FuNGI

A0A238FIQ6

Protein Details

Accession

A0A238FIQ6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
131-153	DKAIKNKGKGKGKGKGKRARMEV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
133-150	AIKNKGKGKGKGKGKRAR

Subcellular Location(s)

cyto 16.5, cyto_nucl 9, mito 4, plas 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR022712 Beta_Casp IPR027075 CPSF2 IPR025069 Cpsf2_C IPR001279 Metallo-B-lactamas IPR036866 RibonucZ/Hydroxyglut_hydro IPR011108 RMMBL
Gene Ontology	GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006379 P:mRNA cleavage GO:0006378 P:mRNA polyadenylation
Pfam	View protein in Pfam PF10996 Beta-Casp PF13299 CPSF100_C PF16661 Lactamase_B_6 PF07521 RMMBL

Amino Acid Sequences

MSITLTSLSESPPCYLLTIDSAKILLDCGIHDTPDEFPSTLTSSTSSTSSISTYLKTLQALAPSLNLVIVTHPLLTSLGLLPWLKAKCGLRCPVYATLPTREMGRYAVEEWIVARSEEEENEAFREGDAVDKAIKNKGKGKGKGKGKRARMEVEDQLVKVEEERDEGMGGQEAGEEDLMQQVWKLSTHEVRQAFLAVNAVRWTQPVHLSGPLKGYTLVAHRSGHTLGGSLFTIRPSLSSSLSPASSASSFLYAPIFNHVKEHHLDSSALLNGARIDEAMRRMGVVVVGAERSLMVNVKRMDKEKTFLDCITTTMRNNHSVLLPVDASARILELLVLLETHWSYENLGRQFPLCVVSRTAKEVVTFARSLTEWMGGQVGRQVGGEKILKFPNVRIYPSIEALDSDIPPDVPKTILVTPLSLSHGFSRRVFVDFAQVQGNVVLLTQRSDEGSLTRWMFGLWDEAQNEGEKWGEGKVGKAVKMDRTIDLKVSLFSGQFAGMKRKVYLEGEELERHLAAEREIEEREARHQAALDRSRRMLHTQGDDSDSDSDLDSDAEDHDGIIKEEGAVVPAQRRRAGGFTGGLGAWDEFLDESNLSGRAATFDIYVKGEAGVKRVMEGLNRYRMFPVVERKRRVDAYGEAIDIEGWLKRGIDEDPMTMGLAVGNSNAAKMLGQAAAALGVGGPGAHKKVKIEEEEKQEEKEVEKPHKYIVEEVLVRMVCSVFVVDFEGASDGRALKTILPQMNPRKLVIVNGSQASINDLAAHCQAVNAYSEEIFTPSLNESIVVGQETKNFSIRLGDSIMASLRLSRVESYDVAYVSGVVRFDPESDLPVLEKVGVLEGGSLMIEASAETKDAEIKVEEGVEVVEKKVDEDEKMEADSTSTSTTLIKTLPPLRPSLFIGDLRLTLLKERLAARGIPSEFAGQGILLCGPAPPQSFGYKGDLNLSGGRVVVKKSGRGRVMIEGTPGETYYVVREVVYSLHAQDG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.17
3	0.16
4	0.2
5	0.22
6	0.21
7	0.2
8	0.19
9	0.19
10	0.18
11	0.17
12	0.12
13	0.09
14	0.09
15	0.15
16	0.15
17	0.15
18	0.16
19	0.16
20	0.18
21	0.19
22	0.21
23	0.15
24	0.14
25	0.17
26	0.2
27	0.19
28	0.18
29	0.17
30	0.16
31	0.18
32	0.19
33	0.17
34	0.15
35	0.15
36	0.15
37	0.17
38	0.17
39	0.16
40	0.18
41	0.2
42	0.21
43	0.21
44	0.22
45	0.21
46	0.23
47	0.24
48	0.22
49	0.19
50	0.17
51	0.17
52	0.15
53	0.12
54	0.09
55	0.08
56	0.1
57	0.1
58	0.1
59	0.09
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.09
65	0.09
66	0.12
67	0.12
68	0.12
69	0.18
70	0.19
71	0.18
72	0.23
73	0.29
74	0.33
75	0.41
76	0.48
77	0.45
78	0.47
79	0.52
80	0.52
81	0.5
82	0.49
83	0.45
84	0.43
85	0.41
86	0.39
87	0.36
88	0.3
89	0.27
90	0.23
91	0.22
92	0.19
93	0.18
94	0.2
95	0.18
96	0.17
97	0.17
98	0.17
99	0.15
100	0.13
101	0.12
102	0.12
103	0.13
104	0.14
105	0.17
106	0.15
107	0.16
108	0.17
109	0.18
110	0.16
111	0.14
112	0.14
113	0.11
114	0.13
115	0.12
116	0.12
117	0.14
118	0.17
119	0.19
120	0.26
121	0.3
122	0.31
123	0.38
124	0.47
125	0.53
126	0.6
127	0.67
128	0.69
129	0.76
130	0.8
131	0.83
132	0.83
133	0.82
134	0.82
135	0.79
136	0.77
137	0.71
138	0.69
139	0.63
140	0.61
141	0.54
142	0.45
143	0.4
144	0.34
145	0.28
146	0.23
147	0.2
148	0.13
149	0.12
150	0.13
151	0.13
152	0.12
153	0.13
154	0.12
155	0.11
156	0.1
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.06
163	0.05
164	0.07
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.08
170	0.09
171	0.11
172	0.15
173	0.2
174	0.24
175	0.31
176	0.31
177	0.31
178	0.31
179	0.3
180	0.26
181	0.2
182	0.22
183	0.14
184	0.15
185	0.15
186	0.15
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.13
191	0.16
192	0.17
193	0.18
194	0.24
195	0.25
196	0.26
197	0.28
198	0.27
199	0.24
200	0.22
201	0.2
202	0.16
203	0.19
204	0.2
205	0.19
206	0.2
207	0.2
208	0.22
209	0.22
210	0.21
211	0.17
212	0.15
213	0.12
214	0.13
215	0.12
216	0.11
217	0.11
218	0.1
219	0.11
220	0.09
221	0.1
222	0.11
223	0.13
224	0.13
225	0.14
226	0.16
227	0.18
228	0.18
229	0.17
230	0.15
231	0.15
232	0.13
233	0.14
234	0.12
235	0.11
236	0.1
237	0.11
238	0.12
239	0.1
240	0.1
241	0.16
242	0.17
243	0.15
244	0.19
245	0.19
246	0.21
247	0.22
248	0.26
249	0.21
250	0.21
251	0.22
252	0.19
253	0.21
254	0.19
255	0.17
256	0.13
257	0.11
258	0.1
259	0.1
260	0.09
261	0.06
262	0.06
263	0.08
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.11
270	0.1
271	0.08
272	0.07
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.08
281	0.07
282	0.14
283	0.16
284	0.22
285	0.25
286	0.27
287	0.32
288	0.32
289	0.35
290	0.34
291	0.37
292	0.34
293	0.32
294	0.33
295	0.27
296	0.27
297	0.28
298	0.26
299	0.22
300	0.24
301	0.27
302	0.27
303	0.27
304	0.27
305	0.23
306	0.23
307	0.22
308	0.19
309	0.16
310	0.13
311	0.13
312	0.12
313	0.11
314	0.08
315	0.08
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.03
324	0.04
325	0.04
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.1
331	0.16
332	0.17
333	0.17
334	0.17
335	0.17
336	0.17
337	0.16
338	0.17
339	0.13
340	0.13
341	0.15
342	0.18
343	0.19
344	0.21
345	0.22
346	0.19
347	0.18
348	0.18
349	0.17
350	0.17
351	0.17
352	0.13
353	0.13
354	0.13
355	0.13
356	0.13
357	0.12
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.08
362	0.09
363	0.1
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.09
368	0.07
369	0.11
370	0.14
371	0.12
372	0.16
373	0.17
374	0.19
375	0.19
376	0.2
377	0.26
378	0.26
379	0.27
380	0.24
381	0.27
382	0.27
383	0.28
384	0.27
385	0.17
386	0.15
387	0.15
388	0.15
389	0.11
390	0.09
391	0.08
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.05
397	0.06
398	0.08
399	0.09
400	0.12
401	0.13
402	0.13
403	0.13
404	0.14
405	0.16
406	0.13
407	0.14
408	0.14
409	0.18
410	0.19
411	0.19
412	0.2
413	0.19
414	0.2
415	0.2
416	0.17
417	0.2
418	0.18
419	0.19
420	0.17
421	0.16
422	0.15
423	0.14
424	0.14
425	0.06
426	0.06
427	0.05
428	0.04
429	0.05
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.06
435	0.07
436	0.09
437	0.12
438	0.12
439	0.12
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.12
445	0.09
446	0.11
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.12
451	0.12
452	0.09
453	0.08
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.08
460	0.12
461	0.14
462	0.15
463	0.16
464	0.18
465	0.19
466	0.23
467	0.24
468	0.21
469	0.22
470	0.22
471	0.21
472	0.2
473	0.17
474	0.13
475	0.13
476	0.12
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.07
481	0.09
482	0.1
483	0.14
484	0.15
485	0.15
486	0.16
487	0.16
488	0.17
489	0.16
490	0.17
491	0.15
492	0.15
493	0.16
494	0.16
495	0.16
496	0.14
497	0.13
498	0.11
499	0.09
500	0.08
501	0.05
502	0.06
503	0.07
504	0.09
505	0.09
506	0.1
507	0.1
508	0.11
509	0.13
510	0.15
511	0.14
512	0.12
513	0.13
514	0.15
515	0.22
516	0.28
517	0.29
518	0.28
519	0.29
520	0.3
521	0.3
522	0.3
523	0.27
524	0.24
525	0.25
526	0.25
527	0.25
528	0.25
529	0.24
530	0.23
531	0.19
532	0.16
533	0.12
534	0.1
535	0.09
536	0.07
537	0.07
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.04
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.06
548	0.06
549	0.05
550	0.06
551	0.06
552	0.05
553	0.05
554	0.05
555	0.1
556	0.12
557	0.15
558	0.16
559	0.16
560	0.17
561	0.19
562	0.19
563	0.17
564	0.15
565	0.13
566	0.13
567	0.12
568	0.11
569	0.1
570	0.08
571	0.06
572	0.05
573	0.05
574	0.03
575	0.04
576	0.05
577	0.04
578	0.05
579	0.06
580	0.06
581	0.06
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.07
589	0.09
590	0.09
591	0.1
592	0.08
593	0.08
594	0.11
595	0.11
596	0.12
597	0.13
598	0.12
599	0.12
600	0.14
601	0.14
602	0.12
603	0.17
604	0.2
605	0.27
606	0.28
607	0.28
608	0.27
609	0.28
610	0.28
611	0.27
612	0.33
613	0.34
614	0.43
615	0.47
616	0.49
617	0.53
618	0.52
619	0.5
620	0.43
621	0.35
622	0.33
623	0.31
624	0.28
625	0.23
626	0.21
627	0.19
628	0.15
629	0.13
630	0.06
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.06
635	0.07
636	0.08
637	0.12
638	0.12
639	0.12
640	0.13
641	0.13
642	0.13
643	0.12
644	0.11
645	0.07
646	0.06
647	0.05
648	0.04
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.04
655	0.04
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.05
661	0.06
662	0.05
663	0.05
664	0.03
665	0.02
666	0.02
667	0.02
668	0.03
669	0.04
670	0.06
671	0.08
672	0.09
673	0.1
674	0.16
675	0.21
676	0.27
677	0.31
678	0.36
679	0.43
680	0.5
681	0.5
682	0.46
683	0.43
684	0.37
685	0.34
686	0.33
687	0.32
688	0.33
689	0.35
690	0.35
691	0.37
692	0.4
693	0.39
694	0.36
695	0.32
696	0.31
697	0.27
698	0.27
699	0.27
700	0.23
701	0.22
702	0.19
703	0.16
704	0.09
705	0.09
706	0.09
707	0.04
708	0.05
709	0.07
710	0.06
711	0.06
712	0.06
713	0.07
714	0.07
715	0.07
716	0.08
717	0.07
718	0.07
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.12
723	0.19
724	0.22
725	0.24
726	0.32
727	0.41
728	0.48
729	0.48
730	0.44
731	0.41
732	0.38
733	0.38
734	0.35
735	0.31
736	0.26
737	0.25
738	0.26
739	0.23
740	0.22
741	0.21
742	0.17
743	0.12
744	0.11
745	0.1
746	0.11
747	0.12
748	0.12
749	0.09
750	0.09
751	0.09
752	0.08
753	0.09
754	0.09
755	0.09
756	0.09
757	0.09
758	0.1
759	0.11
760	0.11
761	0.09
762	0.09
763	0.09
764	0.1
765	0.09
766	0.09
767	0.09
768	0.09
769	0.1
770	0.09
771	0.09
772	0.09
773	0.14
774	0.16
775	0.17
776	0.19
777	0.18
778	0.18
779	0.22
780	0.22
781	0.2
782	0.2
783	0.19
784	0.16
785	0.17
786	0.17
787	0.13
788	0.12
789	0.11
790	0.09
791	0.1
792	0.11
793	0.11
794	0.12
795	0.14
796	0.15
797	0.16
798	0.18
799	0.17
800	0.16
801	0.15
802	0.14
803	0.12
804	0.12
805	0.1
806	0.07
807	0.09
808	0.09
809	0.1
810	0.13
811	0.12
812	0.14
813	0.15
814	0.15
815	0.15
816	0.15
817	0.14
818	0.11
819	0.11
820	0.08
821	0.08
822	0.07
823	0.07
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.05
828	0.05
829	0.04
830	0.03
831	0.03
832	0.03
833	0.05
834	0.05
835	0.05
836	0.05
837	0.06
838	0.09
839	0.09
840	0.11
841	0.11
842	0.11
843	0.12
844	0.12
845	0.11
846	0.09
847	0.09
848	0.1
849	0.1
850	0.1
851	0.11
852	0.11
853	0.11
854	0.15
855	0.17
856	0.16
857	0.17
858	0.2
859	0.2
860	0.21
861	0.21
862	0.17
863	0.16
864	0.15
865	0.15
866	0.13
867	0.11
868	0.11
869	0.11
870	0.12
871	0.13
872	0.13
873	0.13
874	0.19
875	0.26
876	0.32
877	0.33
878	0.38
879	0.38
880	0.4
881	0.41
882	0.39
883	0.37
884	0.32
885	0.33
886	0.3
887	0.28
888	0.27
889	0.26
890	0.21
891	0.19
892	0.2
893	0.18
894	0.2
895	0.22
896	0.23
897	0.24
898	0.25
899	0.25
900	0.31
901	0.31
902	0.28
903	0.27
904	0.26
905	0.23
906	0.22
907	0.19
908	0.11
909	0.1
910	0.1
911	0.08
912	0.06
913	0.06
914	0.06
915	0.07
916	0.11
917	0.13
918	0.15
919	0.17
920	0.21
921	0.23
922	0.26
923	0.31
924	0.29
925	0.28
926	0.3
927	0.29
928	0.29
929	0.29
930	0.27
931	0.22
932	0.19
933	0.21
934	0.19
935	0.19
936	0.23
937	0.24
938	0.31
939	0.38
940	0.47
941	0.47
942	0.48
943	0.5
944	0.51
945	0.53
946	0.47
947	0.43
948	0.35
949	0.33
950	0.31
951	0.28
952	0.2
953	0.15
954	0.14
955	0.13
956	0.14
957	0.13
958	0.12
959	0.13
960	0.13
961	0.14
962	0.15
963	0.14

A0A238FIQ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer