FuNGI

A0A238FIH9

Protein Details

Accession

A0A238FIH9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
770-795	ANQPHPFTLRKPPPNQHRRPWIWILW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 13, cyto 6, extr 5, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000702 Ribosomal_L6 IPR020040 Ribosomal_L6_a/b-dom IPR036789 Ribosomal_L6_a/b-dom_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0005840 C:ribosome GO:0019843 F:rRNA binding GO:0003735 F:structural constituent of ribosome GO:0006412 P:translation
Pfam	View protein in Pfam PF00347 Ribosomal_L6 PF00078 RVT_1
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MTLFRRALGADFCSMCCGNPTRVGTPSLSLSSRSTLSFCTPSLPSSLMLARRIRLFTSSSPTSSHIGSQPVVLPSVVQLVAELAPRVASSPQRSTRLLVTGPKGQLALDIPPFIKLASPRMTSDSIVRGMARDAQPSSVILSVQDARIKHQRAIWGLTRSLLVNAVHGVSQGFSLPIRLVGVGYRASLEPASTLPATSSSSPSSALSKPGSNAQRLHLKLGFAHPVFIDLPHDVHASVPSTTNIVLSGIDKQRLGQVAARIRSWRVPEPYNGKGIFVGGEGLRRKEIKKNNLQYQASYISPADSHKLEKAYPLEEMTKAQESCKSNSSPGPDGLPVEFYRATWTLTGPILRDVINSIPTEGLSAEPSPRNIAHIHLIHKRGDRDQLVNKRPNSLINADERIIPQAHNQRLARLLESLIGSTQRGFVPSCWIGRNIAEVQCLMDPGIPGSPPVSGLLAVMDFEKAYDRLSHIYLDAVLQAVGLGPKARQWFRATHSTQSASIFLNGWLSAAFDVLSGVRQGDPLAPSLFVLAIEGFACQIRSRVKGIESPGLQTIRELLFAVDACCALHDLSDLQDLNRAIRLYERASASKLSNAKSFLYPLGSFRDHPVAPRLGTWRLSAPHFRYLGIQVGVDIAEDAGWEEVKSSTIARINSIPMYDLPHPAKCSIVNIYCYTKILYYNRFLPAPKSVVKEVEDAAMLAIHGRASDGTQRRPRVSRSRLYTPLDHGGFGLIDLPMRLAIDHAKWVFQLRDPDGCFTRHFFDVRIRLLAANQPHPFTLRKPPPNQHRRPWIWILWAYFCHPPPKWNQAVRETRRLLPPHWARYFEAWSSVTTLNPPEFSSNQNLER

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.23
3	0.24
4	0.25
5	0.24
6	0.3
7	0.35
8	0.34
9	0.37
10	0.4
11	0.37
12	0.35
13	0.35
14	0.32
15	0.28
16	0.27
17	0.26
18	0.27
19	0.27
20	0.25
21	0.23
22	0.21
23	0.25
24	0.26
25	0.24
26	0.25
27	0.25
28	0.25
29	0.26
30	0.25
31	0.2
32	0.21
33	0.26
34	0.25
35	0.31
36	0.33
37	0.33
38	0.36
39	0.37
40	0.35
41	0.33
42	0.33
43	0.31
44	0.36
45	0.37
46	0.34
47	0.35
48	0.36
49	0.35
50	0.32
51	0.31
52	0.26
53	0.26
54	0.25
55	0.25
56	0.25
57	0.24
58	0.24
59	0.2
60	0.17
61	0.14
62	0.17
63	0.15
64	0.1
65	0.09
66	0.1
67	0.11
68	0.12
69	0.12
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.1
74	0.12
75	0.17
76	0.22
77	0.31
78	0.38
79	0.43
80	0.45
81	0.46
82	0.47
83	0.46
84	0.44
85	0.41
86	0.39
87	0.41
88	0.4
89	0.39
90	0.35
91	0.29
92	0.28
93	0.23
94	0.23
95	0.17
96	0.19
97	0.18
98	0.19
99	0.19
100	0.17
101	0.18
102	0.15
103	0.2
104	0.24
105	0.27
106	0.28
107	0.32
108	0.34
109	0.32
110	0.34
111	0.32
112	0.27
113	0.25
114	0.24
115	0.2
116	0.19
117	0.25
118	0.23
119	0.22
120	0.22
121	0.21
122	0.22
123	0.22
124	0.22
125	0.16
126	0.14
127	0.11
128	0.13
129	0.14
130	0.15
131	0.18
132	0.17
133	0.21
134	0.3
135	0.32
136	0.32
137	0.33
138	0.37
139	0.38
140	0.44
141	0.45
142	0.41
143	0.39
144	0.37
145	0.34
146	0.29
147	0.26
148	0.23
149	0.16
150	0.13
151	0.13
152	0.12
153	0.11
154	0.11
155	0.1
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.1
169	0.09
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.11
174	0.11
175	0.1
176	0.09
177	0.08
178	0.11
179	0.1
180	0.1
181	0.09
182	0.11
183	0.13
184	0.14
185	0.16
186	0.14
187	0.15
188	0.16
189	0.17
190	0.19
191	0.18
192	0.21
193	0.21
194	0.21
195	0.21
196	0.28
197	0.31
198	0.31
199	0.32
200	0.32
201	0.39
202	0.38
203	0.42
204	0.36
205	0.33
206	0.3
207	0.32
208	0.35
209	0.26
210	0.26
211	0.21
212	0.21
213	0.21
214	0.19
215	0.17
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.13
220	0.1
221	0.1
222	0.11
223	0.11
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.11
228	0.11
229	0.1
230	0.09
231	0.08
232	0.08
233	0.07
234	0.14
235	0.15
236	0.17
237	0.17
238	0.17
239	0.2
240	0.21
241	0.21
242	0.18
243	0.22
244	0.27
245	0.29
246	0.3
247	0.29
248	0.29
249	0.31
250	0.33
251	0.32
252	0.31
253	0.32
254	0.37
255	0.42
256	0.43
257	0.45
258	0.41
259	0.35
260	0.29
261	0.27
262	0.21
263	0.14
264	0.13
265	0.07
266	0.12
267	0.13
268	0.14
269	0.16
270	0.18
271	0.2
272	0.27
273	0.36
274	0.41
275	0.5
276	0.58
277	0.65
278	0.72
279	0.71
280	0.63
281	0.59
282	0.51
283	0.41
284	0.33
285	0.24
286	0.15
287	0.15
288	0.15
289	0.13
290	0.11
291	0.13
292	0.14
293	0.16
294	0.15
295	0.18
296	0.2
297	0.18
298	0.18
299	0.18
300	0.18
301	0.17
302	0.18
303	0.17
304	0.19
305	0.18
306	0.17
307	0.22
308	0.23
309	0.25
310	0.28
311	0.27
312	0.25
313	0.28
314	0.32
315	0.28
316	0.26
317	0.25
318	0.22
319	0.21
320	0.19
321	0.19
322	0.14
323	0.15
324	0.14
325	0.12
326	0.14
327	0.14
328	0.15
329	0.12
330	0.13
331	0.12
332	0.13
333	0.13
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.1
340	0.1
341	0.11
342	0.11
343	0.1
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.07
349	0.06
350	0.07
351	0.09
352	0.1
353	0.1
354	0.12
355	0.12
356	0.13
357	0.12
358	0.13
359	0.16
360	0.18
361	0.23
362	0.26
363	0.29
364	0.3
365	0.33
366	0.33
367	0.3
368	0.33
369	0.3
370	0.3
371	0.36
372	0.42
373	0.47
374	0.52
375	0.5
376	0.48
377	0.47
378	0.44
379	0.38
380	0.31
381	0.26
382	0.22
383	0.24
384	0.21
385	0.21
386	0.19
387	0.18
388	0.16
389	0.14
390	0.15
391	0.21
392	0.22
393	0.27
394	0.27
395	0.27
396	0.3
397	0.3
398	0.26
399	0.19
400	0.17
401	0.13
402	0.13
403	0.12
404	0.08
405	0.08
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.06
410	0.07
411	0.08
412	0.08
413	0.13
414	0.15
415	0.16
416	0.15
417	0.16
418	0.16
419	0.15
420	0.18
421	0.15
422	0.15
423	0.13
424	0.12
425	0.13
426	0.12
427	0.12
428	0.08
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.05
435	0.06
436	0.05
437	0.05
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.04
444	0.05
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.06
453	0.07
454	0.09
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.09
460	0.09
461	0.07
462	0.06
463	0.05
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.03
469	0.04
470	0.04
471	0.07
472	0.12
473	0.13
474	0.16
475	0.18
476	0.22
477	0.27
478	0.36
479	0.36
480	0.35
481	0.38
482	0.37
483	0.35
484	0.32
485	0.3
486	0.2
487	0.19
488	0.15
489	0.12
490	0.11
491	0.09
492	0.08
493	0.06
494	0.06
495	0.05
496	0.05
497	0.04
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.07
508	0.08
509	0.09
510	0.1
511	0.09
512	0.09
513	0.09
514	0.09
515	0.07
516	0.06
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.05
525	0.08
526	0.1
527	0.13
528	0.15
529	0.17
530	0.18
531	0.22
532	0.25
533	0.29
534	0.27
535	0.26
536	0.28
537	0.27
538	0.25
539	0.21
540	0.2
541	0.14
542	0.14
543	0.12
544	0.08
545	0.09
546	0.09
547	0.1
548	0.07
549	0.07
550	0.06
551	0.06
552	0.07
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.06
558	0.1
559	0.1
560	0.09
561	0.13
562	0.13
563	0.14
564	0.16
565	0.15
566	0.12
567	0.14
568	0.17
569	0.15
570	0.19
571	0.21
572	0.2
573	0.22
574	0.24
575	0.23
576	0.25
577	0.27
578	0.25
579	0.26
580	0.26
581	0.27
582	0.25
583	0.26
584	0.22
585	0.21
586	0.2
587	0.18
588	0.22
589	0.22
590	0.22
591	0.23
592	0.27
593	0.23
594	0.25
595	0.28
596	0.25
597	0.24
598	0.26
599	0.28
600	0.25
601	0.27
602	0.27
603	0.25
604	0.25
605	0.28
606	0.32
607	0.32
608	0.36
609	0.35
610	0.34
611	0.32
612	0.31
613	0.32
614	0.26
615	0.22
616	0.15
617	0.15
618	0.14
619	0.12
620	0.09
621	0.04
622	0.04
623	0.04
624	0.04
625	0.04
626	0.04
627	0.04
628	0.05
629	0.05
630	0.06
631	0.07
632	0.07
633	0.11
634	0.15
635	0.16
636	0.17
637	0.19
638	0.2
639	0.21
640	0.2
641	0.18
642	0.15
643	0.19
644	0.19
645	0.23
646	0.24
647	0.26
648	0.28
649	0.27
650	0.28
651	0.24
652	0.25
653	0.26
654	0.26
655	0.27
656	0.28
657	0.32
658	0.31
659	0.31
660	0.29
661	0.24
662	0.26
663	0.28
664	0.3
665	0.3
666	0.34
667	0.36
668	0.37
669	0.37
670	0.34
671	0.34
672	0.34
673	0.34
674	0.34
675	0.33
676	0.34
677	0.36
678	0.35
679	0.3
680	0.26
681	0.22
682	0.17
683	0.15
684	0.11
685	0.09
686	0.07
687	0.07
688	0.05
689	0.05
690	0.05
691	0.05
692	0.07
693	0.16
694	0.21
695	0.3
696	0.38
697	0.44
698	0.5
699	0.54
700	0.61
701	0.64
702	0.67
703	0.67
704	0.67
705	0.7
706	0.72
707	0.72
708	0.68
709	0.63
710	0.63
711	0.54
712	0.46
713	0.37
714	0.3
715	0.25
716	0.2
717	0.16
718	0.07
719	0.07
720	0.07
721	0.07
722	0.06
723	0.07
724	0.06
725	0.07
726	0.1
727	0.11
728	0.18
729	0.18
730	0.18
731	0.19
732	0.24
733	0.24
734	0.25
735	0.32
736	0.28
737	0.35
738	0.36
739	0.41
740	0.39
741	0.39
742	0.37
743	0.33
744	0.34
745	0.3
746	0.29
747	0.26
748	0.33
749	0.38
750	0.39
751	0.38
752	0.35
753	0.32
754	0.33
755	0.37
756	0.34
757	0.35
758	0.34
759	0.33
760	0.32
761	0.34
762	0.35
763	0.33
764	0.39
765	0.41
766	0.49
767	0.56
768	0.66
769	0.74
770	0.83
771	0.88
772	0.87
773	0.88
774	0.85
775	0.83
776	0.81
777	0.74
778	0.7
779	0.66
780	0.6
781	0.53
782	0.48
783	0.43
784	0.41
785	0.4
786	0.4
787	0.36
788	0.37
789	0.41
790	0.49
791	0.55
792	0.56
793	0.61
794	0.63
795	0.73
796	0.75
797	0.78
798	0.73
799	0.69
800	0.71
801	0.68
802	0.59
803	0.59
804	0.61
805	0.61
806	0.62
807	0.6
808	0.55
809	0.57
810	0.61
811	0.51
812	0.47
813	0.37
814	0.33
815	0.34
816	0.31
817	0.26
818	0.23
819	0.26
820	0.23
821	0.24
822	0.24
823	0.25
824	0.26
825	0.29
826	0.35

A0A238FIH9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer