FuNGI

A0A238FBC0

Protein Details

Accession

A0A238FBC0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
644-665	TEQRWKSWWKALRKIRRVHSDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000477 RT_dom
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MLGAASDYFESVYQDRPIDDAALEIIDGLASTRFSPADSHKLERAYPLEEMTKSQESCKSNSSPGPDGLPVEFYRATWTVTGPILRDVINSIPTEGLSAEPSPRNIAHIHLIHKRGERDQLVNKRPISLINADERIISQAHNQRLAPLLESLVGPTQRGFVPNRWIGTNIAEVQCVMDPEIPGSPPVSGLLAVMDFEKAYDRLSHTYLDAVLRAVGLGPKARQWYRATYTNQSASVFLNGWLSAAFDVLSGVRQGDPLAPSLFALAIEGFACQIRSRVKGIESPGLQTIRELLFADDACCALHDLSDLQDLNLAIGLYERASASKLSNTKSFLYPLGSFRNHPIVPRLGTWRLSDSQFRYLGIQVGVDIAEDAGWEEVKSSTIARINSIPMYDLPYAAKCSIVNIYCYTKVLFYNRFLPAPKSVVKEIEDTAMLAIHGRDSDGTRRRPMVSRSRLCTPLDHGGFGLIDLPMRLAIDHTKWVFQLRDPDGCFTQHLFDVRIRLLAANQPHPFTLRKPPPNQHRRPWIWIWWAYFCHPPPKCYHAVRETRCLLPPRWARYFEAWASVTTLNPPEFSSNQNLERWANHVLFFPAGHGIQLSVNPTLFRGPDGEVMTPTSFIDTSKRRHAFVFPPIIPEGHQKIFSLTEQRWKSWWKALRKIRRVHSDAEDTAHLLSLGSLHPGVQLSSATHSQLNNRSASCVMCLSEAPESLPHLAVGCPFARRLWAALSPSPHPIFADFVCPLVSRSERRIVELRILFFHSTWKLFHRRRFSSQPLEPITEAELEELRGLSRGARVASLLYNVSKGGFSGYGRLWLKGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.2
3	0.2
4	0.21
5	0.19
6	0.18
7	0.14
8	0.12
9	0.11
10	0.1
11	0.08
12	0.07
13	0.05
14	0.05
15	0.05
16	0.05
17	0.06
18	0.06
19	0.08
20	0.09
21	0.1
22	0.14
23	0.2
24	0.29
25	0.33
26	0.38
27	0.41
28	0.43
29	0.44
30	0.45
31	0.42
32	0.36
33	0.33
34	0.31
35	0.31
36	0.29
37	0.31
38	0.31
39	0.34
40	0.32
41	0.34
42	0.38
43	0.36
44	0.39
45	0.43
46	0.41
47	0.41
48	0.45
49	0.47
50	0.44
51	0.43
52	0.43
53	0.38
54	0.36
55	0.3
56	0.3
57	0.24
58	0.24
59	0.22
60	0.19
61	0.23
62	0.22
63	0.22
64	0.19
65	0.2
66	0.18
67	0.2
68	0.22
69	0.18
70	0.19
71	0.19
72	0.18
73	0.18
74	0.17
75	0.17
76	0.19
77	0.18
78	0.16
79	0.15
80	0.15
81	0.15
82	0.13
83	0.12
84	0.11
85	0.12
86	0.15
87	0.17
88	0.19
89	0.21
90	0.21
91	0.23
92	0.21
93	0.23
94	0.26
95	0.28
96	0.34
97	0.37
98	0.4
99	0.43
100	0.48
101	0.48
102	0.45
103	0.49
104	0.46
105	0.47
106	0.53
107	0.58
108	0.61
109	0.64
110	0.61
111	0.55
112	0.52
113	0.47
114	0.42
115	0.36
116	0.32
117	0.32
118	0.33
119	0.3
120	0.3
121	0.28
122	0.25
123	0.21
124	0.17
125	0.18
126	0.24
127	0.28
128	0.31
129	0.31
130	0.31
131	0.34
132	0.34
133	0.28
134	0.22
135	0.18
136	0.15
137	0.15
138	0.15
139	0.14
140	0.14
141	0.12
142	0.12
143	0.13
144	0.13
145	0.17
146	0.19
147	0.2
148	0.28
149	0.32
150	0.34
151	0.32
152	0.33
153	0.31
154	0.3
155	0.3
156	0.25
157	0.22
158	0.2
159	0.19
160	0.19
161	0.18
162	0.16
163	0.13
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.12
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.1
172	0.08
173	0.09
174	0.08
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.05
183	0.05
184	0.07
185	0.07
186	0.08
187	0.1
188	0.13
189	0.16
190	0.18
191	0.19
192	0.17
193	0.18
194	0.18
195	0.16
196	0.14
197	0.11
198	0.1
199	0.08
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.09
205	0.1
206	0.13
207	0.2
208	0.21
209	0.25
210	0.27
211	0.34
212	0.37
213	0.45
214	0.46
215	0.46
216	0.51
217	0.49
218	0.47
219	0.4
220	0.36
221	0.28
222	0.25
223	0.19
224	0.14
225	0.12
226	0.11
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.04
234	0.05
235	0.04
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.06
242	0.08
243	0.09
244	0.11
245	0.11
246	0.1
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.07
251	0.07
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.08
261	0.11
262	0.13
263	0.15
264	0.17
265	0.19
266	0.23
267	0.26
268	0.29
269	0.27
270	0.27
271	0.29
272	0.27
273	0.25
274	0.21
275	0.2
276	0.14
277	0.14
278	0.13
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.09
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.1
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.05
302	0.05
303	0.06
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.04
308	0.05
309	0.06
310	0.07
311	0.12
312	0.16
313	0.18
314	0.21
315	0.23
316	0.25
317	0.25
318	0.26
319	0.22
320	0.22
321	0.21
322	0.21
323	0.25
324	0.24
325	0.23
326	0.24
327	0.3
328	0.27
329	0.26
330	0.26
331	0.23
332	0.24
333	0.25
334	0.28
335	0.24
336	0.25
337	0.25
338	0.25
339	0.24
340	0.24
341	0.26
342	0.24
343	0.27
344	0.25
345	0.24
346	0.22
347	0.21
348	0.2
349	0.16
350	0.13
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.05
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.04
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.08
369	0.11
370	0.11
371	0.12
372	0.13
373	0.14
374	0.14
375	0.14
376	0.12
377	0.09
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.11
382	0.11
383	0.13
384	0.12
385	0.12
386	0.08
387	0.09
388	0.12
389	0.12
390	0.12
391	0.13
392	0.15
393	0.15
394	0.16
395	0.15
396	0.12
397	0.13
398	0.16
399	0.17
400	0.16
401	0.22
402	0.22
403	0.24
404	0.24
405	0.24
406	0.22
407	0.23
408	0.24
409	0.21
410	0.21
411	0.22
412	0.22
413	0.22
414	0.2
415	0.18
416	0.14
417	0.12
418	0.11
419	0.08
420	0.07
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.06
428	0.13
429	0.2
430	0.23
431	0.25
432	0.28
433	0.3
434	0.34
435	0.39
436	0.42
437	0.46
438	0.49
439	0.5
440	0.52
441	0.54
442	0.5
443	0.45
444	0.39
445	0.36
446	0.31
447	0.27
448	0.23
449	0.2
450	0.18
451	0.17
452	0.13
453	0.05
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.06
462	0.07
463	0.11
464	0.12
465	0.13
466	0.13
467	0.16
468	0.16
469	0.16
470	0.23
471	0.22
472	0.27
473	0.27
474	0.29
475	0.27
476	0.27
477	0.27
478	0.19
479	0.18
480	0.14
481	0.14
482	0.14
483	0.14
484	0.15
485	0.15
486	0.14
487	0.13
488	0.12
489	0.12
490	0.14
491	0.16
492	0.2
493	0.21
494	0.21
495	0.21
496	0.23
497	0.23
498	0.23
499	0.3
500	0.33
501	0.4
502	0.47
503	0.56
504	0.65
505	0.74
506	0.79
507	0.77
508	0.78
509	0.75
510	0.74
511	0.69
512	0.64
513	0.6
514	0.56
515	0.51
516	0.43
517	0.4
518	0.36
519	0.36
520	0.32
521	0.34
522	0.31
523	0.31
524	0.32
525	0.37
526	0.41
527	0.39
528	0.45
529	0.45
530	0.54
531	0.55
532	0.58
533	0.55
534	0.51
535	0.53
536	0.5
537	0.41
538	0.41
539	0.45
540	0.44
541	0.46
542	0.46
543	0.44
544	0.44
545	0.49
546	0.4
547	0.38
548	0.32
549	0.27
550	0.28
551	0.25
552	0.2
553	0.17
554	0.19
555	0.14
556	0.14
557	0.14
558	0.15
559	0.15
560	0.18
561	0.23
562	0.24
563	0.27
564	0.27
565	0.29
566	0.27
567	0.26
568	0.27
569	0.25
570	0.22
571	0.19
572	0.19
573	0.18
574	0.17
575	0.16
576	0.14
577	0.12
578	0.11
579	0.1
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.09
584	0.11
585	0.1
586	0.1
587	0.1
588	0.11
589	0.12
590	0.11
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.16
595	0.18
596	0.18
597	0.17
598	0.2
599	0.19
600	0.18
601	0.16
602	0.12
603	0.1
604	0.1
605	0.17
606	0.2
607	0.25
608	0.35
609	0.37
610	0.37
611	0.39
612	0.44
613	0.43
614	0.46
615	0.5
616	0.41
617	0.43
618	0.42
619	0.4
620	0.36
621	0.36
622	0.33
623	0.26
624	0.26
625	0.22
626	0.23
627	0.25
628	0.26
629	0.26
630	0.23
631	0.3
632	0.31
633	0.33
634	0.35
635	0.37
636	0.39
637	0.41
638	0.47
639	0.47
640	0.55
641	0.64
642	0.71
643	0.76
644	0.81
645	0.81
646	0.83
647	0.78
648	0.73
649	0.7
650	0.66
651	0.58
652	0.52
653	0.43
654	0.34
655	0.3
656	0.25
657	0.18
658	0.1
659	0.09
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.07
664	0.07
665	0.08
666	0.09
667	0.09
668	0.08
669	0.09
670	0.09
671	0.13
672	0.14
673	0.14
674	0.17
675	0.18
676	0.24
677	0.31
678	0.33
679	0.33
680	0.32
681	0.33
682	0.31
683	0.31
684	0.27
685	0.2
686	0.17
687	0.15
688	0.15
689	0.15
690	0.16
691	0.15
692	0.14
693	0.14
694	0.15
695	0.16
696	0.16
697	0.14
698	0.12
699	0.13
700	0.12
701	0.14
702	0.14
703	0.13
704	0.14
705	0.14
706	0.16
707	0.17
708	0.18
709	0.19
710	0.22
711	0.25
712	0.29
713	0.32
714	0.31
715	0.37
716	0.36
717	0.33
718	0.29
719	0.25
720	0.25
721	0.21
722	0.25
723	0.18
724	0.18
725	0.19
726	0.18
727	0.18
728	0.2
729	0.24
730	0.23
731	0.28
732	0.37
733	0.36
734	0.41
735	0.47
736	0.44
737	0.49
738	0.49
739	0.46
740	0.4
741	0.43
742	0.39
743	0.32
744	0.36
745	0.31
746	0.28
747	0.28
748	0.32
749	0.39
750	0.46
751	0.54
752	0.58
753	0.62
754	0.69
755	0.76
756	0.78
757	0.77
758	0.76
759	0.77
760	0.72
761	0.69
762	0.6
763	0.52
764	0.45
765	0.36
766	0.3
767	0.22
768	0.18
769	0.14
770	0.14
771	0.13
772	0.11
773	0.1
774	0.1
775	0.1
776	0.12
777	0.15
778	0.15
779	0.16
780	0.16
781	0.17
782	0.19
783	0.2
784	0.2
785	0.17
786	0.18
787	0.17
788	0.17
789	0.15
790	0.13
791	0.14
792	0.14
793	0.13
794	0.18
795	0.18
796	0.26
797	0.28

A0A238FBC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer