FuNGI

A0A238F9U3

Protein Details

Accession

A0A238F9U3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
721-743	NEEAKKKWYNQPRSNHPRPSNKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 8.5, cyto_nucl 7.5, nucl 5.5, mito 5, plas 4, extr 1, pero 1, E.R. 1, golg 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00303 retropepsin_like cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MLLLHMDEELSQGLRLSNVIKGMGLSPDELDASILKADVTPTQPDFDYQTFDTEARRIWQVISATRALVKATAQASTRFGRPPPMTNTVKPPRTSTSLSASSPSKIRPPPMTDCERAFLKSNRGCFKCRKINAGHMSDGCTNWATSACKVPAGWQQGPVSPDQLVSITNANANIEDEGKQLHCLDNDKYDNGTDDERCEPISLSVKLTTDDGPVLQALVDMGASASFIADKEVDKLRLTRRKLQVPTSVSVAIQNHKVLHPVTEFVCVPLCTSNGRWSTHHVVLKIAPLMSLRVVLGCPFLKRHNILVDCKQHQVLAPDPSLSGERIDLMDEPEKEKWSEGAVRASIRACLAHLKEQQAEESRLRALESAFRKEFSDRFPADIPPVLQYKLKVRHHIALKPGMKTPRQPTYGTPMRWCTAWRRLLDQHLAAGRLCLSLSEYSLPAFIIPKKGMDMDLSIMPRWVNNYWILNAATVPDRTPLPLPDEILSVSARACFWSKIDMTNSFFQTKMAKEDIPKTAVATPWGLFEWVVMPMGLSNAPATHQHRVNEALLNLIGKSCFVYLDDITIFSNTIEEHQTHVREVLKALRWADLYCSPKMTELFMTLCDFLGHVISQNGIAADQSKVDRIMEWPRPRTVTELRGFLGLVQYLRKFINGLAQHTKPLSDLTSKNANVQLMWGPINHTELADPLWVMTDASNVGIGAILLQGQDWRKAHPVCPNEEAKKKWYNQPRSNHPRPSNKPAAQAQFALTADDVPDEGPSISFAAASFLSATSDVSSLLLDSAASHHMVNDSSAFVELHKTSSIRIGGVGGALSLQGKGIIELISSTGDRIRLSDVFFVPGCPANLISMFALIKDGITPSFTLDGWLSLVRGGKCICTGMAKADRLFHLDAHLCMHTALVAARAPKVPLLTLHHRLGHCSLSTLRKLANSNQVKGIEWTYSANDCNDFQCDACMAHKLPFPLSESYASLPLGLVHSDLLMFPKPSVSGRCYLITFIDDFSHKAWAFPLLRKSNALAAFQRWKAEVENSSGAKIKTLRSNNGGEYTAFDKFCAEQGIRRNKSVPYTPEQNGRAERLNRLIVKGVLALLHNSGLPAHLWEEVTQYYLDCKNLTPHAGLNGDIPNAIWHGKPQDLSRLRTFGCRAWATVPQHEHTKLEPKGTPLIFVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.11
3	0.11
4	0.13
5	0.14
6	0.14
7	0.14
8	0.14
9	0.15
10	0.17
11	0.16
12	0.14
13	0.13
14	0.14
15	0.14
16	0.13
17	0.12
18	0.1
19	0.1
20	0.1
21	0.09
22	0.08
23	0.08
24	0.1
25	0.13
26	0.16
27	0.19
28	0.2
29	0.23
30	0.24
31	0.25
32	0.29
33	0.26
34	0.29
35	0.25
36	0.26
37	0.26
38	0.26
39	0.27
40	0.23
41	0.24
42	0.22
43	0.24
44	0.22
45	0.21
46	0.25
47	0.27
48	0.29
49	0.32
50	0.3
51	0.28
52	0.29
53	0.28
54	0.24
55	0.21
56	0.17
57	0.18
58	0.18
59	0.2
60	0.2
61	0.22
62	0.26
63	0.28
64	0.31
65	0.29
66	0.29
67	0.35
68	0.37
69	0.42
70	0.44
71	0.5
72	0.53
73	0.53
74	0.62
75	0.63
76	0.66
77	0.61
78	0.59
79	0.56
80	0.56
81	0.57
82	0.51
83	0.49
84	0.48
85	0.46
86	0.46
87	0.41
88	0.39
89	0.37
90	0.36
91	0.36
92	0.35
93	0.41
94	0.44
95	0.49
96	0.54
97	0.59
98	0.63
99	0.6
100	0.58
101	0.56
102	0.51
103	0.46
104	0.44
105	0.41
106	0.43
107	0.43
108	0.49
109	0.54
110	0.55
111	0.59
112	0.62
113	0.67
114	0.67
115	0.68
116	0.68
117	0.65
118	0.72
119	0.76
120	0.72
121	0.67
122	0.57
123	0.56
124	0.5
125	0.44
126	0.35
127	0.27
128	0.21
129	0.17
130	0.19
131	0.17
132	0.16
133	0.23
134	0.22
135	0.23
136	0.23
137	0.27
138	0.31
139	0.36
140	0.36
141	0.34
142	0.35
143	0.37
144	0.39
145	0.35
146	0.3
147	0.22
148	0.2
149	0.16
150	0.15
151	0.12
152	0.12
153	0.13
154	0.12
155	0.13
156	0.13
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.12
161	0.11
162	0.11
163	0.1
164	0.12
165	0.12
166	0.14
167	0.14
168	0.15
169	0.16
170	0.19
171	0.21
172	0.28
173	0.3
174	0.3
175	0.3
176	0.28
177	0.28
178	0.27
179	0.28
180	0.21
181	0.21
182	0.22
183	0.22
184	0.22
185	0.2
186	0.19
187	0.19
188	0.24
189	0.22
190	0.22
191	0.24
192	0.24
193	0.24
194	0.25
195	0.22
196	0.17
197	0.16
198	0.13
199	0.12
200	0.11
201	0.1
202	0.08
203	0.07
204	0.06
205	0.05
206	0.04
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.04
215	0.05
216	0.06
217	0.07
218	0.1
219	0.15
220	0.17
221	0.18
222	0.24
223	0.32
224	0.4
225	0.46
226	0.52
227	0.56
228	0.63
229	0.67
230	0.69
231	0.68
232	0.64
233	0.6
234	0.55
235	0.47
236	0.38
237	0.36
238	0.32
239	0.26
240	0.23
241	0.23
242	0.21
243	0.21
244	0.23
245	0.2
246	0.21
247	0.19
248	0.19
249	0.18
250	0.2
251	0.19
252	0.17
253	0.2
254	0.16
255	0.16
256	0.15
257	0.15
258	0.13
259	0.15
260	0.22
261	0.24
262	0.27
263	0.27
264	0.33
265	0.38
266	0.43
267	0.44
268	0.37
269	0.35
270	0.34
271	0.35
272	0.3
273	0.24
274	0.17
275	0.14
276	0.15
277	0.13
278	0.12
279	0.09
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.14
287	0.17
288	0.21
289	0.23
290	0.27
291	0.32
292	0.35
293	0.39
294	0.45
295	0.51
296	0.48
297	0.49
298	0.45
299	0.38
300	0.35
301	0.33
302	0.29
303	0.25
304	0.24
305	0.21
306	0.21
307	0.21
308	0.21
309	0.18
310	0.14
311	0.09
312	0.09
313	0.09
314	0.1
315	0.09
316	0.11
317	0.15
318	0.15
319	0.18
320	0.19
321	0.21
322	0.2
323	0.2
324	0.17
325	0.17
326	0.2
327	0.2
328	0.22
329	0.23
330	0.23
331	0.24
332	0.24
333	0.21
334	0.17
335	0.15
336	0.11
337	0.15
338	0.17
339	0.23
340	0.26
341	0.28
342	0.3
343	0.3
344	0.33
345	0.32
346	0.34
347	0.27
348	0.25
349	0.23
350	0.2
351	0.2
352	0.17
353	0.14
354	0.17
355	0.2
356	0.26
357	0.26
358	0.26
359	0.27
360	0.29
361	0.31
362	0.28
363	0.32
364	0.26
365	0.28
366	0.29
367	0.29
368	0.28
369	0.28
370	0.25
371	0.19
372	0.2
373	0.18
374	0.17
375	0.18
376	0.24
377	0.32
378	0.35
379	0.39
380	0.41
381	0.46
382	0.51
383	0.53
384	0.5
385	0.5
386	0.5
387	0.45
388	0.46
389	0.44
390	0.41
391	0.44
392	0.44
393	0.43
394	0.43
395	0.42
396	0.4
397	0.44
398	0.5
399	0.46
400	0.43
401	0.38
402	0.36
403	0.35
404	0.34
405	0.32
406	0.32
407	0.36
408	0.34
409	0.36
410	0.39
411	0.43
412	0.45
413	0.39
414	0.33
415	0.29
416	0.28
417	0.22
418	0.19
419	0.15
420	0.11
421	0.1
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.09
433	0.09
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.13
438	0.14
439	0.14
440	0.12
441	0.12
442	0.1
443	0.13
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.12
448	0.11
449	0.13
450	0.12
451	0.1
452	0.12
453	0.14
454	0.14
455	0.16
456	0.16
457	0.14
458	0.13
459	0.13
460	0.11
461	0.1
462	0.1
463	0.09
464	0.09
465	0.1
466	0.11
467	0.11
468	0.13
469	0.14
470	0.15
471	0.14
472	0.15
473	0.14
474	0.14
475	0.13
476	0.09
477	0.08
478	0.07
479	0.07
480	0.07
481	0.08
482	0.07
483	0.08
484	0.12
485	0.12
486	0.15
487	0.18
488	0.2
489	0.22
490	0.25
491	0.27
492	0.24
493	0.23
494	0.21
495	0.21
496	0.19
497	0.19
498	0.18
499	0.17
500	0.18
501	0.23
502	0.25
503	0.24
504	0.23
505	0.21
506	0.2
507	0.19
508	0.18
509	0.15
510	0.12
511	0.11
512	0.11
513	0.1
514	0.08
515	0.07
516	0.07
517	0.06
518	0.06
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.05
523	0.05
524	0.04
525	0.04
526	0.04
527	0.05
528	0.09
529	0.12
530	0.16
531	0.18
532	0.19
533	0.21
534	0.23
535	0.24
536	0.22
537	0.19
538	0.16
539	0.13
540	0.12
541	0.11
542	0.08
543	0.07
544	0.05
545	0.05
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.07
550	0.06
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.06
558	0.06
559	0.04
560	0.06
561	0.07
562	0.07
563	0.09
564	0.11
565	0.12
566	0.12
567	0.14
568	0.14
569	0.13
570	0.14
571	0.16
572	0.16
573	0.18
574	0.19
575	0.18
576	0.17
577	0.17
578	0.19
579	0.2
580	0.2
581	0.18
582	0.19
583	0.17
584	0.18
585	0.19
586	0.17
587	0.12
588	0.11
589	0.11
590	0.11
591	0.12
592	0.1
593	0.1
594	0.09
595	0.08
596	0.06
597	0.06
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.04
606	0.04
607	0.05
608	0.05
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.08
615	0.09
616	0.16
617	0.23
618	0.29
619	0.31
620	0.32
621	0.34
622	0.34
623	0.37
624	0.34
625	0.34
626	0.31
627	0.31
628	0.29
629	0.28
630	0.27
631	0.22
632	0.18
633	0.11
634	0.09
635	0.08
636	0.08
637	0.1
638	0.1
639	0.1
640	0.09
641	0.09
642	0.16
643	0.16
644	0.2
645	0.24
646	0.24
647	0.25
648	0.25
649	0.25
650	0.18
651	0.17
652	0.14
653	0.14
654	0.14
655	0.17
656	0.25
657	0.25
658	0.27
659	0.28
660	0.26
661	0.21
662	0.22
663	0.19
664	0.13
665	0.13
666	0.11
667	0.1
668	0.11
669	0.13
670	0.11
671	0.1
672	0.08
673	0.08
674	0.09
675	0.08
676	0.07
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.03
691	0.03
692	0.03
693	0.03
694	0.03
695	0.05
696	0.06
697	0.11
698	0.11
699	0.13
700	0.19
701	0.21
702	0.24
703	0.29
704	0.33
705	0.33
706	0.38
707	0.43
708	0.42
709	0.47
710	0.46
711	0.44
712	0.48
713	0.47
714	0.5
715	0.54
716	0.59
717	0.61
718	0.67
719	0.73
720	0.75
721	0.81
722	0.82
723	0.8
724	0.8
725	0.79
726	0.8
727	0.79
728	0.71
729	0.69
730	0.66
731	0.62
732	0.53
733	0.47
734	0.39
735	0.32
736	0.29
737	0.23
738	0.16
739	0.12
740	0.1
741	0.09
742	0.08
743	0.05
744	0.05
745	0.05
746	0.05
747	0.05
748	0.05
749	0.06
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.06
754	0.06
755	0.06
756	0.06
757	0.05
758	0.06
759	0.06
760	0.06
761	0.06
762	0.06
763	0.06
764	0.06
765	0.05
766	0.05
767	0.05
768	0.05
769	0.04
770	0.04
771	0.05
772	0.06
773	0.07
774	0.07
775	0.07
776	0.08
777	0.08
778	0.09
779	0.08
780	0.07
781	0.07
782	0.08
783	0.07
784	0.07
785	0.1
786	0.1
787	0.1
788	0.11
789	0.11
790	0.11
791	0.15
792	0.16
793	0.13
794	0.13
795	0.12
796	0.11
797	0.11
798	0.1
799	0.05
800	0.05
801	0.05
802	0.05
803	0.04
804	0.04
805	0.04
806	0.04
807	0.04
808	0.05
809	0.05
810	0.05
811	0.05
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.07
816	0.07
817	0.09
818	0.09
819	0.09
820	0.12
821	0.13
822	0.14
823	0.18
824	0.18
825	0.19
826	0.19
827	0.19
828	0.17
829	0.17
830	0.16
831	0.12
832	0.12
833	0.1
834	0.11
835	0.11
836	0.1
837	0.1
838	0.09
839	0.08
840	0.09
841	0.08
842	0.07
843	0.07
844	0.07
845	0.06
846	0.07
847	0.07
848	0.08
849	0.09
850	0.09
851	0.1
852	0.1
853	0.1
854	0.1
855	0.1
856	0.09
857	0.09
858	0.14
859	0.12
860	0.15
861	0.15
862	0.15
863	0.15
864	0.16
865	0.15
866	0.13
867	0.14
868	0.18
869	0.24
870	0.26
871	0.26
872	0.28
873	0.29
874	0.3
875	0.3
876	0.23
877	0.21
878	0.21
879	0.2
880	0.2
881	0.19
882	0.16
883	0.15
884	0.14
885	0.1
886	0.09
887	0.08
888	0.07
889	0.09
890	0.09
891	0.11
892	0.12
893	0.13
894	0.13
895	0.14
896	0.13
897	0.15
898	0.21
899	0.27
900	0.32
901	0.35
902	0.39
903	0.39
904	0.41
905	0.4
906	0.36
907	0.28
908	0.25
909	0.26
910	0.27
911	0.29
912	0.28
913	0.27
914	0.28
915	0.31
916	0.34
917	0.4
918	0.4
919	0.4
920	0.44
921	0.44
922	0.4
923	0.39
924	0.35
925	0.26
926	0.21
927	0.2
928	0.17
929	0.18
930	0.18
931	0.17
932	0.17
933	0.18
934	0.18
935	0.19
936	0.17
937	0.15
938	0.15
939	0.14
940	0.14
941	0.14
942	0.16
943	0.15
944	0.18
945	0.2
946	0.21
947	0.21
948	0.23
949	0.25
950	0.24
951	0.25
952	0.24
953	0.23
954	0.23
955	0.24
956	0.21
957	0.18
958	0.15
959	0.13
960	0.12
961	0.1
962	0.09
963	0.07
964	0.07
965	0.07
966	0.07
967	0.09
968	0.1
969	0.1
970	0.1
971	0.11
972	0.13
973	0.16
974	0.2
975	0.21
976	0.23
977	0.26
978	0.28
979	0.28
980	0.27
981	0.26
982	0.23
983	0.2
984	0.17
985	0.17
986	0.15
987	0.16
988	0.16
989	0.22
990	0.2
991	0.19
992	0.19
993	0.24
994	0.27
995	0.31
996	0.4
997	0.38
998	0.4
999	0.42
1000	0.43
1001	0.42
1002	0.41
1003	0.4
1004	0.33
1005	0.34
1006	0.4
1007	0.4
1008	0.4
1009	0.34
1010	0.33
1011	0.31
1012	0.34
1013	0.3
1014	0.29
1015	0.34
1016	0.32
1017	0.33
1018	0.36
1019	0.33
1020	0.31
1021	0.31
1022	0.3
1023	0.33
1024	0.38
1025	0.43
1026	0.44
1027	0.49
1028	0.48
1029	0.49
1030	0.46
1031	0.37
1032	0.33
1033	0.31
1034	0.3
1035	0.25
1036	0.22
1037	0.19
1038	0.19
1039	0.21
1040	0.23
1041	0.2
1042	0.21
1043	0.31
1044	0.42
1045	0.44
1046	0.46
1047	0.47
1048	0.45
1049	0.51
1050	0.54
1051	0.51
1052	0.47
1053	0.52
1054	0.53
1055	0.59
1056	0.58
1057	0.57
1058	0.53
1059	0.51
1060	0.52
1061	0.47
1062	0.48
1063	0.45
1064	0.5
1065	0.46
1066	0.44
1067	0.44
1068	0.36
1069	0.34
1070	0.3
1071	0.25
1072	0.19
1073	0.17
1074	0.16
1075	0.13
1076	0.13
1077	0.12
1078	0.11
1079	0.1
1080	0.09
1081	0.09
1082	0.09
1083	0.1
1084	0.11
1085	0.12
1086	0.12
1087	0.15
1088	0.15
1089	0.16
1090	0.15
1091	0.14
1092	0.16
1093	0.18
1094	0.19
1095	0.17
1096	0.18
1097	0.23
1098	0.27
1099	0.29
1100	0.27
1101	0.26
1102	0.3
1103	0.31
1104	0.29
1105	0.27
1106	0.26
1107	0.23
1108	0.21
1109	0.19
1110	0.14
1111	0.15
1112	0.16
1113	0.13
1114	0.14
1115	0.18
1116	0.22
1117	0.25
1118	0.26
1119	0.35
1120	0.41
1121	0.47
1122	0.48
1123	0.5
1124	0.48
1125	0.52
1126	0.53
1127	0.46
1128	0.49
1129	0.44
1130	0.41
1131	0.39
1132	0.46
1133	0.44
1134	0.49
1135	0.5
1136	0.45
1137	0.5
1138	0.5
1139	0.48
1140	0.45
1141	0.5
1142	0.45
1143	0.46
1144	0.45
1145	0.42
1146	0.49
1147	0.46

A0A238F9U3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer