FuNGI

A0A238FHR8

Protein Details

Accession

A0A238FHR8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
108-128	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
418-418	R
426-432	RNEKRRK

Subcellular Location(s)

mito 12.5, cyto_mito 9.5, cysk 8, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIVLPVIEDTPVSVPGPNGEMEQLPIDTSGANPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPKTEEDMMHEVFLYTERVVAMVRPRKLLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAAEAKVKEEERIKAIEEWDAMGKPVSDEMRGEKGWDSNAITPGTPFMDLLAKSLRYWVAKKLNEDPAWAGLQVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRSHASHDPNTQHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFAQDSSKKPRGCHTCGQPGHHSSQCTGKPKEAPLERKPDQLVKPSPLKPFIFLDVSILREYLAVELSAPVHSFPFDLERAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLMTIWKNSLESMGGYLAEHGKVNLARAQVILEQLASREDEIFRKRREAEERQDRNEKRRKLENDQRNHGRGGQASGQAGVNWQLQQEQDKIKGMSQAAMSNGLSDYAQHKALQSGGENKGLPPKPTWVDPASLAAAPTSHVASMVGSNASIVANRKAIRMANLSAKEMIKAEMEASNGAAATSEGNPKARSVSPTASKKNSNAAEMLRKQMMGGEQEEQEQEQAVEADAVEVEQIVEENVEVAPIEAEPEAEGAKKDDDPKSDDEVSAIDVDASESSPRGTKRKVEDVEPESAEVTELEEDEEEDDDESSEDTSIVVPGGVHKVKVAPLKHMGNNVVEQDDTVKLWEPGYKERYYRQKFGVELSDLEFRKSIVKSYVEGLCWVLEYYYQGTPSWQWYYPHHFSPFASDFVDMKDLDIDFTLGNPFRPYEQLMGVFPAASRFHLPEPFQPLMIESDSPIIDFYPEEFEVDMNGKKMFWQGVALLPFIDPERLLTAMGTKYPLLSDFENHRNQLGHDSLFVMQEHPLYDYLEGLYTKRRIQEPVALDTKRSKGIAGFALPESTCIPGAIYDSPLPSLPDIQGDRSISAEYKFPEQKTPHRSILLPGVKVGRQVLNQHDRDGVRRGGGEQRYEGNNGFHAQRRNEQTGPGFHKRDQGSRGQGYQQGGYQQGGGGGGGGGGGSGGYQQQQRPGGYQGQPQQGYGGYSGAQGYYAPPPPAVGYGGYQPPVPQAGYGGYQPPAGAAIYGGRGGGVPAPGGYYPPPPIARPQTTYSALPAGMGSAYGGARPVPNAGYQGYQPPVHGRGPPGAPPVAGAYGGYGVGGNAGATPGAASGWRPGQPPRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.61
3	0.65
4	0.67
5	0.64
6	0.61
7	0.58
8	0.52
9	0.45
10	0.4
11	0.33
12	0.28
13	0.23
14	0.18
15	0.14
16	0.12
17	0.13
18	0.15
19	0.14
20	0.14
21	0.14
22	0.14
23	0.14
24	0.16
25	0.14
26	0.13
27	0.12
28	0.12
29	0.1
30	0.11
31	0.16
32	0.16
33	0.16
34	0.16
35	0.17
36	0.19
37	0.2
38	0.2
39	0.15
40	0.15
41	0.16
42	0.16
43	0.16
44	0.13
45	0.12
46	0.12
47	0.1
48	0.08
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.1
53	0.13
54	0.17
55	0.2
56	0.2
57	0.27
58	0.35
59	0.43
60	0.5
61	0.53
62	0.54
63	0.53
64	0.57
65	0.54
66	0.52
67	0.48
68	0.45
69	0.41
70	0.36
71	0.33
72	0.28
73	0.24
74	0.18
75	0.15
76	0.1
77	0.1
78	0.09
79	0.1
80	0.1
81	0.13
82	0.22
83	0.27
84	0.3
85	0.32
86	0.33
87	0.34
88	0.35
89	0.35
90	0.28
91	0.25
92	0.24
93	0.21
94	0.22
95	0.2
96	0.21
97	0.18
98	0.15
99	0.1
100	0.13
101	0.2
102	0.26
103	0.37
104	0.46
105	0.55
106	0.66
107	0.75
108	0.8
109	0.81
110	0.76
111	0.69
112	0.7
113	0.69
114	0.67
115	0.69
116	0.62
117	0.57
118	0.61
119	0.59
120	0.53
121	0.48
122	0.43
123	0.36
124	0.35
125	0.35
126	0.31
127	0.31
128	0.29
129	0.25
130	0.23
131	0.22
132	0.2
133	0.18
134	0.16
135	0.15
136	0.12
137	0.15
138	0.15
139	0.13
140	0.15
141	0.18
142	0.23
143	0.23
144	0.25
145	0.23
146	0.24
147	0.24
148	0.26
149	0.25
150	0.23
151	0.27
152	0.26
153	0.24
154	0.22
155	0.22
156	0.2
157	0.17
158	0.13
159	0.1
160	0.14
161	0.14
162	0.16
163	0.19
164	0.19
165	0.18
166	0.22
167	0.24
168	0.24
169	0.26
170	0.32
171	0.37
172	0.41
173	0.46
174	0.51
175	0.56
176	0.53
177	0.54
178	0.46
179	0.4
180	0.37
181	0.32
182	0.24
183	0.15
184	0.14
185	0.12
186	0.1
187	0.07
188	0.06
189	0.06
190	0.06
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.05
195	0.07
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.08
200	0.1
201	0.11
202	0.16
203	0.21
204	0.28
205	0.38
206	0.4
207	0.42
208	0.5
209	0.53
210	0.57
211	0.6
212	0.61
213	0.57
214	0.64
215	0.64
216	0.58
217	0.58
218	0.49
219	0.4
220	0.31
221	0.26
222	0.18
223	0.16
224	0.13
225	0.09
226	0.08
227	0.08
228	0.07
229	0.06
230	0.05
231	0.03
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.08
238	0.09
239	0.14
240	0.17
241	0.16
242	0.21
243	0.23
244	0.25
245	0.26
246	0.26
247	0.23
248	0.24
249	0.24
250	0.21
251	0.23
252	0.25
253	0.3
254	0.36
255	0.37
256	0.36
257	0.45
258	0.52
259	0.53
260	0.58
261	0.58
262	0.62
263	0.63
264	0.67
265	0.65
266	0.6
267	0.59
268	0.53
269	0.46
270	0.37
271	0.41
272	0.42
273	0.43
274	0.41
275	0.41
276	0.42
277	0.45
278	0.53
279	0.52
280	0.54
281	0.54
282	0.61
283	0.58
284	0.59
285	0.58
286	0.57
287	0.52
288	0.53
289	0.51
290	0.47
291	0.53
292	0.53
293	0.55
294	0.54
295	0.5
296	0.44
297	0.41
298	0.39
299	0.33
300	0.27
301	0.26
302	0.21
303	0.23
304	0.2
305	0.18
306	0.14
307	0.12
308	0.12
309	0.09
310	0.08
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.1
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.12
327	0.12
328	0.14
329	0.13
330	0.09
331	0.09
332	0.08
333	0.08
334	0.06
335	0.06
336	0.04
337	0.04
338	0.05
339	0.06
340	0.05
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.09
349	0.12
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.13
354	0.12
355	0.12
356	0.11
357	0.07
358	0.05
359	0.05
360	0.07
361	0.06
362	0.06
363	0.06
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.09
380	0.09
381	0.11
382	0.13
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.14
