FuNGI

A0A238FM32

Protein Details

Accession

A0A238FM32

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
50-80	CPTRAQHTPPGPCRHCRKKGHWSFDCKKAPE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1211-1222	RAPPRARPPRIR

Subcellular Location(s)

mito 7, extr 6, cyto 5.5, cyto_nucl 5, nucl 3.5, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MQVQLRSTNLLNEQSALLASSSATSSRGSSRPSHDHCLACRSSSHRIAQCPTRAQHTPPGPCRHCRKKGHWSFDCKKAPEVDKKSGNDAPANSNVESQHHVGFLVTGLLARRHKLRNNSFVVDSGATARLVPDKSLFMTYRHMVPTKIGGITGGIDAVGLGNVAFVATSGHPITLTGVLHTQGLNVNLLSVSHLCDTDDVHVAFTKQGIDIEKDGNTIAEGTRLDEGLYLLDAEHSQCQHLALLSRSQTSVPLLTLHRCLGHLAPSSIQRMITAGLLEGFRAGYSDEEVEKFVCNACLSAKGHRLPFPDSELHSQERLGLVHSDVLSFPERSRTGKRYLVTFLDDYSCKLWTYAIGHKSEVFGVFKTWLAEVELETGVTLKVLRTDNGGEYRSRAFTEFCKAQGTHRQYSIPHTPQQNGRAERVNRSIVEGVLALLADAHLPNTFWEEAVAYFVYCKNRCQHSALDKATPDFIWQGRRTDTLVLHPFGCTAWLMVAPKLHSKLDPKATCVLFVGYDLASKAFRFYDTNTDKFILGRNATFLDTKFPGLQGNLAAHKIDSHYADASHTKPQTTIKTGTPLSSSPAPSLPPLPALSLATSLSSSVLPTISDDSDDPLDLIGSHAQVRLNLLNVHRSDNDAYREPISAEDSPNELDLIGRHLCNKSPDEIDFLTQHHCAFIATDDDTSDTEAIQPVKSITSNPQTWREAMSSDQCEVWAKAANDEFTSMCNDFKVFTIEDRSTVPAGATIVTSKFVWKTKQNALGDVTGHKARLVAQGNRQCDGIDFAKTFALVAHFSSICSLLTLVAANGLHVHQADINKAYLHGDLDYDIWMMAPRGFDFPGNKVLRLRRSIYGLKQAGQIWNRHINTSLQDLGYTATGTDHCVYSRLDDRHRPHYIALYVDDLLIISPDLAKIERIISGLEQCYGEWYIMDVLARFHFDTTTRGTTVPMTPGLSLMTIPGQGTKRIRSWYLQAIGSLLYISLGTRPDIAFAISYLARFANNPGRRHWIAVKHVLRYLRATYRNELLYAQGSACITGVAGYSDANLGACVDTSVSTMGYVFYIAGSAVSWSSKRQTRVADSTTNAKYLALLHAGKEGIYLSQLLEELHVKPVAPTHIFTDNKATAAVARDPVRVSGTRHIRLREHFVCNMVNRGDISLSHVGTNNMVANIFTKALGPKVFLTHCYALGLRTRHPRLQSDSHSRGGQDSRGLRAPPRARPPRIRT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.21
3	0.17
4	0.13
5	0.09
6	0.08
7	0.08
8	0.09
9	0.09
10	0.1
11	0.1
12	0.12
13	0.18
14	0.22
15	0.25
16	0.3
17	0.38
18	0.47
19	0.53
20	0.59
21	0.6
22	0.61
23	0.61
24	0.63
25	0.57
26	0.48
27	0.46
28	0.44
29	0.46
30	0.48
31	0.53
32	0.5
33	0.54
34	0.59
35	0.63
36	0.66
37	0.65
38	0.6
39	0.59
40	0.57
41	0.55
42	0.58
43	0.58
44	0.61
45	0.61
46	0.7
47	0.68
48	0.73
49	0.79
50	0.81
51	0.82
52	0.82
53	0.82
54	0.83
55	0.88
56	0.9
57	0.88
58	0.88
59	0.86
60	0.86
61	0.86
62	0.77
63	0.71
64	0.68
65	0.68
66	0.68
67	0.68
68	0.67
69	0.66
70	0.66
71	0.68
72	0.64
73	0.59
74	0.53
75	0.48
76	0.44
77	0.43
78	0.44
79	0.38
80	0.37
81	0.34
82	0.32
83	0.32
84	0.29
85	0.24
86	0.2
87	0.19
88	0.17
89	0.16
90	0.13
91	0.1
92	0.08
93	0.08
94	0.09
95	0.15
96	0.17
97	0.19
98	0.26
99	0.33
100	0.4
101	0.49
102	0.57
103	0.61
104	0.67
105	0.69
106	0.63
107	0.57
108	0.53
109	0.43
110	0.34
111	0.27
112	0.21
113	0.16
114	0.15
115	0.14
116	0.16
117	0.16
118	0.17
119	0.16
120	0.17
121	0.19
122	0.24
123	0.24
124	0.22
125	0.27
126	0.28
127	0.31
128	0.33
129	0.33
130	0.29
131	0.29
132	0.32
133	0.3
134	0.28
135	0.23
136	0.18
137	0.17
138	0.18
139	0.16
140	0.1
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.05
145	0.05
146	0.03
147	0.03
148	0.03
149	0.03
150	0.03
151	0.03
152	0.02
153	0.05
154	0.05
155	0.08
156	0.09
157	0.09
158	0.1
159	0.1
160	0.12
161	0.13
162	0.13
163	0.11
164	0.12
165	0.13
166	0.14
167	0.13
168	0.13
169	0.12
170	0.13
171	0.13
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.1
176	0.11
177	0.09
178	0.1
179	0.1
180	0.11
181	0.1
182	0.11
183	0.12
184	0.13
185	0.18
186	0.15
187	0.16
188	0.16
189	0.17
190	0.17
191	0.16
192	0.15
193	0.1
194	0.12
195	0.14
196	0.16
197	0.18
198	0.2
199	0.19
200	0.19
201	0.18
202	0.16
203	0.14
204	0.12
205	0.09
206	0.1
207	0.09
208	0.1
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.11
214	0.08
215	0.08
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.08
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.11
226	0.12
227	0.13
228	0.14
229	0.14
230	0.18
231	0.19
232	0.2
233	0.21
234	0.2
235	0.2
236	0.19
237	0.18
238	0.13
239	0.15
240	0.16
241	0.18
242	0.21
243	0.21
244	0.2
245	0.19
246	0.2
247	0.18
248	0.21
249	0.21
250	0.2
251	0.21
252	0.24
253	0.26
254	0.25
255	0.24
256	0.18
257	0.16
258	0.15
259	0.14
260	0.1
261	0.08
262	0.09
263	0.09
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.07
272	0.09
273	0.1
274	0.1
275	0.11
276	0.12
277	0.12
278	0.12
279	0.11
280	0.11
281	0.1
282	0.1
283	0.1
284	0.16
285	0.17
286	0.22
287	0.28
288	0.3
289	0.34
290	0.37
291	0.39
292	0.36
293	0.37
294	0.36
295	0.34
296	0.33
297	0.35
298	0.35
299	0.35
300	0.32
301	0.29
302	0.26
303	0.23
304	0.2
305	0.16
306	0.13
307	0.11
308	0.13
309	0.13
310	0.12
311	0.11
312	0.13
313	0.14
314	0.14
315	0.14
316	0.17
317	0.19
318	0.23
319	0.3
320	0.32
321	0.36
322	0.41
323	0.42
324	0.39
325	0.41
326	0.4
327	0.37
328	0.33
329	0.28
330	0.26
331	0.24
332	0.22
333	0.19
334	0.17
335	0.14
336	0.13
337	0.12
338	0.11
339	0.16
340	0.21
341	0.25
342	0.26
343	0.26
344	0.27
345	0.27
346	0.26
347	0.23
348	0.17
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.13
353	0.13
354	0.12
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.09
359	0.11
360	0.1
361	0.09
362	0.09
363	0.08
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.04
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.13
372	0.15
373	0.18
374	0.22
375	0.23
376	0.19
377	0.2
378	0.22
379	0.21
380	0.2
381	0.18
382	0.15
383	0.16
384	0.23
385	0.23
386	0.21
387	0.25
388	0.24
389	0.27
390	0.35
391	0.4
392	0.36
393	0.37
394	0.38
395	0.34
396	0.41
397	0.46
398	0.4
399	0.39
400	0.38
401	0.4
402	0.43
403	0.49
404	0.5
405	0.44
406	0.42
407	0.45
408	0.44
409	0.46
410	0.45
411	0.42
412	0.34
413	0.34
414	0.32
415	0.24
416	0.22
417	0.17
418	0.12
419	0.09
420	0.08
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.04
429	0.04
430	0.08
431	0.08
432	0.07
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.09
437	0.09
438	0.06
439	0.07
440	0.1
441	0.16
442	0.16
443	0.19
444	0.24
445	0.28
446	0.31
447	0.34
448	0.38
449	0.39
450	0.48
451	0.47
452	0.45
453	0.41
454	0.39
455	0.37
456	0.29
457	0.23
458	0.16
459	0.16
460	0.19
461	0.2
462	0.22
463	0.22
464	0.24
465	0.24
466	0.25
467	0.23
468	0.24
469	0.26
470	0.25
471	0.23
472	0.22
473	0.21
474	0.18
475	0.17
476	0.1
477	0.06
478	0.05
479	0.06
480	0.07
481	0.08
482	0.1
483	0.1
484	0.13
485	0.15
486	0.15
487	0.16
488	0.19
489	0.25
490	0.33
491	0.33
492	0.33
493	0.37
494	0.36
495	0.34
496	0.31
497	0.25
498	0.15
499	0.14
500	0.13
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.06
507	0.07
508	0.06
509	0.07
510	0.08
511	0.1
512	0.2
513	0.24
514	0.26
515	0.27
516	0.28
517	0.27
518	0.26
519	0.27
520	0.2
521	0.17
522	0.15
523	0.14
524	0.14
525	0.15
526	0.16
527	0.13
528	0.13
529	0.13
530	0.14
531	0.13
532	0.12
533	0.12
534	0.11
535	0.12
536	0.09
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.1
541	0.09
542	0.09
543	0.09
544	0.1
545	0.09
546	0.09
547	0.09
548	0.09
549	0.11
550	0.12
551	0.13
552	0.17
553	0.17
554	0.16
555	0.17
556	0.21
557	0.23
558	0.25
559	0.26
560	0.22
561	0.27
562	0.27
563	0.26
564	0.24
565	0.21
566	0.2
567	0.19
568	0.19
569	0.15
570	0.15
571	0.15
572	0.14
573	0.15
574	0.12
575	0.11
576	0.1
577	0.1
578	0.1
579	0.09
580	0.09
581	0.09
582	0.08
583	0.07
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.04
592	0.05
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.07
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.04
606	0.05
607	0.05
608	0.06
609	0.07
610	0.07
611	0.08
612	0.08
613	0.09
614	0.11
615	0.11
616	0.15
617	0.15
618	0.18
619	0.16
620	0.18
621	0.18
622	0.19
623	0.22
624	0.19
625	0.19
626	0.18
627	0.18
628	0.16
629	0.15
630	0.16
631	0.14
632	0.13
633	0.12
634	0.12
635	0.12
636	0.12
637	0.11
638	0.07
639	0.06
640	0.06
641	0.09
642	0.09
643	0.09
644	0.1
645	0.11
646	0.13
647	0.16
648	0.17
649	0.16
650	0.17
651	0.17
652	0.19
653	0.19
654	0.19
655	0.17
656	0.17
657	0.17
658	0.15
659	0.15
660	0.11
661	0.1
662	0.08
663	0.08
664	0.08
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.07
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.06
674	0.06
675	0.07
676	0.08
677	0.07
678	0.08
679	0.07
680	0.08
681	0.08
682	0.09
683	0.12
684	0.17
685	0.21
686	0.24
687	0.29
688	0.3
689	0.3
690	0.31
691	0.27
692	0.22
693	0.2
694	0.23
695	0.19
696	0.18
697	0.18
698	0.16
699	0.16
700	0.15
701	0.15
702	0.14
703	0.12
704	0.14
705	0.15
706	0.16
707	0.14
708	0.15
709	0.14
710	0.11
711	0.13
712	0.11
713	0.1
714	0.1
715	0.1
716	0.09
717	0.1
718	0.12
719	0.09
720	0.1
721	0.15
722	0.15
723	0.16
724	0.16
725	0.18
726	0.15
727	0.15
728	0.13
729	0.09
730	0.09
731	0.08
732	0.07
733	0.06
734	0.06
735	0.07
736	0.08
737	0.08
738	0.1
739	0.13
740	0.17
741	0.21
742	0.27
743	0.33
744	0.41
745	0.41
746	0.41
747	0.41
748	0.38
749	0.34
750	0.29
751	0.25
752	0.17
753	0.17
754	0.14
755	0.12
756	0.12
757	0.18
758	0.22
759	0.23
760	0.31
761	0.37
762	0.38
763	0.39
764	0.37
765	0.3
766	0.25
767	0.26
768	0.19
769	0.15
770	0.14
771	0.14
772	0.14
773	0.14
774	0.13
775	0.1
776	0.1
777	0.07
778	0.08
779	0.1
780	0.09
781	0.1
782	0.1
783	0.1
784	0.09
785	0.08
786	0.08
787	0.05
788	0.06
789	0.06
790	0.05
791	0.06
792	0.06
793	0.05
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.07
799	0.07
800	0.08
801	0.1
802	0.11
803	0.11
804	0.11
805	0.11
806	0.12
807	0.1
808	0.1
809	0.09
810	0.08
811	0.08
812	0.08
813	0.08
814	0.07
815	0.06
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.07
820	0.07
821	0.07
822	0.09
823	0.1
824	0.12
825	0.13
826	0.15
827	0.24
828	0.24
829	0.25
830	0.28
831	0.33
832	0.37
833	0.4
834	0.42
835	0.34
836	0.39
837	0.44
838	0.43
839	0.47
840	0.43
841	0.39
842	0.4
843	0.39
844	0.39
845	0.37
846	0.35
847	0.31
848	0.38
849	0.37
850	0.34
851	0.33
852	0.29
853	0.28
854	0.3
855	0.27
856	0.18
857	0.17
858	0.17
859	0.16
860	0.14
861	0.12
862	0.07
863	0.06
864	0.06
865	0.09
866	0.09
867	0.09
868	0.09
869	0.11
870	0.11
871	0.14
872	0.22
873	0.24
874	0.29
875	0.37
876	0.42
877	0.49
878	0.53
879	0.51
880	0.44
881	0.45
882	0.41
883	0.34
884	0.31
885	0.24
886	0.21
887	0.19
888	0.17
889	0.12
890	0.09
891	0.07
892	0.06
893	0.04
894	0.04
895	0.04
896	0.05
897	0.05
898	0.06
899	0.07
900	0.08
901	0.09
902	0.09
903	0.09
904	0.1
905	0.13
906	0.13
907	0.14
908	0.13
909	0.12
910	0.14
911	0.14
912	0.13
913	0.09
914	0.09
915	0.08
916	0.09
917	0.09
918	0.07
919	0.08
920	0.09
921	0.11
922	0.1
923	0.1
924	0.1
925	0.11
926	0.14
927	0.18
928	0.21
929	0.2
930	0.2
931	0.21
932	0.22
933	0.23
934	0.23
935	0.19
936	0.17
937	0.16
938	0.16
939	0.15
940	0.13
941	0.11
942	0.09
943	0.08
944	0.08
945	0.08
946	0.12
947	0.13
948	0.18
949	0.22
950	0.25
951	0.28
952	0.32
953	0.34
954	0.33
955	0.37
956	0.4
957	0.41
958	0.37
959	0.33
960	0.3
961	0.28
962	0.24
963	0.19
964	0.1
965	0.06
966	0.05
967	0.05
968	0.06
969	0.07
970	0.07
971	0.09
972	0.09
973	0.1
974	0.11
975	0.11
976	0.1
977	0.09
978	0.12
979	0.1
980	0.1
981	0.1
982	0.1
983	0.1
984	0.1
985	0.15
986	0.22
987	0.29
988	0.31
989	0.34
990	0.42
991	0.42
992	0.47
993	0.48
994	0.46
995	0.47
996	0.55
997	0.56
998	0.51
999	0.54
1000	0.51
1001	0.47
1002	0.42
1003	0.41
1004	0.39
1005	0.41
1006	0.42
1007	0.42
1008	0.45
1009	0.45
1010	0.42
1011	0.37
1012	0.3
1013	0.25
1014	0.22
1015	0.18
1016	0.15
1017	0.14
1018	0.13
1019	0.12
1020	0.1
1021	0.07
1022	0.07
1023	0.07
1024	0.05
1025	0.06
1026	0.05
1027	0.06
1028	0.06
1029	0.06
1030	0.06
1031	0.06
1032	0.06
1033	0.05
1034	0.05
1035	0.05
1036	0.05
1037	0.06
1038	0.06
1039	0.07
1040	0.07
1041	0.07
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.07
1045	0.06
1046	0.06
1047	0.05
1048	0.05
1049	0.05
1050	0.05
1051	0.04
1052	0.05
1053	0.06
1054	0.07
1055	0.08
1056	0.11
1057	0.18
1058	0.24
1059	0.27
1060	0.32
1061	0.39
1062	0.45
1063	0.52
1064	0.55
1065	0.54
1066	0.51
1067	0.55
1068	0.52
1069	0.46
1070	0.38
1071	0.3
1072	0.25
1073	0.21
1074	0.22
1075	0.19
1076	0.18
1077	0.17
1078	0.2
1079	0.2
1080	0.19
1081	0.18
1082	0.15
1083	0.1
1084	0.1
1085	0.1
1086	0.07
1087	0.08
1088	0.09
1089	0.08
1090	0.1
1091	0.12
1092	0.12
1093	0.15
1094	0.15
1095	0.14
1096	0.14
1097	0.18
1098	0.22
1099	0.22
1100	0.22
1101	0.23
1102	0.31
1103	0.32
1104	0.33
1105	0.38
1106	0.34
1107	0.32
1108	0.31
1109	0.27
1110	0.2
1111	0.24
1112	0.25
1113	0.23
1114	0.24
1115	0.26
1116	0.26
1117	0.28
1118	0.29
1119	0.28
1120	0.3
1121	0.33
1122	0.4
1123	0.45
1124	0.5
1125	0.54
1126	0.56
1127	0.58
1128	0.64
1129	0.62
1130	0.59
1131	0.53
1132	0.52
1133	0.52
1134	0.48
1135	0.49
1136	0.4
1137	0.34
1138	0.28
1139	0.27
1140	0.24
1141	0.19
1142	0.23
1143	0.22
1144	0.22
1145	0.22
1146	0.23
1147	0.22
1148	0.22
1149	0.24
1150	0.19
1151	0.15
1152	0.14
1153	0.13
1154	0.13
1155	0.14
1156	0.14
1157	0.12
1158	0.12
1159	0.13
1160	0.18
1161	0.19
1162	0.2
1163	0.2
1164	0.25
1165	0.27
1166	0.27
1167	0.33
1168	0.31
1169	0.3
1170	0.31
1171	0.29
1172	0.26
1173	0.31
1174	0.32
1175	0.32
1176	0.4
1177	0.46
1178	0.49
1179	0.54
1180	0.58
1181	0.59
1182	0.65
1183	0.68
1184	0.68
1185	0.67
1186	0.66
1187	0.63
1188	0.57
1189	0.54
1190	0.48
1191	0.42
1192	0.4
1193	0.38
1194	0.38
1195	0.42
1196	0.43
1197	0.42
1198	0.48
1199	0.52
1200	0.53
1201	0.61
1202	0.65
1203	0.69

A0A238FM32

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer