FuNGI

A0A238FC17

Protein Details

Accession

A0A238FC17

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
259-280	HSRGFRGCPLRNKKKEPSDSSA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_nucl 8, pero 5, nucl 4.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MNLRADGSWEVILQSVDCLVTSYKASLVSQSAQPASASSTLPATSGLSGLSDESPSTRASSTSLSAVQIADLVFTSRERVETKNAIACKFTANSISEEQMAHCDHLTSAKDMWDTSKAIHTKGRSSRTMELLSILTAPFTGDIPFKVFVNKIKIAMVEFRTLGAPLPQWLFAGMLVRSLPSQYDSIVASLATEVNVVMDWEEFLPKLLMSIEMAQTRNANHSLAARMEVDDNPLVARITGTGPRDYSQVLCTRCKVIGHSRGFRGCPLRNKKKEPSDSSANVAAVGVDESALPGFRLIYPGAPPQFPWIVDSGAHVHCVGDKSVLSNFIEAPLRISTANESKVLSSGHGSVTSFTSFGCRVEIGKVYLMPGGECGFLSVDRLLEGMKYVVGPKNELIFSIASTPVLRTRPGPGFLLDAIHKVPGAPVTMVAATREHGSCTLMAAHRKLGHQSTESILQMVKSGAVTGLTLKDEKVLPCFSCIRAKSKRSPFSMISAEAPHTLYRVFIELGFVETPDRQGNTIYLAIVDQYSTCKWTQVLKDKKAETIIATWRVRSDNGKEFDNAWFRAYLQKQGIIVEITALYTPEQNGQVERLNGSLMGLVRAMLFDSGLPSSFWSDALSVATFVLNRRPHPRIPNKTAFELIAFVHVPNERRTKLAPRATQGVFIGYASEYNYRVWVASEKKVSTSRHITCVDAPEQSLVTGSPSPLPSAFASTPPPPAFASTGGGDVGDVPRDDENGPSDDDNPPAHNSEAIVPREGYAVVRVGPNPGRYENVDAANVLPEGSRRRPPPTEVPPVVAAIMAFVLDSPPMFEDKLSYDIYCAAVFNDEDIEIPKKFEEEAMKSPYRNHWVAAMASELLQFDHHGVFQEETWHEGIRVLGTIWVYSIKRDATGKIIRFKARLVAQGFAQRPGSTIMTPTLLLHLEQFDFDCAFLNGKMTEDVYVRYPKGWTGPQTPCKYLMLVGSMYGTKQAPREWYRAINDLMVARGYMRATADACLYIKHSGSSFAIITLYVDDGLIASNDQSFLDAELSSLHEVFKLKRLGPVSYFLGFEIHRTADYILVHQSKYIRTMLEKFDFASPSKRRAFTPMDDRPSLRIDNTPFPDVSMYQSANSCPTVDDWAAVKRIFRYLNSTVDWGIMYRNNSTTRVMVYSDASFADDPESRRSVGAYASMLAGGVVSWQSKQQSLVATSTTEAEILSASSATREAIWLRRLVGDVGIPQSGPTVIQEDNAACIQIAKDPVDHVRTKHFDIAHLFVRERVASGEVELEYCPTHVNAADLMTKGLEPQRFDQLRALLGMVSLVSLTGGSVRSRV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.09
3	0.08
4	0.08
5	0.09
6	0.09
7	0.1
8	0.12
9	0.12
10	0.13
11	0.15
12	0.16
13	0.17
14	0.2
15	0.22
16	0.24
17	0.28
18	0.27
19	0.26
20	0.25
21	0.23
22	0.22
23	0.21
24	0.19
25	0.15
26	0.16
27	0.15
28	0.16
29	0.16
30	0.14
31	0.12
32	0.11
33	0.1
34	0.09
35	0.09
36	0.11
37	0.11
38	0.1
39	0.1
40	0.11
41	0.12
42	0.13
43	0.15
44	0.14
45	0.13
46	0.15
47	0.18
48	0.19
49	0.21
50	0.22
51	0.2
52	0.21
53	0.2
54	0.18
55	0.16
56	0.14
57	0.1
58	0.09
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.12
63	0.11
64	0.15
65	0.17
66	0.2
67	0.27
68	0.32
69	0.37
70	0.4
71	0.44
72	0.42
73	0.41
74	0.39
75	0.36
76	0.31
77	0.28
78	0.26
79	0.24
80	0.26
81	0.27
82	0.28
83	0.25
84	0.24
85	0.23
86	0.23
87	0.23
88	0.2
89	0.17
90	0.16
91	0.15
92	0.2
93	0.21
94	0.19
95	0.19
96	0.21
97	0.22
98	0.22
99	0.25
100	0.23
101	0.22
102	0.21
103	0.28
104	0.27
105	0.29
106	0.34
107	0.34
108	0.39
109	0.47
110	0.52
111	0.49
112	0.54
113	0.57
114	0.57
115	0.57
116	0.48
117	0.42
118	0.35
119	0.3
120	0.25
121	0.19
122	0.13
123	0.1
124	0.1
125	0.08
126	0.07
127	0.08
128	0.08
129	0.1
130	0.13
131	0.14
132	0.14
133	0.17
134	0.19
135	0.24
136	0.3
137	0.32
138	0.3
139	0.31
140	0.31
141	0.3
142	0.35
143	0.31
144	0.27
145	0.24
146	0.24
147	0.23
148	0.22
149	0.2
150	0.16
151	0.14
152	0.14
153	0.15
154	0.15
155	0.14
156	0.15
157	0.14
158	0.12
159	0.15
160	0.12
161	0.12
162	0.11
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.11
168	0.11
169	0.1
170	0.12
171	0.12
172	0.12
173	0.12
174	0.11
175	0.09
176	0.09
177	0.09
178	0.07
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.07
190	0.08
191	0.09
192	0.08
193	0.09
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.12
198	0.14
199	0.18
200	0.19
201	0.19
202	0.2
203	0.21
204	0.24
205	0.22
206	0.19
207	0.16
208	0.18
209	0.2
210	0.2
211	0.21
212	0.17
213	0.17
214	0.18
215	0.18
216	0.18
217	0.16
218	0.15
219	0.13
220	0.13
221	0.12
222	0.1
223	0.09
224	0.07
225	0.1
226	0.14
227	0.16
228	0.18
229	0.19
230	0.2
231	0.22
232	0.21
233	0.2
234	0.2
235	0.25
236	0.26
237	0.28
238	0.29
239	0.31
240	0.31
241	0.31
242	0.32
243	0.35
244	0.41
245	0.46
246	0.5
247	0.53
248	0.56
249	0.56
250	0.56
251	0.54
252	0.51
253	0.53
254	0.58
255	0.63
256	0.68
257	0.75
258	0.8
259	0.83
260	0.86
261	0.83
262	0.8
263	0.78
264	0.71
265	0.67
266	0.6
267	0.49
268	0.39
269	0.31
270	0.23
271	0.14
272	0.12
273	0.08
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.12
287	0.18
288	0.2
289	0.2
290	0.2
291	0.22
292	0.24
293	0.23
294	0.22
295	0.17
296	0.16
297	0.16
298	0.17
299	0.18
300	0.16
301	0.16
302	0.15
303	0.13
304	0.14
305	0.15
306	0.14
307	0.11
308	0.11
309	0.12
310	0.13
311	0.16
312	0.14
313	0.14
314	0.13
315	0.15
316	0.17
317	0.15
318	0.16
319	0.14
320	0.14
321	0.13
322	0.14
323	0.15
324	0.18
325	0.2
326	0.19
327	0.19
328	0.18
329	0.2
330	0.2
331	0.16
332	0.13
333	0.13
334	0.12
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.13
339	0.13
340	0.11
341	0.1
342	0.12
343	0.11
344	0.11
345	0.11
346	0.1
347	0.11
348	0.13
349	0.16
350	0.14
351	0.15
352	0.15
353	0.15
354	0.15
355	0.14
356	0.12
357	0.1
358	0.1
359	0.09
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.09
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.07
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.09
376	0.12
377	0.12
378	0.14
379	0.15
380	0.18
381	0.18
382	0.18
383	0.16
384	0.13
385	0.13
386	0.14
387	0.13
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.14
393	0.14
394	0.13
395	0.19
396	0.22
397	0.24
398	0.25
399	0.21
400	0.22
401	0.22
402	0.23
403	0.18
404	0.15
405	0.14
406	0.12
407	0.11
408	0.09
409	0.09
410	0.08
411	0.09
412	0.07
413	0.07
414	0.08
415	0.09
416	0.09
417	0.09
418	0.08
419	0.08
420	0.1
421	0.1
422	0.09
423	0.09
424	0.1
425	0.09
426	0.1
427	0.13
428	0.14
429	0.16
430	0.17
431	0.2
432	0.21
433	0.22
434	0.25
435	0.24
436	0.24
437	0.22
438	0.23
439	0.22
440	0.23
441	0.22
442	0.19
443	0.16
444	0.14
445	0.13
446	0.11
447	0.1
448	0.06
449	0.06
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.08
458	0.09
459	0.12
460	0.12
461	0.15
462	0.16
463	0.15
464	0.18
465	0.2
466	0.21
467	0.26
468	0.27
469	0.32
470	0.37
471	0.43
472	0.49
473	0.58
474	0.63
475	0.6
476	0.64
477	0.58
478	0.54
479	0.52
480	0.43
481	0.35
482	0.29
483	0.25
484	0.21
485	0.2
486	0.14
487	0.12
488	0.1
489	0.09
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.07
494	0.08
495	0.07
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.08
500	0.08
501	0.09
502	0.1
503	0.1
504	0.08
505	0.09
506	0.09
507	0.11
508	0.11
509	0.1
510	0.08
511	0.08
512	0.08
513	0.07
514	0.07
515	0.04
516	0.06
517	0.06
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.1
522	0.15
523	0.22
524	0.31
525	0.4
526	0.44
527	0.51
528	0.51
529	0.52
530	0.48
531	0.42
532	0.33
533	0.28
534	0.26
535	0.28
536	0.27
537	0.25
538	0.25
539	0.25
540	0.26
541	0.24
542	0.25
543	0.26
544	0.28
545	0.29
546	0.28
547	0.28
548	0.32
549	0.33
550	0.28
551	0.21
552	0.18
553	0.17
554	0.23
555	0.23
556	0.24
557	0.2
558	0.21
559	0.21
560	0.21
561	0.22
562	0.15
563	0.14
564	0.09
565	0.08
566	0.06
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.07
573	0.08
574	0.08
575	0.08
576	0.1
577	0.12
578	0.12
579	0.12
580	0.1
581	0.09
582	0.09
583	0.08
584	0.08
585	0.06
586	0.06
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.04
593	0.04
594	0.03
595	0.04
596	0.04
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.06
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.12
614	0.13
615	0.16
616	0.21
617	0.25
618	0.29
619	0.38
620	0.48
621	0.51
622	0.57
623	0.64
624	0.61
625	0.59
626	0.56
627	0.46
628	0.36
629	0.28
630	0.2
631	0.13
632	0.1
633	0.08
634	0.09
635	0.1
636	0.12
637	0.15
638	0.19
639	0.18
640	0.19
641	0.21
642	0.27
643	0.34
644	0.4
645	0.39
646	0.37
647	0.42
648	0.41
649	0.41
650	0.34
651	0.26
652	0.18
653	0.15
654	0.13
655	0.07
656	0.07
657	0.06
658	0.07
659	0.07
660	0.07
661	0.08
662	0.07
663	0.07
664	0.08
665	0.12
666	0.14
667	0.17
668	0.2
669	0.2
670	0.22
671	0.28
672	0.29
673	0.29
674	0.34
675	0.32
676	0.35
677	0.36
678	0.35
679	0.31
680	0.33
681	0.29
682	0.21
683	0.2
684	0.14
685	0.13
686	0.11
687	0.1
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.08
693	0.08
694	0.09
695	0.09
696	0.11
697	0.09
698	0.13
699	0.13
700	0.12
701	0.15
702	0.16
703	0.2
704	0.18
705	0.2
706	0.16
707	0.17
708	0.16
709	0.14
710	0.15
711	0.11
712	0.12
713	0.1
714	0.09
715	0.08
716	0.07
717	0.07
718	0.06
719	0.05
720	0.05
721	0.06
722	0.07
723	0.08
724	0.08
725	0.09
726	0.1
727	0.11
728	0.11
729	0.12
730	0.12
731	0.14
732	0.14
733	0.13
734	0.13
735	0.14
736	0.13
737	0.12
738	0.11
739	0.14
740	0.2
741	0.19
742	0.19
743	0.17
744	0.17
745	0.18
746	0.17
747	0.13
748	0.08
749	0.08
750	0.07
751	0.08
752	0.08
753	0.11
754	0.13
755	0.15
756	0.16
757	0.16
758	0.17
759	0.17
760	0.22
761	0.21
762	0.2
763	0.18
764	0.16
765	0.16
766	0.15
767	0.13
768	0.09
769	0.06
770	0.07
771	0.11
772	0.15
773	0.2
774	0.21
775	0.27
776	0.3
777	0.35
778	0.42
779	0.46
780	0.52
781	0.48
782	0.48
783	0.43
784	0.41
785	0.35
786	0.26
787	0.18
788	0.08
789	0.07
790	0.04
791	0.03
792	0.03
793	0.03
794	0.03
795	0.03
796	0.03
797	0.04
798	0.05
799	0.05
800	0.05
801	0.07
802	0.08
803	0.12
804	0.12
805	0.12
806	0.11
807	0.12
808	0.13
809	0.12
810	0.1
811	0.07
812	0.07
813	0.07
814	0.07
815	0.07
816	0.06
817	0.06
818	0.08
819	0.1
820	0.09
821	0.1
822	0.1
823	0.1
824	0.1
825	0.13
826	0.16
827	0.18
828	0.24
829	0.3
830	0.32
831	0.32
832	0.34
833	0.37
834	0.38
835	0.33
836	0.28
837	0.24
838	0.24
839	0.24
840	0.22
841	0.18
842	0.12
843	0.11
844	0.11
845	0.09
846	0.07
847	0.06
848	0.06
849	0.06
850	0.06
851	0.06
852	0.07
853	0.08
854	0.09
855	0.09
856	0.13
857	0.12
858	0.14
859	0.15
860	0.14
861	0.13
862	0.13
863	0.13
864	0.09
865	0.09
866	0.07
867	0.07
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.1
872	0.09
873	0.1
874	0.12
875	0.11
876	0.13
877	0.15
878	0.15
879	0.2
880	0.27
881	0.3
882	0.35
883	0.4
884	0.41
885	0.41
886	0.4
887	0.39
888	0.35
889	0.38
890	0.32
891	0.28
892	0.27
893	0.34
894	0.34
895	0.3
896	0.28
897	0.21
898	0.2
899	0.22
900	0.21
901	0.14
902	0.14
903	0.13
904	0.13
905	0.14
906	0.13
907	0.12
908	0.1
909	0.1
910	0.09
911	0.1
912	0.09
913	0.09
914	0.09
915	0.09
916	0.08
917	0.08
918	0.09
919	0.07
920	0.08
921	0.08
922	0.1
923	0.09
924	0.09
925	0.1
926	0.09
927	0.11
928	0.1
929	0.11
930	0.14
931	0.18
932	0.17
933	0.18
934	0.18
935	0.17
936	0.21
937	0.24
938	0.26
939	0.3
940	0.39
941	0.47
942	0.51
943	0.52
944	0.5
945	0.46
946	0.42
947	0.34
948	0.27
949	0.21
950	0.16
951	0.14
952	0.13
953	0.12
954	0.11
955	0.12
956	0.11
957	0.1
958	0.12
959	0.14
960	0.22
961	0.26
962	0.31
963	0.32
964	0.38
965	0.39
966	0.42
967	0.4
968	0.33
969	0.3
970	0.26
971	0.23
972	0.17
973	0.13
974	0.09
975	0.1
976	0.09
977	0.09
978	0.09
979	0.09
980	0.1
981	0.11
982	0.11
983	0.11
984	0.11
985	0.11
986	0.12
987	0.13
988	0.12
989	0.12
990	0.12
991	0.13
992	0.14
993	0.15
994	0.13
995	0.12
996	0.12
997	0.11
998	0.11
999	0.09
1000	0.08
1001	0.06
1002	0.06
1003	0.05
1004	0.05
1005	0.05
1006	0.05
1007	0.04
1008	0.04
1009	0.05
1010	0.05
1011	0.05
1012	0.06
1013	0.06
1014	0.07
1015	0.08
1016	0.07
1017	0.07
1018	0.07
1019	0.09
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.09
1023	0.1
1024	0.12
1025	0.13
1026	0.19
1027	0.22
1028	0.22
1029	0.27
1030	0.3
1031	0.31
1032	0.31
1033	0.35
1034	0.32
1035	0.28
1036	0.28
1037	0.23
1038	0.23
1039	0.19
1040	0.19
1041	0.17
1042	0.13
1043	0.12
1044	0.13
1045	0.13
1046	0.14
1047	0.15
1048	0.15
1049	0.19
1050	0.21
1051	0.21
1052	0.21
1053	0.24
1054	0.22
1055	0.25
1056	0.25
1057	0.2
1058	0.21
1059	0.27
1060	0.32
1061	0.33
1062	0.32
1063	0.31
1064	0.33
1065	0.33
1066	0.31
1067	0.36
1068	0.32
1069	0.36
1070	0.42
1071	0.43
1072	0.4
1073	0.45
1074	0.5
1075	0.48
1076	0.54
1077	0.56
1078	0.56
1079	0.57
1080	0.57
1081	0.53
1082	0.51
1083	0.45
1084	0.36
1085	0.32
1086	0.3
1087	0.36
1088	0.39
1089	0.39
1090	0.35
1091	0.34
1092	0.34
1093	0.29
1094	0.28
1095	0.25
1096	0.21
1097	0.2
1098	0.21
1099	0.21
1100	0.22
1101	0.22
1102	0.18
1103	0.14
1104	0.14
1105	0.17
1106	0.16
1107	0.17
1108	0.17
1109	0.2
1110	0.23
1111	0.23
1112	0.23
1113	0.2
1114	0.26
1115	0.26
1116	0.26
1117	0.3
1118	0.3
1119	0.35
1120	0.36
1121	0.36
1122	0.3
1123	0.29
1124	0.27
1125	0.2
1126	0.19
1127	0.17
1128	0.17
1129	0.18
1130	0.22
1131	0.24
1132	0.26
1133	0.27
1134	0.26
1135	0.25
1136	0.25
1137	0.24
1138	0.21
1139	0.21
1140	0.2
1141	0.19
1142	0.17
1143	0.17
1144	0.15
1145	0.14
1146	0.16
1147	0.16
1148	0.18
1149	0.22
1150	0.24
1151	0.23
1152	0.23
1153	0.23
1154	0.21
1155	0.19
1156	0.2
1157	0.15
1158	0.14
1159	0.14
1160	0.13
1161	0.12
1162	0.11
1163	0.09
1164	0.05
1165	0.05
1166	0.06
1167	0.06
1168	0.07
1169	0.1
1170	0.12
1171	0.14
1172	0.16
1173	0.18
1174	0.22
1175	0.24
1176	0.26
1177	0.24
1178	0.23
1179	0.22
1180	0.22
1181	0.2
1182	0.14
1183	0.11
1184	0.09
1185	0.08
1186	0.07
1187	0.07
1188	0.06
1189	0.06
1190	0.06
1191	0.07
1192	0.07
1193	0.07
1194	0.09
1195	0.12
1196	0.18
1197	0.21
1198	0.23
1199	0.24
1200	0.26
1201	0.27
1202	0.26
1203	0.24
1204	0.19
1205	0.19
1206	0.19
1207	0.18
1208	0.16
1209	0.15
1210	0.15
1211	0.13
1212	0.12
1213	0.1
1214	0.11
1215	0.1
1216	0.11
1217	0.14
1218	0.13
1219	0.16
1220	0.16
1221	0.15
1222	0.11
1223	0.12
1224	0.12
1225	0.14
1226	0.17
1227	0.15
1228	0.16
1229	0.18
1230	0.24
1231	0.29
1232	0.32
1233	0.31
1234	0.37
1235	0.41
1236	0.45
1237	0.48
1238	0.43
1239	0.42
1240	0.44
1241	0.47
1242	0.44
1243	0.43
1244	0.39
1245	0.35
1246	0.37
1247	0.32
1248	0.28
1249	0.25
1250	0.19
1251	0.16
1252	0.16
1253	0.18
1254	0.15
1255	0.15
1256	0.15
1257	0.14
1258	0.12
1259	0.12
1260	0.13
1261	0.09
1262	0.11
1263	0.1
1264	0.12
1265	0.12
1266	0.14
1267	0.17
1268	0.16
1269	0.17
1270	0.16
1271	0.15
1272	0.17
1273	0.22
1274	0.23
1275	0.23
1276	0.26
1277	0.36
1278	0.38
1279	0.4
1280	0.42
1281	0.39
1282	0.38
1283	0.35
1284	0.32
1285	0.21
1286	0.2
1287	0.18
1288	0.11
1289	0.09
1290	0.06
1291	0.05
1292	0.04
1293	0.04
1294	0.04
1295	0.06
1296	0.08

A0A238FC17

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer