FuNGI

A0A238FD18

Protein Details

Accession

A0A238FD18

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
551-580	AEDKRARKNAVKERRSARRAEKKSTKDEFS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
551-576	AEDKRARKNAVKERRSARRAEKKSTK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MSLWRKPGTRTFQLVHRSQRDPLINDPEASDRVLKEVGAKQRAKGNTAGSFTSDFESTPDHAPSPAAIEGLDDAGDAAAYGVYFDDTKYDYMQHLRRVGDVGESYLVEAPSRKGKRPTGSRNAHSSEGIVVKDSPSNKLELPEDALPSHPLDELSYADATISRTELKGLHPDLDPNIREVLEALDDDDYALDAEGNSKDEDDFFGSIVQGGELVESHGWHGAYDDDELTPDRNERDLLARSMRGLALAHHEDENEQIDDSLEARVARFKATSANAPRSDVSDEDEHSEGGDTIAELKAGSARRPPRRGAVRLGLQTLDECFDQIEKLYEDDSEDDSWGEGSGGPVEDDSAQTRSTPFGQPREDLDQILEEFLSRYEILGGKMRYRAEGDDGDQNHKGELDRLRSELASLDIAGSSEATDPVTMVQQLEKDTILAAVEPQRMESRARKGNESVDVDERPKERWDCETVLSTYSNISNHPRLLRVKGGPTSRAPRIRLDEKTGFPVVESAVTSGLKVHTMGEADEIIEDAEDDNIDGDSPRAETIKRPRDETAEDKRARKNAVKERRSARRAEKKSTKDEFSQETRRQKRAAEKAVADGAAADVRVGQGARRLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.67
3	0.65
4	0.61
5	0.57
6	0.62
7	0.61
8	0.56
9	0.56
10	0.55
11	0.5
12	0.47
13	0.46
14	0.42
15	0.36
16	0.34
17	0.29
18	0.2
19	0.21
20	0.21
21	0.19
22	0.21
23	0.27
24	0.34
25	0.41
26	0.42
27	0.42
28	0.5
29	0.52
30	0.49
31	0.47
32	0.44
33	0.41
34	0.42
35	0.4
36	0.35
37	0.34
38	0.32
39	0.3
40	0.24
41	0.18
42	0.16
43	0.18
44	0.18
45	0.2
46	0.2
47	0.19
48	0.19
49	0.19
50	0.18
51	0.19
52	0.17
53	0.13
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.1
59	0.06
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.04
64	0.04
65	0.03
66	0.03
67	0.03
68	0.04
69	0.05
70	0.05
71	0.05
72	0.07
73	0.09
74	0.1
75	0.11
76	0.13
77	0.15
78	0.23
79	0.29
80	0.33
81	0.37
82	0.37
83	0.37
84	0.37
85	0.34
86	0.3
87	0.25
88	0.21
89	0.17
90	0.16
91	0.16
92	0.16
93	0.15
94	0.12
95	0.12
96	0.13
97	0.22
98	0.26
99	0.31
100	0.36
101	0.44
102	0.53
103	0.62
104	0.7
105	0.71
106	0.77
107	0.76
108	0.77
109	0.74
110	0.66
111	0.55
112	0.46
113	0.39
114	0.32
115	0.27
116	0.2
117	0.16
118	0.15
119	0.19
120	0.19
121	0.19
122	0.17
123	0.2
124	0.19
125	0.22
126	0.22
127	0.2
128	0.23
129	0.22
130	0.22
131	0.2
132	0.2
133	0.19
134	0.18
135	0.17
136	0.13
137	0.11
138	0.1
139	0.11
140	0.1
141	0.11
142	0.11
143	0.09
144	0.09
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.12
153	0.13
154	0.19
155	0.2
156	0.21
157	0.21
158	0.22
159	0.24
160	0.29
161	0.27
162	0.22
163	0.22
164	0.19
165	0.18
166	0.17
167	0.15
168	0.1
169	0.09
170	0.08
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.06
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.04
179	0.03
180	0.06
181	0.06
182	0.08
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.09
194	0.09
195	0.07
196	0.05
197	0.05
198	0.04
199	0.04
200	0.05
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.06
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.08
212	0.06
213	0.07
214	0.08
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.1
219	0.1
220	0.1
221	0.11
222	0.15
223	0.16
224	0.18
225	0.2
226	0.19
227	0.19
228	0.19
229	0.18
230	0.14
231	0.12
232	0.1
233	0.13
234	0.14
235	0.14
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.14
240	0.15
241	0.1
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.07
246	0.08
247	0.07
248	0.06
249	0.05
250	0.06
251	0.09
252	0.09
253	0.1
254	0.09
255	0.09
256	0.13
257	0.15
258	0.22
259	0.24
260	0.3
261	0.3
262	0.31
263	0.31
264	0.29
265	0.28
266	0.22
267	0.19
268	0.14
269	0.14
270	0.15
271	0.15
272	0.13
273	0.12
274	0.11
275	0.09
276	0.07
277	0.06
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.14
288	0.22
289	0.3
290	0.34
291	0.36
292	0.41
293	0.47
294	0.5
295	0.49
296	0.47
297	0.45
298	0.43
299	0.42
300	0.34
301	0.26
302	0.23
303	0.18
304	0.13
305	0.08
306	0.06
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.07
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.09
318	0.1
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.07
325	0.06
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.12
342	0.16
343	0.18
344	0.23
345	0.25
346	0.26
347	0.29
348	0.34
349	0.32
350	0.27
351	0.24
352	0.2
353	0.18
354	0.17
355	0.13
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.06
361	0.05
362	0.07
363	0.08
364	0.1
365	0.15
366	0.16
367	0.16
368	0.2
369	0.2
370	0.2
371	0.2
372	0.2
373	0.18
374	0.19
375	0.19
376	0.21
377	0.23
378	0.25
379	0.25
380	0.24
381	0.21
382	0.2
383	0.18
384	0.17
385	0.2
386	0.22
387	0.22
388	0.23
389	0.24
390	0.23
391	0.23
392	0.19
393	0.16
394	0.1
395	0.09
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.07
409	0.07
410	0.06
411	0.07
412	0.09
413	0.1
414	0.11
415	0.11
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.06
421	0.07
422	0.11
423	0.13
424	0.13
425	0.14
426	0.15
427	0.17
428	0.21
429	0.25
430	0.29
431	0.35
432	0.37
433	0.39
434	0.41
435	0.44
436	0.47
437	0.45
438	0.4
439	0.37
440	0.37
441	0.35
442	0.36
443	0.33
444	0.28
445	0.29
446	0.28
447	0.26
448	0.29
449	0.32
450	0.31
451	0.33
452	0.35
453	0.3
454	0.3
455	0.29
456	0.24
457	0.2
458	0.19
459	0.17
460	0.15
461	0.2
462	0.21
463	0.25
464	0.26
465	0.3
466	0.32
467	0.35
468	0.4
469	0.38
470	0.41
471	0.43
472	0.45
473	0.44
474	0.47
475	0.49
476	0.51
477	0.53
478	0.5
479	0.5
480	0.54
481	0.58
482	0.56
483	0.57
484	0.55
485	0.51
486	0.54
487	0.49
488	0.4
489	0.33
490	0.3
491	0.22
492	0.17
493	0.15
494	0.1
495	0.11
496	0.11
497	0.11
498	0.11
499	0.11
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.11
505	0.11
506	0.11
507	0.11
508	0.1
509	0.1
510	0.09
511	0.07
512	0.06
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.06
523	0.06
524	0.07
525	0.08
526	0.09
527	0.1
528	0.18
529	0.29
530	0.39
531	0.41
532	0.45
533	0.47
534	0.51
535	0.58
536	0.59
537	0.58
538	0.59
539	0.62
540	0.64
541	0.68
542	0.67
543	0.67
544	0.66
545	0.66
546	0.66
547	0.71
548	0.72
549	0.74
550	0.78
551	0.82
552	0.8
553	0.78
554	0.78
555	0.78
556	0.79
557	0.81
558	0.82
559	0.8
560	0.85
561	0.84
562	0.79
563	0.74
564	0.72
565	0.69
566	0.67
567	0.69
568	0.67
569	0.7
570	0.73
571	0.73
572	0.69
573	0.69
574	0.7
575	0.71
576	0.72
577	0.69
578	0.64
579	0.63
580	0.64
581	0.56
582	0.46
583	0.35
584	0.26
585	0.19
586	0.16
587	0.11
588	0.07
589	0.07
590	0.09
591	0.09
592	0.09

A0A238FD18

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer