0.42
953	0.41
954	0.33
955	0.3
956	0.26
957	0.23
958	0.17
959	0.14
960	0.09
961	0.1
962	0.09
963	0.09
964	0.09
965	0.09
966	0.1
967	0.11
968	0.11
969	0.11
970	0.11
971	0.11
972	0.13
973	0.13
974	0.12
975	0.13
976	0.12
977	0.13
978	0.14
979	0.16
980	0.14
981	0.12
982	0.12
983	0.11
984	0.11
985	0.09
986	0.08
987	0.06
988	0.06
989	0.05
990	0.05
991	0.05
992	0.05
993	0.04
994	0.04
995	0.05
996	0.05
997	0.05
998	0.06
999	0.06
1000	0.07
1001	0.08
1002	0.07
1003	0.07
1004	0.08
1005	0.1
1006	0.1
1007	0.1
1008	0.09
1009	0.1
1010	0.12
1011	0.13
1012	0.2
1013	0.23
1014	0.23
1015	0.27
1016	0.3
1017	0.31
1018	0.32
1019	0.35
1020	0.32
1021	0.28
1022	0.28
1023	0.23
1024	0.23
1025	0.2
1026	0.19
1027	0.17
1028	0.14
1029	0.12
1030	0.13
1031	0.13
1032	0.14
1033	0.15
1034	0.15
1035	0.19
1036	0.21
1037	0.21
1038	0.22
1039	0.24
1040	0.22
1041	0.25
1042	0.25
1043	0.2
1044	0.22
1045	0.27
1046	0.32
1047	0.33
1048	0.33
1049	0.31
1050	0.33
1051	0.33
1052	0.31
1053	0.36
1054	0.32
1055	0.37
1056	0.43
1057	0.43
1058	0.4
1059	0.45
1060	0.5
1061	0.48
1062	0.55
1063	0.56
1064	0.57
1065	0.58
1066	0.57
1067	0.53
1068	0.51
1069	0.45
1070	0.36
1071	0.33
1072	0.31
1073	0.37
1074	0.4
1075	0.4
1076	0.35
1077	0.34
1078	0.35
1079	0.29
1080	0.29
1081	0.25
1082	0.21
1083	0.2
1084	0.21
1085	0.21
1086	0.22
1087	0.22
1088	0.18
1089	0.14
1090	0.14
1091	0.18
1092	0.17
1093	0.17
1094	0.17
1095	0.2
1096	0.23
1097	0.23
1098	0.23
1099	0.2
1100	0.26
1101	0.27
1102	0.26
1103	0.3
1104	0.31
1105	0.36
1106	0.36
1107	0.36
1108	0.31
1109	0.29
1110	0.28
1111	0.2
1112	0.19
1113	0.17
1114	0.17
1115	0.18
1116	0.22
1117	0.24
1118	0.26
1119	0.28
1120	0.26
1121	0.25
1122	0.25
1123	0.24
1124	0.21
1125	0.21
1126	0.2
1127	0.19
1128	0.17
1129	0.17
1130	0.15
1131	0.14
1132	0.16
1133	0.17
1134	0.18
1135	0.24
1136	0.27
1137	0.28
1138	0.32
1139	0.38
1140	0.43
1141	0.48
1142	0.53
1143	0.52
1144	0.54
1145	0.58
1146	0.56
1147	0.5
1148	0.42
1149	0.35
1150	0.29
1151	0.23
1152	0.18
1153	0.11
1154	0.09
1155	0.08
1156	0.07
1157	0.07
1158	0.06
1159	0.06
1160	0.06
1161	0.07
1162	0.07
1163	0.07
1164	0.09
1165	0.12
1166	0.18
1167	0.21
1168	0.23
1169	0.24
1170	0.25
1171	0.27
1172	0.25
1173	0.24
1174	0.19
1175	0.19
1176	0.19
1177	0.18
1178	0.16
1179	0.15
1180	0.15
1181	0.13
1182	0.12
1183	0.1
1184	0.11
1185	0.1
1186	0.11
1187	0.14
1188	0.13
1189	0.16
1190	0.16
1191	0.15
1192	0.11
1193	0.12
1194	0.12
1195	0.14
1196	0.16
1197	0.15
1198	0.16
1199	0.18
1200	0.24
1201	0.29
1202	0.32
1203	0.31
1204	0.37
1205	0.41
1206	0.45
1207	0.48
1208	0.43
1209	0.42
1210	0.44
1211	0.47
1212	0.44
1213	0.43
1214	0.39
1215	0.35
1216	0.37
1217	0.32
1218	0.28
1219	0.24
1220	0.19
1221	0.16
1222	0.16
1223	0.18
1224	0.15
1225	0.15
1226	0.15
1227	0.14
1228	0.12
1229	0.12
1230	0.13
1231	0.09
1232	0.11
1233	0.1
1234	0.12
1235	0.12
1236	0.14
1237	0.17
1238	0.16
1239	0.17
1240	0.16
1241	0.15
1242	0.17
1243	0.22
1244	0.23
1245	0.23
1246	0.26
1247	0.36
1248	0.38
1249	0.4
1250	0.42
1251	0.39
1252	0.38
1253	0.35
1254	0.32
1255	0.21
1256	0.2
1257	0.18
1258	0.11
1259	0.09
1260	0.06
1261	0.05
1262	0.04
1263	0.04
1264	0.04
1265	0.06
1266	0.08

A0A238FGE9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer