FuNGI

A0A238F5Y0

Protein Details

Accession

A0A238F5Y0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
296-320	QHTPPGPCRHCRKKGHWSFDCKKAP	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 10.833, cyto 6.5, extr 6, cyto_mito 4.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MPPPNDSTSNIGQPGATSPLTSSENSSLPADQLASLATLLSKLTAAASGTTSSGATRTTFPKHARLDGSKSFANWTCQLCLCLADDIRSYVLNDIVPDDWTALQRSARDAVARDIIANSIDSAAVSAVLDKIPTAELTAPKIYATLKSHYAPDDATRTLELFSRLWGFRPMPGTVAEFDTWITNFKSVAQEIIDAKTTINDVLATLVLVIAHPSLESFKATFTDEQRTRRSLPDIDALADHMRVQLRSTNLSNEQLALLALSLATSSRGSSRPSHNHCLACHSSSHLIAQCPTRAQHTPPGPCRHCRKKGHWSFDCKKAPEVNKKSGNDAPANSNVESQHHIGFLVTGLLARHHKLCNNSFVVDSGATAHLVPDKSLFTTYRHTAPTKIGGIDIEKDGNTIAEGTRLNKGLYLLDAEHSQCQHLALLSRSQTSVPLLTLHRCLGHLAPSSIQRMITAGLLEGFGAGYSDKEVEKFVCNACLSAKGHCLPFPDSESHSQERLGLVHSDVLSFPERSRTGKCYLVTFLDDYSRKLWTYAIGHKSEVFGVFKTWLAKVELETGVTLKVLRTDNGGEYRSRAFTEFCKAQGTRRQYSIPHTPQQNGRTKWVNCSIVEGVLALLADTHLPNTFWEEAVAYFIYCKNRCQHSALDKATPDFIWQGHRTNASALHPFGCTAWLMVTPKLRSKLNPKATRVLFVGYDLASKAFCFYDTNTNKFILGRNATFLDTEFPGLQGNLAAHKIDSHYANASHTKPQTTIKMGTPLVRTAQMDVSSHSDDSILSTADVSSWTCKSLPNSTDTAQSSSPAPSLPPSLALSLATSSSSSVLPTISDKSDDPLDSIGSHAQVCLNLLNVHHLDNDAYCEPISAKDSPNELNLIGRHLRNESPDKIDFLTQHHHVFIATNDDTSDMEAIQPVKSITSDPQTWREAMSSDQREVWAKAANDEFTSMRDDFKVFTIEDRSTVPAGATIVTSKFVWKTKRNATAPKVRWSKVQQSLICSLLALAAANGLHVHQADINKAYLHGDLDYDIWMTAPRGFDFPGNKVLRLRRSIYGLKQAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.25
3	0.2
4	0.15
5	0.14
6	0.19
7	0.22
8	0.22
9	0.23
10	0.22
11	0.24
12	0.26
13	0.27
14	0.23
15	0.21
16	0.21
17	0.18
18	0.14
19	0.13
20	0.11
21	0.1
22	0.09
23	0.08
24	0.07
25	0.07
26	0.07
27	0.07
28	0.06
29	0.06
30	0.06
31	0.08
32	0.08
33	0.09
34	0.1
35	0.11
36	0.11
37	0.12
38	0.11
39	0.1
40	0.11
41	0.11
42	0.11
43	0.15
44	0.2
45	0.25
46	0.33
47	0.37
48	0.45
49	0.48
50	0.53
51	0.57
52	0.58
53	0.6
54	0.59
55	0.6
56	0.53
57	0.49
58	0.48
59	0.44
60	0.43
61	0.4
62	0.37
63	0.35
64	0.35
65	0.35
66	0.3
67	0.27
68	0.24
69	0.23
70	0.21
71	0.2
72	0.19
73	0.2
74	0.21
75	0.2
76	0.19
77	0.15
78	0.16
79	0.14
80	0.14
81	0.14
82	0.14
83	0.14
84	0.13
85	0.13
86	0.13
87	0.14
88	0.16
89	0.16
90	0.18
91	0.18
92	0.21
93	0.23
94	0.23
95	0.24
96	0.23
97	0.25
98	0.27
99	0.26
100	0.24
101	0.22
102	0.21
103	0.18
104	0.17
105	0.13
106	0.09
107	0.09
108	0.07
109	0.07
110	0.06
111	0.06
112	0.05
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.07
119	0.07
120	0.08
121	0.09
122	0.12
123	0.14
124	0.19
125	0.21
126	0.2
127	0.19
128	0.2
129	0.19
130	0.22
131	0.23
132	0.23
133	0.26
134	0.28
135	0.31
136	0.31
137	0.31
138	0.27
139	0.27
140	0.28
141	0.24
142	0.24
143	0.22
144	0.21
145	0.2
146	0.21
147	0.19
148	0.15
149	0.16
150	0.21
151	0.2
152	0.21
153	0.26
154	0.24
155	0.25
156	0.29
157	0.27
158	0.23
159	0.24
160	0.24
161	0.21
162	0.23
163	0.19
164	0.16
165	0.16
166	0.16
167	0.14
168	0.15
169	0.14
170	0.12
171	0.12
172	0.14
173	0.18
174	0.16
175	0.18
176	0.16
177	0.18
178	0.19
179	0.21
180	0.2
181	0.16
182	0.16
183	0.15
184	0.15
185	0.12
186	0.1
187	0.09
188	0.07
189	0.08
190	0.07
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.04
196	0.05
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.06
202	0.07
203	0.09
204	0.08
205	0.09
206	0.11
207	0.14
208	0.17
209	0.19
210	0.29
211	0.33
212	0.39
213	0.43
214	0.46
215	0.46
216	0.46
217	0.48
218	0.41
219	0.39
220	0.4
221	0.36
222	0.32
223	0.3
224	0.28
225	0.24
226	0.2
227	0.17
228	0.13
229	0.14
230	0.13
231	0.14
232	0.16
233	0.17
234	0.21
235	0.23
236	0.25
237	0.27
238	0.29
239	0.28
240	0.25
241	0.22
242	0.18
243	0.16
244	0.11
245	0.08
246	0.05
247	0.04
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.08
255	0.11
256	0.14
257	0.19
258	0.29
259	0.38
260	0.45
261	0.52
262	0.56
263	0.58
264	0.55
265	0.58
266	0.52
267	0.43
268	0.36
269	0.32
270	0.28
271	0.25
272	0.28
273	0.22
274	0.2
275	0.21
276	0.23
277	0.22
278	0.22
279	0.22
280	0.23
281	0.23
282	0.24
283	0.31
284	0.36
285	0.42
286	0.48
287	0.58
288	0.57
289	0.63
290	0.7
291	0.72
292	0.74
293	0.74
294	0.75
295	0.76
296	0.82
297	0.85
298	0.83
299	0.83
300	0.79
301	0.81
302	0.79
303	0.7
304	0.64
305	0.61
306	0.62
307	0.63
308	0.64
309	0.63
310	0.63
311	0.63
312	0.63
313	0.59
314	0.55
315	0.47
316	0.42
317	0.37
318	0.33
319	0.35
320	0.31
321	0.29
322	0.25
323	0.23
324	0.24
325	0.22
326	0.17
327	0.14
328	0.14
329	0.12
330	0.11
331	0.1
332	0.07
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.07
337	0.09
338	0.1
339	0.13
340	0.14
341	0.18
342	0.23
343	0.26
344	0.3
345	0.31
346	0.31
347	0.28
348	0.27
349	0.25
350	0.19
351	0.16
352	0.11
353	0.09
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.09
358	0.09
359	0.1
360	0.09
361	0.1
362	0.1
363	0.12
364	0.13
365	0.13
366	0.18
367	0.2
368	0.23
369	0.26
370	0.26
371	0.26
372	0.27
373	0.3
374	0.27
375	0.25
376	0.21
377	0.18
378	0.18
379	0.18
380	0.16
381	0.12
382	0.1
383	0.1
384	0.09
385	0.08
386	0.07
387	0.06
388	0.05
389	0.07
390	0.08
391	0.09
392	0.12
393	0.13
394	0.13
395	0.13
396	0.14
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.09
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.08
411	0.09
412	0.09
413	0.12
414	0.13
415	0.14
416	0.14
417	0.14
418	0.14
419	0.13
420	0.12
421	0.09
422	0.11
423	0.11
424	0.13
425	0.14
426	0.14
427	0.14
428	0.13
429	0.14
430	0.12
431	0.15
432	0.15
433	0.14
434	0.15
435	0.17
436	0.18
437	0.18
438	0.17
439	0.12
440	0.11
441	0.11
442	0.1
443	0.07
444	0.06
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.04
449	0.04
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.04
456	0.05
457	0.05
458	0.06
459	0.07
460	0.09
461	0.11
462	0.11
463	0.13
464	0.13
465	0.14
466	0.13
467	0.17
468	0.16
469	0.16
470	0.19
471	0.17
472	0.17
473	0.18
474	0.2
475	0.17
476	0.18
477	0.19
478	0.18
479	0.19
480	0.23
481	0.26
482	0.26
483	0.24
484	0.23
485	0.21
486	0.2
487	0.17
488	0.14
489	0.1
490	0.08
491	0.1
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.1
499	0.13
500	0.14
501	0.16
502	0.19
503	0.21
504	0.23
505	0.27
506	0.27
507	0.24
508	0.25
509	0.24
510	0.22
511	0.19
512	0.16
513	0.16
514	0.16
515	0.15
516	0.15
517	0.14
518	0.13
519	0.13
520	0.13
521	0.11
522	0.15
523	0.21
524	0.25
525	0.25
526	0.25
527	0.25
528	0.25
529	0.23
530	0.2
531	0.13
532	0.09
533	0.08
534	0.09
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.11
540	0.11
541	0.11
542	0.14
543	0.13
544	0.12
545	0.12
546	0.1
547	0.09
548	0.09
549	0.08
550	0.05
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.1
555	0.11
556	0.14
557	0.17
558	0.18
559	0.14
560	0.16
561	0.17
562	0.16
563	0.16
564	0.14
565	0.12
566	0.13
567	0.19
568	0.18
569	0.18
570	0.21
571	0.21
572	0.25
573	0.31
574	0.36
575	0.33
576	0.34
577	0.35
578	0.33
579	0.38
580	0.44
581	0.42
582	0.41
583	0.41
584	0.41
585	0.45
586	0.51
587	0.54
588	0.46
589	0.45
590	0.48
591	0.46
592	0.48
593	0.48
594	0.43
595	0.34
596	0.37
597	0.32
598	0.24
599	0.24
600	0.18
601	0.11
602	0.08
603	0.08
604	0.04
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.05
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.09
618	0.09
619	0.1
620	0.1
621	0.06
622	0.07
623	0.09
624	0.15
625	0.15
626	0.18
627	0.23
628	0.27
629	0.3
630	0.33
631	0.37
632	0.39
633	0.47
634	0.47
635	0.44
636	0.4
637	0.39
638	0.36
639	0.29
640	0.23
641	0.15
642	0.13
643	0.15
644	0.17
645	0.19
646	0.2
647	0.21
648	0.21
649	0.21
650	0.22
651	0.19
652	0.2
653	0.18
654	0.17
655	0.16
656	0.15
657	0.14
658	0.13
659	0.1
660	0.07
661	0.07
662	0.08
663	0.1
664	0.12
665	0.16
666	0.17
667	0.21
668	0.25
669	0.26
670	0.27
671	0.35
672	0.43
673	0.5
674	0.56
675	0.55
676	0.61
677	0.6
678	0.59
679	0.51
680	0.42
681	0.32
682	0.24
683	0.22
684	0.13
685	0.13
686	0.1
687	0.09
688	0.07
689	0.07
690	0.08
691	0.06
692	0.07
693	0.07
694	0.09
695	0.2
696	0.24
697	0.28
698	0.28
699	0.29
700	0.29
701	0.28
702	0.29
703	0.24
704	0.25
705	0.22
706	0.22
707	0.23
708	0.23
709	0.22
710	0.2
711	0.16
712	0.13
713	0.13
714	0.11
715	0.1
716	0.1
717	0.1
718	0.09
719	0.07
720	0.07
721	0.07
722	0.08
723	0.08
724	0.07
725	0.08
726	0.09
727	0.11
728	0.12
729	0.12
730	0.13
731	0.14
732	0.17
733	0.21
734	0.21
735	0.25
736	0.26
737	0.26
738	0.26
739	0.29
740	0.32
741	0.32
742	0.34
743	0.3
744	0.35
745	0.34
746	0.37
747	0.34
748	0.31
749	0.28
750	0.27
751	0.25
752	0.2
753	0.22
754	0.19
755	0.18
756	0.18
757	0.21
758	0.19
759	0.19
760	0.17
761	0.14
762	0.12
763	0.14
764	0.13
765	0.09
766	0.07
767	0.07
768	0.07
769	0.07
770	0.08
771	0.07
772	0.09
773	0.09
774	0.11
775	0.11
776	0.14
777	0.17
778	0.24
779	0.25
780	0.26
781	0.3
782	0.3
783	0.36
784	0.35
785	0.35
786	0.27
787	0.26
788	0.24
789	0.21
790	0.2
791	0.14
792	0.13
793	0.12
794	0.13
795	0.13
796	0.14
797	0.14
798	0.14
799	0.14
800	0.14
801	0.13
802	0.11
803	0.11
804	0.09
805	0.08
806	0.07
807	0.08
808	0.08
809	0.08
810	0.07
811	0.07
812	0.08
813	0.1
814	0.12
815	0.12
816	0.14
817	0.14
818	0.16
819	0.2
820	0.19
821	0.18
822	0.16
823	0.16
824	0.14
825	0.15
826	0.14
827	0.12
828	0.11
829	0.1
830	0.1
831	0.1
832	0.11
833	0.1
834	0.1
835	0.1
836	0.1
837	0.15
838	0.15
839	0.15
840	0.15
841	0.15
842	0.14
843	0.13
844	0.17
845	0.13
846	0.13
847	0.12
848	0.12
849	0.12
850	0.14
851	0.17
852	0.15
853	0.17
854	0.19
855	0.23
856	0.24
857	0.25
858	0.25
859	0.21
860	0.22
861	0.2
862	0.22
863	0.23
864	0.23
865	0.23
866	0.25
867	0.26
868	0.29
869	0.35
870	0.34
871	0.36
872	0.37
873	0.38
874	0.36
875	0.37
876	0.32
877	0.3
878	0.32
879	0.29
880	0.3
881	0.27
882	0.26
883	0.23
884	0.22
885	0.19
886	0.2
887	0.17
888	0.16
889	0.15
890	0.16
891	0.16
892	0.16
893	0.15
894	0.08
895	0.08
896	0.1
897	0.11
898	0.1
899	0.11
900	0.1
901	0.1
902	0.11
903	0.12
904	0.14
905	0.19
906	0.25
907	0.28
908	0.34
909	0.36
910	0.36
911	0.35
912	0.32
913	0.27
914	0.26
915	0.32
916	0.31
917	0.3
918	0.31
919	0.32
920	0.34
921	0.34
922	0.31
923	0.27
924	0.24
925	0.26
926	0.28
927	0.27
928	0.25
929	0.26
930	0.24
931	0.2
932	0.24
933	0.2
934	0.18
935	0.18
936	0.18
937	0.17
938	0.19
939	0.21
940	0.16
941	0.19
942	0.23
943	0.22
944	0.23
945	0.23
946	0.24
947	0.22
948	0.22
949	0.18
950	0.15
951	0.15
952	0.13
953	0.12
954	0.11
955	0.11
956	0.13
957	0.13
958	0.14
959	0.18
960	0.24
961	0.32
962	0.37
963	0.46
964	0.54
965	0.64
966	0.69
967	0.75
968	0.77
969	0.8
970	0.79
971	0.8
972	0.78
973	0.69
974	0.7
975	0.68
976	0.7
977	0.68
978	0.72
979	0.64
980	0.62
981	0.65
982	0.57
983	0.49
984	0.39
985	0.29
986	0.2
987	0.17
988	0.11
989	0.07
990	0.07
991	0.06
992	0.07
993	0.07
994	0.06
995	0.08
996	0.08
997	0.09
998	0.11
999	0.13
1000	0.16
1001	0.18
1002	0.19
1003	0.18
1004	0.19
1005	0.19
1006	0.17
1007	0.17
1008	0.14
1009	0.12
1010	0.12
1011	0.12
1012	0.13
1013	0.12
1014	0.1
1015	0.09
1016	0.1
1017	0.1
1018	0.12
1019	0.14
1020	0.14
1021	0.16
1022	0.17
1023	0.23
1024	0.26
1025	0.28
1026	0.36
1027	0.36
1028	0.37
1029	0.42
1030	0.49
1031	0.52
1032	0.54
1033	0.55
1034	0.5
1035	0.55
1036	0.6
1037	0.6

A0A238F5Y0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer