FuNGI

A0A238FHW4

Protein Details

Accession

A0A238FHW4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
281-300	NEEARKKWYNQPQSNRPRPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 10.333, cyto 6.5, cyto_mito 5.666, mito 3.5, extr 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MSSTPSSDMNDLKTILQQLLQARLSDTQPTSGTSSQDDPTPPRVPAASSVTFEAVNKLKDDTTFARWDRVLEMSVPTPVYCYLQTGNFPAEWSHALQASWTDYVQSILFNSLDSSIQILVQSTKTETPHELYIRLKDRFSPRDAQAYAKLIERFWSMPQIPLTSQAEFDQHVDNNIALATAIHLGKVDIEQVLVAARLFNNFNNGLSAWRTTFLQMHEGKDKLPCLEDMIKLMRTEAYNIIDKCPSAYMSNSDKPRASATPPGPCLACKTGAVHWIRKCPNEEARKKWYNQPQSNRPRPSNKPAAQARFALTADNVPDEGPSISFAAASFLSATSDVSSLLLDSAASHHMVNDSSAFVELHKTSSVRIGGVRGALSSQGKGIIELISSTGDRIRLSDIFFVPGCPANLISMFALIKDGITPSFTLDGRLSLVRGGKCICTGMAKADHLFHLDAHLCMHTALVAARAPKVPLLTLHRRLGHCSLSTLRKLANSNQVKGIEWTYSADDCNDFQCDACMASKAHKLPFPLSESHASLPLGLVHLDLLLFPEPSVSGRRYLITFINDFSRKAWAFPLLRKSDALAAFQRWKAEVENSSGAKIKTLRSDNGGKYTAFDKFCAEQGIRCDKSVPYTPEHIRNSAVSKRRCQVEKDWEH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.24
3	0.23
4	0.23
5	0.24
6	0.3
7	0.3
8	0.27
9	0.27
10	0.29
11	0.29
12	0.31
13	0.28
14	0.25
15	0.24
16	0.26
17	0.29
18	0.29
19	0.29
20	0.26
21	0.29
22	0.26
23	0.3
24	0.31
25	0.3
26	0.35
27	0.37
28	0.33
29	0.32
30	0.32
31	0.3
32	0.32
33	0.34
34	0.31
35	0.29
36	0.3
37	0.29
38	0.29
39	0.27
40	0.27
41	0.24
42	0.22
43	0.21
44	0.21
45	0.21
46	0.21
47	0.27
48	0.26
49	0.28
50	0.35
51	0.35
52	0.39
53	0.38
54	0.39
55	0.35
56	0.33
57	0.28
58	0.22
59	0.23
60	0.19
61	0.21
62	0.2
63	0.17
64	0.16
65	0.16
66	0.17
67	0.14
68	0.16
69	0.16
70	0.18
71	0.2
72	0.21
73	0.23
74	0.2
75	0.21
76	0.18
77	0.19
78	0.18
79	0.18
80	0.17
81	0.16
82	0.16
83	0.15
84	0.17
85	0.17
86	0.16
87	0.14
88	0.13
89	0.11
90	0.13
91	0.13
92	0.12
93	0.09
94	0.1
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.09
101	0.1
102	0.08
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.1
107	0.11
108	0.12
109	0.13
110	0.16
111	0.17
112	0.2
113	0.21
114	0.23
115	0.28
116	0.29
117	0.3
118	0.29
119	0.36
120	0.41
121	0.4
122	0.38
123	0.38
124	0.46
125	0.48
126	0.5
127	0.49
128	0.44
129	0.51
130	0.51
131	0.48
132	0.44
133	0.42
134	0.39
135	0.36
136	0.34
137	0.25
138	0.26
139	0.25
140	0.22
141	0.19
142	0.26
143	0.21
144	0.24
145	0.26
146	0.27
147	0.24
148	0.29
149	0.3
150	0.23
151	0.23
152	0.2
153	0.2
154	0.18
155	0.2
156	0.17
157	0.15
158	0.15
159	0.15
160	0.14
161	0.13
162	0.11
163	0.1
164	0.06
165	0.06
166	0.05
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.07
185	0.08
186	0.09
187	0.12
188	0.12
189	0.13
190	0.13
191	0.14
192	0.13
193	0.14
194	0.15
195	0.12
196	0.12
197	0.12
198	0.12
199	0.15
200	0.14
201	0.21
202	0.22
203	0.24
204	0.28
205	0.28
206	0.28
207	0.28
208	0.28
209	0.21
210	0.19
211	0.16
212	0.17
213	0.2
214	0.19
215	0.2
216	0.21
217	0.22
218	0.21
219	0.21
220	0.18
221	0.15
222	0.16
223	0.16
224	0.16
225	0.2
226	0.21
227	0.22
228	0.21
229	0.2
230	0.19
231	0.17
232	0.15
233	0.11
234	0.11
235	0.15
236	0.21
237	0.27
238	0.29
239	0.31
240	0.3
241	0.3
242	0.32
243	0.29
244	0.25
245	0.27
246	0.29
247	0.33
248	0.34
249	0.34
250	0.31
251	0.29
252	0.3
253	0.24
254	0.21
255	0.15
256	0.16
257	0.16
258	0.23
259	0.26
260	0.28
261	0.29
262	0.36
263	0.38
264	0.39
265	0.4
266	0.39
267	0.45
268	0.49
269	0.53
270	0.51
271	0.58
272	0.61
273	0.6
274	0.63
275	0.63
276	0.64
277	0.65
278	0.67
279	0.69
280	0.74
281	0.81
282	0.79
283	0.76
284	0.73
285	0.71
286	0.7
287	0.7
288	0.63
289	0.63
290	0.63
291	0.62
292	0.56
293	0.51
294	0.45
295	0.36
296	0.32
297	0.24
298	0.17
299	0.13
300	0.11
301	0.1
302	0.09
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.04
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.04
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.03
330	0.03
331	0.04
332	0.05
333	0.06
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.05
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.12
352	0.13
353	0.11
354	0.11
355	0.11
356	0.11
357	0.12
358	0.11
359	0.08
360	0.08
361	0.09
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.1
381	0.11
382	0.12
383	0.15
384	0.15
385	0.16
386	0.16
387	0.16
388	0.14
389	0.14
390	0.13
391	0.1
392	0.1
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.07
400	0.07
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.05
406	0.06
407	0.06
408	0.07
409	0.1
410	0.1
411	0.11
412	0.11
413	0.11
414	0.12
415	0.13
416	0.12
417	0.11
418	0.16
419	0.14
420	0.16
421	0.16
422	0.15
423	0.15
424	0.16
425	0.14
426	0.12
427	0.12
428	0.15
429	0.16
430	0.17
431	0.17
432	0.18
433	0.18
434	0.18
435	0.17
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.1
443	0.09
444	0.09
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.08
450	0.08
451	0.1
452	0.11
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.11
457	0.14
458	0.22
459	0.29
460	0.35
461	0.4
462	0.44
463	0.45
464	0.49
465	0.48
466	0.44
467	0.36
468	0.33
469	0.33
470	0.33
471	0.34
472	0.31
473	0.29
474	0.29
475	0.31
476	0.33
477	0.38
478	0.38
479	0.39
480	0.42
481	0.42
482	0.39
483	0.38
484	0.34
485	0.24
486	0.19
487	0.19
488	0.16
489	0.16
490	0.15
491	0.14
492	0.14
493	0.14
494	0.15
495	0.15
496	0.12
497	0.11
498	0.12
499	0.12
500	0.11
501	0.12
502	0.12
503	0.11
504	0.15
505	0.21
506	0.24
507	0.27
508	0.29
509	0.31
510	0.31
511	0.36
512	0.35
513	0.32
514	0.33
515	0.33
516	0.34
517	0.32
518	0.31
519	0.26
520	0.22
521	0.2
522	0.16
523	0.13
524	0.1
525	0.09
526	0.06
527	0.06
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.07
535	0.08
536	0.09
537	0.14
538	0.13
539	0.15
540	0.16
541	0.19
542	0.19
543	0.22
544	0.24
545	0.25
546	0.25
547	0.23
548	0.3
549	0.3
550	0.3
551	0.28
552	0.32
553	0.28
554	0.28
555	0.29
556	0.29
557	0.32
558	0.38
559	0.47
560	0.43
561	0.45
562	0.44
563	0.43
564	0.42
565	0.39
566	0.37
567	0.31
568	0.32
569	0.36
570	0.38
571	0.38
572	0.31
573	0.31
574	0.3
575	0.31
576	0.29
577	0.29
578	0.34
579	0.34
580	0.35
581	0.37
582	0.34
583	0.33
584	0.33
585	0.3
586	0.32
587	0.37
588	0.38
589	0.4
590	0.49
591	0.49
592	0.53
593	0.52
594	0.43
595	0.4
596	0.4
597	0.41
598	0.33
599	0.3
600	0.27
601	0.26
602	0.29
603	0.32
604	0.3
605	0.26
606	0.33
607	0.42
608	0.4
609	0.39
610	0.38
611	0.34
612	0.4
613	0.45
614	0.41
615	0.37
616	0.43
617	0.49
618	0.57
619	0.6
620	0.56
621	0.49
622	0.49
623	0.5
624	0.5
625	0.53
626	0.51
627	0.54
628	0.59
629	0.66
630	0.66
631	0.66
632	0.67

A0A238FHW4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer