FuNGI

A0A238F5Z9

Protein Details

Accession

A0A238F5Z9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
644-665	TEQRWKSWWKALRKVRRVHSDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000477 RT_dom
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MLGAASDYFESVYQDRPIDDAALEIIDGLASTRFSPADSHKLERAYPLEEMTKSQESCKSNSSPGPDGLPVEFYRATWTVTGPILRDVINSIPTEGLSAEPSPRNIAHIHLIHKRGERDQLVNKRPISLINADERIISQAHNQRLAPLLESLVGPTQRGFVPNRWIGTNIAEVQCVMDPEIPGSPPVSGLLAVMDFEKAYDRLSHTYLDAVLRAVGLGPKARQWYRATYTNQSASVFLNGWLSAAFDVLSGVRQGDPLAPSLFALAIEGFACQIRSRVKGIESPGLQTIRELLFADDACCALHDLSDLQDLNLAIGLYERASASKLSNTKSFLYPLGSFRNHPIVPRLGTWRLSDSQFRYLGIQVGVDIAEDAGWEEVKSSTIARINSIPMYDLPYAAKCSIVNIYCYTKVLFYNRFLPAPKSVVKEIEDTAMLAIHGRDSDGTRRRPMVSRSRLCTPLDHGGFGLIDLPMRLAIDHTKWVFQLRDPDGCFTQHLFDVRIRLLAANQPHPFTLRKPPPNQHRRPWIWIWWAYFCHPPPKCYHAVRETRCLLPPRWARYFEAWASVTTLNPPEFSSNQNLERWANHVLFFPAGHGIQLSVNPTLFRGPDGEVMTPTSFIDTSKRRHAFVFPPIIPEGHQKIFSLTEQRWKSWWKALRKVRRVHSDAEDTAHLLSLGSLHPGAQLASPVHTQLNNRSTFCVMCLSEATESLAHLAVGCPFARRLWGALSPAPHPTFLDFVCPVVSRSERRLVELRILFFHSIWKLSRRRRFSSDPLEPITETGFEDLRASIQESKGRLVSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.2
3	0.2
4	0.21
5	0.19
6	0.18
7	0.14
8	0.12
9	0.11
10	0.1
11	0.08
12	0.07
13	0.05
14	0.05
15	0.05
16	0.05
17	0.06
18	0.06
19	0.08
20	0.09
21	0.1
22	0.14
23	0.2
24	0.29
25	0.33
26	0.37
27	0.4
28	0.43
29	0.44
30	0.45
31	0.42
32	0.36
33	0.32
34	0.31
35	0.31
36	0.29
37	0.31
38	0.31
39	0.34
40	0.32
41	0.34
42	0.38
43	0.36
44	0.39
45	0.43
46	0.41
47	0.41
48	0.45
49	0.47
50	0.44
51	0.43
52	0.43
53	0.38
54	0.36
55	0.3
56	0.3
57	0.24
58	0.24
59	0.22
60	0.19
61	0.23
62	0.22
63	0.22
64	0.19
65	0.2
66	0.18
67	0.2
68	0.22
69	0.18
70	0.19
71	0.19
72	0.18
73	0.18
74	0.17
75	0.17
76	0.19
77	0.18
78	0.16
79	0.15
80	0.15
81	0.15
82	0.13
83	0.12
84	0.11
85	0.11
86	0.15
87	0.17
88	0.18
89	0.21
90	0.21
91	0.23
92	0.21
93	0.23
94	0.26
95	0.28
96	0.33
97	0.37
98	0.4
99	0.43
100	0.47
101	0.48
102	0.45
103	0.48
104	0.46
105	0.46
106	0.53
107	0.58
108	0.61
109	0.64
110	0.61
111	0.55
112	0.52
113	0.47
114	0.42
115	0.36
116	0.32
117	0.31
118	0.33
119	0.3
120	0.3
121	0.28
122	0.24
123	0.21
124	0.17
125	0.18
126	0.24
127	0.28
128	0.31
129	0.31
130	0.31
131	0.34
132	0.34
133	0.28
134	0.22
135	0.18
136	0.15
137	0.15
138	0.14
139	0.14
140	0.14
141	0.12
142	0.12
143	0.13
144	0.13
145	0.17
146	0.19
147	0.2
148	0.28
149	0.32
150	0.33
151	0.32
152	0.33
153	0.31
154	0.3
155	0.3
156	0.25
157	0.22
158	0.2
159	0.19
160	0.18
161	0.18
162	0.16
163	0.13
164	0.1
165	0.09
166	0.11
167	0.12
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.1
172	0.08
173	0.09
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.05
183	0.05
184	0.07
185	0.07
186	0.08
187	0.1
188	0.13
189	0.16
190	0.18
191	0.18
192	0.17
193	0.18
194	0.18
195	0.16
196	0.14
197	0.11
198	0.09
199	0.08
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.09
205	0.09
206	0.13
207	0.19
208	0.2
209	0.25
210	0.27
211	0.34
212	0.37
213	0.45
214	0.46
215	0.46
216	0.51
217	0.48
218	0.47
219	0.4
220	0.35
221	0.28
222	0.25
223	0.19
224	0.14
225	0.12
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.08
243	0.09
244	0.1
245	0.11
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.07
251	0.07
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.08
261	0.11
262	0.13
263	0.15
264	0.17
265	0.19
266	0.22
267	0.26
268	0.29
269	0.27
270	0.26
271	0.28
272	0.27
273	0.25
274	0.21
275	0.2
276	0.14
277	0.14
278	0.13
279	0.09
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.1
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.04
308	0.05
309	0.06
310	0.07
311	0.12
312	0.15
313	0.17
314	0.2
315	0.23
316	0.24
317	0.25
318	0.25
319	0.21
320	0.22
321	0.21
322	0.21
323	0.24
324	0.24
325	0.23
326	0.24
327	0.3
328	0.26
329	0.25
330	0.26
331	0.23
332	0.23
333	0.25
334	0.27
335	0.23
336	0.25
337	0.25
338	0.25
339	0.23
340	0.24
341	0.26
342	0.24
343	0.26
344	0.25
345	0.24
346	0.22
347	0.2
348	0.2
349	0.16
350	0.13
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.05
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.07
369	0.11
370	0.11
371	0.12
372	0.13
373	0.14
374	0.14
375	0.14
376	0.12
377	0.09
378	0.13
379	0.12
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.12
384	0.12
385	0.12
386	0.07
387	0.09
388	0.11
389	0.11
390	0.12
391	0.13
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.15
396	0.12
397	0.13
398	0.16
399	0.17
400	0.17
401	0.22
402	0.23
403	0.24
404	0.24
405	0.25
406	0.22
407	0.23
408	0.25
409	0.22
410	0.21
411	0.22
412	0.23
413	0.22
414	0.21
415	0.18
416	0.15
417	0.12
418	0.11
419	0.09
420	0.07
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.06
428	0.14
429	0.2
430	0.23
431	0.26
432	0.28
433	0.31
434	0.34
435	0.4
436	0.43
437	0.46
438	0.49
439	0.51
440	0.53
441	0.54
442	0.51
443	0.45
444	0.39
445	0.37
446	0.32
447	0.28
448	0.23
449	0.2
450	0.19
451	0.17
452	0.14
453	0.05
454	0.05
455	0.04
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.06
462	0.07
463	0.12
464	0.12
465	0.13
466	0.14
467	0.17
468	0.16
469	0.16
470	0.24
471	0.22
472	0.27
473	0.27
474	0.29
475	0.28
476	0.28
477	0.27
478	0.19
479	0.18
480	0.14
481	0.15
482	0.14
483	0.14
484	0.16
485	0.15
486	0.15
487	0.14
488	0.12
489	0.12
490	0.14
491	0.16
492	0.2
493	0.21
494	0.21
495	0.21
496	0.23
497	0.24
498	0.23
499	0.3
500	0.34
501	0.41
502	0.47
503	0.56
504	0.65
505	0.75
506	0.8
507	0.78
508	0.79
509	0.75
510	0.75
511	0.7
512	0.65
513	0.61
514	0.57
515	0.51
516	0.44
517	0.41
518	0.36
519	0.37
520	0.32
521	0.35
522	0.32
523	0.31
524	0.33
525	0.37
526	0.42
527	0.4
528	0.46
529	0.46
530	0.54
531	0.56
532	0.59
533	0.56
534	0.52
535	0.53
536	0.5
537	0.42
538	0.42
539	0.45
540	0.44
541	0.46
542	0.46
543	0.45
544	0.45
545	0.5
546	0.41
547	0.38
548	0.32
549	0.27
550	0.28
551	0.25
552	0.21
553	0.17
554	0.19
555	0.14
556	0.14
557	0.15
558	0.15
559	0.16
560	0.19
561	0.23
562	0.25
563	0.27
564	0.28
565	0.3
566	0.27
567	0.27
568	0.27
569	0.25
570	0.22
571	0.2
572	0.2
573	0.18
574	0.18
575	0.17
576	0.14
577	0.12
578	0.11
579	0.1
580	0.09
581	0.08
582	0.08
583	0.1
584	0.11
585	0.1
586	0.1
587	0.1
588	0.11
589	0.12
590	0.11
591	0.11
592	0.11
593	0.12
594	0.16
595	0.18
596	0.19
597	0.18
598	0.2
599	0.2
600	0.18
601	0.16
602	0.13
603	0.11
604	0.11
605	0.17
606	0.2
607	0.25
608	0.35
609	0.38
610	0.38
611	0.4
612	0.45
613	0.44
614	0.47
615	0.51
616	0.41
617	0.43
618	0.43
619	0.41
620	0.36
621	0.37
622	0.33
623	0.26
624	0.27
625	0.23
626	0.24
627	0.26
628	0.27
629	0.27
630	0.23
631	0.3
632	0.32
633	0.33
634	0.36
635	0.38
636	0.4
637	0.42
638	0.48
639	0.48
640	0.56
641	0.65
642	0.72
643	0.77
644	0.81
645	0.82
646	0.84
647	0.78
648	0.74
649	0.7
650	0.66
651	0.58
652	0.53
653	0.44
654	0.35
655	0.31
656	0.25
657	0.18
658	0.11
659	0.09
660	0.07
661	0.07
662	0.08
663	0.07
664	0.07
665	0.08
666	0.08
667	0.09
668	0.08
669	0.11
670	0.1
671	0.13
672	0.13
673	0.14
674	0.16
675	0.18
676	0.2
677	0.26
678	0.33
679	0.35
680	0.36
681	0.37
682	0.37
683	0.34
684	0.33
685	0.3
686	0.23
687	0.2
688	0.2
689	0.2
690	0.19
691	0.19
692	0.19
693	0.14
694	0.13
695	0.13
696	0.12
697	0.09
698	0.09
699	0.09
700	0.08
701	0.1
702	0.11
703	0.11
704	0.12
705	0.12
706	0.15
707	0.16
708	0.16
709	0.18
710	0.22
711	0.24
712	0.27
713	0.29
714	0.28
715	0.34
716	0.33
717	0.29
718	0.26
719	0.24
720	0.24
721	0.22
722	0.26
723	0.19
724	0.19
725	0.21
726	0.2
727	0.2
728	0.22
729	0.27
730	0.25
731	0.3
732	0.39
733	0.37
734	0.42
735	0.48
736	0.45
737	0.5
738	0.5
739	0.47
740	0.41
741	0.44
742	0.39
743	0.33
744	0.36
745	0.29
746	0.28
747	0.29
748	0.34
749	0.4
750	0.5
751	0.6
752	0.62
753	0.67
754	0.72
755	0.77
756	0.79
757	0.8
758	0.79
759	0.76
760	0.72
761	0.68
762	0.6
763	0.52
764	0.44
765	0.34
766	0.25
767	0.21
768	0.16
769	0.13
770	0.14
771	0.13
772	0.13
773	0.13
774	0.16
775	0.18
776	0.22
777	0.27
778	0.28
779	0.31

A0A238F5Z9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer