Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238F4P1

Protein Details
Accession A0A238F4P1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-332ALNRLGKRRRKVAKRIVKPKVHDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-102GGRKGKKKGK
314-329LGKRRRKVAKRIVKPK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Amino Acid Sequences MAPKRPAESFARPTEASPPSGFGKRVKFDPLTLNPTPSNPHVSTKEGVDLDDDDDADDLITSSTSTRKKVVTDGYDSDSSAEGSQEGFGGVGGGRKGKKKGKSGEGVQVQVQDQDQDQDDDQDDDDMFGAGEGEDDLSSAKVGVAGKKKPKEFLEMGDIEGQEFGKGEEDEDGRGDELAGEDEDEEEEYALEDDLANDDDAPRSRRSKKGMGYQLSSFNMAEELNEGRFSADGTYVRNNDDSLATHDKWLDGVSKASIRAARESKKRMDDDARRREEREARGDEAIAQQRDDCLIGLLGLVRPGETITSALNRLGKRRRKVAKRIVKPKVHDGDEAMMDLDEPSSAPVSSSELSKGKRKEGTGKEEPDPAVKRIDRITYLASTLLAQGELEIYDTSYETIIQTLKEEGAVRRDWVPPLDPDLAEEEEEERLAAQALPKRGLIARPNVVTARPSVNNATAASFSAPQPPTAPVDPNGKKFFYKWKVAQAGQPPNQEYGPFGATEIEQWIAGGFLGANGANIVVRVEGQGGAAWTTWQEAKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.48
3 0.43
4 0.36
5 0.33
6 0.32
7 0.36
8 0.38
9 0.36
10 0.41
11 0.42
12 0.44
13 0.48
14 0.46
15 0.45
16 0.52
17 0.53
18 0.52
19 0.5
20 0.51
21 0.45
22 0.45
23 0.45
24 0.39
25 0.39
26 0.33
27 0.38
28 0.37
29 0.4
30 0.4
31 0.38
32 0.41
33 0.33
34 0.31
35 0.27
36 0.24
37 0.21
38 0.2
39 0.18
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.08
44 0.07
45 0.06
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.13
51 0.17
52 0.19
53 0.23
54 0.25
55 0.27
56 0.34
57 0.41
58 0.4
59 0.43
60 0.45
61 0.47
62 0.45
63 0.43
64 0.37
65 0.29
66 0.24
67 0.18
68 0.14
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.13
81 0.16
82 0.21
83 0.29
84 0.37
85 0.44
86 0.51
87 0.6
88 0.64
89 0.7
90 0.71
91 0.73
92 0.7
93 0.64
94 0.56
95 0.5
96 0.41
97 0.34
98 0.28
99 0.2
100 0.15
101 0.15
102 0.15
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.12
111 0.1
112 0.1
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.07
129 0.08
130 0.14
131 0.2
132 0.28
133 0.36
134 0.43
135 0.45
136 0.49
137 0.5
138 0.52
139 0.48
140 0.44
141 0.44
142 0.38
143 0.37
144 0.34
145 0.32
146 0.24
147 0.22
148 0.18
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.1
188 0.13
189 0.15
190 0.21
191 0.26
192 0.32
193 0.38
194 0.45
195 0.49
196 0.56
197 0.62
198 0.6
199 0.58
200 0.54
201 0.53
202 0.46
203 0.41
204 0.31
205 0.21
206 0.17
207 0.14
208 0.11
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.1
221 0.13
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.14
230 0.19
231 0.19
232 0.19
233 0.19
234 0.19
235 0.18
236 0.18
237 0.14
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.12
244 0.13
245 0.12
246 0.17
247 0.21
248 0.27
249 0.32
250 0.37
251 0.41
252 0.45
253 0.45
254 0.45
255 0.48
256 0.52
257 0.55
258 0.61
259 0.62
260 0.58
261 0.58
262 0.59
263 0.57
264 0.52
265 0.49
266 0.42
267 0.38
268 0.37
269 0.35
270 0.31
271 0.29
272 0.28
273 0.21
274 0.17
275 0.15
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.09
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.13
299 0.14
300 0.21
301 0.3
302 0.37
303 0.41
304 0.5
305 0.58
306 0.63
307 0.73
308 0.77
309 0.78
310 0.81
311 0.87
312 0.87
313 0.84
314 0.77
315 0.76
316 0.72
317 0.64
318 0.54
319 0.45
320 0.38
321 0.32
322 0.29
323 0.19
324 0.12
325 0.09
326 0.09
327 0.07
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.12
339 0.16
340 0.19
341 0.26
342 0.28
343 0.31
344 0.35
345 0.37
346 0.44
347 0.48
348 0.54
349 0.56
350 0.58
351 0.54
352 0.54
353 0.52
354 0.49
355 0.43
356 0.36
357 0.34
358 0.3
359 0.3
360 0.29
361 0.31
362 0.26
363 0.25
364 0.27
365 0.21
366 0.21
367 0.19
368 0.17
369 0.14
370 0.13
371 0.11
372 0.08
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.11
393 0.13
394 0.13
395 0.17
396 0.18
397 0.19
398 0.21
399 0.23
400 0.23
401 0.23
402 0.24
403 0.21
404 0.25
405 0.27
406 0.23
407 0.22
408 0.24
409 0.23
410 0.2
411 0.19
412 0.15
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.07
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.11
421 0.15
422 0.18
423 0.2
424 0.2
425 0.22
426 0.23
427 0.28
428 0.29
429 0.32
430 0.35
431 0.35
432 0.38
433 0.37
434 0.36
435 0.31
436 0.29
437 0.27
438 0.23
439 0.25
440 0.25
441 0.26
442 0.28
443 0.27
444 0.26
445 0.2
446 0.19
447 0.18
448 0.17
449 0.15
450 0.21
451 0.21
452 0.2
453 0.22
454 0.23
455 0.26
456 0.27
457 0.29
458 0.25
459 0.35
460 0.4
461 0.46
462 0.48
463 0.46
464 0.44
465 0.44
466 0.51
467 0.49
468 0.53
469 0.5
470 0.56
471 0.62
472 0.63
473 0.67
474 0.66
475 0.68
476 0.65
477 0.66
478 0.58
479 0.53
480 0.51
481 0.44
482 0.36
483 0.29
484 0.24
485 0.18
486 0.16
487 0.15
488 0.14
489 0.15
490 0.15
491 0.12
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.08
497 0.07
498 0.05
499 0.04
500 0.06
501 0.05
502 0.06
503 0.05
504 0.06
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.09
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.11