Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238FQA3

Protein Details
Accession A0A238FQA3    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27YNVTRFTRQVLKRYRKEPPSLVHydrophilic
205-226SMLRATTPRPPKRKRSRAASEGHydrophilic
416-452VLEARQRAQANKKRQENKLRKEKRKLEKEKQLALANDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-221RPPKRKRSR
421-444QRAQANKKRQENKLRKEKRKLEKE
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 11, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAGATYNVTRFTRQVLKRYRKEPPSLVLHLYNTHFRFEQQHGNFNYDSPMKCFLEAIREQKLPTDLLDVLDEAGVRYYEGCLIVEVHDHRDQSYSSAAPAQPSIRPGLALSFQLGRQAQPVAQSRAEVYRIVLGPNPATLWTELGIMDRRIRETAEENAAEGGVESETLGWTEEEAVEIEAIILARTTAPLCLSPSLQTSRIANSMLRATTPRPPKRKRSRAASEGEAEEDGEDVLRREREEHEKMMKLGDEGVSRGRGHAFARLAFIQSYRERQNNPQDAVQAGPSAAATAGNGGGNATTSSTAGAAQSPTNVIRITTPVHQIPPSGASTPRTAGSPPASISDRKKKMPIDIAASTADDASEAGTPESATLPATSAAAVAHAASTKKAKKIAAQSVSSSVVDPTLPSDPAEREKVLEARQRAQANKKRQENKLRKEKRKLEKEKQLALANDVKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.54
3 0.63
4 0.7
5 0.77
6 0.81
7 0.79
8 0.82
9 0.78
10 0.75
11 0.73
12 0.68
13 0.65
14 0.59
15 0.52
16 0.48
17 0.45
18 0.46
19 0.38
20 0.37
21 0.32
22 0.3
23 0.34
24 0.34
25 0.42
26 0.37
27 0.45
28 0.43
29 0.48
30 0.46
31 0.41
32 0.41
33 0.36
34 0.33
35 0.28
36 0.33
37 0.29
38 0.29
39 0.3
40 0.25
41 0.29
42 0.33
43 0.35
44 0.36
45 0.36
46 0.36
47 0.38
48 0.39
49 0.31
50 0.27
51 0.25
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.14
72 0.15
73 0.18
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.19
80 0.21
81 0.17
82 0.15
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.2
90 0.21
91 0.17
92 0.16
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.18
101 0.18
102 0.16
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.2
107 0.26
108 0.25
109 0.25
110 0.25
111 0.25
112 0.27
113 0.28
114 0.21
115 0.16
116 0.17
117 0.17
118 0.18
119 0.18
120 0.16
121 0.15
122 0.15
123 0.15
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.12
133 0.12
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.17
141 0.2
142 0.22
143 0.21
144 0.2
145 0.2
146 0.19
147 0.16
148 0.13
149 0.09
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.13
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.19
198 0.29
199 0.36
200 0.44
201 0.51
202 0.61
203 0.71
204 0.8
205 0.8
206 0.8
207 0.81
208 0.78
209 0.76
210 0.68
211 0.6
212 0.5
213 0.43
214 0.32
215 0.23
216 0.16
217 0.11
218 0.07
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.08
226 0.12
227 0.19
228 0.23
229 0.28
230 0.31
231 0.32
232 0.32
233 0.31
234 0.28
235 0.21
236 0.18
237 0.15
238 0.11
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.15
248 0.15
249 0.14
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.16
257 0.2
258 0.21
259 0.25
260 0.27
261 0.34
262 0.43
263 0.46
264 0.46
265 0.43
266 0.4
267 0.37
268 0.35
269 0.28
270 0.18
271 0.11
272 0.09
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.11
304 0.14
305 0.15
306 0.19
307 0.19
308 0.22
309 0.22
310 0.21
311 0.2
312 0.21
313 0.2
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.19
318 0.2
319 0.19
320 0.17
321 0.16
322 0.18
323 0.19
324 0.19
325 0.18
326 0.2
327 0.22
328 0.26
329 0.34
330 0.4
331 0.43
332 0.44
333 0.5
334 0.49
335 0.54
336 0.58
337 0.55
338 0.51
339 0.47
340 0.45
341 0.4
342 0.37
343 0.3
344 0.21
345 0.16
346 0.09
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.06
352 0.07
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.07
370 0.08
371 0.1
372 0.18
373 0.23
374 0.27
375 0.32
376 0.34
377 0.39
378 0.49
379 0.57
380 0.56
381 0.54
382 0.53
383 0.52
384 0.52
385 0.45
386 0.35
387 0.25
388 0.19
389 0.16
390 0.13
391 0.13
392 0.13
393 0.13
394 0.13
395 0.16
396 0.19
397 0.25
398 0.29
399 0.27
400 0.26
401 0.3
402 0.34
403 0.38
404 0.42
405 0.42
406 0.42
407 0.49
408 0.53
409 0.56
410 0.62
411 0.64
412 0.67
413 0.72
414 0.77
415 0.79
416 0.83
417 0.88
418 0.88
419 0.89
420 0.9
421 0.91
422 0.91
423 0.93
424 0.94
425 0.93
426 0.94
427 0.94
428 0.93
429 0.93
430 0.92
431 0.9
432 0.87
433 0.82
434 0.73
435 0.67