Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238F790

Protein Details
Accession A0A238F790    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-34IIAPAKPKNARSKRAQQAREPQMIEHydrophilic
300-324KQALKKAEPKSKTNKPKNKNIDIDEHydrophilic
342-361LQARKFKGLKVEKKGKRAAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-316KKAEPKSKTNKPK
346-358KFKGLKVEKKGKR
379-384KKRSRR
Subcellular Location(s) mito 22, mito_nucl 13.333, cyto_mito 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MSATTSAIPIIAPAKPKNARSKRAQQAREPQMIEKGAKTAMIVRGSSISEKVKVALSELNQLKKPHSVSFSKPNQIRPFEDSSSLSFWSTKNDASLFLVGTHTKKRPHGLIWVRCFANEVMEMLEVGIEEVMPMSAFKGIKSPPGSTPLFHFASTSAHANLWESHPTFTQYKSLMLDFFRGVEMDGVALKGLERVISITIGHTTLDATTESLQDALNRESTQNKPRAVLSSLLTSSSKAKSSGSNDSEEDPTLPLIHFRTYTVKFLRSGISTPLVALEPHGPHFTFRLRRSQLPSSEMWKQALKKAEPKSKTNKPKNKNIDIDEMGDKVGRVYVDKQDMGTLQARKFKGLKVEKKGKRAAEDDREGQGQENDEEEKSSKKRSRRAAAQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.43
4 0.53
5 0.6
6 0.66
7 0.7
8 0.78
9 0.8
10 0.84
11 0.84
12 0.83
13 0.84
14 0.84
15 0.83
16 0.74
17 0.66
18 0.62
19 0.59
20 0.51
21 0.41
22 0.35
23 0.27
24 0.25
25 0.23
26 0.22
27 0.23
28 0.24
29 0.23
30 0.22
31 0.23
32 0.25
33 0.26
34 0.24
35 0.21
36 0.21
37 0.21
38 0.22
39 0.22
40 0.21
41 0.21
42 0.22
43 0.21
44 0.28
45 0.32
46 0.35
47 0.37
48 0.38
49 0.38
50 0.39
51 0.41
52 0.37
53 0.38
54 0.38
55 0.41
56 0.5
57 0.56
58 0.59
59 0.6
60 0.63
61 0.65
62 0.65
63 0.62
64 0.58
65 0.56
66 0.49
67 0.49
68 0.41
69 0.36
70 0.34
71 0.31
72 0.26
73 0.21
74 0.19
75 0.21
76 0.21
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.19
81 0.2
82 0.21
83 0.15
84 0.14
85 0.15
86 0.14
87 0.17
88 0.21
89 0.24
90 0.27
91 0.3
92 0.35
93 0.37
94 0.38
95 0.46
96 0.5
97 0.55
98 0.56
99 0.58
100 0.53
101 0.49
102 0.48
103 0.38
104 0.3
105 0.21
106 0.16
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.08
111 0.08
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.03
116 0.02
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.11
126 0.12
127 0.18
128 0.21
129 0.23
130 0.21
131 0.27
132 0.28
133 0.24
134 0.27
135 0.27
136 0.26
137 0.24
138 0.22
139 0.17
140 0.18
141 0.19
142 0.18
143 0.13
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.16
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.15
207 0.2
208 0.26
209 0.3
210 0.3
211 0.3
212 0.31
213 0.33
214 0.31
215 0.28
216 0.22
217 0.2
218 0.19
219 0.2
220 0.18
221 0.16
222 0.17
223 0.17
224 0.16
225 0.13
226 0.14
227 0.17
228 0.22
229 0.3
230 0.29
231 0.31
232 0.3
233 0.32
234 0.32
235 0.28
236 0.24
237 0.16
238 0.13
239 0.11
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.11
246 0.18
247 0.19
248 0.26
249 0.27
250 0.28
251 0.28
252 0.29
253 0.3
254 0.25
255 0.25
256 0.22
257 0.21
258 0.18
259 0.17
260 0.17
261 0.14
262 0.12
263 0.12
264 0.13
265 0.12
266 0.14
267 0.16
268 0.15
269 0.15
270 0.18
271 0.24
272 0.28
273 0.3
274 0.38
275 0.41
276 0.47
277 0.53
278 0.58
279 0.55
280 0.51
281 0.52
282 0.47
283 0.49
284 0.45
285 0.41
286 0.38
287 0.36
288 0.37
289 0.42
290 0.41
291 0.43
292 0.5
293 0.57
294 0.58
295 0.63
296 0.68
297 0.7
298 0.77
299 0.8
300 0.81
301 0.8
302 0.85
303 0.88
304 0.88
305 0.86
306 0.79
307 0.77
308 0.69
309 0.65
310 0.56
311 0.46
312 0.36
313 0.28
314 0.23
315 0.15
316 0.14
317 0.1
318 0.11
319 0.14
320 0.2
321 0.26
322 0.26
323 0.26
324 0.27
325 0.27
326 0.28
327 0.31
328 0.3
329 0.28
330 0.35
331 0.35
332 0.38
333 0.4
334 0.4
335 0.44
336 0.49
337 0.55
338 0.58
339 0.69
340 0.71
341 0.78
342 0.82
343 0.78
344 0.74
345 0.7
346 0.7
347 0.68
348 0.68
349 0.63
350 0.6
351 0.55
352 0.49
353 0.45
354 0.38
355 0.3
356 0.24
357 0.22
358 0.21
359 0.19
360 0.21
361 0.21
362 0.26
363 0.27
364 0.36
365 0.41
366 0.47
367 0.56
368 0.64
369 0.73