Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238FRZ4

Protein Details
Accession A0A238FRZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-89EYITKKEKRHITFSKRKAGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
74-87KKEKRHITFSKRKA
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 11, mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033897  MADS_SRF-like  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000987  F:cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00350  MADS_BOX_1  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00266  MADS_SRF_like  
Amino Acid Sequences MSVPISATTVTPAVMKTPIIREFNPDAASDEDEDDDARPNKKTKRAGMDDDEKNGDDDNGEKGRRKIEIEYITKKEKRHITFSKRKAGIMKKAYELATLTGTQVLLLVVSETGIVYTFTTSKFQPLVGAAENGSPSEGQRLIQRCLVSSQRPMTAKPLADGFRLADSDSLSSFSPQAVTPEDGSNYISPPPNGPLLPLPPSAHKRPFEANSSIHGGQIALRTRAHRPSGRSKGRPSAILTGAPETLPDSSGMNLAIGEQQSSGIPGPPHTPQRLNPLQRSPGLHGDYPSPGLPSGDRPEGPMQSSQDYAYMMQRNMSPGRLPNMSPEGHPAYPPHHPHGSYAAEYGMQHPGMQQHHQQQQHPHHMSPEHGPPHPQHYQRSPGPSPHLQHAGIPSDPAMAMYEQPSVLMPPHSQHPYHSPQHRGSGPELYHQGGGYEERPYMQERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.16
4 0.23
5 0.29
6 0.33
7 0.34
8 0.39
9 0.42
10 0.46
11 0.43
12 0.37
13 0.33
14 0.3
15 0.32
16 0.26
17 0.22
18 0.18
19 0.17
20 0.17
21 0.15
22 0.19
23 0.21
24 0.22
25 0.26
26 0.32
27 0.4
28 0.48
29 0.56
30 0.58
31 0.65
32 0.7
33 0.74
34 0.76
35 0.78
36 0.73
37 0.69
38 0.63
39 0.52
40 0.45
41 0.37
42 0.28
43 0.19
44 0.16
45 0.17
46 0.2
47 0.23
48 0.26
49 0.28
50 0.32
51 0.35
52 0.36
53 0.34
54 0.37
55 0.44
56 0.48
57 0.54
58 0.56
59 0.62
60 0.63
61 0.61
62 0.6
63 0.6
64 0.57
65 0.59
66 0.64
67 0.66
68 0.72
69 0.79
70 0.81
71 0.74
72 0.72
73 0.71
74 0.69
75 0.68
76 0.65
77 0.61
78 0.53
79 0.55
80 0.53
81 0.45
82 0.37
83 0.29
84 0.23
85 0.19
86 0.16
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.08
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.03
96 0.04
97 0.04
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.06
104 0.07
105 0.08
106 0.1
107 0.11
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.12
120 0.12
121 0.09
122 0.07
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.15
127 0.19
128 0.21
129 0.24
130 0.24
131 0.22
132 0.25
133 0.29
134 0.26
135 0.28
136 0.29
137 0.31
138 0.32
139 0.32
140 0.33
141 0.33
142 0.3
143 0.26
144 0.28
145 0.24
146 0.23
147 0.23
148 0.19
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.12
173 0.13
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.14
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.2
187 0.25
188 0.29
189 0.33
190 0.32
191 0.32
192 0.35
193 0.37
194 0.37
195 0.36
196 0.32
197 0.29
198 0.33
199 0.3
200 0.25
201 0.22
202 0.17
203 0.14
204 0.17
205 0.16
206 0.12
207 0.13
208 0.15
209 0.18
210 0.22
211 0.26
212 0.25
213 0.29
214 0.38
215 0.47
216 0.54
217 0.56
218 0.56
219 0.59
220 0.57
221 0.55
222 0.48
223 0.42
224 0.35
225 0.32
226 0.28
227 0.22
228 0.2
229 0.17
230 0.14
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.11
254 0.14
255 0.19
256 0.21
257 0.24
258 0.24
259 0.33
260 0.41
261 0.44
262 0.46
263 0.47
264 0.48
265 0.48
266 0.49
267 0.43
268 0.41
269 0.39
270 0.34
271 0.29
272 0.28
273 0.26
274 0.24
275 0.21
276 0.15
277 0.12
278 0.12
279 0.11
280 0.14
281 0.17
282 0.18
283 0.18
284 0.2
285 0.24
286 0.25
287 0.26
288 0.25
289 0.23
290 0.21
291 0.22
292 0.19
293 0.17
294 0.16
295 0.15
296 0.17
297 0.19
298 0.17
299 0.18
300 0.19
301 0.22
302 0.22
303 0.23
304 0.19
305 0.18
306 0.23
307 0.23
308 0.23
309 0.23
310 0.27
311 0.26
312 0.25
313 0.27
314 0.28
315 0.27
316 0.27
317 0.24
318 0.23
319 0.3
320 0.33
321 0.33
322 0.33
323 0.33
324 0.34
325 0.38
326 0.38
327 0.31
328 0.28
329 0.23
330 0.2
331 0.2
332 0.2
333 0.17
334 0.13
335 0.12
336 0.13
337 0.18
338 0.19
339 0.23
340 0.27
341 0.32
342 0.4
343 0.45
344 0.48
345 0.53
346 0.59
347 0.67
348 0.64
349 0.57
350 0.54
351 0.51
352 0.49
353 0.45
354 0.45
355 0.38
356 0.36
357 0.38
358 0.35
359 0.41
360 0.47
361 0.46
362 0.45
363 0.47
364 0.54
365 0.56
366 0.63
367 0.59
368 0.57
369 0.6
370 0.6
371 0.57
372 0.55
373 0.54
374 0.46
375 0.45
376 0.43
377 0.39
378 0.32
379 0.29
380 0.23
381 0.19
382 0.18
383 0.16
384 0.13
385 0.1
386 0.11
387 0.12
388 0.13
389 0.11
390 0.12
391 0.12
392 0.11
393 0.12
394 0.14
395 0.14
396 0.15
397 0.22
398 0.27
399 0.27
400 0.3
401 0.36
402 0.42
403 0.5
404 0.55
405 0.55
406 0.55
407 0.63
408 0.63
409 0.59
410 0.54
411 0.54
412 0.48
413 0.47
414 0.45
415 0.39
416 0.37
417 0.33
418 0.29
419 0.22
420 0.24
421 0.18
422 0.18
423 0.16
424 0.16
425 0.18