387	0.12
388	0.12
389	0.11
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.13
399	0.2
400	0.26
401	0.27
402	0.32
403	0.34
404	0.39
405	0.47
406	0.5
407	0.55
408	0.59
409	0.64
410	0.65
411	0.73
412	0.7
413	0.71
414	0.72
415	0.67
416	0.62
417	0.65
418	0.66
419	0.66
420	0.73
421	0.73
422	0.73
423	0.76
424	0.77
425	0.7
426	0.64
427	0.56
428	0.48
429	0.39
430	0.34
431	0.28
432	0.22
433	0.2
434	0.2
435	0.18
436	0.16
437	0.15
438	0.14
439	0.11
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.1
444	0.13
445	0.16
446	0.16
447	0.17
448	0.2
449	0.2
450	0.2
451	0.23
452	0.21
453	0.2
454	0.18
455	0.18
456	0.15
457	0.17
458	0.15
459	0.12
460	0.12
461	0.09
462	0.08
463	0.07
464	0.08
465	0.08
466	0.09
467	0.09
468	0.1
469	0.1
470	0.11
471	0.12
472	0.12
473	0.16
474	0.17
475	0.2
476	0.19
477	0.19
478	0.27
479	0.27
480	0.27
481	0.22
482	0.25
483	0.24
484	0.25
485	0.29
486	0.22
487	0.22
488	0.21
489	0.22
490	0.18
491	0.17
492	0.15
493	0.11
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.07
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.06
503	0.06
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.07
511	0.07
512	0.11
513	0.12
514	0.12
515	0.14
516	0.14
517	0.16
518	0.18
519	0.19
520	0.22
521	0.23
522	0.23
523	0.24
524	0.23
525	0.21
526	0.18
527	0.17
528	0.1
529	0.09
530	0.09
531	0.08
532	0.09
533	0.08
534	0.08
535	0.07
536	0.06
537	0.06
538	0.05
539	0.04
540	0.04
541	0.05
542	0.08
543	0.08
544	0.1
545	0.1
546	0.11
547	0.14
548	0.14
549	0.15
550	0.17
551	0.2
552	0.27
553	0.34
554	0.39
555	0.4
556	0.41
557	0.4
558	0.43
559	0.4
560	0.34
561	0.28
562	0.26
563	0.3
564	0.29
565	0.3
566	0.23
567	0.21
568	0.2
569	0.19
570	0.18
571	0.12
572	0.12
573	0.12
574	0.11
575	0.12
576	0.13
577	0.11
578	0.1
579	0.08
580	0.07
581	0.05
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.02
591	0.02
592	0.02
593	0.02
594	0.02
595	0.02
596	0.02
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.04
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.05
612	0.05
613	0.06
614	0.08
615	0.12
616	0.14
617	0.16
618	0.19
619	0.22
620	0.26
621	0.26
622	0.24
623	0.21
624	0.19
625	0.17
626	0.14
627	0.11
628	0.06
629	0.04
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.04
634	0.04
635	0.04
636	0.08
637	0.09
638	0.13
639	0.15
640	0.21
641	0.26
642	0.35
643	0.37
644	0.37
645	0.43
646	0.43
647	0.45
648	0.39
649	0.34
650	0.25
651	0.23
652	0.2
653	0.12
654	0.09
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.04
659	0.04
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.05
666	0.05
667	0.05
668	0.05
669	0.04
670	0.04
671	0.04
672	0.04
673	0.04
674	0.04
675	0.04
676	0.04
677	0.04
678	0.09
679	0.09
680	0.09
681	0.09
682	0.1
683	0.14
684	0.19
685	0.19
686	0.19
687	0.24
688	0.29
689	0.3
690	0.32
691	0.3
692	0.26
693	0.27
694	0.24
695	0.18
696	0.14
697	0.12
698	0.11
699	0.1
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.07
704	0.08
705	0.11
706	0.11
707	0.17
708	0.22
709	0.24
710	0.25
711	0.31
712	0.42
713	0.45
714	0.47
715	0.45
716	0.44
717	0.43
718	0.44
719	0.41
720	0.32
721	0.27
722	0.25
723	0.27
724	0.23
725	0.23
726	0.2
727	0.16
728	0.19
729	0.18
730	0.18
731	0.16
732	0.17
733	0.17
734	0.21
735	0.23
736	0.19
737	0.19
738	0.18
739	0.14
740	0.12
741	0.11
742	0.08
743	0.06
744	0.07
745	0.09
746	0.09
747	0.1
748	0.1
749	0.1
750	0.12
751	0.15
752	0.17
753	0.17
754	0.18
755	0.21
756	0.3
757	0.33
758	0.36
759	0.35
760	0.33
761	0.3
762	0.36
763	0.34
764	0.27
765	0.24
766	0.2
767	0.19
768	0.19
769	0.21
770	0.13
771	0.11
772	0.11
773	0.1
774	0.09
775	0.09
776	0.09
777	0.06
778	0.07
779	0.09
780	0.08
781	0.09
782	0.09
783	0.1
784	0.1
785	0.12
786	0.13
787	0.13
788	0.14
789	0.15
790	0.15
791	0.16
792	0.15
793	0.13
794	0.11
795	0.12
796	0.1
797	0.1
798	0.11
799	0.12
800	0.14
801	0.18
802	0.2
803	0.21
804	0.28
805	0.28
806	0.26
807	0.24
808	0.23
809	0.21
810	0.21
811	0.16
812	0.1
813	0.11
814	0.11
815	0.11
816	0.1
817	0.08
818	0.07
819	0.07
820	0.07
821	0.1
822	0.1
823	0.1
824	0.1
825	0.1
826	0.11
827	0.13
828	0.13
829	0.1
830	0.1
831	0.1
832	0.1
833	0.13
834	0.12
835	0.1
836	0.1
837	0.1
838	0.15
839	0.16
840	0.15
841	0.14
842	0.13
843	0.13
844	0.12
845	0.11
846	0.07
847	0.06
848	0.08
849	0.08
850	0.08
851	0.08
852	0.11
853	0.11
854	0.12
855	0.12
856	0.1
857	0.1
858	0.11
859	0.12
860	0.11
861	0.11
862	0.14
863	0.2
864	0.27
865	0.31
866	0.31
867	0.31
868	0.29
869	0.29
870	0.31
871	0.27
872	0.2
873	0.17
874	0.18
875	0.17
876	0.18
877	0.17
878	0.13
879	0.11
880	0.11
881	0.11
882	0.11
883	0.11
884	0.1
885	0.1
886	0.1
887	0.09
888	0.1
889	0.1
890	0.1
891	0.15
892	0.17
893	0.19
894	0.23
895	0.26
896	0.27
897	0.3
898	0.37
899	0.35
900	0.4
901	0.44
902	0.4
903	0.39
904	0.41
905	0.4
906	0.35
907	0.31
908	0.25
909	0.19
910	0.23
911	0.25
912	0.22
913	0.22
914	0.19
915	0.21
916	0.2
917	0.2
918	0.17
919	0.14
920	0.12
921	0.1
922	0.1
923	0.08
924	0.11
925	0.1
926	0.12
927	0.12
928	0.12
929	0.13
930	0.14
931	0.14
932	0.12
933	0.13
934	0.11
935	0.16
936	0.17
937	0.18
938	0.21
939	0.21
940	0.21
941	0.2
942	0.21
943	0.17
944	0.16
945	0.18
946	0.15
947	0.22
948	0.26
949	0.27
950	0.34
951	0.38
952	0.46
953	0.51
954	0.57
955	0.54
956	0.52
957	0.51
958	0.46
959	0.52
960	0.49
961	0.41
962	0.36
963	0.35
964	0.32
965	0.33
966	0.32
967	0.25
968	0.22
969	0.27
970	0.34
971	0.4
972	0.4
973	0.41
974	0.43
975	0.41
976	0.41
977	0.42
978	0.34
979	0.27
980	0.26
981	0.27
982	0.3
983	0.33
984	0.32
985	0.29
986	0.32
987	0.32
988	0.34
989	0.33
990	0.26
991	0.24
992	0.24
993	0.25
994	0.25
995	0.3
996	0.31
997	0.37
998	0.43
999	0.47
1000	0.46
1001	0.48
1002	0.47
1003	0.49
1004	0.54
1005	0.55
1006	0.52
1007	0.47
1008	0.54
1009	0.53
1010	0.55
1011	0.5
1012	0.5
1013	0.5
1014	0.51
1015	0.52
1016	0.48
1017	0.5
1018	0.45
1019	0.42
1020	0.36
1021	0.3
1022	0.27
1023	0.24
1024	0.2
1025	0.16
1026	0.14
1027	0.13
1028	0.1
1029	0.07
1030	0.05
1031	0.05
1032	0.04
1033	0.04
1034	0.03
1035	0.02
1036	0.02
1037	0.02
1038	0.03
1039	0.04
1040	0.07
1041	0.11
1042	0.12
1043	0.19
1044	0.23
1045	0.25
1046	0.27
1047	0.31
1048	0.36
1049	0.36
1050	0.42
1051	0.44
1052	0.48
1053	0.48
1054	0.45
1055	0.43
1056	0.36
1057	0.33
1058	0.27
1059	0.2
1060	0.11
1061	0.12
1062	0.12
1063	0.1
1064	0.09
1065	0.08
1066	0.09
1067	0.14
1068	0.17
1069	0.17
1070	0.17
1071	0.18
1072	0.19
1073	0.2
1074	0.19
1075	0.15
1076	0.13
1077	0.17
1078	0.2
1079	0.2
1080	0.19
1081	0.18
1082	0.19
1083	0.2
1084	0.19
1085	0.14
1086	0.12
1087	0.14
1088	0.15
1089	0.17
1090	0.17
1091	0.16
1092	0.16
1093	0.16
1094	0.14
1095	0.13
1096	0.11
1097	0.09
1098	0.07
1099	0.08
1100	0.09
1101	0.09
1102	0.09
1103	0.07
1104	0.07
1105	0.08
1106	0.09
1107	0.08
1108	0.08
1109	0.07
1110	0.09
1111	0.09
1112	0.11
1113	0.13
1114	0.14
1115	0.17
1116	0.22
1117	0.24
1118	0.24
1119	0.33
1120	0.4
1121	0.44
1122	0.46
1123	0.47
1124	0.48
1125	0.5
1126	0.49
1127	0.44
1128	0.38
1129	0.32
1130	0.27
1131	0.22
1132	0.16
1133	0.12
1134	0.11
1135	0.08
1136	0.07
1137	0.07
1138	0.07
1139	0.08
1140	0.08
1141	0.09
1142	0.1
1143	0.12
1144	0.12
1145	0.13
1146	0.16
1147	0.17
1148	0.18
1149	0.19
1150	0.24
1151	0.26
1152	0.26
1153	0.25
1154	0.28
1155	0.31
1156	0.32
1157	0.33
1158	0.3
1159	0.33
1160	0.36
1161	0.39
1162	0.39
1163	0.36
1164	0.33
1165	0.3
1166	0.3
1167	0.24
1168	0.21
1169	0.16
1170	0.12
1171	0.12
1172	0.11
1173	0.1
1174	0.07
1175	0.06
1176	0.06
1177	0.06
1178	0.05
1179	0.04
1180	0.05
1181	0.04
1182	0.04
1183	0.05
1184	0.04
1185	0.05
1186	0.05
1187	0.06
1188	0.11
1189	0.16
1190	0.19
1191	0.22

A0A238FHR8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer