Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238FFW7

Protein Details
Accession A0A238FFW7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
335-355ETNILTKKKAKYTTKKAEALGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-26PKRGGGARGRPRERGHGRGRGSGT
47-58PRRKQAAAPARR
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MPPKRGGGARGRPRERGHGRGRGSGTGARQASRSTEEQTAAPDEAPPRRKQAAAPARRGAIVRGAADARSRAEPAVSATQDLSSFVAATPTLPLQSTPVTAFVLQHHLYFLSADWISSLRLDVDELLDAFVEAYRGLSGDAQSPFKAFKSCWITKGWSRIHLFGVMEGRTRQSWGRASSERLSPDSTSEPLIQVAAFFAIYTFFSTQADTQEQVYIKVDPPTLEHVLTLPNSLASALDSRPSSIGTSSSSSLPPSLDLHQVLLWLLESQAFFVIPSETYRHPNRLPAVHLVPHDKHFQKQEQKQKDDTTIAMAIRTEMEAATSRSEGIIGESVAETNILTKKKAKYTTKKAEALGPRPIEESDEDARASKDIVGRILARAKKATWENLTSNLGEGIDGMGVEGDNLLNLLR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.73
3 0.73
4 0.71
5 0.7
6 0.69
7 0.7
8 0.69
9 0.61
10 0.57
11 0.52
12 0.45
13 0.44
14 0.42
15 0.35
16 0.33
17 0.31
18 0.31
19 0.32
20 0.31
21 0.27
22 0.29
23 0.29
24 0.29
25 0.31
26 0.3
27 0.26
28 0.23
29 0.23
30 0.23
31 0.3
32 0.36
33 0.35
34 0.39
35 0.41
36 0.43
37 0.42
38 0.48
39 0.51
40 0.54
41 0.59
42 0.57
43 0.55
44 0.55
45 0.53
46 0.44
47 0.39
48 0.33
49 0.25
50 0.23
51 0.23
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.16
59 0.15
60 0.15
61 0.18
62 0.23
63 0.21
64 0.2
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.2
69 0.16
70 0.09
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.13
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.14
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.16
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.1
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.17
134 0.12
135 0.18
136 0.26
137 0.28
138 0.3
139 0.32
140 0.36
141 0.38
142 0.47
143 0.41
144 0.4
145 0.4
146 0.39
147 0.37
148 0.35
149 0.31
150 0.24
151 0.25
152 0.18
153 0.17
154 0.15
155 0.15
156 0.13
157 0.14
158 0.13
159 0.14
160 0.18
161 0.2
162 0.25
163 0.26
164 0.3
165 0.31
166 0.34
167 0.32
168 0.29
169 0.28
170 0.23
171 0.23
172 0.2
173 0.18
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.09
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.14
205 0.14
206 0.11
207 0.12
208 0.16
209 0.17
210 0.15
211 0.14
212 0.13
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.1
250 0.08
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.06
262 0.07
263 0.11
264 0.13
265 0.19
266 0.22
267 0.27
268 0.27
269 0.33
270 0.36
271 0.35
272 0.37
273 0.37
274 0.37
275 0.35
276 0.36
277 0.37
278 0.34
279 0.34
280 0.38
281 0.34
282 0.35
283 0.37
284 0.44
285 0.48
286 0.55
287 0.63
288 0.66
289 0.7
290 0.71
291 0.69
292 0.65
293 0.57
294 0.48
295 0.42
296 0.35
297 0.29
298 0.24
299 0.2
300 0.16
301 0.14
302 0.14
303 0.1
304 0.06
305 0.07
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.06
323 0.08
324 0.13
325 0.14
326 0.16
327 0.22
328 0.28
329 0.37
330 0.47
331 0.54
332 0.6
333 0.7
334 0.79
335 0.82
336 0.82
337 0.75
338 0.74
339 0.73
340 0.67
341 0.65
342 0.56
343 0.48
344 0.44
345 0.42
346 0.36
347 0.29
348 0.29
349 0.23
350 0.23
351 0.22
352 0.22
353 0.22
354 0.2
355 0.19
356 0.17
357 0.18
358 0.18
359 0.19
360 0.21
361 0.22
362 0.25
363 0.33
364 0.33
365 0.32
366 0.34
367 0.33
368 0.38
369 0.42
370 0.46
371 0.44
372 0.48
373 0.47
374 0.5
375 0.52
376 0.44
377 0.39
378 0.32
379 0.26
380 0.19
381 0.16
382 0.11
383 0.08
384 0.07
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.04
391 0.04