FuNGI

A0A238FFM0

Protein Details

Accession

A0A238FFM0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
486-505	RTPFTLRKPPPNQHRRPWIW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto_nucl 12.5, cyto 8, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MLGAASDYFESVYQDRPIDDAALEEIIDGLASTRFSPADSHKLEKAYSLEEMTKAQESGKSNSSPGPDGLPVEFYRATWTVTGPILRDVINSISTEGLSAEPSPRNIAHIHLIHKRGDRDQLVNKRPISLINADERIISQAHNQRLAPLLESLIGPTQCGFVPNRWIGTNIAEVQCLMDPEIPGSPPVSGLLAVMDFEKAYDRLSHTYLDAVLRVVGLGPKARQWYRATYTNQSASIFLNGWLSAAFDVLSGVRQGDPLAPSLFVLAIEGFACQIRSRVKGIESPGLQTIRELLFADDACCALHDLSDLEHLDRAIRLYERASASKLSTTKSFLYPLGSFRDHPVAPRLGTWRLSASHFRYLGIQVGVDIAEDAGWEEVKSSTIARINSIPMYDLPYAAKCSIVNIYCYTKILYYNRFLPAPKSVVKEIEDAAMLAIHGRASDGTQRRPRVSRSRLYTPLDHGGFGLIDLPRRLAIDHAKWAANQRTPFTLRKPPPNQHRRPWIWIWWAYFCHPPPKWDHAVRKTRELLPQRWVRYFEAWESRWANHVLFFPAGHGIQLSVNPTLFRGPDDEVMTPSSFVNASKRYHAFVYPPIVPEGHQKIFSLPEQRWNSWWKALRKVRRVHSDAEDTAHLLSLGSLHPGAQLASPVHTQLNNRSTFCVMCLSEATESLAHLAVGCPFARRLWGALSPAPHPTFLDFVCPVVSRSERRLVELRILFFHSIWKLSRRRRFSSDPLEPIAETTFEDLRASIQESKGRLVSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.2
3	0.2
4	0.21
5	0.19
6	0.18
7	0.15
8	0.13
9	0.13
10	0.12
11	0.1
12	0.09
13	0.07
14	0.07
15	0.06
16	0.05
17	0.05
18	0.06
19	0.07
20	0.09
21	0.09
22	0.1
23	0.15
24	0.2
25	0.29
26	0.33
27	0.37
28	0.4
29	0.42
30	0.42
31	0.41
32	0.38
33	0.31
34	0.29
35	0.28
36	0.26
37	0.24
38	0.26
39	0.25
40	0.24
41	0.21
42	0.2
43	0.22
44	0.24
45	0.28
46	0.32
47	0.31
48	0.31
49	0.34
50	0.36
51	0.34
52	0.31
53	0.29
54	0.25
55	0.25
56	0.24
57	0.24
58	0.21
59	0.23
60	0.22
61	0.19
62	0.22
63	0.21
64	0.22
65	0.19
66	0.19
67	0.18
68	0.2
69	0.22
70	0.18
71	0.19
72	0.19
73	0.18
74	0.18
75	0.17
76	0.16
77	0.16
78	0.15
79	0.14
80	0.13
81	0.13
82	0.12
83	0.11
84	0.09
85	0.09
86	0.1
87	0.13
88	0.15
89	0.16
90	0.2
91	0.19
92	0.21
93	0.2
94	0.22
95	0.26
96	0.28
97	0.33
98	0.37
99	0.4
100	0.43
101	0.47
102	0.48
103	0.44
104	0.48
105	0.46
106	0.46
107	0.53
108	0.58
109	0.6
110	0.64
111	0.6
112	0.55
113	0.51
114	0.46
115	0.41
116	0.35
117	0.32
118	0.31
119	0.32
120	0.3
121	0.29
122	0.27
123	0.24
124	0.2
125	0.17
126	0.18
127	0.23
128	0.27
129	0.31
130	0.3
131	0.3
132	0.34
133	0.34
134	0.28
135	0.21
136	0.18
137	0.15
138	0.15
139	0.14
140	0.14
141	0.13
142	0.12
143	0.11
144	0.12
145	0.11
146	0.14
147	0.14
148	0.13
149	0.21
150	0.23
151	0.25
152	0.24
153	0.25
154	0.24
155	0.25
156	0.26
157	0.23
158	0.21
159	0.19
160	0.19
161	0.18
162	0.17
163	0.15
164	0.12
165	0.1
166	0.09
167	0.1
168	0.12
169	0.11
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.08
174	0.09
175	0.08
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.05
184	0.05
185	0.07
186	0.07
187	0.08
188	0.1
189	0.13
190	0.15
191	0.17
192	0.18
193	0.16
194	0.17
195	0.18
196	0.16
197	0.13
198	0.11
199	0.09
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.09
206	0.09
207	0.12
208	0.19
209	0.2
210	0.24
211	0.27
212	0.33
213	0.36
214	0.44
215	0.45
216	0.45
217	0.5
218	0.48
219	0.46
220	0.39
221	0.35
222	0.27
223	0.24
224	0.19
225	0.14
226	0.12
227	0.1
228	0.1
229	0.08
230	0.08
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.06
243	0.08
244	0.09
245	0.1
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.07
252	0.07
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.08
262	0.1
263	0.13
264	0.15
265	0.17
266	0.18
267	0.22
268	0.25
269	0.28
270	0.26
271	0.26
272	0.28
273	0.26
274	0.24
275	0.2
276	0.2
277	0.14
278	0.14
279	0.12
280	0.09
281	0.1
282	0.1
283	0.11
284	0.08
285	0.08
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.09
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.08
306	0.13
307	0.15
308	0.16
309	0.16
310	0.16
311	0.16
312	0.2
313	0.2
314	0.18
315	0.17
316	0.19
317	0.2
318	0.2
319	0.21
320	0.17
321	0.19
322	0.19
323	0.19
324	0.21
325	0.2
326	0.2
327	0.2
328	0.24
329	0.2
330	0.2
331	0.22
332	0.19
333	0.18
334	0.2
335	0.21
336	0.19
337	0.2
338	0.2
339	0.18
340	0.17
341	0.19
342	0.22
343	0.23
344	0.26
345	0.25
346	0.24
347	0.24
348	0.23
349	0.22
350	0.18
351	0.14
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.06
356	0.05
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.02
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.05
368	0.05
369	0.07
370	0.1
371	0.11
372	0.11
373	0.12
374	0.13
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.09
379	0.13
380	0.12
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.13
385	0.12
386	0.12
387	0.08
388	0.09
389	0.12
390	0.12
391	0.13
392	0.13
393	0.16
394	0.15
395	0.16
396	0.16
397	0.13
398	0.16
399	0.18
400	0.19
401	0.2
402	0.23
403	0.24
404	0.25
405	0.25
406	0.23
407	0.23
408	0.23
409	0.24
410	0.23
411	0.22
412	0.23
413	0.25
414	0.24
415	0.21
416	0.18
417	0.14
418	0.11
419	0.1
420	0.08
421	0.06
422	0.05
423	0.04
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.03
428	0.04
429	0.12
430	0.15
431	0.23
432	0.29
433	0.33
434	0.37
435	0.4
436	0.46
437	0.49
438	0.53
439	0.53
440	0.54
441	0.58
442	0.61
443	0.62
444	0.57
445	0.51
446	0.5
447	0.43
448	0.36
449	0.28
450	0.22
451	0.18
452	0.15
453	0.14
454	0.07
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.09
461	0.09
462	0.15
463	0.16
464	0.21
465	0.23
466	0.23
467	0.24
468	0.3
469	0.32
470	0.31
471	0.3
472	0.27
473	0.3
474	0.34
475	0.36
476	0.36
477	0.41
478	0.42
479	0.5
480	0.57
481	0.61
482	0.68
483	0.76
484	0.78
485	0.77
486	0.82
487	0.76
488	0.75
489	0.7
490	0.65
491	0.61
492	0.58
493	0.52
494	0.44
495	0.41
496	0.36
497	0.37
498	0.33
499	0.34
500	0.31
501	0.31
502	0.34
503	0.39
504	0.44
505	0.47
506	0.55
507	0.56
508	0.65
509	0.66
510	0.67
511	0.65
512	0.62
513	0.62
514	0.6
515	0.54
516	0.53
517	0.58
518	0.55
519	0.54
520	0.52
521	0.47
522	0.43
523	0.41
524	0.38
525	0.38
526	0.35
527	0.38
528	0.37
529	0.34
530	0.34
531	0.33
532	0.28
533	0.23
534	0.24
535	0.19
536	0.17
537	0.17
538	0.14
539	0.15
540	0.14
541	0.11
542	0.09
543	0.08
544	0.08
545	0.09
546	0.11
547	0.1
548	0.1
549	0.1
550	0.11
551	0.12
552	0.11
553	0.11
554	0.12
555	0.13
556	0.16
557	0.19
558	0.19
559	0.19
560	0.21
561	0.21
562	0.19
563	0.16
564	0.13
565	0.11
566	0.11
567	0.16
568	0.18
569	0.2
570	0.26
571	0.28
572	0.29
573	0.3
574	0.31
575	0.29
576	0.29
577	0.33
578	0.29
579	0.29
580	0.28
581	0.26
582	0.25
583	0.3
584	0.31
585	0.28
586	0.27
587	0.26
588	0.26
589	0.29
590	0.32
591	0.3
592	0.24
593	0.32
594	0.37
595	0.38
596	0.4
597	0.42
598	0.42
599	0.44
600	0.51
601	0.46
602	0.51
603	0.59
604	0.66
605	0.7
606	0.75
607	0.76
608	0.78
609	0.76
610	0.72
611	0.69
612	0.66
613	0.58
614	0.52
615	0.44
616	0.34
617	0.31
618	0.25
619	0.18
620	0.11
621	0.09
622	0.07
623	0.07
624	0.08
625	0.07
626	0.07
627	0.08
628	0.08
629	0.09
630	0.08
631	0.11
632	0.1
633	0.12
634	0.13
635	0.14
636	0.16
637	0.18
638	0.2
639	0.26
640	0.33
641	0.35
642	0.35
643	0.36
644	0.36
645	0.34
646	0.33
647	0.3
648	0.22
649	0.2
650	0.2
651	0.2
652	0.18
653	0.18
654	0.19
655	0.13
656	0.13
657	0.13
658	0.12
659	0.09
660	0.09
661	0.09
662	0.08
663	0.1
664	0.11
665	0.11
666	0.12
667	0.12
668	0.15
669	0.15
670	0.16
671	0.18
672	0.22
673	0.24
674	0.26
675	0.29
676	0.28
677	0.34
678	0.33
679	0.29
680	0.26
681	0.24
682	0.24
683	0.22
684	0.26
685	0.19
686	0.19
687	0.21
688	0.2
689	0.19
690	0.22
691	0.27
692	0.25
693	0.3
694	0.39
695	0.37
696	0.42
697	0.48
698	0.45
699	0.5
700	0.5
701	0.47
702	0.41
703	0.44
704	0.39
705	0.33
706	0.36
707	0.29
708	0.27
709	0.29
710	0.34
711	0.4
712	0.49
713	0.59
714	0.62
715	0.67
716	0.72
717	0.77
718	0.79
719	0.8
720	0.79
721	0.75
722	0.71
723	0.66
724	0.57
725	0.5
726	0.41
727	0.31
728	0.22
729	0.2
730	0.17
731	0.15
732	0.15
733	0.14
734	0.14
735	0.15
736	0.19
737	0.2
738	0.23
739	0.28
740	0.29
741	0.33

A0A238FFM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer