Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238F803

Protein Details
Accession A0A238F803    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-274QGPPPPKPSKRSKKETSKETTPHydrophilic
280-303IAPAKSPLKKSSRRKVAQKSVTNEHydrophilic
390-411LAKPAPPQKKAARPPKDQSIRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
234-270RARKAAARSASRGKIPALAQGPPPPKPSKRSKKETSK
281-294APAKSPLKKSSRRK
398-400KKA
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MGPKTKTKPKPVPQSLTSGPVDQGRRSAQLTNTRAAPSRLKVVVRRLPPALPEPVFWSSVASWVALPPDLTAAPPVSTSAVNTGVDSVVWAQYRPGKVRARHDKDDTHSRAYLSFKSPEALIAFHHAYDGWNFKARTGEPQTNPLFGGDLQLRSRLTRSMLAPLPGQVTRAVVEFAPYQNTRSVSNKRDPRQGTIEQDPDFIAFQDALANPKVPQVELPAKITPTSTPLLDHLRARKAAARSASRGKIPALAQGPPPPKPSKRSKKETSKETTPVAVAAIAPAKSPLKKSSRRKVAQKSVTNERGGSAFDSESKSELKSARGVKQESKTKPSEAENQVVATKSRVIAATEAAKPKQAREAPTPTQIAEATELVRRTLQTKHQAKYQGGALAKPAPPQKKAARPPKDQSIRTQLWVVFPRC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.72
3 0.67
4 0.59
5 0.49
6 0.41
7 0.39
8 0.39
9 0.32
10 0.34
11 0.31
12 0.32
13 0.33
14 0.36
15 0.36
16 0.43
17 0.46
18 0.45
19 0.45
20 0.45
21 0.45
22 0.44
23 0.43
24 0.36
25 0.4
26 0.41
27 0.42
28 0.45
29 0.52
30 0.56
31 0.55
32 0.56
33 0.52
34 0.49
35 0.48
36 0.47
37 0.45
38 0.38
39 0.34
40 0.34
41 0.34
42 0.33
43 0.29
44 0.27
45 0.19
46 0.22
47 0.21
48 0.16
49 0.14
50 0.14
51 0.15
52 0.13
53 0.12
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.14
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.17
80 0.21
81 0.24
82 0.31
83 0.36
84 0.42
85 0.53
86 0.62
87 0.65
88 0.68
89 0.71
90 0.69
91 0.68
92 0.73
93 0.67
94 0.61
95 0.54
96 0.47
97 0.44
98 0.41
99 0.38
100 0.32
101 0.29
102 0.25
103 0.24
104 0.24
105 0.23
106 0.2
107 0.16
108 0.13
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.14
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.16
117 0.12
118 0.18
119 0.18
120 0.19
121 0.23
122 0.23
123 0.29
124 0.34
125 0.4
126 0.36
127 0.44
128 0.44
129 0.41
130 0.4
131 0.32
132 0.25
133 0.17
134 0.19
135 0.13
136 0.14
137 0.13
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.15
143 0.16
144 0.17
145 0.18
146 0.21
147 0.23
148 0.24
149 0.23
150 0.22
151 0.23
152 0.19
153 0.18
154 0.13
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.18
169 0.22
170 0.29
171 0.3
172 0.38
173 0.45
174 0.47
175 0.54
176 0.54
177 0.53
178 0.53
179 0.52
180 0.48
181 0.45
182 0.46
183 0.37
184 0.36
185 0.31
186 0.24
187 0.2
188 0.15
189 0.1
190 0.06
191 0.05
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.11
199 0.11
200 0.09
201 0.09
202 0.13
203 0.17
204 0.18
205 0.21
206 0.2
207 0.2
208 0.21
209 0.21
210 0.16
211 0.14
212 0.13
213 0.11
214 0.1
215 0.12
216 0.16
217 0.18
218 0.21
219 0.22
220 0.24
221 0.25
222 0.25
223 0.28
224 0.25
225 0.27
226 0.3
227 0.29
228 0.3
229 0.36
230 0.37
231 0.34
232 0.33
233 0.3
234 0.29
235 0.26
236 0.27
237 0.22
238 0.21
239 0.22
240 0.27
241 0.29
242 0.27
243 0.32
244 0.32
245 0.33
246 0.39
247 0.49
248 0.53
249 0.6
250 0.67
251 0.73
252 0.79
253 0.83
254 0.86
255 0.83
256 0.79
257 0.74
258 0.66
259 0.57
260 0.46
261 0.38
262 0.28
263 0.2
264 0.13
265 0.09
266 0.1
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.11
271 0.13
272 0.16
273 0.22
274 0.29
275 0.39
276 0.49
277 0.58
278 0.67
279 0.74
280 0.81
281 0.84
282 0.86
283 0.86
284 0.84
285 0.8
286 0.79
287 0.77
288 0.68
289 0.57
290 0.47
291 0.38
292 0.31
293 0.26
294 0.18
295 0.12
296 0.13
297 0.15
298 0.15
299 0.16
300 0.16
301 0.15
302 0.17
303 0.19
304 0.18
305 0.23
306 0.28
307 0.33
308 0.39
309 0.43
310 0.46
311 0.53
312 0.6
313 0.59
314 0.61
315 0.58
316 0.53
317 0.53
318 0.51
319 0.53
320 0.48
321 0.47
322 0.41
323 0.39
324 0.38
325 0.35
326 0.31
327 0.22
328 0.19
329 0.15
330 0.16
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.17
335 0.21
336 0.24
337 0.29
338 0.27
339 0.32
340 0.31
341 0.32
342 0.38
343 0.38
344 0.38
345 0.41
346 0.5
347 0.49
348 0.56
349 0.56
350 0.47
351 0.44
352 0.39
353 0.32
354 0.26
355 0.22
356 0.17
357 0.19
358 0.19
359 0.17
360 0.19
361 0.18
362 0.18
363 0.23
364 0.3
365 0.37
366 0.45
367 0.48
368 0.53
369 0.6
370 0.59
371 0.57
372 0.52
373 0.48
374 0.41
375 0.38
376 0.34
377 0.33
378 0.34
379 0.35
380 0.39
381 0.39
382 0.4
383 0.48
384 0.54
385 0.57
386 0.66
387 0.72
388 0.73
389 0.77
390 0.82
391 0.85
392 0.86
393 0.79
394 0.77
395 0.77
396 0.71
397 0.65
398 0.63
399 0.53
400 0.52