FuNGI

A0A238FFI6

Protein Details

Accession

A0A238FFI6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
761-780	QRWKLWWKALRKIRRVHSDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 11.5, cyto_mito 8.5, nucl 6, cyto 4.5, extr 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000477 RT_dom
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MSITFFKSALVISKPARLTVHSMVVARFQVPGAIDIGPGKFKLGLHVIEGDATCEYLSFTVQTLYNEALLQTPDDPKAAWTTTKHRLLPQLQALARTLARFRRGGSEQERADHSRYGAALRSRIDTSLAGPFSIFIRLRKVRASDLIPSLTLNDVVLSDPDSMLGAASDYFERVYQDRPIDDAALEEIIDGLASTRLSPEDSHELEKTYPLEEMTKAQKSFEFYRATWAATGPILRDVINSIPTEGPRPEPSPRNTAHIHLIHKRGDRDQLANKRPISLINADERFISQAHKQRLAPLLESLIGPTQRGFVPNRWIGTNIAEVQCLIDPEIPGSAPLSGLLAVMDFEKAYDRLSHTYLDAVLRAVGLGPKARQWYRATYTSQSASIFLNGWLSAAFDVLSGVRRGDPLAPSLFVLAIEGFACQIRSRVKGMESAGLQTIRELLADDACCTPHDISDLDHLNEAIRVYERASASKLSNTKSFLYPLATRSSVTFGIQVGVDTAEDAGWDEVKSATIARIRFIPMYDLPYAAKCSIINIYCYTKVLFYNRFLPLPRVSSRRSWMPPCSQFTVETRMALKGARWSPGRASAPLDHGGFGLIDLPMRLAIDHSKWVFQLRDSDDCFIRHLFDVRIRLQAANQPHPFTLRKPPPSQHRRSWIWIWWAYFCHPPPKWNHAVRETRRLLPPRWARYSEAWASRWANHVLFFPAGHGIQLSVNPTFFRGPDGELMTQASFIDASKRRHAFVFPPIIPEGHQKIFSFPEQRWKLWWKALRKIRRVHSDAEDTAHLLSLGSLHPGVQLSLSHLAVGCPFARRLWAALSPSPHPILADFVCPLVSRSGRRLVELRVLFFHSIWKVSRRRRFSSQLLEPITETEFGELRDSIEGCKGRLVSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.33
3	0.34
4	0.31
5	0.35
6	0.34
7	0.38
8	0.34
9	0.36
10	0.33
11	0.35
12	0.34
13	0.28
14	0.24
15	0.17
16	0.16
17	0.15
18	0.16
19	0.14
20	0.12
21	0.13
22	0.14
23	0.16
24	0.15
25	0.15
26	0.15
27	0.15
28	0.15
29	0.19
30	0.22
31	0.22
32	0.22
33	0.25
34	0.24
35	0.24
36	0.24
37	0.2
38	0.15
39	0.14
40	0.11
41	0.09
42	0.09
43	0.07
44	0.08
45	0.07
46	0.08
47	0.1
48	0.12
49	0.13
50	0.15
51	0.16
52	0.16
53	0.16
54	0.15
55	0.14
56	0.13
57	0.14
58	0.14
59	0.16
60	0.16
61	0.17
62	0.17
63	0.16
64	0.2
65	0.21
66	0.23
67	0.25
68	0.31
69	0.4
70	0.48
71	0.5
72	0.5
73	0.57
74	0.57
75	0.6
76	0.6
77	0.59
78	0.52
79	0.51
80	0.47
81	0.42
82	0.39
83	0.32
84	0.3
85	0.27
86	0.3
87	0.3
88	0.3
89	0.35
90	0.37
91	0.44
92	0.45
93	0.48
94	0.46
95	0.48
96	0.52
97	0.48
98	0.48
99	0.41
100	0.35
101	0.3
102	0.28
103	0.27
104	0.27
105	0.27
106	0.28
107	0.27
108	0.3
109	0.28
110	0.27
111	0.27
112	0.22
113	0.21
114	0.24
115	0.22
116	0.19
117	0.17
118	0.17
119	0.16
120	0.22
121	0.21
122	0.15
123	0.25
124	0.29
125	0.31
126	0.36
127	0.38
128	0.37
129	0.41
130	0.43
131	0.4
132	0.4
133	0.39
134	0.34
135	0.31
136	0.28
137	0.23
138	0.19
139	0.13
140	0.09
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.08
150	0.07
151	0.06
152	0.05
153	0.04
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.1
160	0.11
161	0.14
162	0.18
163	0.2
164	0.21
165	0.22
166	0.23
167	0.22
168	0.2
169	0.18
170	0.14
171	0.11
172	0.1
173	0.08
174	0.06
175	0.05
176	0.05
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.05
181	0.05
182	0.06
183	0.07
184	0.08
185	0.09
186	0.13
187	0.19
188	0.21
189	0.25
190	0.25
191	0.26
192	0.25
193	0.27
194	0.24
195	0.17
196	0.16
197	0.13
198	0.15
199	0.14
200	0.18
201	0.22
202	0.27
203	0.26
204	0.27
205	0.28
206	0.31
207	0.35
208	0.37
209	0.35
210	0.29
211	0.37
212	0.37
213	0.36
214	0.31
215	0.27
216	0.22
217	0.18
218	0.18
219	0.11
220	0.12
221	0.12
222	0.11
223	0.11
224	0.12
225	0.12
226	0.14
227	0.14
228	0.13
229	0.14
230	0.15
231	0.18
232	0.17
233	0.19
234	0.2
235	0.24
236	0.28
237	0.34
238	0.37
239	0.41
240	0.41
241	0.43
242	0.41
243	0.41
244	0.42
245	0.4
246	0.42
247	0.4
248	0.44
249	0.44
250	0.47
251	0.47
252	0.42
253	0.44
254	0.41
255	0.41
256	0.46
257	0.5
258	0.53
259	0.56
260	0.54
261	0.49
262	0.46
263	0.41
264	0.36
265	0.3
266	0.26
267	0.27
268	0.28
269	0.26
270	0.26
271	0.25
272	0.22
273	0.18
274	0.18
275	0.16
276	0.23
277	0.27
278	0.32
279	0.32
280	0.35
281	0.41
282	0.41
283	0.36
284	0.29
285	0.26
286	0.22
287	0.21
288	0.17
289	0.13
290	0.12
291	0.11
292	0.1
293	0.1
294	0.1
295	0.13
296	0.15
297	0.16
298	0.23
299	0.26
300	0.27
301	0.26
302	0.27
303	0.25
304	0.25
305	0.24
306	0.2
307	0.17
308	0.16
309	0.15
310	0.14
311	0.14
312	0.12
313	0.1
314	0.08
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.08
338	0.1
339	0.12
340	0.14
341	0.14
342	0.13
343	0.14
344	0.14
345	0.13
346	0.11
347	0.09
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.07
355	0.07
356	0.1
357	0.15
358	0.16
359	0.2
360	0.22
361	0.28
362	0.31
363	0.36
364	0.36
365	0.34
366	0.36
367	0.33
368	0.32
369	0.25
370	0.22
371	0.17
372	0.14
373	0.12
374	0.1
375	0.09
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.05
381	0.04
382	0.04
383	0.03
384	0.04
385	0.04
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.09
393	0.09
394	0.1
395	0.11
396	0.11
397	0.11
398	0.11
399	0.1
400	0.08
401	0.07
402	0.05
403	0.04
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.07
411	0.09
412	0.11
413	0.12
414	0.14
415	0.15
416	0.18
417	0.19
418	0.2
419	0.18
420	0.17
421	0.17
422	0.15
423	0.14
424	0.11
425	0.1
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.06
431	0.07
432	0.08
433	0.07
434	0.08
435	0.08
436	0.09
437	0.09
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.13
443	0.14
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.12
448	0.12
449	0.11
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.1
455	0.11
456	0.11
457	0.12
458	0.14
459	0.14
460	0.18
461	0.2
462	0.19
463	0.21
464	0.23
465	0.24
466	0.23
467	0.23
468	0.2
469	0.2
470	0.19
471	0.19
472	0.2
473	0.18
474	0.17
475	0.17
476	0.18
477	0.15
478	0.14
479	0.13
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.06
485	0.06
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.04
492	0.03
493	0.04
494	0.04
495	0.04
496	0.04
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.07
501	0.1
502	0.11
503	0.11
504	0.13
505	0.14
506	0.14
507	0.14
508	0.16
509	0.13
510	0.17
511	0.17
512	0.16
513	0.15
514	0.15
515	0.17
516	0.13
517	0.13
518	0.09
519	0.1
520	0.13
521	0.13
522	0.14
523	0.15
524	0.18
525	0.17
526	0.18
527	0.17
528	0.15
529	0.16
530	0.19
531	0.2
532	0.2
533	0.25
534	0.26
535	0.28
536	0.27
537	0.29
538	0.26
539	0.28
540	0.3
541	0.28
542	0.29
543	0.32
544	0.35
545	0.39
546	0.42
547	0.42
548	0.44
549	0.48
550	0.52
551	0.52
552	0.53
553	0.46
554	0.43
555	0.4
556	0.41
557	0.33
558	0.28
559	0.24
560	0.2
561	0.2
562	0.18
563	0.17
564	0.17
565	0.18
566	0.22
567	0.22
568	0.23
569	0.25
570	0.32
571	0.33
572	0.27
573	0.29
574	0.26
575	0.29
576	0.3
577	0.29
578	0.21
579	0.19
580	0.18
581	0.14
582	0.11
583	0.09
584	0.05
585	0.05
586	0.04
587	0.05
588	0.04
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.07
593	0.09
594	0.14
595	0.15
596	0.15
597	0.16
598	0.2
599	0.19
600	0.18
601	0.24
602	0.23
603	0.28
604	0.29
605	0.31
606	0.3
607	0.3
608	0.3
609	0.23
610	0.21
611	0.16
612	0.17
613	0.17
614	0.19
615	0.24
616	0.24
617	0.27
618	0.27
619	0.26
620	0.25
621	0.28
622	0.3
623	0.34
624	0.34
625	0.32
626	0.31
627	0.35
628	0.35
629	0.34
630	0.38
631	0.39
632	0.44
633	0.48
634	0.55
635	0.62
636	0.71
637	0.75
638	0.73
639	0.73
640	0.71
641	0.71
642	0.68
643	0.63
644	0.61
645	0.56
646	0.49
647	0.43
648	0.39
649	0.36
650	0.37
651	0.33
652	0.34
653	0.31
654	0.35
655	0.39
656	0.46
657	0.52
658	0.53
659	0.58
660	0.58
661	0.68
662	0.68
663	0.72
664	0.68
665	0.64
666	0.65
667	0.64
668	0.57
669	0.56
670	0.6
671	0.58
672	0.61
673	0.59
674	0.55
675	0.54
676	0.59
677	0.56
678	0.52
679	0.45
680	0.43
681	0.43
682	0.4
683	0.4
684	0.36
685	0.29
686	0.25
687	0.26
688	0.22
689	0.21
690	0.19
691	0.15
692	0.15
693	0.14
694	0.12
695	0.11
696	0.09
697	0.09
698	0.11
699	0.12
700	0.11
701	0.11
702	0.11
703	0.13
704	0.14
705	0.13
706	0.15
707	0.13
708	0.15
709	0.18
710	0.22
711	0.21
712	0.21
713	0.22
714	0.19
715	0.18
716	0.16
717	0.12
718	0.08
719	0.08
720	0.15
721	0.2
722	0.25
723	0.34
724	0.36
725	0.37
726	0.39
727	0.42
728	0.38
729	0.41
730	0.46
731	0.38
732	0.4
733	0.4
734	0.38
735	0.36
736	0.38
737	0.35
738	0.28
739	0.3
740	0.27
741	0.28
742	0.32
743	0.36
744	0.33
745	0.29
746	0.37
747	0.38
748	0.39
749	0.43
750	0.45
751	0.46
752	0.51
753	0.56
754	0.54
755	0.59
756	0.68
757	0.72
758	0.74
759	0.78
760	0.78
761	0.81
762	0.77
763	0.73
764	0.7
765	0.67
766	0.6
767	0.55
768	0.46
769	0.36
770	0.33
771	0.27
772	0.19
773	0.12
774	0.1
775	0.08
776	0.07
777	0.08
778	0.08
779	0.08
780	0.09
781	0.1
782	0.1
783	0.09
784	0.09
785	0.12
786	0.15
787	0.15
788	0.15
789	0.14
790	0.14
791	0.14
792	0.16
793	0.13
794	0.12
795	0.13
796	0.13
797	0.16
798	0.17
799	0.18
800	0.2
801	0.24
802	0.27
803	0.3
804	0.34
805	0.33
806	0.36
807	0.35
808	0.31
809	0.26
810	0.22
811	0.23
812	0.2
813	0.21
814	0.17
815	0.16
816	0.17
817	0.16
818	0.17
819	0.18
820	0.21
821	0.22
822	0.27
823	0.36
824	0.36
825	0.4
826	0.42
827	0.4
828	0.46
829	0.45
830	0.43
831	0.37
832	0.39
833	0.37
834	0.33
835	0.34
836	0.27
837	0.28
838	0.29
839	0.34
840	0.4
841	0.5
842	0.6
843	0.62
844	0.67
845	0.73
846	0.78
847	0.79
848	0.79
849	0.78
850	0.78
851	0.73
852	0.67
853	0.59
854	0.52
855	0.44
856	0.35
857	0.26
858	0.19
859	0.16
860	0.15
861	0.17
862	0.15
863	0.15
864	0.17
865	0.18
866	0.17
867	0.23
868	0.24
869	0.22
870	0.27

A0A238FFI6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer