FuNGI

A0A238F6B0

Protein Details

Accession

A0A238F6B0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
99-122	QQQQQSQQKQQQQQQQQQQQQQSG	Hydrophilic
757-776	APVLPPRRKRQKISYHPLTR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 8.5, mito 8, cyto_nucl 6.5, extr 5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001606 ARID_dom IPR036431 ARID_dom_sf IPR002078 Sigma_54_int
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0003677 F:DNA binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF01388 ARID
PROSITE	View protein in PROSITE PS51011 ARID PS50045 SIGMA54_INTERACT_4

Amino Acid Sequences

MLCAPLLPGPSPPSLLEASLRPRLLLRSSPPQLDPTAHPVPTASDACRRDKTRSSYPATTASSIDPTAMYASQAIGSQQPLWQQAQQQQAQQAHLQQHQQQQQSQQKQQQQQQQQQQQQQSGQMNGMSNYGYKPGSPNSYPTQGHNPGNPSTVLLAQQMAQQQQRQQAMAAAGLGHLTPQQQQAYIQARQAQMQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAAQNGGSMPPPPLPGQPRFDFANQQQPPQSSQQMGTLGQPPFGAPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQMPPPGSANQAIPIDVQAFMRAFLAQGPITPERFAALPPQQQQMVSHVMRQRRLAQQQAQAQAQVQAQASGPGQAQPPSQLGSSGTLQPNGVPIPSTPHPSSGTPAASGANHASPTPTALPGAPSGHPTATAPSAFSAPSPMGAPSPIAAAQMSAVNGASPTPQLQPGASTSFLRAIMDFYQKRGMTWPGAPTIEGRTVNLSALYAFVMRGGGFQRVHNAGQWRQIAHVLGFPAPSPAAQPESRCQQIAAVYHSIILPFETAFVQMRAQQQQQQAAQAMRAAQTADQGALASNGTLSSDPPPVALANGSIAPMPPPVAAPAPTTTPAPATTLVPVPASNPYSQSAPIPGSSAMPPAEMTRTPFTGPVASQPPPIMPAPVAPIAAPVQSAPNPAAGAATTVRMGSTDRKGKGKAKDEPTPMVSFPSGNGKGPTPPQQLKQQQPYRVPEPSFAAKPILPPPAPVLPPRRKRQKISYHPLTRVVDSHASWDLGAVEEGLHTVTTRKRPRIAADLNVIDVPSLVMSLKSRLASEVAFALNALTLVSLSMRIVPQDSQSMPFSLANCGVLLEELVVLLEEVAFGPPKDEDEREEADALDQSQDAPARNGRLDEDAGASGSQREGALGPMPRSYRELFKLVVQEESELRDGVRISSGEQRDPTSLADDGTVPLGRAETVLSLTNLLRNLSVSDDNARFMSSDRWRVLEVLLRVAELPLRRNSTAKPTHWPLRLSAGDLMIVRKDVLEMINNLGLEIKLEDLTADTARALYDLLMFFLRDADHHDQLYFDLSTSPSISSRIVQPNTVQVSHYLELGVSAFARTTVLDANRYVVADLAVDTDLYALFESLIHLLPITEGDFQLVTTEAGLVFVENLAMSLYNLAFLAPLELKMQLREMPAFVKALLRVVRRLAGTMTNPSENAFLTLSDRCISTLQLLSDCGGVVAGVGGARDQNDVMWWGLSMSGSEEDRPLQAMPTEADHGTVKPRLPSQGTKQATIPILTGETRSLLEWLHSGSLTSVFGQLASMTNTVGTKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.22
4	0.24
5	0.29
6	0.33
7	0.33
8	0.3
9	0.31
10	0.34
11	0.36
12	0.37
13	0.38
14	0.41
15	0.46
16	0.5
17	0.5
18	0.5
19	0.47
20	0.45
21	0.42
22	0.4
23	0.41
24	0.36
25	0.34
26	0.31
27	0.31
28	0.33
29	0.32
30	0.28
31	0.3
32	0.35
33	0.41
34	0.5
35	0.5
36	0.52
37	0.58
38	0.63
39	0.64
40	0.69
41	0.71
42	0.68
43	0.68
44	0.69
45	0.64
46	0.57
47	0.49
48	0.42
49	0.36
50	0.3
51	0.27
52	0.19
53	0.16
54	0.16
55	0.14
56	0.13
57	0.1
58	0.1
59	0.11
60	0.11
61	0.11
62	0.11
63	0.13
64	0.13
65	0.15
66	0.18
67	0.21
68	0.23
69	0.25
70	0.29
71	0.34
72	0.43
73	0.44
74	0.44
75	0.48
76	0.48
77	0.48
78	0.45
79	0.44
80	0.41
81	0.42
82	0.44
83	0.43
84	0.49
85	0.53
86	0.56
87	0.54
88	0.58
89	0.64
90	0.67
91	0.7
92	0.69
93	0.71
94	0.75
95	0.79
96	0.79
97	0.79
98	0.79
99	0.81
100	0.82
101	0.82
102	0.81
103	0.8
104	0.75
105	0.68
106	0.66
107	0.59
108	0.51
109	0.44
110	0.38
111	0.33
112	0.28
113	0.26
114	0.19
115	0.16
116	0.15
117	0.17
118	0.14
119	0.13
120	0.16
121	0.2
122	0.27
123	0.27
124	0.32
125	0.35
126	0.43
127	0.43
128	0.44
129	0.49
130	0.49
131	0.52
132	0.51
133	0.49
134	0.43
135	0.44
136	0.4
137	0.31
138	0.26
139	0.24
140	0.2
141	0.17
142	0.15
143	0.13
144	0.17
145	0.19
146	0.22
147	0.24
148	0.26
149	0.29
150	0.36
151	0.38
152	0.35
153	0.32
154	0.31
155	0.28
156	0.25
157	0.21
158	0.14
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.1
166	0.14
167	0.15
168	0.16
169	0.17
170	0.24
171	0.3
172	0.31
173	0.32
174	0.33
175	0.33
176	0.34
177	0.36
178	0.3
179	0.29
180	0.29
181	0.29
182	0.24
183	0.26
184	0.24
185	0.25
186	0.23
187	0.21
188	0.18
189	0.19
190	0.18
191	0.18
192	0.18
193	0.18
194	0.18
195	0.18
196	0.18
197	0.17
198	0.17
199	0.18
200	0.19
201	0.17
202	0.17
203	0.14
204	0.14
205	0.12
206	0.12
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.11
211	0.13
212	0.14
213	0.2
214	0.26
215	0.31
216	0.37
217	0.37
218	0.39
219	0.4
220	0.41
221	0.42
222	0.39
223	0.45
224	0.39
225	0.41
226	0.42
227	0.4
228	0.42
229	0.4
230	0.4
231	0.31
232	0.31
233	0.31
234	0.29
235	0.28
236	0.27
237	0.29
238	0.25
239	0.24
240	0.23
241	0.19
242	0.19
243	0.2
244	0.21
245	0.15
246	0.23
247	0.31
248	0.38
249	0.44
250	0.49
251	0.57
252	0.61
253	0.69
254	0.69
255	0.7
256	0.72
257	0.75
258	0.76
259	0.75
260	0.76
261	0.76
262	0.76
263	0.76
264	0.76
265	0.76
266	0.76
267	0.76
268	0.76
269	0.76
270	0.76
271	0.76
272	0.76
273	0.76
274	0.76
275	0.76
276	0.76
277	0.76
278	0.76
279	0.76
280	0.74
281	0.73
282	0.69
283	0.65
284	0.62
285	0.6
286	0.52
287	0.44
288	0.4
289	0.34
290	0.31
291	0.28
292	0.22
293	0.2
294	0.19
295	0.19
296	0.17
297	0.16
298	0.13
299	0.12
300	0.12
301	0.1
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.11
309	0.08
310	0.09
311	0.14
312	0.16
313	0.17
314	0.17
315	0.16
316	0.15
317	0.15
318	0.15
319	0.16
320	0.2
321	0.25
322	0.28
323	0.31
324	0.31
325	0.31
326	0.31
327	0.28
328	0.3
329	0.24
330	0.27
331	0.28
332	0.32
333	0.35
334	0.37
335	0.4
336	0.41
337	0.46
338	0.48
339	0.51
340	0.53
341	0.57
342	0.59
343	0.53
344	0.45
345	0.4
346	0.36
347	0.29
348	0.25
349	0.19
350	0.15
351	0.14
352	0.15
353	0.14
354	0.12
355	0.12
356	0.11
357	0.12
358	0.13
359	0.13
360	0.14
361	0.15
362	0.14
363	0.14
364	0.13
365	0.13
366	0.14
367	0.16
368	0.19
369	0.19
370	0.19
371	0.19
372	0.18
373	0.19
374	0.16
375	0.14
376	0.09
377	0.08
378	0.14
379	0.16
380	0.22
381	0.2
382	0.23
383	0.26
384	0.26
385	0.28
386	0.26
387	0.25
388	0.19
389	0.19
390	0.17
391	0.15
392	0.16
393	0.14
394	0.12
395	0.11
396	0.1
397	0.11
398	0.09
399	0.12
400	0.12
401	0.11
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.12
406	0.15
407	0.13
408	0.13
409	0.15
410	0.14
411	0.14
412	0.13
413	0.14
414	0.13
415	0.13
416	0.11
417	0.1
418	0.11
419	0.11
420	0.1
421	0.1
422	0.08
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.08
427	0.08
428	0.09
429	0.07
430	0.08
431	0.08
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.07
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.11
451	0.12
452	0.14
453	0.14
454	0.13
455	0.13
456	0.14
457	0.15
458	0.14
459	0.12
460	0.11
461	0.13
462	0.21
463	0.2
464	0.2
465	0.26
466	0.26
467	0.26
468	0.27
469	0.27
470	0.21
471	0.23
472	0.24
473	0.2
474	0.21
475	0.21
476	0.19
477	0.19
478	0.21
479	0.18
480	0.16
481	0.16
482	0.16
483	0.16
484	0.15
485	0.12
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.05
490	0.05
491	0.04
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.07
496	0.1
497	0.11
498	0.11
499	0.15
500	0.17
501	0.18
502	0.19
503	0.23
504	0.21
505	0.26
506	0.28
507	0.24
508	0.23
509	0.24
510	0.22
511	0.18
512	0.17
513	0.12
514	0.11
515	0.11
516	0.1
517	0.09
518	0.08
519	0.08
520	0.07
521	0.07
522	0.11
523	0.12
524	0.14
525	0.16
526	0.21
527	0.22
528	0.22
529	0.2
530	0.18
531	0.2
532	0.2
533	0.2
534	0.17
535	0.15
536	0.16
537	0.15
538	0.14
539	0.11
540	0.09
541	0.06
542	0.04
543	0.05
544	0.05
545	0.06
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.11
550	0.15
551	0.18
552	0.19
553	0.23
554	0.25
555	0.29
556	0.3
557	0.28
558	0.26
559	0.23
560	0.22
561	0.17
562	0.16
563	0.12
564	0.11
565	0.1
566	0.07
567	0.08
568	0.08
569	0.07
570	0.06
571	0.06
572	0.05
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.03
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.06
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.08
587	0.08
588	0.08
589	0.06
590	0.05
591	0.06
592	0.06
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.06
598	0.05
599	0.05
600	0.06
601	0.07
602	0.08
603	0.08
604	0.09
605	0.1
606	0.11
607	0.11
608	0.1
609	0.1
610	0.1
611	0.1
612	0.1
613	0.09
614	0.1
615	0.1
616	0.1
617	0.1
618	0.09
619	0.09
620	0.11
621	0.12
622	0.11
623	0.11
624	0.12
625	0.13
626	0.13
627	0.13
628	0.12
629	0.11
630	0.11
631	0.1
632	0.1
633	0.1
634	0.1
635	0.11
636	0.09
637	0.08
638	0.09
639	0.08
640	0.09
641	0.09
642	0.11
643	0.11
644	0.12
645	0.13
646	0.13
647	0.13
648	0.12
649	0.12
650	0.13
651	0.15
652	0.15
653	0.15
654	0.15
655	0.14
656	0.15
657	0.15
658	0.12
659	0.08
660	0.08
661	0.1
662	0.1
663	0.1
664	0.08
665	0.09
666	0.09
667	0.09
668	0.08
669	0.06
670	0.06
671	0.07
672	0.08
673	0.07
674	0.07
675	0.07
676	0.07
677	0.07
678	0.05
679	0.06
680	0.06
681	0.06
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.07
687	0.09
688	0.15
689	0.21
690	0.23
691	0.26
692	0.3
693	0.36
694	0.43
695	0.47
696	0.5
697	0.49
698	0.54
699	0.55
700	0.54
701	0.51
702	0.44
703	0.37
704	0.3
705	0.24
706	0.17
707	0.14
708	0.19
709	0.17
710	0.16
711	0.17
712	0.16
713	0.18
714	0.2
715	0.28
716	0.27
717	0.29
718	0.31
719	0.39
720	0.46
721	0.51
722	0.59
723	0.57
724	0.56
725	0.6
726	0.62
727	0.57
728	0.54
729	0.48
730	0.4
731	0.37
732	0.34
733	0.29
734	0.25
735	0.23
736	0.18
737	0.19
738	0.21
739	0.22
740	0.19
741	0.18
742	0.21
743	0.23
744	0.24
745	0.25
746	0.31
747	0.36
748	0.44
749	0.53
750	0.61
751	0.63
752	0.68
753	0.74
754	0.76
755	0.77
756	0.79
757	0.81
758	0.77
759	0.73
760	0.74
761	0.65
762	0.55
763	0.45
764	0.38
765	0.3
766	0.23
767	0.23
768	0.17
769	0.16
770	0.14
771	0.13
772	0.1
773	0.08
774	0.08
775	0.05
776	0.04
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.03
782	0.06
783	0.1
784	0.19
785	0.25
786	0.29
787	0.34
788	0.37
789	0.41
790	0.48
791	0.48
792	0.44
793	0.43
794	0.4
795	0.36
796	0.33
797	0.29
798	0.19
799	0.15
800	0.1
801	0.04
802	0.04
803	0.03
804	0.04
805	0.04
806	0.06
807	0.08
808	0.09
809	0.09
810	0.1
811	0.11
812	0.1
813	0.1
814	0.11
815	0.09
816	0.08
817	0.08
818	0.07
819	0.06
820	0.06
821	0.05
822	0.03
823	0.03
824	0.03
825	0.03
826	0.03
827	0.03
828	0.05
829	0.05
830	0.06
831	0.07
832	0.08
833	0.09
834	0.12
835	0.13
836	0.14
837	0.15
838	0.16
839	0.16
840	0.17
841	0.16
842	0.14
843	0.14
844	0.12
845	0.11
846	0.1
847	0.09
848	0.07
849	0.06
850	0.04
851	0.04
852	0.03
853	0.03
854	0.03
855	0.03
856	0.03
857	0.02
858	0.02
859	0.03
860	0.03
861	0.04
862	0.04
863	0.05
864	0.05
865	0.07
866	0.1
867	0.11
868	0.13
869	0.17
870	0.2
871	0.21
872	0.21
873	0.19
874	0.17
875	0.17
876	0.15
877	0.11
878	0.08
879	0.07
880	0.08
881	0.09
882	0.09
883	0.11
884	0.12
885	0.14
886	0.15
887	0.15
888	0.15
889	0.16
890	0.16
891	0.15
892	0.14
893	0.12
894	0.12
895	0.11
896	0.1
897	0.08
898	0.07
899	0.07
900	0.05
901	0.06
902	0.05
903	0.06
904	0.1
905	0.12
906	0.13
907	0.16
908	0.17
909	0.18
910	0.21
911	0.22
912	0.23
913	0.25
914	0.26
915	0.24
916	0.26
917	0.3
918	0.28
919	0.28
920	0.23
921	0.21
922	0.19
923	0.21
924	0.18
925	0.13
926	0.12
927	0.12
928	0.12
929	0.11
930	0.12
931	0.09
932	0.11
933	0.19
934	0.21
935	0.22
936	0.23
937	0.24
938	0.23
939	0.24
940	0.23
941	0.17
942	0.16
943	0.14
944	0.13
945	0.11
946	0.11
947	0.11
948	0.11
949	0.08
950	0.08
951	0.08
952	0.07
953	0.07
954	0.07
955	0.05
956	0.07
957	0.08
958	0.08
959	0.09
960	0.1
961	0.12
962	0.12
963	0.12
964	0.11
965	0.1
966	0.11
967	0.12
968	0.13
969	0.12
970	0.17
971	0.17
972	0.18
973	0.18
974	0.18
975	0.15
976	0.15
977	0.21
978	0.22
979	0.28
980	0.28
981	0.3
982	0.3
983	0.31
984	0.31
985	0.29
986	0.24
987	0.21
988	0.2
989	0.19
990	0.18
991	0.17
992	0.19
993	0.15
994	0.18
995	0.19
996	0.23
997	0.24
998	0.26
999	0.28
1000	0.36
1001	0.42
1002	0.41
1003	0.44
1004	0.47
1005	0.54
1006	0.57
1007	0.56
1008	0.48
1009	0.48
1010	0.46
1011	0.4
1012	0.35
1013	0.27
1014	0.24
1015	0.23
1016	0.22
1017	0.14
1018	0.14
1019	0.11
1020	0.09
1021	0.09
1022	0.08
1023	0.09
1024	0.1
1025	0.11
1026	0.13
1027	0.15
1028	0.15
1029	0.15
1030	0.14
1031	0.13
1032	0.1
1033	0.09
1034	0.08
1035	0.06
1036	0.06
1037	0.06
1038	0.06
1039	0.09
1040	0.08
1041	0.08
1042	0.07
1043	0.07
1044	0.07
1045	0.08
1046	0.07
1047	0.05
1048	0.08
1049	0.07
1050	0.08
1051	0.09
1052	0.09
1053	0.09
1054	0.1
1055	0.09
1056	0.07
1057	0.14
1058	0.19
1059	0.21
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.21
1063	0.22
1064	0.25
1065	0.17
1066	0.12
1067	0.11
1068	0.11
1069	0.12
1070	0.13
1071	0.14
1072	0.11
1073	0.13
1074	0.13
1075	0.14
1076	0.21
1077	0.29
1078	0.29
1079	0.3
1080	0.3
1081	0.36
1082	0.39
1083	0.38
1084	0.31
1085	0.24
1086	0.29
1087	0.27
1088	0.26
1089	0.18
1090	0.14
1091	0.14
1092	0.14
1093	0.12
1094	0.06
1095	0.06
1096	0.06
1097	0.06
1098	0.06
1099	0.06
1100	0.07
1101	0.11
1102	0.13
1103	0.15
1104	0.16
1105	0.18
1106	0.19
1107	0.19
1108	0.18
1109	0.13
1110	0.11
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.08
1114	0.07
1115	0.07
1116	0.07
1117	0.06
1118	0.06
1119	0.06
1120	0.06
1121	0.05
1122	0.05
1123	0.05
1124	0.06
1125	0.07
1126	0.07
1127	0.07
1128	0.07
1129	0.07
1130	0.07
1131	0.08
1132	0.08
1133	0.08
1134	0.08
1135	0.09
1136	0.09
1137	0.09
1138	0.1
1139	0.1
1140	0.08
1141	0.07
1142	0.07
1143	0.06
1144	0.06
1145	0.07
1146	0.06
1147	0.05
1148	0.05
1149	0.05
1150	0.04
1151	0.04
1152	0.04
1153	0.04
1154	0.04
1155	0.06
1156	0.06
1157	0.06
1158	0.06
1159	0.06
1160	0.06
1161	0.06
1162	0.09
1163	0.08
1164	0.09
1165	0.1
1166	0.13
1167	0.14
1168	0.14
1169	0.17
1170	0.16
1171	0.19
1172	0.19
1173	0.2
1174	0.19
1175	0.2
1176	0.2
1177	0.18
1178	0.18
1179	0.16
1180	0.2
1181	0.25
1182	0.25
1183	0.27
1184	0.28
1185	0.32
1186	0.29
1187	0.3
1188	0.26
1189	0.26
1190	0.27
1191	0.31
1192	0.33
1193	0.31
1194	0.3
1195	0.3
1196	0.29
1197	0.24
1198	0.23
1199	0.16
1200	0.13
1201	0.14
1202	0.16
1203	0.17
1204	0.16
1205	0.16
1206	0.15
1207	0.16
1208	0.16
1209	0.17
1210	0.19
1211	0.19
1212	0.19
1213	0.2
1214	0.19
1215	0.19
1216	0.17
1217	0.13
1218	0.09
1219	0.07
1220	0.05
1221	0.05
1222	0.04
1223	0.04
1224	0.04
1225	0.04
1226	0.05
1227	0.07
1228	0.08
1229	0.08
1230	0.08
1231	0.09
1232	0.11
1233	0.11
1234	0.11
1235	0.1
1236	0.09
1237	0.1
1238	0.09
1239	0.08
1240	0.09
1241	0.11
1242	0.12
1243	0.13
1244	0.15
1245	0.15
1246	0.16
1247	0.17
1248	0.15
1249	0.14
1250	0.14
1251	0.15
1252	0.15
1253	0.17
1254	0.2
1255	0.18
1256	0.2
1257	0.19
1258	0.2
1259	0.23
1260	0.26
1261	0.25
1262	0.27
1263	0.3
1264	0.35
1265	0.4
1266	0.46
1267	0.5
1268	0.56
1269	0.57
1270	0.55
1271	0.53
1272	0.53
1273	0.49
1274	0.42
1275	0.34
1276	0.25
1277	0.24
1278	0.23
1279	0.22
1280	0.17
1281	0.16
1282	0.15
1283	0.15
1284	0.14
1285	0.12
1286	0.13
1287	0.13
1288	0.14
1289	0.15
1290	0.14
1291	0.14
1292	0.14
1293	0.15
1294	0.15
1295	0.14
1296	0.14
1297	0.12
1298	0.12
1299	0.11
1300	0.11
1301	0.11
1302	0.13
1303	0.12
1304	0.11
1305	0.12

A0A238F6B0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer