Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238FDV8

Protein Details
Accession A0A238FDV8    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-365RQEINKKRKSTERRAKKDIKNANAHydrophilic
639-661EETMNARKRRRIEKREAKGKKVVBasic
866-902NSRNVRKKSTSSLQQKSKKLRNHIDRIKRGGRRGNNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-370INKKRKSTERRAKKDIKNANAKRRQR
645-659RKRRRIEKREAKGKK
833-901EKFGSLKHKKLSEKEHSTTNEEKRKKKAFAMVANSRNVRKKSTSSLQQKSKKLRNHIDRIKRGGRRGNN
Subcellular Location(s) mito 21, cyto_mito 12, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
Gene Ontology GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MAAVEVYKRIAPTIKNPKSSTKSRQQAAPNALRVKTARGALITTSLPSLQNLIKRSSDSYAEEFAVQWARFGSLVKIVQLGLGGAKGDEDKLREVTGFVCQVAHLYPTMTSSLPSTLSTLLLSSAPTPSSSSAAGSISQVGNGVSGGGVQLGPETRKTMMQGLVLLRRREVISGVDPSLISVIRLLKTLFPLLSLTTSPNLRSFILKTILGDIRNANLKTKNLKLNRMVQGLLFGMIEKGIDAEAERLGTGVKPSRRGDVKIVGAREAMWAVKIASDLWRKNVWKDARTVSIVASACFHPDTKVQSAAIHFFLALPDGSKEGGQDSSDEEDEGPDIQMVKHRQEINKKRKSTERRAKKDIKNANAKRRQREAAAAEVTGNFSALQLLNDPQTFGEKLYQSLVKYDRSYTLDHKVLVMQLFGRVCSSHKLTVLSFYSYVVKYLTHHQLQITAILVALAESVHELTPPDELTPVVRKLAHEFVHSGVAAEVNAAGLNAITEICRRQPWSMEKDLLDDLIEYRSSKDKGVMIAARGLLALYREVNPGLLQRRDRGKVASMKSTGEMQPLGFGQSRQEATGIEGLDLLAQHLAEREAKGEEVDEEAEWDNWEVDEDDSDSSGGWNDVSSDEEDIDISDDDDDEETMNARKRRRIEKREAKGKKVVEAAGLVEEDKIAFDEGSEEEEGDSDDEDEEESDDESEDEEEANEEEGGTASKKVKFAGVVDPEDEDEMSLTRANKELAGTTFAELAMSKILTPADFAKINELRTAAAEEEAKNGGGGATRRKLAALAAARKANTGESSSFLTEGVIIGVQKKAKASYEERLALIAEGREGREKFGSLKHKKLSEKEHSTTNEEKRKKKAFAMVANSRNVRKKSTSSLQQKSKKLRNHIDRIKRGGRRGNNG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.55
3 0.59
4 0.67
5 0.69
6 0.75
7 0.74
8 0.74
9 0.75
10 0.71
11 0.76
12 0.74
13 0.76
14 0.76
15 0.75
16 0.72
17 0.69
18 0.65
19 0.61
20 0.54
21 0.5
22 0.44
23 0.39
24 0.33
25 0.28
26 0.29
27 0.26
28 0.28
29 0.23
30 0.19
31 0.18
32 0.17
33 0.16
34 0.15
35 0.18
36 0.18
37 0.23
38 0.25
39 0.28
40 0.29
41 0.3
42 0.33
43 0.33
44 0.34
45 0.33
46 0.34
47 0.33
48 0.32
49 0.3
50 0.27
51 0.26
52 0.28
53 0.23
54 0.2
55 0.17
56 0.17
57 0.17
58 0.18
59 0.17
60 0.17
61 0.19
62 0.19
63 0.19
64 0.18
65 0.18
66 0.17
67 0.15
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.09
75 0.11
76 0.13
77 0.15
78 0.17
79 0.18
80 0.17
81 0.18
82 0.17
83 0.2
84 0.19
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.1
92 0.09
93 0.09
94 0.11
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.14
105 0.13
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.15
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.07
139 0.09
140 0.1
141 0.12
142 0.13
143 0.15
144 0.17
145 0.2
146 0.21
147 0.21
148 0.24
149 0.26
150 0.33
151 0.37
152 0.36
153 0.32
154 0.32
155 0.31
156 0.28
157 0.25
158 0.2
159 0.19
160 0.22
161 0.23
162 0.21
163 0.2
164 0.2
165 0.19
166 0.15
167 0.11
168 0.1
169 0.12
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.16
175 0.19
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.19
188 0.18
189 0.2
190 0.2
191 0.22
192 0.24
193 0.23
194 0.22
195 0.25
196 0.28
197 0.25
198 0.25
199 0.21
200 0.2
201 0.27
202 0.27
203 0.25
204 0.26
205 0.29
206 0.33
207 0.39
208 0.45
209 0.44
210 0.51
211 0.53
212 0.59
213 0.61
214 0.58
215 0.52
216 0.43
217 0.39
218 0.32
219 0.27
220 0.17
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.09
238 0.15
239 0.17
240 0.24
241 0.25
242 0.33
243 0.36
244 0.38
245 0.41
246 0.41
247 0.46
248 0.43
249 0.43
250 0.37
251 0.33
252 0.31
253 0.26
254 0.2
255 0.12
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.13
263 0.2
264 0.2
265 0.24
266 0.3
267 0.31
268 0.32
269 0.41
270 0.4
271 0.36
272 0.4
273 0.4
274 0.38
275 0.39
276 0.37
277 0.29
278 0.29
279 0.27
280 0.22
281 0.2
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.15
286 0.1
287 0.12
288 0.17
289 0.18
290 0.2
291 0.19
292 0.2
293 0.21
294 0.22
295 0.21
296 0.16
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.09
301 0.08
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.11
325 0.13
326 0.15
327 0.2
328 0.24
329 0.29
330 0.39
331 0.5
332 0.56
333 0.63
334 0.64
335 0.63
336 0.69
337 0.74
338 0.75
339 0.75
340 0.75
341 0.75
342 0.81
343 0.86
344 0.84
345 0.84
346 0.81
347 0.78
348 0.78
349 0.78
350 0.79
351 0.78
352 0.78
353 0.75
354 0.73
355 0.67
356 0.57
357 0.56
358 0.48
359 0.44
360 0.39
361 0.32
362 0.26
363 0.24
364 0.22
365 0.15
366 0.13
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.12
382 0.11
383 0.12
384 0.14
385 0.16
386 0.14
387 0.17
388 0.19
389 0.18
390 0.19
391 0.19
392 0.21
393 0.21
394 0.24
395 0.23
396 0.27
397 0.26
398 0.25
399 0.24
400 0.21
401 0.21
402 0.18
403 0.15
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.08
411 0.11
412 0.14
413 0.13
414 0.14
415 0.16
416 0.15
417 0.19
418 0.2
419 0.18
420 0.15
421 0.14
422 0.16
423 0.14
424 0.14
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.15
429 0.2
430 0.18
431 0.19
432 0.19
433 0.21
434 0.21
435 0.2
436 0.15
437 0.09
438 0.08
439 0.07
440 0.06
441 0.04
442 0.04
443 0.03
444 0.02
445 0.02
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.04
450 0.04
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.07
457 0.1
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.15
463 0.21
464 0.2
465 0.18
466 0.18
467 0.18
468 0.19
469 0.18
470 0.15
471 0.1
472 0.09
473 0.07
474 0.06
475 0.05
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.02
481 0.02
482 0.02
483 0.03
484 0.03
485 0.04
486 0.05
487 0.06
488 0.08
489 0.1
490 0.11
491 0.17
492 0.24
493 0.29
494 0.32
495 0.34
496 0.33
497 0.33
498 0.33
499 0.27
500 0.2
501 0.14
502 0.11
503 0.08
504 0.09
505 0.06
506 0.08
507 0.12
508 0.12
509 0.13
510 0.15
511 0.15
512 0.16
513 0.2
514 0.2
515 0.17
516 0.18
517 0.17
518 0.15
519 0.13
520 0.12
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.07
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.12
531 0.16
532 0.19
533 0.2
534 0.24
535 0.3
536 0.32
537 0.33
538 0.31
539 0.33
540 0.36
541 0.38
542 0.39
543 0.35
544 0.33
545 0.33
546 0.34
547 0.28
548 0.22
549 0.2
550 0.13
551 0.13
552 0.12
553 0.14
554 0.11
555 0.1
556 0.1
557 0.14
558 0.14
559 0.13
560 0.14
561 0.11
562 0.12
563 0.15
564 0.14
565 0.1
566 0.09
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.07
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.06
576 0.07
577 0.07
578 0.08
579 0.09
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.08
584 0.08
585 0.09
586 0.07
587 0.08
588 0.09
589 0.09
590 0.09
591 0.09
592 0.08
593 0.07
594 0.08
595 0.07
596 0.06
597 0.06
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.05
607 0.04
608 0.05
609 0.05
610 0.07
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.08
616 0.07
617 0.08
618 0.07
619 0.06
620 0.06
621 0.05
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.05
626 0.05
627 0.06
628 0.09
629 0.15
630 0.19
631 0.22
632 0.27
633 0.34
634 0.45
635 0.56
636 0.62
637 0.68
638 0.75
639 0.82
640 0.88
641 0.88
642 0.83
643 0.8
644 0.72
645 0.65
646 0.59
647 0.49
648 0.39
649 0.33
650 0.27
651 0.21
652 0.19
653 0.14
654 0.1
655 0.09
656 0.07
657 0.06
658 0.06
659 0.05
660 0.05
661 0.04
662 0.06
663 0.07
664 0.1
665 0.1
666 0.09
667 0.09
668 0.09
669 0.09
670 0.08
671 0.08
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.06
677 0.06
678 0.06
679 0.06
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.07
684 0.07
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.07
690 0.07
691 0.07
692 0.06
693 0.06
694 0.06
695 0.07
696 0.07
697 0.1
698 0.13
699 0.16
700 0.17
701 0.17
702 0.19
703 0.2
704 0.22
705 0.28
706 0.3
707 0.29
708 0.29
709 0.29
710 0.27
711 0.26
712 0.23
713 0.14
714 0.09
715 0.08
716 0.08
717 0.1
718 0.1
719 0.11
720 0.13
721 0.13
722 0.14
723 0.14
724 0.16
725 0.15
726 0.18
727 0.18
728 0.17
729 0.17
730 0.16
731 0.15
732 0.12
733 0.11
734 0.09
735 0.08
736 0.07
737 0.08
738 0.09
739 0.08
740 0.1
741 0.11
742 0.14
743 0.16
744 0.16
745 0.24
746 0.26
747 0.27
748 0.27
749 0.26
750 0.22
751 0.21
752 0.23
753 0.15
754 0.15
755 0.16
756 0.15
757 0.17
758 0.17
759 0.16
760 0.14
761 0.13
762 0.11
763 0.12
764 0.14
765 0.19
766 0.22
767 0.24
768 0.24
769 0.24
770 0.25
771 0.22
772 0.27
773 0.28
774 0.31
775 0.35
776 0.38
777 0.38
778 0.39
779 0.39
780 0.33
781 0.26
782 0.23
783 0.19
784 0.18
785 0.21
786 0.21
787 0.21
788 0.19
789 0.17
790 0.13
791 0.12
792 0.1
793 0.08
794 0.07
795 0.08
796 0.12
797 0.13
798 0.15
799 0.16
800 0.18
801 0.21
802 0.28
803 0.32
804 0.37
805 0.44
806 0.45
807 0.44
808 0.42
809 0.39
810 0.32
811 0.29
812 0.21
813 0.16
814 0.14
815 0.16
816 0.22
817 0.21
818 0.24
819 0.24
820 0.25
821 0.25
822 0.32
823 0.42
824 0.43
825 0.52
826 0.56
827 0.62
828 0.68
829 0.73
830 0.74
831 0.74
832 0.76
833 0.7
834 0.71
835 0.68
836 0.67
837 0.68
838 0.68
839 0.67
840 0.66
841 0.7
842 0.71
843 0.76
844 0.75
845 0.73
846 0.73
847 0.72
848 0.73
849 0.76
850 0.76
851 0.73
852 0.75
853 0.72
854 0.69
855 0.68
856 0.61
857 0.58
858 0.54
859 0.54
860 0.56
861 0.61
862 0.66
863 0.68
864 0.75
865 0.8
866 0.83
867 0.86
868 0.87
869 0.86
870 0.84
871 0.84
872 0.85
873 0.85
874 0.87
875 0.88
876 0.89
877 0.89
878 0.9
879 0.89
880 0.85
881 0.83
882 0.82