FuNGI

A0A238FF49

Protein Details

Accession

A0A238FF49

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
311-334	GGATARRKRKTKKGTSAARHRQAN	Hydrophilic
373-405	SDADNDPSKSKRKKKVRTKKPLRKVKPEDDDDK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
286-300	RRRKKDAAAKKRKRA
314-343	TARRKRKTKKGTSAARHRQANGKSSRKKSR
381-398	KSKRKKKVRTKKPLRKVK

Subcellular Location(s)

mito 9.5, cyto_mito 9.333, cyto_nucl 8.833, nucl 8.5, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MAPVASTSKAPATTVKLTAAEKRLIEIGLAAPKGQITQAELLAKSNLTTQAVTDAVNSILRKNLVQLLRTSTGQVEFRFIAKEEAKAMGAMDSDEKLVLDHIKDANNNGIWTKFLHNKTGLPRTTINKVLKTLEGRKVVKTVKSVKTSGQIAYSQHPTRKIYMMSNIAPSVELTGGPWFTDNELDVEFVEALKKITLTYLTKQTRPRSYKSKNAMPNELARFPLWPVSASPRLPRVRDVLDYITESGIAVSVELNEEHVESLLELMIYEGTVERILVQTTGDQGSRRRKKDAAAKKRKRAMMSSDEDGSDGGATARRKRKTKKGTSAARHRQANGKSSRKKSRLDSTNLDDDDDDDDESDASADFDEDEERGSDADNDPSKSKRKKKVRTKKPLRKVKPEDDDDKDAASAAYDSTSESSASERDEDDEEEEERLAALRHQREGGVNDYVYRTIREYHPVIGWTDMPCGKCPVESFCYEPPRRFAQPSAIPASRAARRPGFLFSGRPKIGIEIEGGMKGVGMIGGAGAAIGISTAKWGESKGAVGHGVAPVNPRDCQYFKNWLDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.31
3	0.32
4	0.34
5	0.4
6	0.4
7	0.38
8	0.34
9	0.33
10	0.33
11	0.29
12	0.26
13	0.2
14	0.19
15	0.2
16	0.2
17	0.19
18	0.17
19	0.17
20	0.17
21	0.17
22	0.14
23	0.12
24	0.15
25	0.18
26	0.22
27	0.22
28	0.22
29	0.23
30	0.22
31	0.19
32	0.19
33	0.19
34	0.17
35	0.16
36	0.15
37	0.17
38	0.18
39	0.18
40	0.15
41	0.13
42	0.13
43	0.16
44	0.16
45	0.14
46	0.17
47	0.18
48	0.17
49	0.19
50	0.25
51	0.25
52	0.27
53	0.29
54	0.33
55	0.35
56	0.35
57	0.33
58	0.28
59	0.28
60	0.3
61	0.27
62	0.24
63	0.22
64	0.23
65	0.23
66	0.22
67	0.25
68	0.23
69	0.24
70	0.22
71	0.23
72	0.22
73	0.2
74	0.19
75	0.14
76	0.12
77	0.11
78	0.11
79	0.09
80	0.09
81	0.09
82	0.09
83	0.08
84	0.09
85	0.11
86	0.1
87	0.13
88	0.16
89	0.19
90	0.2
91	0.21
92	0.25
93	0.25
94	0.25
95	0.22
96	0.2
97	0.18
98	0.19
99	0.22
100	0.25
101	0.26
102	0.31
103	0.32
104	0.37
105	0.44
106	0.51
107	0.47
108	0.43
109	0.46
110	0.44
111	0.47
112	0.51
113	0.48
114	0.42
115	0.43
116	0.41
117	0.41
118	0.44
119	0.45
120	0.44
121	0.48
122	0.46
123	0.45
124	0.5
125	0.5
126	0.47
127	0.47
128	0.49
129	0.48
130	0.51
131	0.51
132	0.47
133	0.49
134	0.48
135	0.41
136	0.35
137	0.3
138	0.27
139	0.29
140	0.34
141	0.32
142	0.32
143	0.36
144	0.35
145	0.35
146	0.37
147	0.35
148	0.31
149	0.33
150	0.36
151	0.33
152	0.33
153	0.3
154	0.26
155	0.24
156	0.21
157	0.16
158	0.1
159	0.08
160	0.07
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.08
165	0.07
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.09
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.05
182	0.06
183	0.1
184	0.13
185	0.16
186	0.26
187	0.29
188	0.34
189	0.41
190	0.47
191	0.54
192	0.55
193	0.58
194	0.59
195	0.62
196	0.67
197	0.68
198	0.7
199	0.68
200	0.68
201	0.67
202	0.59
203	0.59
204	0.53
205	0.47
206	0.39
207	0.31
208	0.27
209	0.22
210	0.22
211	0.15
212	0.12
213	0.12
214	0.17
215	0.21
216	0.22
217	0.24
218	0.29
219	0.32
220	0.32
221	0.33
222	0.31
223	0.29
224	0.29
225	0.3
226	0.24
227	0.22
228	0.22
229	0.2
230	0.16
231	0.13
232	0.11
233	0.08
234	0.06
235	0.05
236	0.04
237	0.03
238	0.03
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.05
244	0.04
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.06
267	0.07
268	0.08
269	0.08
270	0.14
271	0.24
272	0.32
273	0.35
274	0.37
275	0.38
276	0.43
277	0.52
278	0.58
279	0.59
280	0.63
281	0.7
282	0.74
283	0.8
284	0.78
285	0.7
286	0.63
287	0.58
288	0.55
289	0.5
290	0.44
291	0.38
292	0.34
293	0.31
294	0.27
295	0.2
296	0.11
297	0.07
298	0.05
299	0.07
300	0.08
301	0.16
302	0.23
303	0.29
304	0.36
305	0.44
306	0.54
307	0.62
308	0.72
309	0.75
310	0.78
311	0.82
312	0.85
313	0.89
314	0.88
315	0.84
316	0.77
317	0.67
318	0.65
319	0.58
320	0.57
321	0.55
322	0.56
323	0.56
324	0.62
325	0.7
326	0.68
327	0.7
328	0.68
329	0.69
330	0.67
331	0.66
332	0.63
333	0.58
334	0.6
335	0.55
336	0.49
337	0.39
338	0.31
339	0.26
340	0.21
341	0.15
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.05
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.07
361	0.08
362	0.14
363	0.16
364	0.17
365	0.19
366	0.23
367	0.32
368	0.4
369	0.49
370	0.53
371	0.62
372	0.71
373	0.81
374	0.88
375	0.91
376	0.93
377	0.95
378	0.95
379	0.95
380	0.95
381	0.93
382	0.93
383	0.91
384	0.89
385	0.87
386	0.83
387	0.79
388	0.74
389	0.7
390	0.6
391	0.51
392	0.41
393	0.31
394	0.24
395	0.18
396	0.11
397	0.06
398	0.06
399	0.05
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.08
406	0.09
407	0.1
408	0.11
409	0.1
410	0.12
411	0.13
412	0.14
413	0.15
414	0.16
415	0.15
416	0.15
417	0.14
418	0.12
419	0.1
420	0.1
421	0.08
422	0.1
423	0.16
424	0.18
425	0.21
426	0.22
427	0.23
428	0.26
429	0.28
430	0.29
431	0.25
432	0.23
433	0.22
434	0.22
435	0.23
436	0.2
437	0.19
438	0.16
439	0.16
440	0.19
441	0.24
442	0.24
443	0.26
444	0.27
445	0.28
446	0.27
447	0.25
448	0.25
449	0.2
450	0.23
451	0.23
452	0.22
453	0.22
454	0.24
455	0.23
456	0.22
457	0.23
458	0.25
459	0.26
460	0.27
461	0.31
462	0.35
463	0.45
464	0.46
465	0.48
466	0.46
467	0.49
468	0.51
469	0.5
470	0.45
471	0.44
472	0.48
473	0.51
474	0.54
475	0.48
476	0.44
477	0.43
478	0.46
479	0.43
480	0.4
481	0.4
482	0.37
483	0.38
484	0.39
485	0.41
486	0.4
487	0.37
488	0.4
489	0.41
490	0.47
491	0.45
492	0.44
493	0.4
494	0.38
495	0.37
496	0.3
497	0.25
498	0.18
499	0.19
500	0.18
501	0.17
502	0.14
503	0.12
504	0.1
505	0.09
506	0.05
507	0.04
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.02
514	0.02
515	0.02
516	0.02
517	0.02
518	0.02
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.06
523	0.07
524	0.11
525	0.12
526	0.15
527	0.16
528	0.18
529	0.18
530	0.18
531	0.2
532	0.19
533	0.19
534	0.18
535	0.2
536	0.21
537	0.24
538	0.25
539	0.24
540	0.28
541	0.29
542	0.32
543	0.35
544	0.41

A0A238FF49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer