Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238F5J3

Protein Details
Accession A0A238F5J3    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-102DGEGKGKKKLKVKKVKDPNAPKRPASBasic
226-250ASGSGDKKKTPKSSKKQKDFAPVSSHydrophilic
270-298VAPPPKKSPISKKGKALPEHKPKSKKAKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-99GKGKKKLKVKKVKDPNAPKR
192-197KKRGRK
233-241KKTPKSSKK
273-298PPKKSPISKKGKALPEHKPKSKKAKH
Subcellular Location(s) cyto 12.5, nucl 10.5, cyto_mito 7.833, mito_nucl 6.833, cyto_pero 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSDKRQALANAYVELASSLTRAANAADAYARELGVASAPAQLEALVANPPNLPFYGAKHGSKAAAAHAAAGSDEEEDGEGKGKKKLKVKKVKDPNAPKRPASAYIEFQNSVRDEFRQADPEATYQEILRKISGVWQAMPDHEKKRWNDITAEKTIEYEKAKRNYKPVEGAEAAAAIPAVITVGKDGKEYTGKKRGRKSNAEKAAEAAHGLVDTNGNIDVATGGILASGSGDKKKTPKSSKKQKDFAPVSSDSDESESDSDDSSEEEEEEVAPPPKKSPISKKGKALPEHKPKSKKAKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.16
3 0.09
4 0.07
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.13
16 0.14
17 0.13
18 0.1
19 0.1
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.07
24 0.09
25 0.09
26 0.1
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.13
40 0.12
41 0.16
42 0.24
43 0.28
44 0.29
45 0.3
46 0.31
47 0.29
48 0.29
49 0.26
50 0.19
51 0.18
52 0.17
53 0.16
54 0.14
55 0.14
56 0.12
57 0.12
58 0.1
59 0.06
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.09
66 0.11
67 0.12
68 0.18
69 0.24
70 0.29
71 0.38
72 0.47
73 0.54
74 0.63
75 0.7
76 0.75
77 0.81
78 0.85
79 0.87
80 0.89
81 0.89
82 0.88
83 0.85
84 0.75
85 0.68
86 0.62
87 0.56
88 0.51
89 0.44
90 0.37
91 0.36
92 0.38
93 0.33
94 0.3
95 0.29
96 0.23
97 0.21
98 0.18
99 0.15
100 0.15
101 0.17
102 0.19
103 0.19
104 0.19
105 0.19
106 0.19
107 0.19
108 0.18
109 0.15
110 0.14
111 0.1
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.16
119 0.19
120 0.16
121 0.15
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.2
126 0.19
127 0.18
128 0.21
129 0.26
130 0.25
131 0.34
132 0.36
133 0.35
134 0.36
135 0.39
136 0.41
137 0.37
138 0.38
139 0.29
140 0.26
141 0.25
142 0.23
143 0.2
144 0.2
145 0.24
146 0.31
147 0.36
148 0.37
149 0.44
150 0.46
151 0.47
152 0.48
153 0.42
154 0.4
155 0.35
156 0.34
157 0.26
158 0.22
159 0.18
160 0.11
161 0.1
162 0.04
163 0.03
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.03
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.09
174 0.16
175 0.19
176 0.25
177 0.34
178 0.39
179 0.46
180 0.55
181 0.62
182 0.64
183 0.72
184 0.74
185 0.75
186 0.8
187 0.76
188 0.67
189 0.59
190 0.53
191 0.42
192 0.33
193 0.22
194 0.12
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.05
215 0.06
216 0.08
217 0.09
218 0.12
219 0.19
220 0.28
221 0.38
222 0.47
223 0.57
224 0.66
225 0.77
226 0.86
227 0.89
228 0.9
229 0.87
230 0.87
231 0.81
232 0.75
233 0.7
234 0.61
235 0.56
236 0.5
237 0.43
238 0.33
239 0.29
240 0.25
241 0.2
242 0.18
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.11
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.16
258 0.17
259 0.18
260 0.2
261 0.26
262 0.31
263 0.39
264 0.47
265 0.53
266 0.62
267 0.69
268 0.76
269 0.78
270 0.81
271 0.81
272 0.78
273 0.78
274 0.79
275 0.82
276 0.82
277 0.82
278 0.82