FuNGI

A0A238F5Z6

Protein Details

Accession

A0A238F5Z6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
306-336	PKYDANYKRGRSKNHKKKKKQQQHSKGSADS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
313-326	KRGRSKNHKKKKKQ

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 9.5, cyto 6, mito 5, pero 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MTCCGNYVKGLRSRGTRGIGEMARARRGAEWRQMAGASVIYQHHVMSSTTTTVSNDGGDIKITKLGKDNYELWSIRVDAFLEGRSLASVIEHGIVRPASMDEEAWKSLHGIDSSLQATNVDNTLRKRDRSARSTIIACLDDSNLKMVKSKELSAKTIWEKLKKHHEGNADPFKIRTLLMEISNATYDEDSNLGEFLNGITDKVDQLKDLGQTFKDEAVVAYMLQALLPSYEMLKQAIKLSEKCSVDYAVNRLTDEYSERKLTGKYDKVLKNAGALAVQSTQVRRDPNCICRGCKGTGYYQIDPECPKYDANYKRGRSKNHKKKKKQQQHSKGSADSEDSASFALAVKPLDESTSLHFNVANRVSQVDQSEIWILDTGASQHYVGDASLLSDRQHGSLNVQTASGQVVHCDTYGTVRFKLTSGASLSLSKVYHLPGAPVNLVSTRALFIAGASCGWEDGKDVMTIKIKGLTVARTLNGTGYTLDFSRIVEDQAHVATRATVGAPLMEWHRRYGHLPVSSVMELVKSGAVEGLVLTDKEVHDCEPCIKSKSRATKFSEMVTNVTDVLQRVFMDIGFVAEDQADFQGRKAYLAIVDQVTRVWIAFRLGVEKMTGRKIKRVRTDNGNEFTNKLIGADFQSQGILHETSAPYTPQQNGTVERFNGFEARERSRAFHGSLMAIVRAVLSASKLSWKYWSYALEYATFIANRVLHSKLDGKTAYEVFYGKKPKVSHFRPFGSTVYAQIPKSKRSKLESTSVKGTFIGYDSEYNYRVLIDSDSEHKVVISRDIAVLNLQPEEVRVPEVTALLEGPDEDDSPVTDGKEAVDELQEEDDEVQIAPARQNRPRWEYGDPAVRGRNPGRFEEIDAGNELPQRTRGQRRIAEQQAGPSSIFIRLRKVRASDLIPSLAVNDVVLSDPDSMLGAANDYFESVYQDRVSGLLAVMDFEKAYDRLSHTYLDAVLRAVGLGPKARQWYRATYTNQSASIFLNGWLSAAFDVLSGVRQGDPLAPSLFVLAIEGFACQIRSRVKGIESPGLQTIRELLFADDACCALHDLSDLEHLDRAIRLYERASASKLSTTKSFLYSLGSFRDHPVAPRLGTWRLSASHFRYLGIQVGVDIAEDAGWEEVKSSTIARTNSIPMYDLPYTAKCSIVNIYCYTKILYYNRFLPAPKRVVKEIEDAAMLAIHGRASDGTQRRRGFPAIDHAKWVFQLRDPDGCFC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.56
3	0.5
4	0.46
5	0.49
6	0.45
7	0.44
8	0.45
9	0.42
10	0.41
11	0.4
12	0.38
13	0.35
14	0.4
15	0.42
16	0.44
17	0.46
18	0.44
19	0.46
20	0.45
21	0.41
22	0.35
23	0.29
24	0.2
25	0.17
26	0.16
27	0.15
28	0.15
29	0.14
30	0.14
31	0.14
32	0.14
33	0.14
34	0.15
35	0.16
36	0.17
37	0.18
38	0.18
39	0.18
40	0.19
41	0.16
42	0.14
43	0.14
44	0.13
45	0.14
46	0.14
47	0.13
48	0.18
49	0.19
50	0.19
51	0.25
52	0.3
53	0.31
54	0.36
55	0.38
56	0.36
57	0.43
58	0.42
59	0.35
60	0.34
61	0.32
62	0.27
63	0.25
64	0.22
65	0.16
66	0.17
67	0.16
68	0.14
69	0.13
70	0.13
71	0.12
72	0.11
73	0.09
74	0.08
75	0.07
76	0.07
77	0.1
78	0.1
79	0.09
80	0.13
81	0.13
82	0.12
83	0.13
84	0.13
85	0.12
86	0.13
87	0.13
88	0.13
89	0.17
90	0.19
91	0.18
92	0.17
93	0.16
94	0.17
95	0.2
96	0.17
97	0.15
98	0.14
99	0.19
100	0.2
101	0.2
102	0.19
103	0.15
104	0.16
105	0.16
106	0.17
107	0.15
108	0.18
109	0.2
110	0.31
111	0.36
112	0.38
113	0.44
114	0.52
115	0.59
116	0.6
117	0.65
118	0.61
119	0.61
120	0.61
121	0.56
122	0.5
123	0.42
124	0.36
125	0.29
126	0.24
127	0.21
128	0.19
129	0.21
130	0.18
131	0.17
132	0.21
133	0.21
134	0.27
135	0.28
136	0.33
137	0.38
138	0.4
139	0.44
140	0.41
141	0.48
142	0.45
143	0.5
144	0.51
145	0.5
146	0.5
147	0.55
148	0.64
149	0.65
150	0.65
151	0.63
152	0.66
153	0.65
154	0.71
155	0.73
156	0.65
157	0.58
158	0.53
159	0.49
160	0.41
161	0.33
162	0.24
163	0.18
164	0.18
165	0.19
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.21
170	0.19
171	0.16
172	0.13
173	0.12
174	0.1
175	0.1
176	0.09
177	0.09
178	0.08
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.05
183	0.09
184	0.08
185	0.08
186	0.09
187	0.1
188	0.11
189	0.15
190	0.15
191	0.12
192	0.13
193	0.16
194	0.19
195	0.21
196	0.23
197	0.19
198	0.22
199	0.24
200	0.23
201	0.2
202	0.17
203	0.15
204	0.14
205	0.14
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.08
210	0.07
211	0.07
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.08
218	0.09
219	0.11
220	0.12
221	0.13
222	0.17
223	0.22
224	0.25
225	0.26
226	0.29
227	0.35
228	0.35
229	0.34
230	0.32
231	0.29
232	0.27
233	0.28
234	0.29
235	0.26
236	0.25
237	0.25
238	0.23
239	0.22
240	0.21
241	0.22
242	0.21
243	0.21
244	0.22
245	0.22
246	0.24
247	0.25
248	0.28
249	0.33
250	0.35
251	0.36
252	0.44
253	0.48
254	0.49
255	0.52
256	0.48
257	0.41
258	0.36
259	0.32
260	0.22
261	0.18
262	0.16
263	0.12
264	0.13
265	0.12
266	0.12
267	0.14
268	0.17
269	0.21
270	0.21
271	0.27
272	0.33
273	0.39
274	0.48
275	0.49
276	0.48
277	0.5
278	0.53
279	0.48
280	0.46
281	0.41
282	0.36
283	0.42
284	0.46
285	0.42
286	0.42
287	0.41
288	0.4
289	0.39
290	0.37
291	0.3
292	0.25
293	0.24
294	0.22
295	0.3
296	0.35
297	0.41
298	0.47
299	0.49
300	0.58
301	0.63
302	0.7
303	0.72
304	0.76
305	0.79
306	0.81
307	0.87
308	0.88
309	0.93
310	0.95
311	0.95
312	0.95
313	0.95
314	0.95
315	0.95
316	0.93
317	0.88
318	0.79
319	0.7
320	0.6
321	0.5
322	0.41
323	0.32
324	0.22
325	0.17
326	0.14
327	0.12
328	0.1
329	0.09
330	0.08
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.11
340	0.17
341	0.17
342	0.17
343	0.18
344	0.18
345	0.23
346	0.24
347	0.22
348	0.16
349	0.18
350	0.18
351	0.19
352	0.19
353	0.15
354	0.13
355	0.13
356	0.15
357	0.13
358	0.13
359	0.11
360	0.1
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.1
378	0.1
379	0.11
380	0.13
381	0.12
382	0.14
383	0.16
384	0.18
385	0.16
386	0.16
387	0.15
388	0.13
389	0.14
390	0.13
391	0.09
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.1
399	0.16
400	0.18
401	0.18
402	0.18
403	0.18
404	0.18
405	0.21
406	0.18
407	0.15
408	0.15
409	0.15
410	0.16
411	0.16
412	0.17
413	0.16
414	0.16
415	0.13
416	0.13
417	0.12
418	0.13
419	0.13
420	0.14
421	0.13
422	0.15
423	0.15
424	0.14
425	0.13
426	0.11
427	0.12
428	0.11
429	0.09
430	0.08
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.06
445	0.07
446	0.07
447	0.08
448	0.1
449	0.14
450	0.14
451	0.14
452	0.16
453	0.15
454	0.16
455	0.16
456	0.16
457	0.15
458	0.16
459	0.16
460	0.14
461	0.14
462	0.13
463	0.12
464	0.11
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.08
469	0.09
470	0.08
471	0.08
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.09
479	0.1
480	0.08
481	0.08
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.08
492	0.11
493	0.12
494	0.13
495	0.15
496	0.16
497	0.18
498	0.21
499	0.25
500	0.24
501	0.24
502	0.23
503	0.25
504	0.24
505	0.22
506	0.17
507	0.11
508	0.09
509	0.08
510	0.08
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.03
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.06
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.09
528	0.12
529	0.13
530	0.15
531	0.18
532	0.2
533	0.23
534	0.3
535	0.39
536	0.42
537	0.48
538	0.52
539	0.56
540	0.56
541	0.54
542	0.51
543	0.41
544	0.37
545	0.29
546	0.23
547	0.16
548	0.15
549	0.13
550	0.09
551	0.08
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.06
558	0.05
559	0.05
560	0.05
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.09
571	0.09
572	0.1
573	0.1
574	0.1
575	0.09
576	0.1
577	0.11
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.08
582	0.08
583	0.07
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.06
590	0.08
591	0.08
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.11
596	0.16
597	0.2
598	0.19
599	0.26
600	0.32
601	0.39
602	0.46
603	0.51
604	0.5
605	0.55
606	0.62
607	0.62
608	0.59
609	0.54
610	0.46
611	0.4
612	0.36
613	0.27
614	0.18
615	0.11
616	0.08
617	0.07
618	0.09
619	0.1
620	0.1
621	0.1
622	0.1
623	0.09
624	0.1
625	0.11
626	0.09
627	0.06
628	0.08
629	0.08
630	0.09
631	0.1
632	0.1
633	0.09
634	0.1
635	0.12
636	0.12
637	0.14
638	0.15
639	0.17
640	0.2
641	0.22
642	0.2
643	0.19
644	0.18
645	0.16
646	0.16
647	0.14
648	0.16
649	0.17
650	0.21
651	0.24
652	0.24
653	0.26
654	0.27
655	0.29
656	0.25
657	0.23
658	0.2
659	0.16
660	0.17
661	0.15
662	0.12
663	0.09
664	0.08
665	0.06
666	0.05
667	0.05
668	0.03
669	0.03
670	0.04
671	0.04
672	0.09
673	0.09
674	0.1
675	0.14
676	0.15
677	0.16
678	0.19
679	0.21
680	0.2
681	0.22
682	0.22
683	0.2
684	0.19
685	0.18
686	0.16
687	0.14
688	0.11
689	0.1
690	0.1
691	0.09
692	0.11
693	0.12
694	0.11
695	0.13
696	0.18
697	0.17
698	0.21
699	0.21
700	0.2
701	0.21
702	0.22
703	0.21
704	0.16
705	0.16
706	0.13
707	0.18
708	0.22
709	0.2
710	0.24
711	0.24
712	0.31
713	0.4
714	0.45
715	0.48
716	0.51
717	0.54
718	0.52
719	0.53
720	0.47
721	0.41
722	0.35
723	0.29
724	0.26
725	0.26
726	0.23
727	0.27
728	0.28
729	0.3
730	0.36
731	0.38
732	0.39
733	0.42
734	0.49
735	0.46
736	0.53
737	0.54
738	0.53
739	0.55
740	0.5
741	0.45
742	0.37
743	0.33
744	0.24
745	0.18
746	0.15
747	0.09
748	0.1
749	0.11
750	0.13
751	0.14
752	0.14
753	0.13
754	0.11
755	0.1
756	0.1
757	0.09
758	0.08
759	0.08
760	0.12
761	0.14
762	0.14
763	0.13
764	0.12
765	0.14
766	0.13
767	0.14
768	0.12
769	0.11
770	0.12
771	0.12
772	0.12
773	0.11
774	0.11
775	0.1
776	0.09
777	0.08
778	0.07
779	0.07
780	0.08
781	0.07
782	0.08
783	0.07
784	0.07
785	0.08
786	0.08
787	0.08
788	0.07
789	0.07
790	0.05
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.05
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.06
799	0.07
800	0.08
801	0.08
802	0.07
803	0.07
804	0.07
805	0.08
806	0.08
807	0.07
808	0.07
809	0.08
810	0.08
811	0.09
812	0.08
813	0.07
814	0.07
815	0.07
816	0.06
817	0.06
818	0.05
819	0.06
820	0.07
821	0.09
822	0.15
823	0.2
824	0.24
825	0.31
826	0.37
827	0.43
828	0.47
829	0.48
830	0.47
831	0.47
832	0.47
833	0.49
834	0.44
835	0.4
836	0.4
837	0.36
838	0.38
839	0.36
840	0.37
841	0.31
842	0.32
843	0.34
844	0.31
845	0.33
846	0.33
847	0.31
848	0.26
849	0.25
850	0.23
851	0.18
852	0.19
853	0.17
854	0.12
855	0.14
856	0.17
857	0.23
858	0.31
859	0.37
860	0.43
861	0.48
862	0.53
863	0.6
864	0.62
865	0.61
866	0.53
867	0.51
868	0.45
869	0.41
870	0.36
871	0.26
872	0.21
873	0.21
874	0.24
875	0.19
876	0.24
877	0.28
878	0.32
879	0.36
880	0.37
881	0.37
882	0.38
883	0.4
884	0.37
885	0.35
886	0.32
887	0.28
888	0.25
889	0.22
890	0.18
891	0.14
892	0.09
893	0.06
894	0.05
895	0.05
896	0.06
897	0.06
898	0.06
899	0.06
900	0.07
901	0.07
902	0.06
903	0.06
904	0.06
905	0.06
906	0.05
907	0.06
908	0.06
909	0.06
910	0.06
911	0.06
912	0.1
913	0.1
914	0.12
915	0.12
916	0.12
917	0.12
918	0.12
919	0.12
920	0.09
921	0.08
922	0.07
923	0.07
924	0.07
925	0.07
926	0.07
927	0.06
928	0.06
929	0.08
930	0.07
931	0.09
932	0.11
933	0.14
934	0.16
935	0.18
936	0.19
937	0.18
938	0.19
939	0.19
940	0.17
941	0.14
942	0.12
943	0.1
944	0.09
945	0.08
946	0.08
947	0.07
948	0.08
949	0.1
950	0.11
951	0.14
952	0.22
953	0.23
954	0.28
955	0.3
956	0.37
957	0.4
958	0.48
959	0.49
960	0.49
961	0.55
962	0.53
963	0.51
964	0.44
965	0.39
966	0.32
967	0.28
968	0.22
969	0.17
970	0.14
971	0.12
972	0.11
973	0.1
974	0.1
975	0.07
976	0.07
977	0.06
978	0.05
979	0.05
980	0.05
981	0.06
982	0.06
983	0.07
984	0.07
985	0.07
986	0.08
987	0.1
988	0.11
989	0.13
990	0.14
991	0.13
992	0.13
993	0.13
994	0.12
995	0.09
996	0.09
997	0.06
998	0.06
999	0.06
1000	0.06
1001	0.06
1002	0.06
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.11
1006	0.14
1007	0.17
1008	0.2
1009	0.23
1010	0.25
1011	0.29
1012	0.34
1013	0.38
1014	0.35
1015	0.35
1016	0.37
1017	0.35
1018	0.32
1019	0.27
1020	0.27
1021	0.19
1022	0.19
1023	0.17
1024	0.13
1025	0.15
1026	0.15
1027	0.16
1028	0.12
1029	0.12
1030	0.1
1031	0.1
1032	0.11
1033	0.08
1034	0.08
1035	0.07
1036	0.08
1037	0.08
1038	0.13
1039	0.13
1040	0.13
1041	0.14
1042	0.14
1043	0.14
1044	0.14
1045	0.14
1046	0.13
1047	0.14
1048	0.14
1049	0.15
1050	0.21
1051	0.23
1052	0.25
1053	0.26
1054	0.26
1055	0.26
1056	0.31
1057	0.32
1058	0.29
1059	0.28
1060	0.3
1061	0.3
1062	0.31
1063	0.31
1064	0.25
1065	0.28
1066	0.27
1067	0.27
1068	0.28
1069	0.28
1070	0.26
1071	0.27
1072	0.32
1073	0.27
1074	0.28
1075	0.31
1076	0.31
1077	0.29
1078	0.32
1079	0.34
1080	0.33
1081	0.35
1082	0.34
1083	0.31
1084	0.29
1085	0.33
1086	0.37
1087	0.37
1088	0.41
1089	0.39
1090	0.38
1091	0.37
1092	0.36
1093	0.36
1094	0.29
1095	0.23
1096	0.15
1097	0.15
1098	0.15
1099	0.12
1100	0.1
1101	0.06
1102	0.05
1103	0.05
1104	0.05
1105	0.05
1106	0.05
1107	0.05
1108	0.06
1109	0.07
1110	0.08
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.13
1114	0.19
1115	0.2
1116	0.21
1117	0.24
1118	0.28
1119	0.3
1120	0.29
1121	0.27
1122	0.22
1123	0.28
1124	0.26
1125	0.24
1126	0.23
1127	0.23
1128	0.28
1129	0.27
1130	0.28
1131	0.22
1132	0.24
1133	0.29
1134	0.29
1135	0.31
1136	0.29
1137	0.34
1138	0.33
1139	0.34
1140	0.33
1141	0.29
1142	0.31
1143	0.34
1144	0.36
1145	0.36
1146	0.41
1147	0.44
1148	0.45
1149	0.46
1150	0.45
1151	0.48
1152	0.51
1153	0.53
1154	0.52
1155	0.52
1156	0.55
1157	0.56
1158	0.56
1159	0.5
1160	0.43
1161	0.36
1162	0.31
1163	0.27
1164	0.21
1165	0.18
1166	0.11
1167	0.09
1168	0.07
1169	0.06
1170	0.07
1171	0.07
1172	0.09
1173	0.18
1174	0.27
1175	0.34
1176	0.44
1177	0.47
1178	0.51
1179	0.55
1180	0.56
1181	0.51
1182	0.47
1183	0.5
1184	0.5
1185	0.48
1186	0.5
1187	0.46
1188	0.45
1189	0.43
1190	0.43
1191	0.35
1192	0.3
1193	0.37
1194	0.36
1195	0.43

A0A238F5Z6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer